CuGenDBv2

Gene ID	Sed0003722
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	Unknown protein
Genome location	LG05:38835988..38837415
RNA-Seq Expression	Sed0003722
Synteny	Sed0003722
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_004140725.1 uncharacterized protein LOC101203967 [Cucumis sativus]

5.6e-70

81.98

Show/hide

Query:  MITHIKPPFPPA--LAQHPNWNTAALRFTLPLALTRATSRIATTAAAILAAAALIASPAPSSAAESSALEQQEVEESGATLSNIPQTLSGECAQPSDCKK
        M+TH+K P PP      HPNWNT  LRFT PLALT +T RIATTAAAILAAAA+IASP PS+A E+SA   ++ EES +TLSNIPQTLSGECAQPSDCKK
Subjt:  MITHIKPPFPPA--LAQHPNWNTAALRFTLPLALTRATSRIATTAAAILAAAALIASPAPSSAAESSALEQQEVEESGATLSNIPQTLSGECAQPSDCKK

Query:  ARIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRPLIVFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP
        ARIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRP++VFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP
Subjt:  ARIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRPLIVFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP

XP_008456185.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103496200 [Cucumis melo]

3.3e-70

81.98

Show/hide

Query:  MITHIKPPFP--PALAQHPNWNTAALRFTLPLALTRATSRIATTAAAILAAAALIASPAPSSAAESSALEQQEVEESGATLSNIPQTLSGECAQPSDCKK
        M++H+K PFP  P    HPNWNT  LRFT PLALT +T RIATTAAAILAAAA+IASP PS+A E+SA   ++ EES +TLSNIPQTLSGECAQPSDCKK
Subjt:  MITHIKPPFP--PALAQHPNWNTAALRFTLPLALTRATSRIATTAAAILAAAALIASPAPSSAAESSALEQQEVEESGATLSNIPQTLSGECAQPSDCKK

Query:  ARIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRPLIVFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP
        ARIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRP++VFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP
Subjt:  ARIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRPLIVFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP

XP_022934222.1 uncharacterized protein LOC111441457 isoform X2 [Cucurbita moschata]

2.5e-70

83.04

Show/hide

Query:  MITHIKPPFPPALA-QHPNWNTAALRFTLPLALTRATSRIATTAAAILAAAALIASPAPSSAAESSALEQQEVEESGATLSNIPQTLSGECAQPSDCKKA
        MI+H+K PFPP  A  HPNWN+A +RFT PLALTRA+ RIATTAAAILAAA +I SPAPS+A ESS+   ++ EES  TLSNIPQTLSGECAQPSDCKKA
Subjt:  MITHIKPPFPPALA-QHPNWNTAALRFTLPLALTRATSRIATTAAAILAAAALIASPAPSSAAESSALEQQEVEESGATLSNIPQTLSGECAQPSDCKKA

Query:  RIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRPLIVFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP
        RIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRP++VFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP
Subjt:  RIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRPLIVFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP

XP_022983921.1 uncharacterized protein LOC111482398 isoform X2 [Cucurbita maxima]

9.6e-70

82.46

Show/hide

Query:  MITHIKPPFPPALA-QHPNWNTAALRFTLPLALTRATSRIATTAAAILAAAALIASPAPSSAAESSALEQQEVEESGATLSNIPQTLSGECAQPSDCKKA
        MI+H+K PFPP  A  HPNWN+A +RFT PLALTRA+ RI TTAAAILAAA +I SPAPS+A ESS+   ++ EES  TLSNIPQTLSGECAQPSDCKKA
Subjt:  MITHIKPPFPPALA-QHPNWNTAALRFTLPLALTRATSRIATTAAAILAAAALIASPAPSSAAESSALEQQEVEESGATLSNIPQTLSGECAQPSDCKKA

Query:  RIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRPLIVFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP
        RIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRP++VFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP
Subjt:  RIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRPLIVFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP

XP_023526623.1 uncharacterized protein LOC111790064 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

3.3e-70

83.04

Show/hide

Query:  MITHIKPPFPPALA-QHPNWNTAALRFTLPLALTRATSRIATTAAAILAAAALIASPAPSSAAESSALEQQEVEESGATLSNIPQTLSGECAQPSDCKKA
        MI+H+K PFPP  A  HPNWN+A +RFT PLALTRA+ RIATTAAAILAAA +I SPAPS+A ESS+   ++ EES  TLSNIPQTLSGECAQPSDCKKA
Subjt:  MITHIKPPFPPALA-QHPNWNTAALRFTLPLALTRATSRIATTAAAILAAAALIASPAPSSAAESSALEQQEVEESGATLSNIPQTLSGECAQPSDCKKA

Query:  RIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRPLIVFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP
        RIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRP++VFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP
Subjt:  RIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRPLIVFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LA46 Uncharacterized protein

2.7e-70

81.98

Show/hide

Query:  MITHIKPPFPPA--LAQHPNWNTAALRFTLPLALTRATSRIATTAAAILAAAALIASPAPSSAAESSALEQQEVEESGATLSNIPQTLSGECAQPSDCKK
        M+TH+K P PP      HPNWNT  LRFT PLALT +T RIATTAAAILAAAA+IASP PS+A E+SA   ++ EES +TLSNIPQTLSGECAQPSDCKK
Subjt:  MITHIKPPFPPA--LAQHPNWNTAALRFTLPLALTRATSRIATTAAAILAAAALIASPAPSSAAESSALEQQEVEESGATLSNIPQTLSGECAQPSDCKK

Query:  ARIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRPLIVFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP
        ARIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRP++VFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP
Subjt:  ARIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRPLIVFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP

A0A1S3C289 uncharacterized protein LOC103496200

1.6e-70

81.98

Show/hide

Query:  MITHIKPPFP--PALAQHPNWNTAALRFTLPLALTRATSRIATTAAAILAAAALIASPAPSSAAESSALEQQEVEESGATLSNIPQTLSGECAQPSDCKK
        M++H+K PFP  P    HPNWNT  LRFT PLALT +T RIATTAAAILAAAA+IASP PS+A E+SA   ++ EES +TLSNIPQTLSGECAQPSDCKK
Subjt:  MITHIKPPFP--PALAQHPNWNTAALRFTLPLALTRATSRIATTAAAILAAAALIASPAPSSAAESSALEQQEVEESGATLSNIPQTLSGECAQPSDCKK

Query:  ARIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRPLIVFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP
        ARIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRP++VFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP
Subjt:  ARIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRPLIVFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP

A0A5A7T6W8 Uncharacterized protein

1.6e-70

81.98

Show/hide

Query:  MITHIKPPFP--PALAQHPNWNTAALRFTLPLALTRATSRIATTAAAILAAAALIASPAPSSAAESSALEQQEVEESGATLSNIPQTLSGECAQPSDCKK
        M++H+K PFP  P    HPNWNT  LRFT PLALT +T RIATTAAAILAAAA+IASP PS+A E+SA   ++ EES +TLSNIPQTLSGECAQPSDCKK
Subjt:  MITHIKPPFP--PALAQHPNWNTAALRFTLPLALTRATSRIATTAAAILAAAALIASPAPSSAAESSALEQQEVEESGATLSNIPQTLSGECAQPSDCKK

Query:  ARIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRPLIVFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP
        ARIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRP++VFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP
Subjt:  ARIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRPLIVFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP

A0A6J1F235 uncharacterized protein LOC111441457 isoform X2

1.2e-70

83.04

Show/hide

Query:  MITHIKPPFPPALA-QHPNWNTAALRFTLPLALTRATSRIATTAAAILAAAALIASPAPSSAAESSALEQQEVEESGATLSNIPQTLSGECAQPSDCKKA
        MI+H+K PFPP  A  HPNWN+A +RFT PLALTRA+ RIATTAAAILAAA +I SPAPS+A ESS+   ++ EES  TLSNIPQTLSGECAQPSDCKKA
Subjt:  MITHIKPPFPPALA-QHPNWNTAALRFTLPLALTRATSRIATTAAAILAAAALIASPAPSSAAESSALEQQEVEESGATLSNIPQTLSGECAQPSDCKKA

Query:  RIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRPLIVFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP
        RIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRP++VFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP
Subjt:  RIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRPLIVFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP

A0A6J1J3Q4 uncharacterized protein LOC111482398 isoform X2

4.6e-70

82.46

Show/hide

Query:  MITHIKPPFPPALA-QHPNWNTAALRFTLPLALTRATSRIATTAAAILAAAALIASPAPSSAAESSALEQQEVEESGATLSNIPQTLSGECAQPSDCKKA
        MI+H+K PFPP  A  HPNWN+A +RFT PLALTRA+ RI TTAAAILAAA +I SPAPS+A ESS+   ++ EES  TLSNIPQTLSGECAQPSDCKKA
Subjt:  MITHIKPPFPPALA-QHPNWNTAALRFTLPLALTRATSRIATTAAAILAAAALIASPAPSSAAESSALEQQEVEESGATLSNIPQTLSGECAQPSDCKKA

Query:  RIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRPLIVFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP
        RIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRP++VFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP
Subjt:  RIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRPLIVFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G78995.1 unknown protein

7.9e-38

60.99

Show/hide

Query:  LALTRATSRIATTAAAILAAAALIASPAPSSAAESSALEQQEVEESGATLSNIPQTLSGECAQPSDCKKARIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPG
        L    A  RI+T     +AAA ++A+ + +SA      E     + G TLSN+PQTLSGE     DCKK RIQRPKS+ AE CT+KCV TCIR GD   G
Subjt:  LALTRATSRIATTAAAILAAAALIASPAPSSAAESSALEQQEVEESGATLSNIPQTLSGECAQPSDCKKARIQRPKSRKAESCTIKCVGTCIRGGDGSPG

Query:  EGPLNIRRPLIVFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP
        EGP+NIRRPL+VFKQGFRSR YCLVECSDICNLIGDGD GP
Subjt:  EGPLNIRRPLIVFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGATAACCCATATAAAACCTCCATTTCCACCGGCCCTAGCGCAGCATCCGAATTGGAACACCGCCGCCCTCCGATTCACCCTCCCGCTCGCCCTAACCAGAGCCACTTC
CCGAATCGCCACCACCGCGGCGGCGATTCTGGCAGCCGCAGCCCTCATCGCTTCGCCGGCGCCGTCATCCGCGGCGGAGAGCAGTGCATTGGAACAACAAGAAGTGGAAG
AGAGTGGTGCAACGCTGTCGAACATTCCGCAGACGCTTTCCGGCGAGTGCGCGCAGCCGAGCGACTGCAAGAAGGCGAGAATCCAACGGCCGAAGTCGAGGAAGGCGGAG
TCGTGCACGATCAAGTGCGTCGGAACTTGCATTCGCGGCGGCGATGGATCTCCCGGCGAAGGACCTCTCAATATCAGGAGACCGCTTATTGTCTTTAAACAAGGGTTTCG
AAGTCGTCAATATTGTTTGGTGGAGTGTTCAGATATCTGCAATTTGATCGGCGATGGTGATGATGGACCTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MITHIKPPFPPALAQHPNWNTAALRFTLPLALTRATSRIATTAAAILAAAALIASPAPSSAAESSALEQQEVEESGATLSNIPQTLSGECAQPSDCKKARIQRPKSRKAE
SCTIKCVGTCIRGGDGSPGEGPLNIRRPLIVFKQGFRSRQYCLVECSDICNLIGDGDDGP

Sed0003722 (gene) of Chayote v1 genome