; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0003140 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0003140
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionRas-related protein Rab-1A
Genome locationLG13:10207383..10210557
RNA-Seq ExpressionSed0003140
SyntenySed0003140
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG5229355.1 GTP-binding family protein [Salix suchowensis]1.1e-10194.5Show/hide
Query:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
        MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
Subjt:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK

Query:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC
        QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVE+KVVDT+TAKAFADE GIPFLETSAKDSINVEQAFLTMA EIKKKMGSQPT+S S+G VQ+KGQPIEQK++CC
Subjt:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC

XP_004133726.1 ras-related protein RABD1 [Cucumis sativus]1.7e-10295.52Show/hide
Query:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
        MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
Subjt:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK

Query:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC
        QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVE+KVVDT+TAKAFADE GIPFLETSAKDS NVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSS SSGNVQ+KGQPI+QKSSCC
Subjt:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC

Query:  N
        +
Subjt:  N

XP_006385060.1 ras-related protein RABD1 [Populus trichocarpa]2.5e-10194Show/hide
Query:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
        MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
Subjt:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK

Query:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC
        QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVE+KVVDT+TAKAFADE GIPFLETSAKDSINVEQAFLTMA EIKKKMG+QPT+S S+G VQ+KGQPIEQK++CC
Subjt:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC

XP_008452238.1 PREDICTED: ras-related protein RABD1 isoform X1 [Cucumis melo]1.7e-10295.02Show/hide
Query:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
        MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNN+K
Subjt:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK

Query:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC
        QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVE+KVVDT+TAKAFA+E GIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSS SSGNVQ+KGQPI+QKSSCC
Subjt:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC

Query:  N
        +
Subjt:  N

XP_022929522.1 ras-related protein RABD1-like [Cucurbita moschata]5.9e-10396.02Show/hide
Query:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
        MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVE DGKT+KLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
Subjt:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK

Query:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC
        QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVE+KVVDTETAKAFADE GIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQP+SS SSGNVQ+KGQPIEQKSSCC
Subjt:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC

Query:  N
        +
Subjt:  N

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6Q4 Uncharacterized protein8.4e-10395.52Show/hide
Query:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
        MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
Subjt:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK

Query:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC
        QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVE+KVVDT+TAKAFADE GIPFLETSAKDS NVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSS SSGNVQ+KGQPI+QKSSCC
Subjt:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC

Query:  N
        +
Subjt:  N

A0A1S3BTF1 ras-related protein RABD1 isoform X18.4e-10395.02Show/hide
Query:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
        MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNN+K
Subjt:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK

Query:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC
        QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVE+KVVDT+TAKAFA+E GIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSS SSGNVQ+KGQPI+QKSSCC
Subjt:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC

Query:  N
        +
Subjt:  N

A0A3N7EV37 Uncharacterized protein1.2e-10194Show/hide
Query:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
        MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
Subjt:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK

Query:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC
        QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVE+KVVDT+TAKAFADE GIPFLETSAKDSINVEQAFLTMA EIKKKMG+QPT+S S+G VQ+KGQPIEQK++CC
Subjt:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC

A0A6J1EMZ9 ras-related protein RABD1-like2.9e-10396.02Show/hide
Query:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
        MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVE DGKT+KLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
Subjt:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK

Query:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC
        QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVE+KVVDTETAKAFADE GIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQP+SS SSGNVQ+KGQPIEQKSSCC
Subjt:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC

Query:  N
        +
Subjt:  N

A0A6J1JCC5 ras-related protein RABD1-like2.9e-10396.02Show/hide
Query:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
        MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVE DGKT+KLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
Subjt:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK

Query:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC
        QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVE+KVVDTETAKAFADE GIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQP+SS SSGNVQ+KGQPIEQKSSCC
Subjt:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC

Query:  N
        +
Subjt:  N

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P40392 Ras-related protein RIC12.8e-8778.71Show/hide
Query:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
        M+ EYDYLFKLLLIGDS VGKSCLLLRFADDSY++SYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+VYDVT+ ESFNNVK
Subjt:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK

Query:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQP-TSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSC
        QWLNEIDRYA+++V KLLVGNKCDL E++VV  E  KA ADE GIPFLETSAKD+ NVE+AF+TMA EIK +M SQP T+++    VQ++GQP+ Q+SSC
Subjt:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQP-TSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSC

Query:  CN
        C+
Subjt:  CN

Q05737 GTP-binding protein YPTM21.9e-8880.69Show/hide
Query:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
        M+ EYDYLFKLLLIGDS VGKSCLLLRFADDSY+DSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVT+ ESFNNVK
Subjt:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK

Query:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNS-SGNVQIKGQPIEQKSSC
        QWLNEIDRYA+D+V KLLVGNK DL  +KVV TETAKAFADE GIPF+ETSAK++ NV+QAF+ MAA IK +M SQP ++N+    VQI+GQP+ QK+SC
Subjt:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNS-SGNVQIKGQPIEQKSSC

Query:  CN
        C+
Subjt:  CN

Q9FPJ4 Ras-related protein RABD2b1.8e-8678.61Show/hide
Query:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
        M+ EYDYLFKLLLIGDS VGKSCLLLRFADDSY+DSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ YDVT++ESFNNVK
Subjt:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK

Query:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC
        QWLNEIDRYA+++V KLLVGNK DL   KVV TETAKAFADE GIPFLETSAK++ NVE+AF+ M A IK +M SQP        VQI+GQP+ Q+S CC
Subjt:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC

Query:  N
        +
Subjt:  N

Q9SEH3 Ras-related protein RABD2c3.3e-8879.1Show/hide
Query:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
        M+ EYDYLFKLLLIGDS VGKSCLLLRFADDSY+DSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ YDVT++ESFNNVK
Subjt:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK

Query:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC
        QWLNEIDRYA+++V KLLVGNKCDL   KVV TETAKAFADE GIPFLETSAK++ NVE+AF+ M A IK +M SQP   +    VQI+GQP+ Q+S CC
Subjt:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC

Query:  N
        +
Subjt:  N

Q9ZRE2 Ras-related protein RABD12.2e-9284.16Show/hide
Query:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
        MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADD+Y+DSYISTIGVDFKIRT+EQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYD TEMESFNNVK
Subjt:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK

Query:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSS--GNVQIKGQPIEQKSS
        QWL+EIDRYAN+SVCKLL+GNK D+VE KVV TET +A ADE GIPFLETSAKDSINVEQAFLT+A EIKKKMGSQ  ++ +S  G VQ+KGQPI+Q + 
Subjt:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSS--GNVQIKGQPIEQKSS

Query:  CC
         C
Subjt:  CC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02130.1 RAS 53.7e-8778.22Show/hide
Query:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
        M+ EYDYLFKLLLIGDS VGKSCLLLRF+DDSYV+SYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVT+ ESFNNVK
Subjt:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK

Query:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNS-SGNVQIKGQPIEQKSSC
        QWL+EIDRYA+D+V KLLVGNK DL E++ +  ETAKAFADE GIPF+ETSAKD+ NVEQAF+ M+A IK++M SQP  +N+    VQI+GQP+ QK+ C
Subjt:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNS-SGNVQIKGQPIEQKSSC

Query:  CN
        C+
Subjt:  CN

AT3G09900.1 RAB GTPase homolog E1E1.1e-6257.69Show/hide
Query:  NEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVKQW
        ++YDYL KLLLIGDS VGKSCLLLRF+DD++  S+I+TIG+DFKIRTVE DGK IKLQIWDTAGQERFRTIT++YYRGA GI++VYDVT+  SFNN++ W
Subjt:  NEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVKQW

Query:  LNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDK-VVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQ--------PI
        +  I+++A+DSV K+LVGNK D+ E K  V T   +A ADE+GI F ETSAK + NVEQ FL++A +IK+++    T +   G ++I  Q          
Subjt:  LNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDK-VVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQ--------PI

Query:  EQKSSCCN
         +KS+CC+
Subjt:  EQKSSCCN

AT3G11730.1 Ras-related small GTP-binding family protein1.6e-9384.16Show/hide
Query:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
        MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADD+Y+DSYISTIGVDFKIRT+EQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYD TEMESFNNVK
Subjt:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK

Query:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSS--GNVQIKGQPIEQKSS
        QWL+EIDRYAN+SVCKLL+GNK D+VE KVV TET +A ADE GIPFLETSAKDSINVEQAFLT+A EIKKKMGSQ  ++ +S  G VQ+KGQPI+Q + 
Subjt:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSS--GNVQIKGQPIEQKSS

Query:  CC
         C
Subjt:  CC

AT4G17530.1 RAB GTPase homolog 1C2.3e-8979.1Show/hide
Query:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
        M+ EYDYLFKLLLIGDS VGKSCLLLRFADDSY+DSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ YDVT++ESFNNVK
Subjt:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK

Query:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC
        QWLNEIDRYA+++V KLLVGNKCDL   KVV TETAKAFADE GIPFLETSAK++ NVE+AF+ M A IK +M SQP   +    VQI+GQP+ Q+S CC
Subjt:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC

Query:  N
        +
Subjt:  N

AT5G47200.1 RAB GTPase homolog 1A1.3e-8778.61Show/hide
Query:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK
        M+ EYDYLFKLLLIGDS VGKSCLLLRFADDSY+DSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ YDVT++ESFNNVK
Subjt:  MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVK

Query:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC
        QWLNEIDRYA+++V KLLVGNK DL   KVV TETAKAFADE GIPFLETSAK++ NVE+AF+ M A IK +M SQP        VQI+GQP+ Q+S CC
Subjt:  QWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCC

Query:  N
        +
Subjt:  N


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGCAACGAATATGATTATTTGTTCAAGCTCTTGCTCATCGGCGACTCGTCCGTTGGCAAATCATGCCTTCTTCTCCGATTTGCGGATGATTCCTATGTGGATAGCTA
TATAAGCACAATTGGAGTTGATTTCAAAATCAGAACTGTGGAACAGGATGGAAAGACTATTAAGCTTCAGATTTGGGACACTGCTGGTCAAGAGAGATTCAGGACCATAA
CAAGCAGCTATTACAGAGGAGCACATGGAATAATTATTGTTTATGATGTCACTGAGATGGAGAGCTTTAACAATGTCAAACAGTGGTTGAATGAGATTGATAGATATGCT
AATGACAGTGTATGCAAGCTTTTAGTTGGGAATAAGTGTGATTTAGTCGAGGACAAGGTTGTTGACACAGAGACAGCAAAGGCATTTGCAGACGAGCATGGAATCCCTTT
TCTAGAGACAAGTGCAAAAGACTCGATCAACGTGGAGCAAGCTTTCTTAACAATGGCTGCTGAAATAAAGAAAAAAATGGGGAGCCAGCCAACTTCCTCGAACTCGTCGG
GGAATGTGCAGATCAAGGGGCAACCAATTGAGCAAAAGAGCAGCTGTTGCAATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAGTAAAGGATTAAAATGTCACATTTTGAAATACGAAGAGGCGGACAGAAAAAGTAAGATAGTGAAAGAAAAAAAAAACAAAGTTGAATTAATTAAGAATTGAAGAGATT
TTATAAAGAAAGAAATTCATCAAACGGGTTTCTTACTTCATCCCCACTTTCTCTCCTTCTCCTTCGCAGACGCCGACAGAAATTCACGGCAGCCGATTTCTCCATTGCGA
TTCAAGCCATGAGCAACGAATATGATTATTTGTTCAAGCTCTTGCTCATCGGCGACTCGTCCGTTGGCAAATCATGCCTTCTTCTCCGATTTGCGGATGATTCCTATGTG
GATAGCTATATAAGCACAATTGGAGTTGATTTCAAAATCAGAACTGTGGAACAGGATGGAAAGACTATTAAGCTTCAGATTTGGGACACTGCTGGTCAAGAGAGATTCAG
GACCATAACAAGCAGCTATTACAGAGGAGCACATGGAATAATTATTGTTTATGATGTCACTGAGATGGAGAGCTTTAACAATGTCAAACAGTGGTTGAATGAGATTGATA
GATATGCTAATGACAGTGTATGCAAGCTTTTAGTTGGGAATAAGTGTGATTTAGTCGAGGACAAGGTTGTTGACACAGAGACAGCAAAGGCATTTGCAGACGAGCATGGA
ATCCCTTTTCTAGAGACAAGTGCAAAAGACTCGATCAACGTGGAGCAAGCTTTCTTAACAATGGCTGCTGAAATAAAGAAAAAAATGGGGAGCCAGCCAACTTCCTCGAA
CTCGTCGGGGAATGTGCAGATCAAGGGGCAACCAATTGAGCAAAAGAGCAGCTGTTGCAATTAAGCACTTCCTCACGCCTGAGTATATAATGGTAAAATCTAAGTTAACA
GGTTTTTAAATAGGTGGAAATTTGTGTTTACTTTGTGTTGGCTTAAGGATCTCTATGTTATTGTGAATTATTCCCTGTTTGGATCCTTGTGTGTGATATTGACCTTTGGA
TTCACACTCTCTCCTAGTTATCTTTATATATTAAAGTTGGGACTTGGGAGAGATGCATATCAGTGTAGTTTGGAGAAAAGAAATCATTTAGACATTCACTGAACATGGTA
GTTTAATGGTCGAAACTTGAAAAACGTTGTGTCAAGTCCGAATACAATACAAAGAGACTATTGTATATCGTTTTGCTAGGTATACAAAATTTCAAAATTGAAAGACAAAA
CACCTTAAACATTTTGATTGTTGTGCTGGATCTGCAATTAAGCCTATGGATCCTTAGGATTGGTGTAGTCGTTTGATATATTATACCCCGTAGGGTTGTTTCAAATCATG
GATCAATCCAAGTATCACGTGTCACATGTTTATCTTGTGATGTTCGAGCTACATCACAATAGCTTAGATAGACACACTTCTACTTATTACTTGGTTCATGTCTAACTCAA
GGATCCAAGCTTGAATATAACCGTAGTTCCCATCTCTTGTGATAGTTGTCTCGCTTTCGACTACATTATGGGGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVKQWLNEIDRYA
NDSVCKLLVGNKCDLVEDKVVDTETAKAFADEHGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSNSSGNVQIKGQPIEQKSSCCN