; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0004118 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0004118
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionglycine-rich cell wall structural protein
Genome locationLG10:34974430..34975371
RNA-Seq ExpressionSed0004118
SyntenySed0004118
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6571715.1 hypothetical protein SDJN03_28443, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.7e-2350.24Show/hide
Query:  MTMQGGGRMGGRLGKGGKVIGGKFGRGGKVSGGTVERGGKVTGGRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGGTVERGGRVTG
        M  +GG  +GG LG+GG  +GG  GRGG+  GG + RGGKV  G ++GRGG+  GG   RGG+  GGT+GRGG   GG ++GRGGKV G  + RGG   G
Subjt:  MTMQGGGRMGGRLGKGGKVIGGKFGRGGKVSGGTVERGGKVTGGRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGGTVERGGRVTG

Query:  GRVVGRGGKVTGGTVESGGNVTGGTVGRGGKVNG--GRGGKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTVIGGTVGKGGRV----------TGGTVGREGTRIGRG
        G ++GRGG   GGT+  GG   GG +GRGGKV    GRGG+  GG +  GG   GGT+GRGG V+GG +G+GG+V           GG +GR G  IG  
Subjt:  GRVVGRGGKVTGGTVESGGNVTGGTVGRGGKVNG--GRGGKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTVIGGTVGKGGRV----------TGGTVGREGTRIGRG

Query:  VNIGRGG
          IGRGG
Subjt:  VNIGRGG

KAG7011439.1 hypothetical protein SDJN02_26344, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.8e-2348.36Show/hide
Query:  GGRMGGRLGKGGKVIGGKFGRGGKVSGGTVERGGKVTG---------GRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGGTVERGG
        GG++G  +G+GG+ IGG  GRGG   GGT+ERGG+  G         G ++GRGG+  GG   RGG+  GGT+GRGG   GG ++GRGGKV G  + RGG
Subjt:  GGRMGGRLGKGGKVIGGKFGRGGKVSGGTVERGGKVTG---------GRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGGTVERGG

Query:  RVTGGRVVGRGGKVTGGTVESGGNVTGGTVGRGGKVNG--GRGGKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTVIGGTVGKGGRV----------TGGTVGREGTR
           GG ++GRGG   GGT+  GG   GG +GRGGKV    GRGG+  GG +  GG   GGT+GRGG  IGG +G+GG+V           GG +GR G  
Subjt:  RVTGGRVVGRGGKVTGGTVESGGNVTGGTVGRGGKVNG--GRGGKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTVIGGTVGKGGRV----------TGGTVGREGTR

Query:  IGR--GVNIGRGG
        +G   G  IGRGG
Subjt:  IGR--GVNIGRGG

TYK13397.1 glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like [Cucumis melo var. makuwa]5.2e-1141.54Show/hide
Query:  QGGGRMGGRLGKGGKVIGGKFGRGGKVSGGTVERGGKVTGGRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGGTVERGGRVTGGRV
        +GG  +G  LG+ G+ +G   GRGG+  G  + RGG+   G ++GRGG   G    RGG   G  +GRGG    G ++GRGG+  G  + RGG    G +
Subjt:  QGGGRMGGRLGKGGKVIGGKFGRGGKVSGGTVERGGKVTGGRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGGTVERGGRVTGGRV

Query:  VGRGGKVTGGTVESGGNVTGGTVGRGGKVNG---GRGGKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTVIGGTVGKGGRVTGGTVGREGTRIGRGVNIGRGG
        +GRGG+  G  +  GG   G  +GRGGK  G   GRGG+  G  V  GGK  G   GRGG  +G   G+GG   G  +GR G  I  G  +GRGG
Subjt:  VGRGGKVTGGTVESGGNVTGGTVGRGGKVNG---GRGGKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTVIGGTVGKGGRVTGGTVGREGTRIGRGVNIGRGG

XP_028409946.1 hornerin-like [Dendronephthya gigantea]6.8e-1142.03Show/hide
Query:  GGGRM--GGRLGKGGKVIGGKFGRGGKV-SGGTVERGGKVTGGRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGGTVERGGRVTGG
        GGG +  GG +G GG V GG    GG V +GG++  GG V+GG + G G    GG+   GG  +GG +G GG VN G  +G G  V+GG +E GG V GG
Subjt:  GGGRM--GGRLGKGGKVIGGKFGRGGKV-SGGTVERGGKVTGGRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGGTVERGGRVTGG

Query:  RVVGRGGKVTGGTVESGGNVT-------GGTVGRGGKVNG----GRGGKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTV-IGGTVGKGGRVTGGTVGREGTRIGRGV
          +  G  V+GG +E  G+V        GG +G GG+V+G    G G    GG +  GG ++GG  G GG V  GG++  GG V+GG +   G  +  G 
Subjt:  RVVGRGGKVTGGTVESGGNVT-------GGTVGRGGKVNG----GRGGKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTV-IGGTVGKGGRVTGGTVGREGTRIGRGV

Query:  NIGRGGS
        NIG GGS
Subjt:  NIGRGGS

XP_031742894.1 glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like [Cucumis sativus]3.0e-1445.26Show/hide
Query:  MGGRLGKGGKVIGGKFGRGGKVSGGTVERGGKVTGGRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGGTVERGGRVTGGRVVGRGG
        MG  LG+GG+ +G   GRGGK  G    RGG+   G ++GRGG+  G T  RGG   G   GRGGR   G ++GRGG+  G T+ RGG+   G + GRGG
Subjt:  MGGRLGKGGKVIGGKFGRGGKVSGGTVERGGKVTGGRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGGTVERGGRVTGGRVVGRGG

Query:  KVTGGTVESGGNVTGGTVGRGGKVNG---GRGGKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTVIGGTVGKGGRVTGGTVGREGTRIGRGVNIGRGG
        +  G  +  GG   G T+GRGGK  G   GRGG+  G  +  GG+  G T+GRGG  IG   G+GG   G  VGR    +G G  +GRGG
Subjt:  KVTGGTVESGGNVTGGTVGRGGKVNG---GRGGKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTVIGGTVGKGGRVTGGTVGREGTRIGRGVNIGRGG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KHS4 Pollen coat oleosin-glycine rich protein2.9e-1545.13Show/hide
Query:  QGGGRMGGRLGKGGKVIGGKFGRGGKVSGGTVERGGKVTGGRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGGTVERGGRVTGGRV
        +GG  MG  LG+GG+ +G   GRGGK  G    RGG+   G ++GRGG+  G T  RGG   G   GRGGR   G ++GRGG+  G T+ RGG+   G +
Subjt:  QGGGRMGGRLGKGGKVIGGKFGRGGKVSGGTVERGGKVTGGRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGGTVERGGRVTGGRV

Query:  VGRGGKVTGGTVESGGNVTGGTVGRGGKVNG---GRGGKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTVIGGTVGKGGRVTGGTVGREGTRIGRGVNIGRGG
         GRGG+  G  +  GG   G T+GRGGK  G   GRGG+  G  +  GG+  G T+GRGG  IG   G+GGR  G  +GR G  +G    +GRGG
Subjt:  VGRGGKVTGGTVESGGNVTGGTVGRGGKVNG---GRGGKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTVIGGTVGKGGRVTGGTVGREGTRIGRGVNIGRGG

A0A1I9LMI8 Transmembrane protein5.3e-0945.03Show/hide
Query:  GGRMGGRLGKGGKVIGGKFGRGGKVSGGTVERGGKVTGGRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGGTVERGGRVTGGRVVG
        GG +GG +GKGG V GG FG+GG V GG + +GG + GG  +G+GG + GG  + GG   GG +G+GG + GG  +G+GG + GG + +GG + GG   G
Subjt:  GGRMGGRLGKGGKVIGGKFGRGGKVSGGTVERGGKVTGGRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGGTVERGGRVTGGRVVG

Query:  RGGKVTGGTVESGGNVTGGTVGRGGKVNGGRG-GKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTVIGGTVGKGGRVTGGTVGREGTRIGRGVNIGRGG
        +GG + GG  + GG   GG  G+GG + GG G G G GG    GG + GG  G GG   GG  GKGG + GG +G+ G   G G   G+GG
Subjt:  RGGKVTGGTVESGGNVTGGTVGRGGKVNGGRG-GKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTVIGGTVGKGGRVTGGTVGREGTRIGRGVNIGRGG

A0A1S3V0K5 glycine-rich cell wall structural protein isoform X15.3e-0946.43Show/hide
Query:  GGRMGGRLGKGGKV---IGGKFGRGGKVSGGTVERGGKVTGGRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGGTVERGGRVTGGR
        GG  GG  GKGG +    GG FG+GG V GG + +GG + GG   G+GG V GG  + GG   GG +G+GG + GG   G+GG V GG + +GG + GG 
Subjt:  GGRMGGRLGKGGKV---IGGKFGRGGKVSGGTVERGGKVTGGRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGGTVERGGRVTGGR

Query:  VVGRGGKVTGGTVESGGNVTGGTVGRGGKVNGG---RGGKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTVIGGTVGKGGRVTGGTVGREGTRIGRGVNIGRGG
          G+GG V GG  + GG   GG  G+GG V GG    GG G GG    GG + GG +G+GG V GG +GKGG + GG    +G  IG G  IG+GG
Subjt:  VVGRGGKVTGGTVESGGNVTGGTVGRGGKVNGG---RGGKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTVIGGTVGKGGRVTGGTVGREGTRIGRGVNIGRGG

A0A3N4LC35 Uncharacterized protein1.2e-0851.91Show/hide
Query:  GGGRMGGRLGKGGKVIGGKFGRGGKVSGGTVERGGKVTGGRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGGTVERGGRVTGGRVV
        GG  +GG    GG +  GK GR GKV GG V  GGKV+GG+V   GGKV+      GG V GG VGR G+V+ G+    GGKV GG V  GG+V GG+V 
Subjt:  GGGRMGGRLGKGGKVIGGKFGRGGKVSGGTVERGGKVTGGRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGGTVERGGRVTGGRVV

Query:  GRGGKVTGGTVESGGNVTGGTVGRGGKVNGGR-GGKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTVIGGTVGKG----GRVTGGTVGREG
          GGKV GG V+ GG V GG VG GGKVNGG+ GG   GG    GGK+ GG VGR G + GG +G+G    G   GGT+ R G
Subjt:  GRGGKVTGGTVESGGNVTGGTVGRGGKVNGGR-GGKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTVIGGTVGKG----GRVTGGTVGREG

A0A5D3CNE0 Glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like2.5e-1141.54Show/hide
Query:  QGGGRMGGRLGKGGKVIGGKFGRGGKVSGGTVERGGKVTGGRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGGTVERGGRVTGGRV
        +GG  +G  LG+ G+ +G   GRGG+  G  + RGG+   G ++GRGG   G    RGG   G  +GRGG    G ++GRGG+  G  + RGG    G +
Subjt:  QGGGRMGGRLGKGGKVIGGKFGRGGKVSGGTVERGGKVTGGRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGGTVERGGRVTGGRV

Query:  VGRGGKVTGGTVESGGNVTGGTVGRGGKVNG---GRGGKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTVIGGTVGKGGRVTGGTVGREGTRIGRGVNIGRGG
        +GRGG+  G  +  GG   G  +GRGGK  G   GRGG+  G  V  GGK  G   GRGG  +G   G+GG   G  +GR G  I  G  +GRGG
Subjt:  VGRGGKVTGGTVESGGNVTGGTVGRGGKVNG---GRGGKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTVIGGTVGKGGRVTGGTVGREGTRIGRGVNIGRGG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G23450.1 unknown protein6.6e-1243.98Show/hide
Query:  GGRMGGRLGKGGKVIGGKFGRGGKVSGGTVERGGKVTGGRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGGTVERGGRVTGGRVVG
        GG +GG +GKGG  IGG  G+GG + GG + +GG + GG  +G+GG + GG  + GG   GG +G+GG + GG  +G+GG + GG + +GG + GG   G
Subjt:  GGRMGGRLGKGGKVIGGKFGRGGKVSGGTVERGGKVTGGRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGGTVERGGRVTGGRVVG

Query:  RGGKVTGGTVESGGNVTGGTVGRGGKVNGGRG-GKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTVIGGTVGKGGRVTGGTVGREGTRIGRGVNIGRGG
        +GG + GG  + GG   GG  G+GG + GG G G G GG    GG + GG  G GG   GG  GKGG + GG +G+ G   G G   G+GG
Subjt:  RGGKVTGGTVESGGNVTGGTVGRGGKVNGGRG-GKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTVIGGTVGKGGRVTGGTVGREGTRIGRGVNIGRGG

AT4G01985.1 unknown protein3.7e-0742.71Show/hide
Query:  GGGRMGGRLGKGGKVIGGKFGRGGKVSGGTVERGGKVTGGRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGG-TVERGGRVTGGRV
        GGG +GG     G   GG  G     +GG+V  GG V GG   G GG V GG     G   GG VG G    GG  VG GG+ +GG +    G  +GG  
Subjt:  GGGRMGGRLGKGGKVIGGKFGRGGKVSGGTVERGGKVTGGRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGG-TVERGGRVTGGRV

Query:  VGRGGKVTGGTVESGGNVTGGTVGRGGKVNGGRGGKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTVIGGTVGKGGRVTGGTVGREGTRIGRGVNIGRGG
         G  G  +GG   +GG   GG+VG GG V GG GG   GG   + G   GG VG GG   GG+VG GGR +GG  G  G  +G G  +G GG
Subjt:  VGRGGKVTGGTVESGGNVTGGTVGRGGKVNGGRGGKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTVIGGTVGKGGRVTGGTVGREGTRIGRGVNIGRGG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACCATGCAAGGTGGTGGAAGAATGGGAGGAAGACTAGGCAAAGGAGGTAAAGTGATTGGTGGAAAATTTGGAAGAGGGGGCAAAGTGAGTGGTGGAACAGTGGAAAG
AGGGGGCAAGGTAACTGGTGGAAGAGTTGTTGGAAGAGGAGGTAAAGTGACTGGTGGAACAGCTGAAAGGGGTGGCAATGTTACTGGTGGAACAGTGGGAAGAGGAGGCA
GAGTGAATGGTGGAAGAGTTGTTGGAAGAGGAGGTAAAGTGACTGGTGGAACAGTGGAAAGAGGGGGTAGGGTAACTGGTGGAAGAGTTGTTGGAAGAGGAGGTAAAGTG
ACTGGTGGAACAGTGGAAAGCGGCGGCAACGTGACTGGAGGAACAGTGGGAAGAGGAGGCAAAGTGAATGGTGGAAGAGGAGGTAAAGGGACTGGTGGAACAGTTGCAAG
TGGCGGCAAGATGACTGGTGGAACAGTTGGAAGAGGAGGCACGGTGATTGGTGGAACAGTGGGAAAAGGCGGTAGGGTGACTGGTGGAACAGTGGGAAGAGAAGGGACTC
GAATAGGAAGAGGTGTTAATATTGGGAGAGGAGGGAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATATATATATATATATATATATATATATATATAATACTTTTGATGATGGAGGAGAGGCTAAGCAATGACCATGCAAGGTGGTGGAAGAATGGGAGGAAGACTAGGCAAAG
GAGGTAAAGTGATTGGTGGAAAATTTGGAAGAGGGGGCAAAGTGAGTGGTGGAACAGTGGAAAGAGGGGGCAAGGTAACTGGTGGAAGAGTTGTTGGAAGAGGAGGTAAA
GTGACTGGTGGAACAGCTGAAAGGGGTGGCAATGTTACTGGTGGAACAGTGGGAAGAGGAGGCAGAGTGAATGGTGGAAGAGTTGTTGGAAGAGGAGGTAAAGTGACTGG
TGGAACAGTGGAAAGAGGGGGTAGGGTAACTGGTGGAAGAGTTGTTGGAAGAGGAGGTAAAGTGACTGGTGGAACAGTGGAAAGCGGCGGCAACGTGACTGGAGGAACAG
TGGGAAGAGGAGGCAAAGTGAATGGTGGAAGAGGAGGTAAAGGGACTGGTGGAACAGTTGCAAGTGGCGGCAAGATGACTGGTGGAACAGTTGGAAGAGGAGGCACGGTG
ATTGGTGGAACAGTGGGAAAAGGCGGTAGGGTGACTGGTGGAACAGTGGGAAGAGAAGGGACTCGAATAGGAAGAGGTGTTAATATTGGGAGAGGAGGGAGTTGAATTGG
TGGTGTTAATATTGGGAGAGGGGGGAGCCGAATTGGTGGTGGTAATATTGGAAGAGGGGGGAGCCGAATTGGTGGTGGTAATATTGGGAGAGGGGGGAGCCGAATTGGTG
GTGGTAATATTGGAAGAGGGGGGAGTCGAATTGGTGGTGATAATGTTGGGAGAGGAGGGAGTGGAATATTTAGAAATTTGGAAATAATTTTAGGGAAAGAAAGCTTTTGA
TCATGATTGATTTGTTGGAGATGGCGAGCCTCATTGGGAGCAATGCTTAAAGTCACAAACAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTMQGGGRMGGRLGKGGKVIGGKFGRGGKVSGGTVERGGKVTGGRVVGRGGKVTGGTAERGGNVTGGTVGRGGRVNGGRVVGRGGKVTGGTVERGGRVTGGRVVGRGGKV
TGGTVESGGNVTGGTVGRGGKVNGGRGGKGTGGTVASGGKMTGGTVGRGGTVIGGTVGKGGRVTGGTVGREGTRIGRGVNIGRGGS