; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0003049 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0003049
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionprotein SAMBA-like isoform X2
Genome locationLG05:1603263..1608047
RNA-Seq ExpressionSed0003049
SyntenySed0003049
Gene Ontology termsGO:0046621 - negative regulation of organ growth (biological process)
GO:0010997 - anaphase-promoting complex binding (molecular function)
InterPro domainsIPR037547 - Protein SAMBA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004136198.1 protein SAMBA isoform X2 [Cucumis sativus]1.7e-3580.2Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEKK
        MN+ SPANSS+STTAVAGRC+TNAA+S+DDFR P+N +S+PERKDEAMTAL+SNIMAALNKEVKSLDDDNW+FEGPRSRIN MSR+  GG FLKKTEEK+
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEKK

Query:  K
        +
Subjt:  K
XP_008466003.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503566 isoform X2 [Cucumis melo]1.1e-3479.21Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEKK
        MN+ SPANSS STTAVAGRC+TNAA+S+DDFR P+N +S+PERKDEAMTAL+SNIMAALNKEVKSLDDDNW+FEGPRSRIN MSR+  GG FLKKT+EK+
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEKK

Query:  K
        +
Subjt:  K
XP_022131248.1 protein SAMBA isoform X2 [Momordica charantia]2.0e-3684.16Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEKK
        MNSSSPANSSISTTAVAGRC+TNAAMS+DDFR PAN +SIPERKDEAM+AL+SNIMAALNKEVKSLDDD+W+FEGPRSRIN MSR+  GG FLKKTEEK+
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEKK

Query:  K
        +
Subjt:  K
XP_022149251.1 protein SAMBA-like isoform X2 [Momordica charantia]9.0e-3784.16Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEKK
        MNSSSPANSSISTTAVAGRC+TNAAMS+DDFR PAN +SIPERKDE M+AL+SNIMAALNKEVKSLDDDNW+FEGPRS IN MSR+  GGPFLKKTEEK+
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEKK

Query:  K
        +
Subjt:  K
XP_038888368.1 protein SAMBA isoform X2 [Benincasa hispida]2.6e-3683.17Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEKK
        MN+SSPANSSISTTAVAGRC+TNAAMS+DDFR PAN +S+PERKDEAMTAL+SNIMAALNKEVKSLDDDNW+FEGPRSRIN MS++  GG FLKKTEEK+
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEKK

Query:  K
        +
Subjt:  K
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LK11 Uncharacterized protein8.2e-3680.2Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEKK
        MN+ SPANSS+STTAVAGRC+TNAA+S+DDFR P+N +S+PERKDEAMTAL+SNIMAALNKEVKSLDDDNW+FEGPRSRIN MSR+  GG FLKKTEEK+
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEKK

Query:  K
        +
Subjt:  K
A0A1S3CQ76 uncharacterized protein LOC103503566 isoform X25.3e-3579.21Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEKK
        MN+ SPANSS STTAVAGRC+TNAA+S+DDFR P+N +S+PERKDEAMTAL+SNIMAALNKEVKSLDDDNW+FEGPRSRIN MSR+  GG FLKKT+EK+
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEKK

Query:  K
        +
Subjt:  K
A0A6J1BST3 protein SAMBA isoform X29.7e-3784.16Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEKK
        MNSSSPANSSISTTAVAGRC+TNAAMS+DDFR PAN +SIPERKDEAM+AL+SNIMAALNKEVKSLDDD+W+FEGPRSRIN MSR+  GG FLKKTEEK+
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEKK

Query:  K
        +
Subjt:  K
A0A6J1D7T9 protein SAMBA-like isoform X24.4e-3784.16Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEKK
        MNSSSPANSSISTTAVAGRC+TNAAMS+DDFR PAN +SIPERKDE M+AL+SNIMAALNKEVKSLDDDNW+FEGPRS IN MSR+  GGPFLKKTEEK+
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEKK

Query:  K
        +
Subjt:  K
A0A6J1HGF1 protein SAMBA isoform X29.1e-3582.18Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEKK
        MN+SSPANSSISTT VAGRCTTNAAMS+DDFR PAN VS+ ERKDEAM+AL+SNIMAALNKEVKSLDDDNW+FEGPRSRIN MSR+G+   FLKKTEEK 
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEKK

Query:  K
        +
Subjt:  K
SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9C613 Protein SAMBA1.8e-1954.46Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEK
        MN +SPA+S +STTAVA G  ++ AA  +DDF  P +  S+ ERKDEAM  L++++M  L+KEVKSL++D+W+FEGPRSRI+ +SR+G+   FLKK  E 
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEK

Query:  K
        K
Subjt:  K
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32310.1 unknown protein1.3e-2054.46Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEK
        MN +SPA+S +STTAVA G  ++ AA  +DDF  P +  S+ ERKDEAM  L++++M  L+KEVKSL++D+W+FEGPRSRI+ +SR+G+   FLKK  E 
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEK

Query:  K
        K
Subjt:  K

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAACAGCTCGTCACCGGCCAATTCTTCAATTTCTACCACGGCGGTTGCCGGAAGATGTACCACCAATGCTGCAATGTCCATTGACGATTTTCGCCTCCCAGCCAATTC
GGTATCTATACCGGAGCGCAAGGACGAGGCCATGACCGCTCTTAGGTCTAATATAATGGCTGCACTGAACAAGGAGGTCAAATCCTTGGATGATGATAACTGGGTGTTTG
AAGGTCCTCGCTCCCGTATCAACCGTATGTCACGAAAAGGATCAGGTGGTCCTTTCCTCAAAAAGACAGAAGAAAAAAAGAAGATAATGGGTCAGTTTGATAAGAATGAA
TGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAAAGAGAAAGGGTATCCCAATTCCACATTTCGGTATCATCTTTGAAAATCCCTCAAAGCACTTCAAATTCATATAGAAAAATCGATTCTCATCTTCTTCATCTCTGAAA
TTTTTTCGTGTGATTCCTGCTCGTTGAATTTGGCGTTTTCGTTGTTTCTACAAATTAATCAAATTCCGATTCGTGTACCGTTCGTCGGAAAATTGCGAACATCATGAACA
GCTCGTCACCGGCCAATTCTTCAATTTCTACCACGGCGGTTGCCGGAAGATGTACCACCAATGCTGCAATGTCCATTGACGATTTTCGCCTCCCAGCCAATTCGGTATCT
ATACCGGAGCGCAAGGACGAGGCCATGACCGCTCTTAGGTCTAATATAATGGCTGCACTGAACAAGGAGGTCAAATCCTTGGATGATGATAACTGGGTGTTTGAAGGTCC
TCGCTCCCGTATCAACCGTATGTCACGAAAAGGATCAGGTGGTCCTTTCCTCAAAAAGACAGAAGAAAAAAAGAAGATAATGGGTCAGTTTGATAAGAATGAATGATTAT
GGTGGCTAGCTAGCACTCAGACAACACCCATTTTCTTTCATCAAATCAAGGGACCACATAAAAACCTAATCATCAATATCCCAATGGGAGATTTTCAAGCAGGAAATCAC
ATCATGACACGTGGGCCGACCCACTCCATCAGATCCTTATTGGACACTGCCTAGTTAATTTGTTCATTTTGTATTTTATTCAATAGTATTTGTTTATCAATTAAAAAGAT
GAAATTAAAAAAGTAATAATAATTCTTTCCAAAAAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNSSSPANSSISTTAVAGRCTTNAAMSIDDFRLPANSVSIPERKDEAMTALRSNIMAALNKEVKSLDDDNWVFEGPRSRINRMSRKGSGGPFLKKTEEKKKIMGQFDKNE