; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0003331 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0003331
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionprotein LITTLE ZIPPER 3-like
Genome locationLG12:1357721..1359684
RNA-Seq ExpressionSed0003331
SyntenySed0003331
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR039312 - Protein LITTLE ZIPPER


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6597188.1 Protein LITTLE ZIPPER 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.0e-2875.24Show/hide
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XP_023540138.1 protein LITTLE ZIPPER 3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.0e-2875.24Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
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A0A6J1E9A8 protein LITTLE ZIPPER 1-like1.4e-2674.29Show/hide
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A0A6J1F7Z1 protein LITTLE ZIPPER 3-like6.0e-3077.14Show/hide
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A0A6J1IF90 protein LITTLE ZIPPER 3-like7.8e-3076.19Show/hide
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A0A6J1IWC5 protein LITTLE ZIPPER 1-like1.8e-2674.29Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4IG60 Protein LITTLE ZIPPER 12.5e-0946Show/hide
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Q56WL5 Protein LITTLE ZIPPER 45.4e-0450Show/hide
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Q9LXI8 Protein LITTLE ZIPPER 34.2e-0453.85Show/hide
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Q9LZX5 Protein LITTLE ZIPPER 21.4e-0751.52Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G45450.1 protein binding1.8e-1046Show/hide
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AT3G60890.1 protein binding9.8e-0951.52Show/hide
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AT3G60890.2 protein binding1.1e-0747.3Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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ATTGCAACCAAAAGCCTCTCTTTCTCTCTCCTCTCCTATTTATACTCTCAATCCGCCATTAATGCTCTGCTCTGATCTAAACCATTTCCCAAATATTCTACTTGTTTCGG
ATCACATCGCCTCCAAAATGTGCGATTCTTCTCCGTTCGTGCTCTTTTCATTCTCTCCTTCCTCTTTCGCCTCTCGCCATCACCGCCGCCCGATTCGAGTTCACCGGCTC
TTGAGAAGAATGAGATTCGCGAAGCGAGAGGCTCAGGATCGGTCCGGCGTAAAGGTAGAAATGGAGATCAAGAACTTGAAACTGTATATGGAGAATCAAAGCATTATCGA
AGAGAACGAGAGGCTGAGAAAGAAGGCGTTTCTTCTTCACAAAGAGAATCAGGTTTTGTTCTCTCAACTCCAGAGTTTCTCTAATAAGCAGAAATCGCTACCTAACTCCG
ATTAGAGCGATTCGCTGCGAAATCGAATCATCTGAAAACGATGGAGAAAAGGATCTGATCTCAATTCCTTTTCATAATTTTCTTTTGTTCTACGATATTCCTTGGTTTGT
AATCTGTTGTTTTTTGACAATAAATTAGGTTTTGATTTAGGGGGAGGGGAATAAATAATTAAGGGTAAATTAGGTTATTAGGGGATAGATTTTTAGAGTATATTCAATTT
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