CuGenDBv2

Gene ID	Sed0003013
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	Protein OS-9
Genome location	LG12:2066348..2069894
RNA-Seq Expression	Sed0003013
Synteny	Sed0003013
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	IPR031985 - Protein of unknown function DUF4787

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_008438284.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103483444 [Cucumis melo]

1.4e-58

83.97

Show/hide

Query:  MKVNNSHRNSNLFNTAKLLLILGFVFSFLSCHTVLAKSRRPVTDAETRQRKQECYSDIESGLWGWQCKSSAIEKENCALRCLSSPCYDLVYGSDPLEEGE
        M+VNNS +NS L NT K L++LGF+FS L+ HTV+AKSRRPVTDAETRQ+KQECY+DIESGLWGWQC+SS  EKENCALRCLS  CYDLVYGSDPLEEGE
Subjt:  MKVNNSHRNSNLFNTAKLLLILGFVFSFLSCHTVLAKSRRPVTDAETRQRKQECYSDIESGLWGWQCKSSAIEKENCALRCLSSPCYDLVYGSDPLEEGE

Query:  KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY
        KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY
Subjt:  KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY

XP_022924279.1 uncharacterized protein LOC111431806 [Cucurbita moschata]

5.8e-60

86.26

Show/hide

Query:  MKVNNSHRNSNLFNTAKLLLILGFVFSFLSCHTVLAKSRRPVTDAETRQRKQECYSDIESGLWGWQCKSSAIEKENCALRCLSSPCYDLVYGSDPLEEGE
        M++NNS RNSN  NT + LLILGF+FS LS HTVLAKSRRPVTDAETRQ+KQ+CY+DIESGLWGWQCKSSA EKENCALRCLS  CYD+VYGSDPLEEGE
Subjt:  MKVNNSHRNSNLFNTAKLLLILGFVFSFLSCHTVLAKSRRPVTDAETRQRKQECYSDIESGLWGWQCKSSAIEKENCALRCLSSPCYDLVYGSDPLEEGE

Query:  KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY
        KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY
Subjt:  KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY

XP_022980443.1 uncharacterized protein LOC111479810 [Cucurbita maxima]

2.6e-60

86.26

Show/hide

Query:  MKVNNSHRNSNLFNTAKLLLILGFVFSFLSCHTVLAKSRRPVTDAETRQRKQECYSDIESGLWGWQCKSSAIEKENCALRCLSSPCYDLVYGSDPLEEGE
        M++NN+ RNSN  NT +LLLILGF+FS LS HTVLAKSRRPVTDAETRQ+KQ+CY+DIESGLWGWQCKSSA EKENCALRCLS  CYD+VYGSDPLEEGE
Subjt:  MKVNNSHRNSNLFNTAKLLLILGFVFSFLSCHTVLAKSRRPVTDAETRQRKQECYSDIESGLWGWQCKSSAIEKENCALRCLSSPCYDLVYGSDPLEEGE

Query:  KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY
        KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY
Subjt:  KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY

XP_023526484.1 uncharacterized protein LOC111789973 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

6.8e-61

87.79

Show/hide

Query:  MKVNNSHRNSNLFNTAKLLLILGFVFSFLSCHTVLAKSRRPVTDAETRQRKQECYSDIESGLWGWQCKSSAIEKENCALRCLSSPCYDLVYGSDPLEEGE
        M++NNS RN N FNT +LLLILGFVFS LS HTVLAKSRRPVTDAETRQ+KQ+CY+DIESGLWGWQCKSSA EKENCALRCLS  CYD+VYGSDPLEEGE
Subjt:  MKVNNSHRNSNLFNTAKLLLILGFVFSFLSCHTVLAKSRRPVTDAETRQRKQECYSDIESGLWGWQCKSSAIEKENCALRCLSSPCYDLVYGSDPLEEGE

Query:  KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY
        KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY
Subjt:  KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY

XP_038899863.1 uncharacterized protein LOC120087079 [Benincasa hispida]

7.6e-60

87.79

Show/hide

Query:  MKVNNSHRNSNLFNTAKLLLILGFVFSFLSCHTVLAKSRRPVTDAETRQRKQECYSDIESGLWGWQCKSSAIEKENCALRCLSSPCYDLVYGSDPLEEGE
        M+VNNS RNSNL N  K L+ILGF+F  LS HTVLAKSRRPVTDAETRQ+KQECY+DIESGLWGWQCKSSA EKENCALRCLS  CYDLVYGSDPLEEGE
Subjt:  MKVNNSHRNSNLFNTAKLLLILGFVFSFLSCHTVLAKSRRPVTDAETRQRKQECYSDIESGLWGWQCKSSAIEKENCALRCLSSPCYDLVYGSDPLEEGE

Query:  KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY
        KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY
Subjt:  KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0L9A0 Uncharacterized protein

9.0e-59

84.73

Show/hide

Query:  MKVNNSHRNSNLFNTAKLLLILGFVFSFLSCHTVLAKSRRPVTDAETRQRKQECYSDIESGLWGWQCKSSAIEKENCALRCLSSPCYDLVYGSDPLEEGE
        M+VNNS RNS L NT K L++LG +FS L+ HTVLAKSRRPVTDAETRQ+KQECY+DIESGLWGWQC+SS  EKENCALRCLS  CYDLVYGSDPLEEGE
Subjt:  MKVNNSHRNSNLFNTAKLLLILGFVFSFLSCHTVLAKSRRPVTDAETRQRKQECYSDIESGLWGWQCKSSAIEKENCALRCLSSPCYDLVYGSDPLEEGE

Query:  KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY
        KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY
Subjt:  KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY

A0A1S3AW07 uncharacterized protein LOC103483444

6.9e-59

83.97

Show/hide

Query:  MKVNNSHRNSNLFNTAKLLLILGFVFSFLSCHTVLAKSRRPVTDAETRQRKQECYSDIESGLWGWQCKSSAIEKENCALRCLSSPCYDLVYGSDPLEEGE
        M+VNNS +NS L NT K L++LGF+FS L+ HTV+AKSRRPVTDAETRQ+KQECY+DIESGLWGWQC+SS  EKENCALRCLS  CYDLVYGSDPLEEGE
Subjt:  MKVNNSHRNSNLFNTAKLLLILGFVFSFLSCHTVLAKSRRPVTDAETRQRKQECYSDIESGLWGWQCKSSAIEKENCALRCLSSPCYDLVYGSDPLEEGE

Query:  KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY
        KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY
Subjt:  KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY

A0A5D3D394 Protein OS-9

6.9e-59

83.97

Show/hide

Query:  MKVNNSHRNSNLFNTAKLLLILGFVFSFLSCHTVLAKSRRPVTDAETRQRKQECYSDIESGLWGWQCKSSAIEKENCALRCLSSPCYDLVYGSDPLEEGE
        M+VNNS +NS L NT K L++LGF+FS L+ HTV+AKSRRPVTDAETRQ+KQECY+DIESGLWGWQC+SS  EKENCALRCLS  CYDLVYGSDPLEEGE
Subjt:  MKVNNSHRNSNLFNTAKLLLILGFVFSFLSCHTVLAKSRRPVTDAETRQRKQECYSDIESGLWGWQCKSSAIEKENCALRCLSSPCYDLVYGSDPLEEGE

Query:  KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY
        KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY
Subjt:  KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY

A0A6J1E8P8 uncharacterized protein LOC111431806

2.8e-60

86.26

Show/hide

Query:  MKVNNSHRNSNLFNTAKLLLILGFVFSFLSCHTVLAKSRRPVTDAETRQRKQECYSDIESGLWGWQCKSSAIEKENCALRCLSSPCYDLVYGSDPLEEGE
        M++NNS RNSN  NT + LLILGF+FS LS HTVLAKSRRPVTDAETRQ+KQ+CY+DIESGLWGWQCKSSA EKENCALRCLS  CYD+VYGSDPLEEGE
Subjt:  MKVNNSHRNSNLFNTAKLLLILGFVFSFLSCHTVLAKSRRPVTDAETRQRKQECYSDIESGLWGWQCKSSAIEKENCALRCLSSPCYDLVYGSDPLEEGE

Query:  KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY
        KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY
Subjt:  KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY

A0A6J1IZB5 uncharacterized protein LOC111479810

1.3e-60

86.26

Show/hide

Query:  MKVNNSHRNSNLFNTAKLLLILGFVFSFLSCHTVLAKSRRPVTDAETRQRKQECYSDIESGLWGWQCKSSAIEKENCALRCLSSPCYDLVYGSDPLEEGE
        M++NN+ RNSN  NT +LLLILGF+FS LS HTVLAKSRRPVTDAETRQ+KQ+CY+DIESGLWGWQCKSSA EKENCALRCLS  CYD+VYGSDPLEEGE
Subjt:  MKVNNSHRNSNLFNTAKLLLILGFVFSFLSCHTVLAKSRRPVTDAETRQRKQECYSDIESGLWGWQCKSSAIEKENCALRCLSSPCYDLVYGSDPLEEGE

Query:  KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY
        KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY
Subjt:  KDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G17610.1 unknown protein

5.8e-42

70.27

Show/hide

Query:  LLILGFVFSFLSCHTVLAKSRRPVTDAETRQRKQECYSDIESGLWGWQCKSSAIEKENCALRCLSSPCYDLVYGSDPLEEGEKDLARSQEYKYCIYKLSM
        LL+L     F+ C  V +KS RP++D E RQ+K ECY DIESGLWGWQCKSSAI KENCALRCLS  CY L+Y SDPLEEGEKDL RSQEYKYC+YK S+
Subjt:  LLILGFVFSFLSCHTVLAKSRRPVTDAETRQRKQECYSDIESGLWGWQCKSSAIEKENCALRCLSSPCYDLVYGSDPLEEGEKDLARSQEYKYCIYKLSM

Query:  GESLEGIKGSF
        GESLEG++G F
Subjt:  GESLEGIKGSF

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAATTGGAGGGCATATGAATCTGATCTAAACGCCATGAAAGTCAACAATTCTCACAGAAATTCAAATCTCTTCAACACAGCGAAGCTCTTGCTGATTCTAGGGTTTGT
TTTCTCCTTCCTTTCTTGCCATACAGTTCTTGCCAAATCTCGTCGTCCCGTCACTGATGCTGAAACCAGGCAAAGGAAGCAGGAGTGTTATTCTGATATCGAGAGTGGCT
TGTGGGGTTGGCAATGCAAATCTTCCGCTATCGAAAAGGAAAATTGCGCTCTGCGATGTCTTTCTTCTCCTTGTTATGATTTAGTGTATGGCAGTGATCCGCTCGAGGAA
GGAGAGAAGGATCTTGCTAGGAGTCAAGAGTATAAGTATTGTATCTATAAGTTGTCAATGGGGGAGAGTCTGGAGGGTATTAAGGGCTCCTTTGACTACTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

AACTATTCAATTGAAACTATATATACGTGCGAATGTTGGAAGCATTAGTTCATCAAACGCACTCTGAAAAGAGGTCGAGAGAGAGGAATGAATTGGAGGGCATATGAATC
TGATCTAAACGCCATGAAAGTCAACAATTCTCACAGAAATTCAAATCTCTTCAACACAGCGAAGCTCTTGCTGATTCTAGGGTTTGTTTTCTCCTTCCTTTCTTGCCATA
CAGTTCTTGCCAAATCTCGTCGTCCCGTCACTGATGCTGAAACCAGGCAAAGGAAGCAGGAGTGTTATTCTGATATCGAGAGTGGCTTGTGGGGTTGGCAATGCAAATCT
TCCGCTATCGAAAAGGAAAATTGCGCTCTGCGATGTCTTTCTTCTCCTTGTTATGATTTAGTGTATGGCAGTGATCCGCTCGAGGAAGGAGAGAAGGATCTTGCTAGGAG
TCAAGAGTATAAGTATTGTATCTATAAGTTGTCAATGGGGGAGAGTCTGGAGGGTATTAAGGGCTCCTTTGACTACTGATTGATGTGTGTATGCTTTCTCAAGATTGTCT
TTGTTCCATTTATGCCCTGTTCTTCTGACTTGACTACCTTTTAACATTAGGTCAAAATTTGAGGTACTAATCCAATCCCAAGTTCATATATTTTTCTTTCTCTATATGTA
TACATATTTTAAAATTAAGTGAAATATGGATGTTGTGTGGCAATGGCAATCTTGGAATCGAAACCACAGGTACGTGCAAAATTTTCAATTAATGAGTGGAATTTTTTAAC
CTTTGCTCAAGTAGATTGTAATGTATTAATAATCATGTTTATACTCATTTATGTTTGATCTCCAAAGTTTTCTTCCTTCACGGCCTTAGGTTCGAAATTCACGTTTTAGC
TTTATTGTAGAATTTTGTGTTGTTTCTTTCTAAAACTAGAATATCTACATTGAAACACATATTTCTTTAATTCCAAAGCGAATTTCTTCAATTTCATTCCTCCGAAGTCA
GATCTGGG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MNWRAYESDLNAMKVNNSHRNSNLFNTAKLLLILGFVFSFLSCHTVLAKSRRPVTDAETRQRKQECYSDIESGLWGWQCKSSAIEKENCALRCLSSPCYDLVYGSDPLEE
GEKDLARSQEYKYCIYKLSMGESLEGIKGSFDY

Sed0003013 (gene) of Chayote v1 genome