; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0003086 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0003086
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Description60S ribosomal protein L13
Genome locationLG07:9129425..9133282
RNA-Seq ExpressionSed0003086
SyntenySed0003086
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001380 - Ribosomal protein L13e
IPR018256 - Ribosomal protein L13e, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_011653106.1 60S ribosomal protein L13-3 [Cucumis sativus]2.6e-8294.74Show/hide
Query:  SRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
        +RQEKAVKNFPRPTAGPLRP+VHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGI VDHRRRNRSLE LQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
Subjt:  SRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG

Query:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK
        DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLR+ERTN RH+GARLK+AAEAEKE+KK
Subjt:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK

XP_022923040.1 60S ribosomal protein L13-1 [Cucurbita moschata]1.5e-8295.91Show/hide
Query:  SRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
        +RQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGI VDHRRRNRSLE LQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
Subjt:  SRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG

Query:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK
        DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKA VELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTN+RH+GARLK+AAEAEKEEKK
Subjt:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK

XP_022941800.1 60S ribosomal protein L13-1-like [Cucurbita moschata]3.4e-8295.32Show/hide
Query:  SRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
        +RQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGI VDHRRRNRSLE LQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
Subjt:  SRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG

Query:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK
        DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKA VELVKVTEEMKSFKAYDKLR ERTN+RH+GARLK+AAEAEKEEKK
Subjt:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK

XP_022984589.1 60S ribosomal protein L13-1 [Cucurbita maxima]8.9e-8395.91Show/hide
Query:  SRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
        +RQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGI VDHRRRNRSLE LQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
Subjt:  SRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG

Query:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK
        DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKA VELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTN+RH+GARLK+AAEAEKEEKK
Subjt:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK

XP_022990054.1 60S ribosomal protein L13-1-like [Cucurbita maxima]1.5e-8295.32Show/hide
Query:  SRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
        +RQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGI VDHRRRNRSLE LQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
Subjt:  SRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG

Query:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK
        DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKA VE+VKVTEEMKSFKAYDKLRIERTN+RH+GARLK+AAEAEKEEKK
Subjt:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KU76 60S ribosomal protein L131.3e-8294.74Show/hide
Query:  SRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
        +RQEKAVKNFPRPTAGPLRP+VHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGI VDHRRRNRSLE LQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
Subjt:  SRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG

Query:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK
        DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLR+ERTN RH+GARLK+AAEAEKE+KK
Subjt:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK

A0A6J1E5R8 60S ribosomal protein L137.4e-8395.91Show/hide
Query:  SRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
        +RQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGI VDHRRRNRSLE LQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
Subjt:  SRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG

Query:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK
        DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKA VELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTN+RH+GARLK+AAEAEKEEKK
Subjt:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK

A0A6J1FUT5 60S ribosomal protein L131.6e-8295.32Show/hide
Query:  SRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
        +RQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGI VDHRRRNRSLE LQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
Subjt:  SRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG

Query:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK
        DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKA VELVKVTEEMKSFKAYDKLR ERTN+RH+GARLK+AAEAEKEEKK
Subjt:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK

A0A6J1J2K7 60S ribosomal protein L134.3e-8395.91Show/hide
Query:  SRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
        +RQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGI VDHRRRNRSLE LQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
Subjt:  SRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG

Query:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK
        DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKA VELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTN+RH+GARLK+AAEAEKEEKK
Subjt:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK

A0A6J1JSD3 60S ribosomal protein L137.4e-8395.32Show/hide
Query:  SRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
        +RQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGI VDHRRRNRSLE LQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG
Subjt:  SRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAG

Query:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK
        DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKA VE+VKVTEEMKSFKAYDKLRIERTN+RH+GARLK+AAEAEKEEKK
Subjt:  DSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P41127 60S ribosomal protein L13-12.2e-7683.72Show/hide
Query:  ISRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKA
        I+RQ+KAVK FPRPT+GPLRP+VHGQTLKYNMKVR G+GF+LEELKAAGIPKKLAPTIGI VDHRR+NRSLEGLQ NVQRLKTYK K+V+FPRRARK KA
Subjt:  ISRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKA

Query:  GDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK
        GDSTPEELANATQVQG YLPI REK ++ELVK+T EMKSFKA+DK+R+ERTNKRH GAR K+AAEAEKEEKK
Subjt:  GDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK

P41128 60S ribosomal protein L13-13.5e-7481.4Show/hide
Query:  ISRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKA
        ++RQ+KAVK FPRPTAGPLRP+VHGQTLKYNMKVR G+GF+LEELK+AGIPKKLAPTIGI VDHRR+NRSLEGLQ+NVQRLKTYKAK+V+FPRRARK KA
Subjt:  ISRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKA

Query:  GDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK
        GDST EELANATQVQG Y+PI REK + ELVK+T EMKS KA+DK+R+ERTNKRH GAR K+AA+AEKEEKK
Subjt:  GDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK

P41129 60S ribosomal protein L13-23.5e-7481.4Show/hide
Query:  ISRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKA
        ++RQ+KAVK FPRPTAGPLRP+VHGQTLKYNMKVR G+GF+LEELKAAGIPKKLAPTIGI +DHRR+NRSLEGLQ+NVQRLKTYKAK+V+FPRRARK KA
Subjt:  ISRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKA

Query:  GDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK
        GDST EELANATQVQG Y+PI REK ++ELVK+T EMKS  AYDK+R+ERTNKRH GAR K+AA+AEKEEKK
Subjt:  GDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK

Q9FF90 60S ribosomal protein L13-37.9e-7471.57Show/hide
Query:  HNLVQPTSQ-----ENKKKKWL--------VFISRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRN
        HN V P+S      +N  K W           ++RQ+KAVK FPRPT+GPLRP+VHGQTLKYNMKVRAG+GF+LEELK AGIPKKLAPTIGI VDHRR+N
Subjt:  HNLVQPTSQ-----ENKKKKWL--------VFISRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRN

Query:  RSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEK
        RSLEGLQ+NVQRLKTYKAK+VVFPRR+R+ KAGDSTPEELANATQVQG Y+PI   KA++ELVK+T ++K+FKAYDK+R+ERTN RH GAR K+AAEAEK
Subjt:  RSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEK

Query:  EEKK
        EEKK
Subjt:  EEKK

Q9SMT4 Putative 60S ribosomal protein L13-25.1e-6565.53Show/hide
Query:  HNLVQPTSQENKKKKWLVF---------------ISRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRR
        HN V P    + KKKW  +               I+RQ KAVK FPRPTAGP+RP+VH QTL YNMKVRAG+GF+LEELKAAGIPKKLAPTIGI VDH R
Subjt:  HNLVQPTSQENKKKKWLVF---------------ISRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRR

Query:  RNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEA
        +NRSLEG Q NVQRLKTYKAK+V+FPR AR  K GDS  +ELANATQVQ  ++PI RE  ++ELVK+T +MK F AYDK+R+E  NKRH G R K+AAEA
Subjt:  RNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEA

Query:  EKEEKK
        EKEEKK
Subjt:  EKEEKK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G49010.1 breast basic conserved 11.6e-7783.72Show/hide
Query:  ISRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKA
        I+RQ+KAVK FPRPT+GPLRP+VHGQTLKYNMKVR G+GF+LEELKAAGIPKKLAPTIGI VDHRR+NRSLEGLQ NVQRLKTYK K+V+FPRRARK KA
Subjt:  ISRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKA

Query:  GDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK
        GDSTPEELANATQVQG YLPI REK ++ELVK+T EMKSFKA+DK+R+ERTNKRH GAR K+AAEAEKEEKK
Subjt:  GDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK

AT3G49010.2 breast basic conserved 11.6e-7783.72Show/hide
Query:  ISRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKA
        I+RQ+KAVK FPRPT+GPLRP+VHGQTLKYNMKVR G+GF+LEELKAAGIPKKLAPTIGI VDHRR+NRSLEGLQ NVQRLKTYK K+V+FPRRARK KA
Subjt:  ISRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKA

Query:  GDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK
        GDSTPEELANATQVQG YLPI REK ++ELVK+T EMKSFKA+DK+R+ERTNKRH GAR K+AAEAEKEEKK
Subjt:  GDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK

AT3G49010.3 breast basic conserved 11.6e-7783.72Show/hide
Query:  ISRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKA
        I+RQ+KAVK FPRPT+GPLRP+VHGQTLKYNMKVR G+GF+LEELKAAGIPKKLAPTIGI VDHRR+NRSLEGLQ NVQRLKTYK K+V+FPRRARK KA
Subjt:  ISRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKA

Query:  GDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK
        GDSTPEELANATQVQG YLPI REK ++ELVK+T EMKSFKA+DK+R+ERTNKRH GAR K+AAEAEKEEKK
Subjt:  GDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK

AT3G49010.4 breast basic conserved 11.5e-7583.14Show/hide
Query:  ISRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKA
        I+RQ+KAVK FPRPT+GPLRP+VHGQTLKYNMKVR G+GF+LEELKAAGIPKKLAPTIGI VDHRR+NRSLEGLQ NVQRLKTYK K+V+FPRRAR  KA
Subjt:  ISRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKA

Query:  GDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK
        GDSTPEELANATQVQG YLPI REK ++ELVK+T EMKSFKA+DK+R+ERTNKRH GAR K+AAEAEKEEKK
Subjt:  GDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK

AT5G23900.1 Ribosomal protein L13e family protein5.6e-7571.57Show/hide
Query:  HNLVQPTSQ-----ENKKKKWL--------VFISRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRN
        HN V P+S      +N  K W           ++RQ+KAVK FPRPT+GPLRP+VHGQTLKYNMKVRAG+GF+LEELK AGIPKKLAPTIGI VDHRR+N
Subjt:  HNLVQPTSQ-----ENKKKKWL--------VFISRQEKAVKNFPRPTAGPLRPIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRN

Query:  RSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEK
        RSLEGLQ+NVQRLKTYKAK+VVFPRR+R+ KAGDSTPEELANATQVQG Y+PI   KA++ELVK+T ++K+FKAYDK+R+ERTN RH GAR K+AAEAEK
Subjt:  RSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVELVKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEK

Query:  EEKK
        EEKK
Subjt:  EEKK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAAGTTCCGATGAGCAAAGATTCAGCGGCTGTGCAAGTCGAGAGAGAAAGGCCACTCTGCTACGCCGCCGCGCTGATATCTTTTTTCCTTTTCTTTTGCTTCCCTAA
CGCAGACACACACCCTCATTCTTGTTTTTTTTCTTCTCTTTTTTTTTTTGGATGTCGTCACAGCACCACCGCAGCCCTCATAGCCACTTTTATACTTAATCTGCATAACC
TGGTTCAACCAACCAGCCAGGAAAACAAGAAGAAGAAATGGTTAGTGTTTATTTCCCGTCAGGAGAAAGCTGTGAAGAACTTTCCCCGCCCAACTGCTGGACCACTCCGC
CCCATTGTTCATGGGCAGACATTGAAGTACAACATGAAAGTGAGGGCTGGTAGGGGCTTTTCTCTTGAGGAGTTGAAGGCTGCTGGTATTCCCAAGAAACTAGCACCAAC
AATTGGAATTGTAGTGGACCATCGCCGTAGGAACCGCTCTCTTGAAGGTCTACAGGCCAATGTGCAGAGGCTGAAGACATACAAGGCTAAGGTGGTCGTCTTCCCAAGAC
GTGCTCGCAAATTCAAGGCTGGGGATTCTACCCCGGAGGAGCTTGCAAATGCGACGCAAGTCCAAGGGCCATACTTGCCTATTGGACGCGAGAAGGCATCGGTTGAGCTT
GTTAAGGTCACCGAAGAGATGAAATCATTCAAGGCATACGACAAGCTACGTATTGAGAGGACGAACAAACGACATCTTGGTGCCAGATTGAAGAAGGCAGCAGAGGCCGA
GAAGGAAGAAAAGAAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAAGTTCCGATGAGCAAAGATTCAGCGGCTGTGCAAGTCGAGAGAGAAAGGCCACTCTGCTACGCCGCCGCGCTGATATCTTTTTTCCTTTTCTTTTGCTTCCCTAA
CGCAGACACACACCCTCATTCTTGTTTTTTTTCTTCTCTTTTTTTTTTTGGATGTCGTCACAGCACCACCGCAGCCCTCATAGCCACTTTTATACTTAATCTGCATAACC
TGGTTCAACCAACCAGCCAGGAAAACAAGAAGAAGAAATGGTTAGTGTTTATTTCCCGTCAGGAGAAAGCTGTGAAGAACTTTCCCCGCCCAACTGCTGGACCACTCCGC
CCCATTGTTCATGGGCAGACATTGAAGTACAACATGAAAGTGAGGGCTGGTAGGGGCTTTTCTCTTGAGGAGTTGAAGGCTGCTGGTATTCCCAAGAAACTAGCACCAAC
AATTGGAATTGTAGTGGACCATCGCCGTAGGAACCGCTCTCTTGAAGGTCTACAGGCCAATGTGCAGAGGCTGAAGACATACAAGGCTAAGGTGGTCGTCTTCCCAAGAC
GTGCTCGCAAATTCAAGGCTGGGGATTCTACCCCGGAGGAGCTTGCAAATGCGACGCAAGTCCAAGGGCCATACTTGCCTATTGGACGCGAGAAGGCATCGGTTGAGCTT
GTTAAGGTCACCGAAGAGATGAAATCATTCAAGGCATACGACAAGCTACGTATTGAGAGGACGAACAAACGACATCTTGGTGCCAGATTGAAGAAGGCAGCAGAGGCCGA
GAAGGAAGAAAAGAAATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKVPMSKDSAAVQVERERPLCYAAALISFFLFFCFPNADTHPHSCFFSSLFFFGCRHSTTAALIATFILNLHNLVQPTSQENKKKKWLVFISRQEKAVKNFPRPTAGPLR
PIVHGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIPKKLAPTIGIVVDHRRRNRSLEGLQANVQRLKTYKAKVVVFPRRARKFKAGDSTPEELANATQVQGPYLPIGREKASVEL
VKVTEEMKSFKAYDKLRIERTNKRHLGARLKKAAEAEKEEKK