| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6607892.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 4.6e-54 | 88.15 | Show/hide |
Query: FRVGCLSMSKSQKPYRYSVVCEAAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGT
F GCLSMS +Q+P RYSVVCEAAP KK DSAAKRARQAEKRR YNKARKSEI+TR+KKA+EA+DDLKKKPEAQSEEVL IEKLIAEAYSVIDKAVKVGT
Subjt: FRVGCLSMSKSQKPYRYSVVCEAAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGT
Query: LHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPLAA
LHRNTAA RKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASP AA
Subjt: LHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPLAA
|
|
| XP_022139608.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic [Momordica charantia] | 1.9e-55 | 87.14 | Show/hide |
Query: ICFVHFRVGCLSMSKSQKPYRYSVVCEAAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKA
+ F F GCLSMS++Q+P RYSVVCEAAP KK DSAAKRARQAEKRR+YNKARKSEIKTR+KK LEA+DDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKA
Subjt: ICFVHFRVGCLSMSKSQKPYRYSVVCEAAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKA
Query: VKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPLAA
VKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWY PASP AA
Subjt: VKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPLAA
|
|
| XP_022941386.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic [Cucurbita moschata] | 4.6e-54 | 88.15 | Show/hide |
Query: FRVGCLSMSKSQKPYRYSVVCEAAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGT
F GCLSMS +Q+P RYSVVCEAAP KK DSAAKRARQAEKRR YNKARKSEI+TR+KKA+EA+DDLKKKPEAQSEEVL IEKLIAEAYSVIDKAVKVGT
Subjt: FRVGCLSMSKSQKPYRYSVVCEAAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGT
Query: LHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPLAA
LHRNTAA RKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASP AA
Subjt: LHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPLAA
|
|
| XP_022976587.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like [Cucurbita maxima] | 7.8e-54 | 88.15 | Show/hide |
Query: FRVGCLSMSKSQKPYRYSVVCEAAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGT
F GCLS+SK+Q+P+RYSVVCEAAP KK DSAAKRARQAEKRR+YNKARKSEIKTR+KK +EA+DDLKKKPEAQSEEVL IEKLIAEA+SVIDKAVKVGT
Subjt: FRVGCLSMSKSQKPYRYSVVCEAAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGT
Query: LHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPLAA
LHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASP AA
Subjt: LHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPLAA
|
|
| XP_022981947.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like [Cucurbita maxima] | 6.0e-54 | 87.41 | Show/hide |
Query: FRVGCLSMSKSQKPYRYSVVCEAAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGT
F GCLSMS +Q+P RYSVVCEAAP KK DSAAKRARQAEKRR YNKARKSEI+TR+KKA+EA+DDLKKKPEAQSEEVL +EKLIAEAYSVIDKAVKVGT
Subjt: FRVGCLSMSKSQKPYRYSVVCEAAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGT
Query: LHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPLAA
LHRNTAA RKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASP AA
Subjt: LHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPLAA
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A6J1CG14 30S ribosomal protein S20, chloroplastic | 9.0e-56 | 87.14 | Show/hide |
Query: ICFVHFRVGCLSMSKSQKPYRYSVVCEAAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKA
+ F F GCLSMS++Q+P RYSVVCEAAP KK DSAAKRARQAEKRR+YNKARKSEIKTR+KK LEA+DDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKA
Subjt: ICFVHFRVGCLSMSKSQKPYRYSVVCEAAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKA
Query: VKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPLAA
VKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWY PASP AA
Subjt: VKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPLAA
|
|
| A0A6J1F6F1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like | 3.8e-54 | 88.15 | Show/hide |
Query: FRVGCLSMSKSQKPYRYSVVCEAAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGT
F GCLS+SK+Q+P+RYSVVCEAAP KK DSAAKRARQAEKRR+YNKARKSEIKTR+KK +EA+DDLKKKPEAQSEEVL IEKLIAEA+SVIDKAVKVGT
Subjt: FRVGCLSMSKSQKPYRYSVVCEAAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGT
Query: LHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPLAA
LHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASP AA
Subjt: LHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPLAA
|
|
| A0A6J1FKZ1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic | 2.2e-54 | 88.15 | Show/hide |
Query: FRVGCLSMSKSQKPYRYSVVCEAAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGT
F GCLSMS +Q+P RYSVVCEAAP KK DSAAKRARQAEKRR YNKARKSEI+TR+KKA+EA+DDLKKKPEAQSEEVL IEKLIAEAYSVIDKAVKVGT
Subjt: FRVGCLSMSKSQKPYRYSVVCEAAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGT
Query: LHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPLAA
LHRNTAA RKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASP AA
Subjt: LHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPLAA
|
|
| A0A6J1IG57 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like | 3.8e-54 | 88.15 | Show/hide |
Query: FRVGCLSMSKSQKPYRYSVVCEAAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGT
F GCLS+SK+Q+P+RYSVVCEAAP KK DSAAKRARQAEKRR+YNKARKSEIKTR+KK +EA+DDLKKKPEAQSEEVL IEKLIAEA+SVIDKAVKVGT
Subjt: FRVGCLSMSKSQKPYRYSVVCEAAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGT
Query: LHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPLAA
LHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASP AA
Subjt: LHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPLAA
|
|
| A0A6J1IVC5 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like | 2.9e-54 | 87.41 | Show/hide |
Query: FRVGCLSMSKSQKPYRYSVVCEAAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGT
F GCLSMS +Q+P RYSVVCEAAP KK DSAAKRARQAEKRR YNKARKSEI+TR+KKA+EA+DDLKKKPEAQSEEVL +EKLIAEAYSVIDKAVKVGT
Subjt: FRVGCLSMSKSQKPYRYSVVCEAAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGT
Query: LHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPLAA
LHRNTAA RKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASP AA
Subjt: LHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPLAA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| B0C2C8 30S ribosomal protein S20 | 7.2e-10 | 50.56 | Show/hide |
Query: SAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKA
SA KR AE+ RL NKA KS IKT K+ A+DD K P +++ +I+ ++ YS IDKAVKVG HRNT AR+K+ LAR KA
Subjt: SAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKA
|
|
| P62661 30S ribosomal protein S20 | 1.6e-09 | 52.69 | Show/hide |
Query: KKPD---SAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARR
KKP SA KR RQ+ KRRL NKA+KS IKT KKA++ E ++EE L K++ +A S+IDKA K TLH+N AARRKSRL R+
Subjt: KKPD---SAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARR
|
|
| P80380 30S ribosomal protein S20 | 1.2e-09 | 52.69 | Show/hide |
Query: KKPD---SAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARR
KKP SA KR RQ+ KRRL NKA+KS IKT KKA++ E ++EE L K++ +A S+IDKA K TLH+N AARRKSRL R+
Subjt: KKPD---SAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARR
|
|
| P82130 30S ribosomal protein S20, chloroplastic | 6.2e-38 | 68.46 | Show/hide |
Query: FRVGCLSMSKSQKPYRYSVVCEAAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGT
F GC S+ Q+ +SVVCE A KK DSAAKR RQAE RRL NKARKSE+KTR++K EA+D LKKK A +EE++ I+ LIAEAYS IDKAV GT
Subjt: FRVGCLSMSKSQKPYRYSVVCEAAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGT
Query: LHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPA
LHRNTAARRKSRLAR KK VEIHHGWYTP+
Subjt: LHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPA
|
|
| Q9ASV6 30S ribosomal protein S20, chloroplastic | 6.0e-41 | 72 | Show/hide |
Query: QKPYRYSVVCE-AAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAARRK
QKP R +VCE AAPTKK DSAAKRARQAEKRR+YNK++KSE +TR+KK LEA++ LKKK +AQ++E++++EKLI EAYS IDKAVKV LH+NT ARRK
Subjt: QKPYRYSVVCE-AAPTKKPDSAAKRARQAEKRRLYNKARKSEIKTRIKKALEAMDDLKKKPEAQSEEVLSIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAARRK
Query: SRLARRKKAVEIHHGWYTPASPLAA
SRLARRKKAVEIHHGWY P + AA
Subjt: SRLARRKKAVEIHHGWYTPASPLAA
|
|
