; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0002550 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0002550
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionzinc finger protein 511
Genome locationLG03:4357041..4359205
RNA-Seq ExpressionSed0002550
SyntenySed0002550
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR039258 - Zinc finger protein 511


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6602683.1 Zinc finger protein 511, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.6e-12793.17Show/hide
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KAG7033369.1 Zinc finger protein [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.1e-12692.77Show/hide
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XP_022922829.1 zinc finger protein 511 [Cucurbita moschata]8.9e-12591.97Show/hide
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XP_022990047.1 zinc finger protein 511 [Cucurbita maxima]5.8e-12491.16Show/hide
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XP_023522582.1 zinc finger protein 511-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.8e-12692.77Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LMY3 Uncharacterized protein9.0e-12389.96Show/hide
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A0A1S3B3Y4 zinc finger protein 5111.4e-12389.56Show/hide
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A0A6J1BVX1 zinc finger protein 5112.2e-12187.95Show/hide
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A0A6J1E4J7 zinc finger protein 5114.3e-12591.97Show/hide
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A0A6J1JHI5 zinc finger protein 5112.8e-12491.16Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6P0X2 Zinc finger protein 5113.0e-2236.88Show/hide
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        A  E P+ + P   RF  D  FF  G+V+R +  + +   LT+  +    +MV     E  C + GC     +++D++ HY+  H  +CS C R FP+  
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        LL +H+ E HDS FQ  +A+  DMY+CLVE C  KFK+ + R  H+V  H + A F F K
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Q7ZZ00 Zinc finger protein 5113.4e-2632.91Show/hide
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        E +A S F + +P + RF  +  +F  G++ R +  + +     +D++    +       E  C I GC     +L+ +E HYN+ H   CS C R FP+
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        +RLL +H+ E HDS FQ  +A    MYECLVEGCGLKFK+ K R  HL+  H + A F F K  +  +    K  +K+      +A+ ++ E +E+MD  
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        +           +   K   S   PSS+ FG+   RG
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Q8NB15 Zinc finger protein 5119.6e-2131.65Show/hide
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        RF  +  FF  G+V+R +  + + + + +  EK ++            C + GC     +LDD+E HY++ H   CS C R FP+  LL  H+ E HDS 
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Query:  FQAKVARGYDMYECLVEGCGLKFKSYKSRHQHLVDKHKFSASFEFFKKAQPSKKQRHKLHRKQVLQEREAASKMEVENETMDILISGVS--------KLS
        FQ  ++   DMY+CLVEGC  KFK+ + R  H+V  H + A F F K          K  R     E    S    E E M+I    V+        +  
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Query:  TSDSTPSSVSFGRMHTRG
             PS++ FG+   RG
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Q9V574 Protein lethal(2)k102011.3e-0929.81Show/hide
Query:  DHYNSRHTASCSVCPRVFPTSRLLSLHVSEAHDSFFQAKVARG-YDMYECLVEGCGLKFKSYKSRHQHLVDKHKFSASFEFFKKAQPSKKQRHKLHRKQV
        D+ +   + SC  C ++ PT+ LL LH++E HD +F A V RG   M+ C +E C +KF + + R  H +  HK  A++  F  ++   KQ+H+   K  
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Query:  LQEREAASKMEVENETMDILISGVSKLSTSDSTPSSVSFGRMHTRGLTFVPRAVQREKVSD
          E +     EV  ET    +  V   S    T  S   G+    G T       +E ++D
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G14140.1 zinc ion binding;nucleic acid binding;zinc ion binding2.4e-9168.85Show/hide
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        FPYW P +RRF PDSPFFASGNVERE+LAKQ+ LD TEDE   LH  V    R I CPIVGC   LKSLD FEDHYN+RHTASCSVC RV+PTSRLLS+H
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Query:  VSEAHDSFFQAKVARGYDMYECLVEGCGLKFKSYKSRHQHLVDKHKFSASFEFFKKAQPSKKQRHKLHRKQVL-----QEREAASK--MEVENE-TMDIL
        +SEAHDSFFQAKV+RGYDMYECLVEGCGLKFK+YK+RH+HL+DKHKF  +FEFFKK Q SKK+R KL R+ V      +++EAAS   MEVE++ ++D L
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Query:  ISGVSKLSTSDSTPSSVSFGRMHTRGLTFVPRAVQREKVSDSST
        +S +S L+TSD+TPS+VSFGR H RGLTFVPR+V REK ++SS+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGTTGAAGCACAATCAGAGTTTCCTTACTGGAAGCCTTTCCAACGGAGATTCAATCCTGATTCTCCCTTCTTCGCCTCTGGAAATGTCGAGCGCGAAATCTTAGC
CAAACAGCTTGCCTTGGATTTAACCGAAGATGAAAAGCTCCAGCTACACAATATGGTGGTTGATGCCGGCAGGGAAATCTTTTGCCCAATTGTTGGTTGTGGTGCGCATT
TGAAATCACTGGATGACTTTGAAGATCATTACAATTCACGGCATACTGCCTCTTGTTCAGTTTGCCCAAGAGTTTTCCCGACATCGCGACTGCTTAGTCTACACGTGTCC
GAGGCGCATGACTCGTTCTTTCAAGCAAAAGTCGCTCGTGGCTATGACATGTACGAATGCCTGGTGGAAGGTTGTGGTTTAAAGTTCAAGAGCTACAAAAGCAGACATCA
GCATCTAGTGGACAAGCATAAGTTTTCTGCTTCATTTGAATTCTTTAAGAAAGCTCAACCGTCCAAGAAACAAAGACACAAATTACATCGTAAACAAGTACTTCAAGAAA
GGGAAGCGGCTTCGAAAATGGAAGTCGAGAATGAAACTATGGACATCCTCATTTCAGGAGTATCTAAACTAAGTACGTCAGACTCAACTCCATCGTCGGTCAGCTTTGGT
CGAATGCACACTCGGGGGTTAACGTTCGTTCCTCGAGCAGTTCAGCGTGAAAAAGTGTCAGACTCCTCAACAGTAGGATCAAAGAAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTGAATCGGGCAATTTGGTGAATGGATCTAACCCGGAATCTTGCGGGTCGGAAGGATTCAAATTGGAAGGTTGATTAGCATTGCCCTTTGTTCATGTTCTGCCATTGAA
GCTGAACTGAAAGAATCGTCCATGGAAGTTGAAGCACAATCAGAGTTTCCTTACTGGAAGCCTTTCCAACGGAGATTCAATCCTGATTCTCCCTTCTTCGCCTCTGGAAA
TGTCGAGCGCGAAATCTTAGCCAAACAGCTTGCCTTGGATTTAACCGAAGATGAAAAGCTCCAGCTACACAATATGGTGGTTGATGCCGGCAGGGAAATCTTTTGCCCAA
TTGTTGGTTGTGGTGCGCATTTGAAATCACTGGATGACTTTGAAGATCATTACAATTCACGGCATACTGCCTCTTGTTCAGTTTGCCCAAGAGTTTTCCCGACATCGCGA
CTGCTTAGTCTACACGTGTCCGAGGCGCATGACTCGTTCTTTCAAGCAAAAGTCGCTCGTGGCTATGACATGTACGAATGCCTGGTGGAAGGTTGTGGTTTAAAGTTCAA
GAGCTACAAAAGCAGACATCAGCATCTAGTGGACAAGCATAAGTTTTCTGCTTCATTTGAATTCTTTAAGAAAGCTCAACCGTCCAAGAAACAAAGACACAAATTACATC
GTAAACAAGTACTTCAAGAAAGGGAAGCGGCTTCGAAAATGGAAGTCGAGAATGAAACTATGGACATCCTCATTTCAGGAGTATCTAAACTAAGTACGTCAGACTCAACT
CCATCGTCGGTCAGCTTTGGTCGAATGCACACTCGGGGGTTAACGTTCGTTCCTCGAGCAGTTCAGCGTGAAAAAGTGTCAGACTCCTCAACAGTAGGATCAAAGAAATA
AAAGCTCTGCTTCTAGACCAAGTAAGGGTATGTCAGTTTCAGCTTATCTGCTTCCGATTTTCGCTGTACATTTCTTAATTCTTCTTATGGATATCTGGTGCTGCAACATT
TATGGAGTTAGATACATACATTTTTTCCATTTGACATTGATCATTAATCTCATCAGTGAGATGATTCATAGCCAAATTTGAGAACATATGTGAAATTATGGGAAAATGGT
AGCAGACTTGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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