| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAE8647621.1 hypothetical protein Csa_003197 [Cucumis sativus] | 6.7e-99 | 81.15 | Show/hide |
Query: MADSHRPRYSRTPSPLRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
MAD HR RYSR+PSP +APSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPR +RGRSRSRS GRE+A NPG+TLYVTGLSTRVTE DLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADSHRPRYSRTPSPLRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRYGGGSFRNDYGYRRSPR
RTRISRGFAF+TM N DDA++CVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLK+TRDSGY RGG+RG +R R GGGSFR DYGYRRSPR
Subjt: RTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRYGGGSFRNDYGYRRSPR
Query: RSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPY-GGRSRRDHSRS-PPYSP--YGSPDRRYPRGTR
RSPYRG+ +EYSPRHSPPY GGRSRRDHSRS PPYSP GSPDRRYPRG+R
Subjt: RSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPY-GGRSRRDHSRS-PPYSP--YGSPDRRYPRGTR
|
|
| XP_022926991.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like [Cucurbita moschata] | 4.3e-98 | 79.69 | Show/hide |
Query: MADSHRPRYSRTPSPLRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
MADSHR RYSR+PSP RAP SRSRSRPRSRSRSWSRPR Q+RGRSRSRS GRENALNPG+TLYVTGLS RVTE DLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADSHRPRYSRTPSPLRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRYGGGSFRNDYGYRRSPR
RTRISRGFAF+ M N DDA++ VKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLK TRDSGY D RGRY GGS R+DYGYRR
Subjt: RTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRYGGGSFRNDYGYRRSPR
Query: RSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSPYGSPDRRYPRGTR
SPRRSPYRGP+EYSPRHSP YGGRSRRDHSRSPPYSPYGSPDRRYPRG+R
Subjt: RSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSPYGSPDRRYPRGTR
|
|
| XP_023003930.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like [Cucurbita maxima] | 5.5e-101 | 80.86 | Show/hide |
Query: MADSHRPRYSRTPSPLRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
MA SHR R+SR+PSP RAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPR Q+RGRSRSRS GRENALNPG+TLYVTGLS RVTE DLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADSHRPRYSRTPSPLRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRYGGGSFRNDYGYRRSPR
RTRISRGFAF+ M N DDA++CVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLK TRDSGY D RGRY GGS R+DYGYRRSPR
Subjt: RTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRYGGGSFRNDYGYRRSPR
Query: RSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSPYGSPDRRYPRGTR
RSPYRG+ +EYSPRHSP YGGRSRRDHSRSPPYSPYGSPD RYPRG+R
Subjt: RSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSPYGSPDRRYPRGTR
|
|
| XP_031743118.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Cucumis sativus] | 6.7e-99 | 81.15 | Show/hide |
Query: MADSHRPRYSRTPSPLRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
MAD HR RYSR+PSP +APSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPR +RGRSRSRS GRE+A NPG+TLYVTGLSTRVTE DLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADSHRPRYSRTPSPLRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRYGGGSFRNDYGYRRSPR
RTRISRGFAF+TM N DDA++CVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLK+TRDSGY RGG+RG +R R GGGSFR DYGYRRSPR
Subjt: RTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRYGGGSFRNDYGYRRSPR
Query: RSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPY-GGRSRRDHSRS-PPYSP--YGSPDRRYPRGTR
RSPYRG+ +EYSPRHSPPY GGRSRRDHSRS PPYSP GSPDRRYPRG+R
Subjt: RSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPY-GGRSRRDHSRS-PPYSP--YGSPDRRYPRGTR
|
|
| XP_038881911.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Benincasa hispida] | 3.0e-99 | 80 | Show/hide |
Query: MADSHRPRYSRTPSPLRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
MADSHR RYSR+PSP RAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPR +RGRSRSRS GR++A NPG+TLYVTGLSTRVTE DLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADSHRPRYSRTPSPLRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRY-GGGSFRNDYGYRRSP
RTRISRGFAF+TM N DDA++CVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLK+TRD+GY GDRG RY GGGSFR+DYGYRRSP
Subjt: RTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRY-GGGSFRNDYGYRRSP
Query: RRSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSP---YGSPDRRYPRGTR
RRSPYRG+ SP PRHSPPYGGRSRRDHSRSPPY+P GSPDRRYPRG+R
Subjt: RRSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSP---YGSPDRRYPRGTR
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0KMM4 RRM domain-containing protein | 3.2e-99 | 81.15 | Show/hide |
Query: MADSHRPRYSRTPSPLRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
MAD HR RYSR+PSP +APSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPR +RGRSRSRS GRE+A NPG+TLYVTGLSTRVTE DLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADSHRPRYSRTPSPLRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRYGGGSFRNDYGYRRSPR
RTRISRGFAF+TM N DDA++CVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLK+TRDSGY RGG+RG +R R GGGSFR DYGYRRSPR
Subjt: RTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRYGGGSFRNDYGYRRSPR
Query: RSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPY-GGRSRRDHSRS-PPYSP--YGSPDRRYPRGTR
RSPYRG+ +EYSPRHSPPY GGRSRRDHSRS PPYSP GSPDRRYPRG+R
Subjt: RSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPY-GGRSRRDHSRS-PPYSP--YGSPDRRYPRGTR
|
|
| A0A1S4DTT1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 7.9e-98 | 79.69 | Show/hide |
Query: MADSHRPRYSRTPSPLRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
MAD HR RYSR+PSP RAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPR +RGRSRSRS GR++A NPG+TLYVTGLSTRVTE DLE+HFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADSHRPRYSRTPSPLRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRY-GGGSFRNDYGYRRSP
RTRISRGFAF+TM N DDA++CVKHLNQS+LEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLK+TRDSGY GDRG RY GGGSFR DYGYRRSP
Subjt: RTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRY-GGGSFRNDYGYRRSP
Query: RRSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPY-GGRSRRDHSRS-PPYSP--YGSPDRRYPRGTR
RRSPYRG+ +EYSPRHSPPY GGRSRRDHSRS PPYSP GSPDRRYPRG+R
Subjt: RRSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPY-GGRSRRDHSRS-PPYSP--YGSPDRRYPRGTR
|
|
| A0A6J1BUT3 serine/arginine-rich splicing factor SR45a isoform X1 | 1.8e-97 | 80.23 | Show/hide |
Query: MADSHRPRYSRTPSPLRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
MADSHR RYSR+PSP RAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPR ++RGRSRSRS GR++ALN G+TLYVTGLSTRVTE DLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADSHRPRYSRTPSPLRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRYGGGSFRNDYGYRRSPR
RTRISRGFAF+TM N DDA++CVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLK+TRDSGY GDRGG G GGGSFR DYGYRRSPR
Subjt: RTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRYGGGSFRNDYGYRRSPR
Query: RSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYS-PYGSPDRRY-PRGTR
RSPYRG+ +EY SPPYGGRSRR+HSRSPPYS PYGSPDRRY PRG R
Subjt: RSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYS-PYGSPDRRY-PRGTR
|
|
| A0A6J1EGF8 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like | 2.1e-98 | 79.69 | Show/hide |
Query: MADSHRPRYSRTPSPLRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
MADSHR RYSR+PSP RAP SRSRSRPRSRSRSWSRPR Q+RGRSRSRS GRENALNPG+TLYVTGLS RVTE DLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADSHRPRYSRTPSPLRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRYGGGSFRNDYGYRRSPR
RTRISRGFAF+ M N DDA++ VKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLK TRDSGY D RGRY GGS R+DYGYRR
Subjt: RTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRYGGGSFRNDYGYRRSPR
Query: RSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSPYGSPDRRYPRGTR
SPRRSPYRGP+EYSPRHSP YGGRSRRDHSRSPPYSPYGSPDRRYPRG+R
Subjt: RSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSPYGSPDRRYPRGTR
|
|
| A0A6J1KT61 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like | 2.6e-101 | 80.86 | Show/hide |
Query: MADSHRPRYSRTPSPLRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
MA SHR R+SR+PSP RAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPR Q+RGRSRSRS GRENALNPG+TLYVTGLS RVTE DLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADSHRPRYSRTPSPLRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRYGGGSFRNDYGYRRSPR
RTRISRGFAF+ M N DDA++CVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLK TRDSGY D RGRY GGS R+DYGYRRSPR
Subjt: RTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRYGGGSFRNDYGYRRSPR
Query: RSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSPYGSPDRRYPRGTR
RSPYRG+ +EYSPRHSP YGGRSRRDHSRSPPYSPYGSPD RYPRG+R
Subjt: RSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSPYGSPDRRYPRGTR
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P62995 Transformer-2 protein homolog beta | 1.5e-16 | 40.44 | Show/hide |
Query: DSHRPR-YSRTPSPLRAPSR-------SRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRS------RSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKE
DS R R SR+ S R+ SR +RSRSRSRS RSRSRS+SR + S R R G +P L V GLS TE DL E FSK
Subjt: DSHRPR-YSRTPSPLRAPSR-------SRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRS------RSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKE
Query: GKVASCFLVVEPRTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKT---TRDSGYLGDRGGDRG------GNRGG
G +A +V + ++R SRGFAF+ N DDA + + N L+GR I V+ S KRP TPTPG Y+G T +R Y DRG DRG +R
Subjt: GKVASCFLVVEPRTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKT---TRDSGYLGDRGGDRG------GNRGG
Query: NRGRYGGGSFRNDYGYRRSPRRSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSPYGSPDRRY
G GGG +R R YR RRSP SP Y R SRS YSP RRY
Subjt: NRGRYGGGSFRNDYGYRRSPRRSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSPYGSPDRRY
|
|
| P62996 Transformer-2 protein homolog beta | 1.5e-16 | 40.44 | Show/hide |
Query: DSHRPR-YSRTPSPLRAPSR-------SRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRS------RSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKE
DS R R SR+ S R+ SR +RSRSRSRS RSRSRS+SR + S R R G +P L V GLS TE DL E FSK
Subjt: DSHRPR-YSRTPSPLRAPSR-------SRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRS------RSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKE
Query: GKVASCFLVVEPRTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKT---TRDSGYLGDRGGDRG------GNRGG
G +A +V + ++R SRGFAF+ N DDA + + N L+GR I V+ S KRP TPTPG Y+G T +R Y DRG DRG +R
Subjt: GKVASCFLVVEPRTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKT---TRDSGYLGDRGGDRG------GNRGG
Query: NRGRYGGGSFRNDYGYRRSPRRSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSPYGSPDRRY
G GGG +R R YR RRSP SP Y R SRS YSP RRY
Subjt: NRGRYGGGSFRNDYGYRRSPRRSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSPYGSPDRRY
|
|
| P62997 Transformer-2 protein homolog beta | 1.5e-16 | 40.44 | Show/hide |
Query: DSHRPR-YSRTPSPLRAPSR-------SRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRS------RSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKE
DS R R SR+ S R+ SR +RSRSRSRS RSRSRS+SR + S R R G +P L V GLS TE DL E FSK
Subjt: DSHRPR-YSRTPSPLRAPSR-------SRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRS------RSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKE
Query: GKVASCFLVVEPRTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKT---TRDSGYLGDRGGDRG------GNRGG
G +A +V + ++R SRGFAF+ N DDA + + N L+GR I V+ S KRP TPTPG Y+G T +R Y DRG DRG +R
Subjt: GKVASCFLVVEPRTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKT---TRDSGYLGDRGGDRG------GNRGG
Query: NRGRYGGGSFRNDYGYRRSPRRSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSPYGSPDRRY
G GGG +R R YR RRSP SP Y R SRS YSP RRY
Subjt: NRGRYGGGSFRNDYGYRRSPRRSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSPYGSPDRRY
|
|
| Q3ZBT6 Transformer-2 protein homolog beta | 1.5e-16 | 40.44 | Show/hide |
Query: DSHRPR-YSRTPSPLRAPSR-------SRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRS------RSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKE
DS R R SR+ S R+ SR +RSRSRSRS RSRSRS+SR + S R R G +P L V GLS TE DL E FSK
Subjt: DSHRPR-YSRTPSPLRAPSR-------SRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRS------RSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKE
Query: GKVASCFLVVEPRTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKT---TRDSGYLGDRGGDRG------GNRGG
G +A +V + ++R SRGFAF+ N DDA + + N L+GR I V+ S KRP TPTPG Y+G T +R Y DRG DRG +R
Subjt: GKVASCFLVVEPRTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKT---TRDSGYLGDRGGDRG------GNRGG
Query: NRGRYGGGSFRNDYGYRRSPRRSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSPYGSPDRRY
G GGG +R R YR RRSP SP Y R SRS YSP RRY
Subjt: NRGRYGGGSFRNDYGYRRSPRRSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSPYGSPDRRY
|
|
| Q84TH4 Serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 5.2e-30 | 44.27 | Show/hide |
Query: PLRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRSRSRSPGR---ENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFI
PLR +RS RSR + + R ++ RS SRSP R +A NPG++LYVTGLS RVTE DLE+HF+KEGKV LV++P TR SRGF FI
Subjt: PLRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRPQNRGRSRSRSPGR---ENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFI
Query: TMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTR----DSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRYGGGSFRNDYGYR-RSPRRSPYRG
+M + DA++C++ L+ S+L+GR ITVEK+RR+R RTPTPG YLGL+T R Y R +R + G S+ YG R RS SP+
Subjt: TMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTR----DSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRYGGGSFRNDYGYR-RSPRRSPYRG
Query: SPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSPY---GSPDRRYPRGTR
YR + YSP SP R R RS YSPY R Y R R
Subjt: SPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSPY---GSPDRRYPRGTR
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT4G35785.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.1e-58 | 61.66 | Show/hide |
Query: MADS-HRPRYSRTPSPL--RAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRP----QNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVAS
MADS R R SR+PSP RA SRSRSRSRSRSRPR RSRS S PRP ++RGRSRSRS G E NPG TLYVTGLSTRVT+ DLE HF+KEGKVAS
Subjt: MADS-HRPRYSRTPSPL--RAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRP----QNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVAS
Query: CFLVVEPRTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRYGGGSFRNDY
CFLV+EPRTR+SRGFAF+TM + DA +C+K+LNQS+LEGRYITVE+SRRKRPRTPTPGHYLGLK++RDS DR G +RGR+ R+DY
Subjt: CFLVVEPRTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRYGGGSFRNDY
Query: GYRRSPRRSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSPYGS
RRSPRR RRS R + YSP P RR Y P GS
Subjt: GYRRSPRRSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSPYGS
|
|
| AT4G35785.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 6.5e-60 | 61.66 | Show/hide |
Query: MADS-HRPRYSRTPSPL--RAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRP----QNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVAS
MADS R R SR+PSP RA SRSRSRSRSRSRPR RSRS S PRP ++RGRSRSRS GR NPG TLYVTGLSTRVT+ DLE HF+KEGKVAS
Subjt: MADS-HRPRYSRTPSPL--RAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRP----QNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVAS
Query: CFLVVEPRTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRYGGGSFRNDY
CFLV+EPRTR+SRGFAF+TM + DA +C+K+LNQS+LEGRYITVE+SRRKRPRTPTPGHYLGLK++RDS DR G +RGR+ R+DY
Subjt: CFLVVEPRTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKTTRDSGYLGDRGGDRGGNRGGNRGRYGGGSFRNDY
Query: GYRRSPRRSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSPYGS
RRSPRR RRS R + YSP P RR Y P GS
Subjt: GYRRSPRRSPYRGSPRRSPYRGPQEYSPRHSPPYGGRSRRDHSRSPPYSPYGS
|
|
| AT4G35785.3 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 5.9e-45 | 72.11 | Show/hide |
Query: MADS-HRPRYSRTPSPL--RAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRP----QNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVAS
MADS R R SR+PSP RA SRSRSRSRSRSRPR RSRS S PRP ++RGRSRSRS GR NPG TLYVTGLSTRVT+ DLE HF+KEGKVAS
Subjt: MADS-HRPRYSRTPSPL--RAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRP----QNRGRSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTETDLEEHFSKEGKVAS
Query: CFLVVEPRTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEK
CFLV+EPRTR+SRGFAF+TM + DA +C+K+LNQS+LEGRYITVE+
Subjt: CFLVVEPRTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEK
|
|
| AT4G35785.4 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.0e-40 | 65.43 | Show/hide |
Query: MADS-HRPRYSRTPSPL--RAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRP----QNRG---------------RSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTE
MADS R R SR+PSP RA SRSRSRSRSRSRPR RSRS S PRP ++RG RSRSRS G E NPG TLYVTGLSTRVT+
Subjt: MADS-HRPRYSRTPSPL--RAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRP----QNRG---------------RSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTE
Query: TDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEK
DLE HF+KEGKVASCFLV+EPRTR+SRGFAF+TM + DA +C+K+LNQS+LEGRYITVE+
Subjt: TDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEK
|
|
| AT4G35785.5 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.0e-40 | 65.43 | Show/hide |
Query: MADS-HRPRYSRTPSPL--RAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRP----QNRG---------------RSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTE
MADS R R SR+PSP RA SRSRSRSRSRSRPR RSRS S PRP ++RG RSRSRS G E NPG TLYVTGLSTRVT+
Subjt: MADS-HRPRYSRTPSPL--RAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRP----QNRG---------------RSRSRSPGRENALNPGDTLYVTGLSTRVTE
Query: TDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEK
DLE HF+KEGKVASCFLV+EPRTR+SRGFAF+TM + DA +C+K+LNQS+LEGRYITVE+
Subjt: TDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFITMGNDDDASQCVKHLNQSILEGRYITVEK
|
|
