; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0003811 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0003811
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptioneukaryotic initiation factor 4A-III
Genome locationLG05:25302551..25308756
RNA-Seq ExpressionSed0003811
SyntenySed0003811
Gene Ontology termsGO:0006413 - translational initiation (biological process)
GO:0005730 - nucleolus (cellular component)
GO:0071013 - catalytic step 2 spliceosome (cellular component)
GO:0003724 - RNA helicase activity (molecular function)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0003743 - translation initiation factor activity (molecular function)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0016787 - hydrolase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001650 - Helicase, C-terminal
IPR011545 - DEAD/DEAH box helicase domain
IPR014001 - Helicase superfamily 1/2, ATP-binding domain
IPR014014 - RNA helicase, DEAD-box type, Q motif
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A6J1K814 eukaryotic initiation factor 4A-3-like2.8e-22296.34Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P41380 Eukaryotic initiation factor 4A-32.2e-20391.26Show/hide
Query:  DEKLEFETTEGVEPILSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQTVDTSSREVQALILSPTRELATQT
        +++L FET++GVEPI SF +MGIKDDLLRG+Y YGFEKPSAIQQRAV PII GRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQ VDT S EVQALILSPTRELA QT
Subjt:  DEKLEFETTEGVEPILSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQTVDTSSREVQALILSPTRELATQT

Query:  EKVILAVGDYINIQAHACIGGTSVGEDIRKLEFGVQVVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP
        EKVILA+GDYIN+QAHACIGG SVGEDIRKLE GVQVVSGTPGRVCDMIKRRTLRTR IKLL+LDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP
Subjt:  EKVILAVGDYINIQAHACIGGTSVGEDIRKLEFGVQVVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP

Query:  HEILEITNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSQMHGDMPQRERDAIMGE
        +EILEIT+KFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVE+EEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKV+WLT KMR NNFTVS MHGDMPQ+ERDAIM E
Subjt:  HEILEITNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSQMHGDMPQRERDAIMGE

Query:  FRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKTDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
        FR GTTRVLITTDVWARGLDVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVK+DDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
Subjt:  FRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKTDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI

Q10I26 Eukaryotic initiation factor 4A-III homolog B3.4e-20187.5Show/hide
Query:  AAAMTSVVPANRRRAVNAPDEKLEFETTEGVEPILSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQTVDTS
        AAA TS     RR      DE L FET+ GVE I SFDQMGI++DLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAV PII GRDVIAQAQSGTGKTSMI+L+VCQ VDT+
Subjt:  AAAMTSVVPANRRRAVNAPDEKLEFETTEGVEPILSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQTVDTS

Query:  SREVQALILSPTRELATQTEKVILAVGDYINIQAHACIGGTSVGEDIRKLEFGVQVVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYD
         REVQALILSPTRELA QTE+V+LA+GDYINIQ HACIGG S+GEDIRKLE GV VVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLL+LDE+DEML RGFKDQIYD
Subjt:  SREVQALILSPTRELATQTEKVILAVGDYINIQAHACIGGTSVGEDIRKLEFGVQVVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYD

Query:  VYRYLPPELQVVLISATLPHEILEITNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFT
        VYRYLPPELQV LISATLPHEILE+T+KFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVE+EEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKV+WLTE+MRSNNFT
Subjt:  VYRYLPPELQVVLISATLPHEILEITNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFT

Query:  VSQMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKTDDIKILRDIEQYYSTQIDEM
        VS MHGDMPQ+ERDAIMGEFRSG TRVLITTDVWARGLDVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVK +DI+ILRDIEQYYSTQIDEM
Subjt:  VSQMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKTDDIKILRDIEQYYSTQIDEM

Query:  PMNVADLI
        PMNVADLI
Subjt:  PMNVADLI

Q5VNM3 Eukaryotic initiation factor 4A-III homolog A3.4e-20187.5Show/hide
Query:  AAAMTSVVPANRRRAVNAPDEKLEFETTEGVEPILSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQTVDTS
        AAA TS     RR      DE L FET+ GVE I SFDQMGI+DDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAV PII GRDVIAQAQSGTGKTSMI+L+VCQ VDT+
Subjt:  AAAMTSVVPANRRRAVNAPDEKLEFETTEGVEPILSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQTVDTS

Query:  SREVQALILSPTRELATQTEKVILAVGDYINIQAHACIGGTSVGEDIRKLEFGVQVVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYD
         REVQALILSPTRELA QTE+V+LA+GD+INIQ HACIGG S+GEDIRKLE GV VVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLL+LDE+DEML RGFKDQIYD
Subjt:  SREVQALILSPTRELATQTEKVILAVGDYINIQAHACIGGTSVGEDIRKLEFGVQVVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYD

Query:  VYRYLPPELQVVLISATLPHEILEITNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFT
        VYRYLPPELQV LISATLPHEILE+T+KFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVE+EEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKV+WLTE+MRSNNFT
Subjt:  VYRYLPPELQVVLISATLPHEILEITNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFT

Query:  VSQMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKTDDIKILRDIEQYYSTQIDEM
        VS MHGDMPQ+ERDAIMGEFRSG TRVLITTDVWARGLDVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVK +DI+ILRDIEQYYSTQIDEM
Subjt:  VSQMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKTDDIKILRDIEQYYSTQIDEM

Query:  PMNVADLI
        PMNVADLI
Subjt:  PMNVADLI

Q7ZVA6 Eukaryotic initiation factor 4A-III1.0e-18478.71Show/hide
Query:  TSVVPANRRRAVNAPDEKLEFETTEGVEPILSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQTVDTSSREV
        T+VVP  +R        K+EFET+E V+   +FD MG+++DLLRGIYAYGFEKPSAIQQRA++ II+GRDVIAQ+QSGTGKT+   ++V Q +D   RE 
Subjt:  TSVVPANRRRAVNAPDEKLEFETTEGVEPILSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQTVDTSSREV

Query:  QALILSPTRELATQTEKVILAVGDYINIQAHACIGGTSVGEDIRKLEFGVQVVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRY
        QALIL+PTRELA Q +KV+LA+GDY+N+Q HACIGGT+VGEDIRKL++G  VV+GTPGRV DMI+RR+LRTRAIK+LVLDE+DEML++GFK+QIYDVYRY
Subjt:  QALILSPTRELATQTEKVILAVGDYINIQAHACIGGTSVGEDIRKLEFGVQVVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRY

Query:  LPPELQVVLISATLPHEILEITNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSQM
        LPP  QV LISATLPHEILE+TNKFMTDP+RILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKV+WLTEKMR  NFTVS M
Subjt:  LPPELQVVLISATLPHEILEITNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSQM

Query:  HGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKTDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNV
        HGDMPQ+ER++IM EFRSG +RVLI+TDVWARGLDV QVSL+INYDLPNNRELYIHRIGRSGR+GRKGVAINFVK DDI+ILRDIEQYYSTQIDEMPMNV
Subjt:  HGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKTDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNV

Query:  ADLI
        ADLI
Subjt:  ADLI

Q94A52 Eukaryotic initiation factor 4A-III homolog2.7e-19886.9Show/hide
Query:  RRRAVNAPDEKLEFETTEGVEPILSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQTVDTSSREVQALILSP
        RR      D+KL FETT+G+EPI SF+ MGIK+D+LRG+Y YGFEKPSAIQQRAV PI++GRDVIAQAQSGTGKTSMIAL+VCQ VDTSSREVQALILSP
Subjt:  RRRAVNAPDEKLEFETTEGVEPILSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQTVDTSSREVQALILSP

Query:  TRELATQTEKVILAVGDYINIQAHACIGGTSVGEDIRKLEFGVQVVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQV
        TRELATQTEK I A+G + NIQAHACIGG SVGEDIRKLE GV VVSGTPGRVCDMIKRR+LRTRAIKLL+LDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPP+LQV
Subjt:  TRELATQTEKVILAVGDYINIQAHACIGGTSVGEDIRKLEFGVQVVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQV

Query:  VLISATLPHEILEITNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSQMHGDMPQR
         L+SATLPHEILE+T+KFMT+PV+ILVKRDELTLEGIKQFFVAVE+EEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKV++L+EKMRS+NFTVS MHGDMPQ+
Subjt:  VLISATLPHEILEITNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSQMHGDMPQR

Query:  ERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKTDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
        ERDAIM EFRSG +RVLITTDVWARG+DVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVK+DDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
Subjt:  ERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKTDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G51380.1 DEA(D/H)-box RNA helicase family protein1.5e-16272.49Show/hide
Query:  DEKLEFETTEGVEPILSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQTVDTSSREVQALILSPTRELATQT
        +E L FETT+G++PI SFD MG+ D +LRG+Y YG++KPS IQQRA+ PI++GRDVIAQAQSGTGKTSMIA++VCQ V+ SSR+VQ L+LSP+RELA+QT
Subjt:  DEKLEFETTEGVEPILSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQTVDTSSREVQALILSPTRELATQT

Query:  EKVILAVGDYINIQAHACIGGTSVGEDIRKLEFGVQVVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP
        EK I A+G + NIQAHACIGG S+GEDI+KLE GV  VSGTPGRV DMIKR +L+T+A+KLLVLDESDEMLS+G KDQIYDVYR LP ++QV LISATLP
Subjt:  EKVILAVGDYINIQAHACIGGTSVGEDIRKLEFGVQVVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP

Query:  HEILEITNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSQMHGDMPQRERDAIMGE
         EILE+T KFMTDPVRILVK DELTLEGIKQ++V V++EEWKFDTLCDLY  LTI QA+IFCNT++KV+WLTEKMRS+NF VS MHGD  Q+ERD IM +
Subjt:  HEILEITNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSQMHGDMPQRERDAIMGE

Query:  FRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKTDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
        FRS  +RVLI +DVWARG+DVQ VS VINYD+PNN ELYIHRIGR+GRFGR+GVAINFVK+ D+K L+DIE++Y T+I EMP   ADL+
Subjt:  FRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKTDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI

AT1G54270.1 eif4a-24.9e-14266.49Show/hide
Query:  SFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQTVDTSSREVQALILSPTRELATQTEKVILAVGDYINIQAH
        SFD MG++++LLRGIYAYGFEKPSAIQQR + P  +G DVI QAQSGTGKT+     V Q +D +  + QAL+L+PTRELA Q EKV+ A+GDY  ++ H
Subjt:  SFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQTVDTSSREVQALILSPTRELATQTEKVILAVGDYINIQAH

Query:  ACIGGTSVGEDIRKLEFGVQVVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEITNKFMTDPVR
        AC+GGTSV ED R L+ GV VV GTPGRV DM++R++LR   IK+ VLDE+DEMLSRGFKDQIYD+++ LPP++QV + SAT+P E LEIT KFM+ PVR
Subjt:  ACIGGTSVGEDIRKLEFGVQVVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEITNKFMTDPVR

Query:  ILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSQMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWA
        ILVKRDELTLEGIKQF+V VE+E+WK +TLCDLY+TL ITQ+VIF NT+RKV+WLT+KMRS + TVS  HGDM Q  RD IM EFRSG++RVLITTD+ A
Subjt:  ILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSQMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWA

Query:  RGLDVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKTDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
        RG+DVQQVSLVIN+DLP   E Y+HRIGRSGRFGRKGVAINFV  DD ++L DI+++Y+  ++E+P NVADL+
Subjt:  RGLDVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKTDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI

AT3G13920.1 eukaryotic translation initiation factor 4A12.0e-14367.29Show/hide
Query:  SFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQTVDTSSREVQALILSPTRELATQTEKVILAVGDYINIQAH
        SFD MG++++LLRGIYAYGFEKPSAIQQR + P  +G DVI QAQSGTGKT+     V Q +D S  + QAL+L+PTRELA Q EKV+ A+GDY+ ++ H
Subjt:  SFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQTVDTSSREVQALILSPTRELATQTEKVILAVGDYINIQAH

Query:  ACIGGTSVGEDIRKLEFGVQVVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEITNKFMTDPVR
        AC+GGTSV ED R L+ GV VV GTPGRV DM+KR++LR   IK+ VLDE+DEMLSRGFKDQIYD+++ LPP++QV + SAT+P E LEIT KFM+ PVR
Subjt:  ACIGGTSVGEDIRKLEFGVQVVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEITNKFMTDPVR

Query:  ILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSQMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWA
        ILVKRDELTLEGIKQF+V VE+EEWK +TLCDLY+TL ITQ+VIF NT+RKV+WLT+KMRS + TVS  HGDM Q  RD IM EFRSG++RVLITTD+ A
Subjt:  ILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSQMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWA

Query:  RGLDVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKTDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
        RG+DVQQVSLVIN+DLP   E Y+HRIGRSGRFGRKGVAINFV  DD ++L DI+++Y+  ++E+P NVADL+
Subjt:  RGLDVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKTDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI

AT3G13920.3 eukaryotic translation initiation factor 4A12.0e-14367.29Show/hide
Query:  SFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQTVDTSSREVQALILSPTRELATQTEKVILAVGDYINIQAH
        SFD MG++++LLRGIYAYGFEKPSAIQQR + P  +G DVI QAQSGTGKT+     V Q +D S  + QAL+L+PTRELA Q EKV+ A+GDY+ ++ H
Subjt:  SFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQTVDTSSREVQALILSPTRELATQTEKVILAVGDYINIQAH

Query:  ACIGGTSVGEDIRKLEFGVQVVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEITNKFMTDPVR
        AC+GGTSV ED R L+ GV VV GTPGRV DM+KR++LR   IK+ VLDE+DEMLSRGFKDQIYD+++ LPP++QV + SAT+P E LEIT KFM+ PVR
Subjt:  ACIGGTSVGEDIRKLEFGVQVVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEITNKFMTDPVR

Query:  ILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSQMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWA
        ILVKRDELTLEGIKQF+V VE+EEWK +TLCDLY+TL ITQ+VIF NT+RKV+WLT+KMRS + TVS  HGDM Q  RD IM EFRSG++RVLITTD+ A
Subjt:  ILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSQMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWA

Query:  RGLDVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKTDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
        RG+DVQQVSLVIN+DLP   E Y+HRIGRSGRFGRKGVAINFV  DD ++L DI+++Y+  ++E+P NVADL+
Subjt:  RGLDVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKTDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI

AT3G19760.1 eukaryotic initiation factor 4A-III1.9e-19986.9Show/hide
Query:  RRRAVNAPDEKLEFETTEGVEPILSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQTVDTSSREVQALILSP
        RR      D+KL FETT+G+EPI SF+ MGIK+D+LRG+Y YGFEKPSAIQQRAV PI++GRDVIAQAQSGTGKTSMIAL+VCQ VDTSSREVQALILSP
Subjt:  RRRAVNAPDEKLEFETTEGVEPILSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQTVDTSSREVQALILSP

Query:  TRELATQTEKVILAVGDYINIQAHACIGGTSVGEDIRKLEFGVQVVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQV
        TRELATQTEK I A+G + NIQAHACIGG SVGEDIRKLE GV VVSGTPGRVCDMIKRR+LRTRAIKLL+LDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPP+LQV
Subjt:  TRELATQTEKVILAVGDYINIQAHACIGGTSVGEDIRKLEFGVQVVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQV

Query:  VLISATLPHEILEITNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSQMHGDMPQR
         L+SATLPHEILE+T+KFMT+PV+ILVKRDELTLEGIKQFFVAVE+EEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKV++L+EKMRS+NFTVS MHGDMPQ+
Subjt:  VLISATLPHEILEITNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSQMHGDMPQR

Query:  ERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKTDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
        ERDAIM EFRSG +RVLITTDVWARG+DVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVK+DDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
Subjt:  ERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKTDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGCTGCAGCAATGACTAGCGTTGTGCCGGCGAATCGACGGCGGGCGGTTAACGCGCCGGATGAGAAGTTGGAATTCGAGACAACGGAGGGGGTTGAGCCGATATT
GAGTTTCGATCAGATGGGCATCAAGGATGATCTTCTCCGTGGCATATATGCATACGGTTTTGAAAAGCCCTCGGCCATTCAGCAGAGAGCCGTCAGGCCGATTATCGAGG
GTCGAGATGTTATTGCTCAGGCTCAATCTGGAACTGGCAAGACCTCCATGATTGCCCTTACTGTTTGCCAGACCGTTGATACCTCCAGCAGAGAGGTACAGGCATTGATC
TTGTCCCCTACAAGAGAATTGGCAACTCAAACAGAGAAAGTTATATTGGCAGTTGGAGACTACATTAATATACAGGCACATGCATGTATTGGAGGCACAAGTGTGGGTGA
AGACATTAGAAAGCTTGAGTTTGGAGTTCAGGTAGTTTCAGGAACTCCGGGAAGAGTTTGTGACATGATCAAGAGGAGAACATTGCGTACCAGAGCCATTAAGTTGTTAG
TTCTGGATGAATCCGATGAGATGTTGAGCAGAGGTTTTAAAGACCAAATTTATGATGTATACCGATACCTTCCACCAGAACTTCAGGTTGTCTTGATTTCTGCCACTCTT
CCTCATGAAATCCTGGAGATTACAAATAAGTTTATGACTGATCCTGTGAGGATCCTTGTGAAGCGTGATGAGTTAACTTTGGAGGGTATTAAGCAATTCTTCGTTGCTGT
TGAAAGGGAAGAGTGGAAATTTGATACCTTATGTGATCTTTATGACACCTTAACTATCACTCAAGCTGTAATATTCTGTAACACCAAGCGTAAGGTTGAATGGTTGACTG
AGAAGATGCGCAGTAATAACTTCACAGTTTCACAAATGCATGGGGACATGCCTCAAAGGGAAAGAGATGCAATCATGGGGGAGTTTCGTTCAGGAACTACCCGTGTCCTA
ATCACTACTGATGTTTGGGCCCGAGGGCTTGATGTTCAGCAGGTATCACTGGTGATTAACTATGACCTTCCGAACAATCGAGAACTTTACATTCACAGGATAGGAAGGTC
TGGTCGGTTTGGGCGCAAGGGTGTTGCTATTAACTTTGTGAAAACTGATGACATCAAGATCCTGAGAGATATTGAACAATACTACAGTACCCAGATTGATGAAATGCCCA
TGAACGTTGCGGATTTGATTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCGGTGAAGATTCGATTCGTATATGGAAAATTAGATGGGATTTTAGCCCGACCTCAGCCAGTAACCTTTTTCTTCTTTCTGAGCCTGCGATTTCATCTCCATCGGACAGT
CGTCGGTAATCATCGGAAAATCTCTCCGGCCAGTGGAAACCCTAGATCCCGGCGAACTCTATCACGGATATGGAGGCTGCAGCAATGACTAGCGTTGTGCCGGCGAATCG
ACGGCGGGCGGTTAACGCGCCGGATGAGAAGTTGGAATTCGAGACAACGGAGGGGGTTGAGCCGATATTGAGTTTCGATCAGATGGGCATCAAGGATGATCTTCTCCGTG
GCATATATGCATACGGTTTTGAAAAGCCCTCGGCCATTCAGCAGAGAGCCGTCAGGCCGATTATCGAGGGTCGAGATGTTATTGCTCAGGCTCAATCTGGAACTGGCAAG
ACCTCCATGATTGCCCTTACTGTTTGCCAGACCGTTGATACCTCCAGCAGAGAGGTACAGGCATTGATCTTGTCCCCTACAAGAGAATTGGCAACTCAAACAGAGAAAGT
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GTT
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