; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0003618 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0003618
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionNAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein
Genome locationLG14:463573..464185
RNA-Seq ExpressionSed0003618
SyntenySed0003618
Gene Ontology termsGO:0016491 - oxidoreductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002347 - Short-chain dehydrogenase/reductase SDR
IPR020904 - Short-chain dehydrogenase/reductase, conserved site
IPR036291 - NAD(P)-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK27821.1 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase FabG-like isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]4.8e-4877.61Show/hide
Query:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL
        M  ANR GSIINISSISGL+RA+QRGALAY TSKAALNTLTKVMAMELG H IRVN ICPG+FKSEITKD++ K+WIKNV  R+  L T GTSNPALTT 
Subjt:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL

Query:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL
        IRYLVHDSS+YVS NIF+ D+G SL G+PIFSSL
Subjt:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL

XP_011653852.2 uncharacterized protein LOC101207345 [Cucumis sativus]1.7e-5079.1Show/hide
Query:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL
        M  ANR GSIINISSISGL RA+QRGALAY TSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPG+FKSEITKD++ K+WIKNV  R++ L+T GTSNPALTT 
Subjt:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL

Query:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL
        +RYLVH+SS+YVS NIF+ DAG SL G+PIFSSL
Subjt:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL

XP_022154460.1 uncharacterized protein LOC111021732 [Momordica charantia]2.8e-4877.61Show/hide
Query:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL
        MR +NRSGSIINISSI GL+R    G +AYATSKA LNTLTKVMAMELGAHKIRVN+I PGIFKSEITKD++ K W+KNV  RIV LKT GTS+PALTTL
Subjt:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL

Query:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL
        IRYLVHDSS+YVS NIF+ DAG +LPG+PIFSSL
Subjt:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL

XP_031740575.1 uncharacterized protein LOC101207105 [Cucumis sativus]6.6e-5076.87Show/hide
Query:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL
        M  ANR GSIINISSISGL R ++ GA+AY TSKAALNT TKVMAMELGAHKIRVNSICPG+FKSEITKD++ K+WIKNV  R+V L+T GTSNPALTT+
Subjt:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL

Query:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL
        +RYLVHDSS+YVS NIF+ DAG++LPG+PIFSSL
Subjt:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL

XP_038883585.1 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG-like [Benincasa hispida]1.3e-4876.12Show/hide
Query:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL
        M  A+R GSIINISSISGL RA+Q GALAY TSKAALNTLTKVMA ELGAHKIRVN ICPG+FKSEITKD++ K+WIKNV  R + LKT GTS+PALT  
Subjt:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL

Query:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL
        +RYL+HDSS+YV+ NIF+ADAG SLPG+PIFSSL
Subjt:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KYF0 Uncharacterized protein8.5e-5179.1Show/hide
Query:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL
        M  ANR GSIINISSISGL RA+QRGALAY TSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPG+FKSEITKD++ K+WIKNV  R++ L+T GTSNPALTT 
Subjt:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL

Query:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL
        +RYLVH+SS+YVS NIF+ DAG SL G+PIFSSL
Subjt:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL

A0A0A0L258 Uncharacterized protein3.2e-5076.87Show/hide
Query:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL
        M  ANR GSIINISSISGL R ++ GA+AY TSKAALNT TKVMAMELGAHKIRVNSICPG+FKSEITKD++ K+WIKNV  R+V L+T GTSNPALTT+
Subjt:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL

Query:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL
        +RYLVHDSS+YVS NIF+ DAG++LPG+PIFSSL
Subjt:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL

A0A5A7SNS1 3-oxoacyl-(Acyl-carrier-protein) reductase FabG-like isoform X22.3e-4877.61Show/hide
Query:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL
        M  ANR GSIINISSISGL+RA+QRGALAY TSKAALNTLTKVMAMELG H IRVN ICPG+FKSEITKD++ K+WIKNV  R+  L T GTSNPALTT 
Subjt:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL

Query:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL
        IRYLVHDSS+YVS NIF+ D+G SL G+PIFSSL
Subjt:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL

A0A5D3DVU8 3-oxoacyl-(Acyl-carrier-protein) reductase FabG-like isoform X22.3e-4877.61Show/hide
Query:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL
        M  ANR GSIINISSISGL+RA+QRGALAY TSKAALNTLTKVMAMELG H IRVN ICPG+FKSEITKD++ K+WIKNV  R+  L T GTSNPALTT 
Subjt:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL

Query:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL
        IRYLVHDSS+YVS NIF+ D+G SL G+PIFSSL
Subjt:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL

A0A6J1DJN6 uncharacterized protein LOC1110217321.4e-4877.61Show/hide
Query:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL
        MR +NRSGSIINISSI GL+R    G +AYATSKA LNTLTKVMAMELGAHKIRVN+I PGIFKSEITKD++ K W+KNV  RIV LKT GTS+PALTTL
Subjt:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL

Query:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL
        IRYLVHDSS+YVS NIF+ DAG +LPG+PIFSSL
Subjt:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P38004 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG2.0e-0934.17Show/hide
Query:  RSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITK---DVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTLIR
        RSG+IINISSI GL  +   G   YA +KA +   +K ++ E+G+  IRVN I PG   +++TK   D +  EW+K V +  V +         +     
Subjt:  RSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITK---DVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTLIR

Query:  YLVHDSSQYVSANIFVADAG
        +L  D S Y++  +   D G
Subjt:  YLVHDSSQYVSANIFVADAG

P69166 3-alpha-(or 20-beta)-hydroxysteroid dehydrogenase2.7e-0938.71Show/hide
Query:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPA-LTT
        M++A R GSIINISSI GL   +      Y  +K A+  LTK  A+ELG   IRVNSI PG+ K+ +T      +W+      I        + P  ++ 
Subjt:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPA-LTT

Query:  LIRYLVHDSSQYVSANIFVADAGT
        L+ YL  D S Y +   FV D GT
Subjt:  LIRYLVHDSSQYVSANIFVADAGT

P9WGT0 3-alpha-(or 20-beta)-hydroxysteroid dehydrogenase3.5e-0938.71Show/hide
Query:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPA-LTT
        M++A R GSIINISSI GL   +      Y  +K A+  LTK  A+ELG   IRVNSI PG+ K+ +T      +W+      I        + P  ++ 
Subjt:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPA-LTT

Query:  LIRYLVHDSSQYVSANIFVADAGT
        L+ YL  D S Y +   FV D GT
Subjt:  LIRYLVHDSSQYVSANIFVADAGT

P9WGT1 3-alpha-(or 20-beta)-hydroxysteroid dehydrogenase2.7e-0938.71Show/hide
Query:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPA-LTT
        M++A R GSIINISSI GL   +      Y  +K A+  LTK  A+ELG   IRVNSI PG+ K+ +T      +W+      I        + P  ++ 
Subjt:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPA-LTT

Query:  LIRYLVHDSSQYVSANIFVADAGT
        L+ YL  D S Y +   FV D GT
Subjt:  LIRYLVHDSSQYVSANIFVADAGT

Q9ZW03 Tropinone reductase homolog At2g291502.7e-0929.84Show/hide
Query:  ANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTLIRY
        A+ SGSI+ +SS++GL   +  GA  Y  SK A+N L + +A E  +  IRVNS+CP +  + +T  + + E ++        +   G +N  +++L+ +
Subjt:  ANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTLIRY

Query:  LVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPG
        L   ++ Y++      D G S+ G
Subjt:  LVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G62610.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein1.2e-4159.7Show/hide
Query:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL
        MRDA R GS+IN+SSISGL R + RG LAYA SK  ++T+T++MA+EL  +KIRVNSI PGIF+SEIT+ +  KEW++ V  +IV LK   T +P LT+L
Subjt:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL

Query:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL
        +RYL+HDSSQYV+ N ++ D+G +LPG+PIFSSL
Subjt:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL

AT1G62610.2 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein1.2e-4159.7Show/hide
Query:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL
        MRDA R GS+IN+SSISGL R + RG LAYA SK  ++T+T++MA+EL  +KIRVNSI PGIF+SEIT+ +  KEW++ V  +IV LK   T +P LT+L
Subjt:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL

Query:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL
        +RYL+HDSSQYV+ N ++ D+G +LPG+PIFSSL
Subjt:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL

AT1G62610.3 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein1.2e-4159.7Show/hide
Query:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL
        MRDA R GS+IN+SSISGL R + RG LAYA SK  ++T+T++MA+EL  +KIRVNSI PGIF+SEIT+ +  KEW++ V  +IV LK   T +P LT+L
Subjt:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL

Query:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL
        +RYL+HDSSQYV+ N ++ D+G +LPG+PIFSSL
Subjt:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL

AT1G62610.4 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein1.2e-4159.7Show/hide
Query:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL
        MRDA R GS+IN+SSISGL R + RG LAYA SK  ++T+T++MA+EL  +KIRVNSI PGIF+SEIT+ +  KEW++ V  +IV LK   T +P LT+L
Subjt:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL

Query:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL
        +RYL+HDSSQYV+ N ++ D+G +LPG+PIFSSL
Subjt:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL

AT1G63380.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein1.4e-4260.45Show/hide
Query:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL
        MRDA R GS+IN+SSISGL R + RG LAYA SK  ++T+T++MA+EL  +KIRVNSI PGIF+SEIT+ +  KEW+K V  ++V LK   T +P LT+L
Subjt:  MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTL

Query:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL
        +RYL+HDSSQYV+ N ++ D+GT+LPG+PIFSSL
Subjt:  IRYLVHDSSQYVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCGTGACGCCAATCGAAGTGGATCCATTATCAATATTTCTTCAATTAGTGGTCTTGAAAGAGCTATACAACGTGGAGCTCTTGCTTATGCTACGTCAAAGGCAGCCTT
GAACACCTTGACAAAGGTTATGGCCATGGAATTGGGAGCACATAAAATAAGAGTGAATTCAATATGTCCCGGAATTTTCAAGTCTGAAATTACAAAAGATGTGGTGAATA
AAGAATGGATTAAGAATGTGGAAATGCGAATCGTGGCTTTGAAAACATCTGGAACTTCAAATCCCGCACTAACCACACTCATTCGATACTTGGTCCATGACTCTTCTCAG
TATGTCTCCGCCAACATTTTTGTTGCTGATGCAGGCACCTCTTTGCCCGGTCTTCCTATTTTCTCATCCCTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCGTGACGCCAATCGAAGTGGATCCATTATCAATATTTCTTCAATTAGTGGTCTTGAAAGAGCTATACAACGTGGAGCTCTTGCTTATGCTACGTCAAAGGCAGCCTT
GAACACCTTGACAAAGGTTATGGCCATGGAATTGGGAGCACATAAAATAAGAGTGAATTCAATATGTCCCGGAATTTTCAAGTCTGAAATTACAAAAGATGTGGTGAATA
AAGAATGGATTAAGAATGTGGAAATGCGAATCGTGGCTTTGAAAACATCTGGAACTTCAAATCCCGCACTAACCACACTCATTCGATACTTGGTCCATGACTCTTCTCAG
TATGTCTCCGCCAACATTTTTGTTGCTGATGCAGGCACCTCTTTGCCCGGTCTTCCTATTTTCTCATCCCTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRDANRSGSIINISSISGLERAIQRGALAYATSKAALNTLTKVMAMELGAHKIRVNSICPGIFKSEITKDVVNKEWIKNVEMRIVALKTSGTSNPALTTLIRYLVHDSSQ
YVSANIFVADAGTSLPGLPIFSSL