; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0003052 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0003052
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionPSI subunit V
Genome locationLG11:9407208..9408894
RNA-Seq ExpressionSed0003052
SyntenySed0003052
Gene Ontology termsGO:0015979 - photosynthesis (biological process)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0009538 - photosystem I reaction center (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR003757 - Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI
IPR022980 - Photosystem I, reaction centre subunit XI
IPR036592 - Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
NP_001267647.1 photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic [Cucumis sativus]1.3e-10894.93Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LHJ8 PSI subunit V6.5e-10994.93Show/hide
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A0A1S3B555 PSI subunit V1.9e-10894.01Show/hide
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A0A6J1D7U0 PSI subunit V1.9e-10893.55Show/hide
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A0A6J1FBZ4 PSI subunit V5.5e-10892.63Show/hide
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A0A6J1HKH3 PSI subunit V7.2e-10892.63Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P23993 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic1.8e-7968.81Show/hide
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Q39654 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic6.7e-11194.47Show/hide
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Q41385 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic8.5e-9076.71Show/hide
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Q8DGB4 Photosystem I reaction center subunit XI5.6e-3344Show/hide
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Q9SUI4 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic5.9e-9177.17Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G12800.1 photosystem I subunit l4.2e-9277.17Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CATCCCTGCAAGAACACCATCCTTCACCATCAGAGCCATCCAAGCTGATAAGCCAACATTCCAAGTGATCCAACCCATCAATGGAGACCCATTCATTGGAAGCCTTGAGA
CTCCAGTAACCTCAAGCCCTCTCATAGCCTGGTACCTCTCAAACCTCCCAGCCTACAGAACAGCAGTCAGCCCATTGCTTAGAGGCATTGAAGTGGGCCTGGCCCATGGC
TTTTTCCTCGTCGGCCCATTCGTCAAAGCCGGGCCTCTAAGAGACACGGCCTACGCTGGAGACGCCGGCTCCCTCGCTGCAGGCGGCCTCATTACCATTTTGAGCGTATG
CTTGACCATGTATGGCATTGCATCCTTCAATGAAGGAGAGCCATCCACCGCGCCCGCCTTGACCTTGACCGGCCGAAAGAAGACCCCTGATCAGCTGCAAACAGCGGACG
GGTGGGCAAAATTCTCGGGCGGGTTCTTCTTCGGCGGTATCTCAGGCGTGATCTGGGCTCACTTTCTCCTCTATGTCCTGGACCTCCCATACTACGTTAAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAATGGATAAGAGATAAGGTTATGTGGCAAGTTCCATCCAATTAAAAGAGAGAGATTTGATGAACCATAGCCTCCCACAAATTTGCATGGCCACAACCAATAAACCAAA
CTCCCAATACCAATACCAAAATCTAAAGCCTTCACCTCATTCTTCTTCTCTCCCACACATCCTTTCACAAGCCAAAGGCAGCAGCAGCTAGCCATGGCCACTGCAACCTC
CCCCATTGCCAGCCAGCTTAGTTCCAGCTTCGCTTCGTCGAACGCCCGAGCCTTGATCTCGCCTAAAGGCCTCTCCATCTCGCCCCTCCGACGCATCCCTGCAAGAACAC
CATCCTTCACCATCAGAGCCATCCAAGCTGATAAGCCAACATTCCAAGTGATCCAACCCATCAATGGAGACCCATTCATTGGAAGCCTTGAGACTCCAGTAACCTCAAGC
CCTCTCATAGCCTGGTACCTCTCAAACCTCCCAGCCTACAGAACAGCAGTCAGCCCATTGCTTAGAGGCATTGAAGTGGGCCTGGCCCATGGCTTTTTCCTCGTCGGCCC
ATTCGTCAAAGCCGGGCCTCTAAGAGACACGGCCTACGCTGGAGACGCCGGCTCCCTCGCTGCAGGCGGCCTCATTACCATTTTGAGCGTATGCTTGACCATGTATGGCA
TTGCATCCTTCAATGAAGGAGAGCCATCCACCGCGCCCGCCTTGACCTTGACCGGCCGAAAGAAGACCCCTGATCAGCTGCAAACAGCGGACGGGTGGGCAAAATTCTCG
GGCGGGTTCTTCTTCGGCGGTATCTCAGGCGTGATCTGGGCTCACTTTCTCCTCTATGTCCTGGACCTCCCATACTACGTTAAGTAGATTTGGTATCATTTTGTGCTTAT
GTAAGAATGTATATTTAATGCCAAACCTCCCTTTATTAGATCCTTTGTGATTGCATTTTGATTTCCCTTTTGCAACTATTGTGTTCACACCATCATTTGCCTTAAATTGT
GTTAAGGTTCCTAGGGAGAATAGTTCGAGAAATCTCATGTTTTTCTTCCTTTTTCATTATACAACATATATAGCAATATAAATACAAGGCACCACTTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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FFLVGPFVKAGPLRDTAYAGDAGSLAAGGLITILSVCLTMYGIASFNEGEPSTAPALTLTGRKKTPDQLQTADGWAKFSGGFFFGGISGVIWAHFLLYVLDLPYYVK