; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0004635 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0004635
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionRAB GTPase homolog A2B
Genome locationLG11:35620623..35622581
RNA-Seq ExpressionSed0004635
SyntenySed0004635
Gene Ontology termsGO:0005768 - endosome (cellular component)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7033328.1 Ras-related protein Rab2BV, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.9e-11398.15Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQ+LAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPG+PHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANPSANYNKRTCCSN
        VAN S NYNKRTCCSN
Subjt:  VANPSANYNKRTCCSN

XP_022938534.1 ras-related protein Rab2BV-like [Cucurbita moschata]1.5e-11298.15Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQ+LAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANPSANYNKRTCCSN
        VAN S NYNKR+CCSN
Subjt:  VANPSANYNKRTCCSN

XP_022962630.1 ras-related protein Rab2BV-like [Cucurbita moschata]8.9e-11398.15Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQ+LAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPG+PHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANPSANYNKRTCCSN
        VAN S NYNKRTCCSN
Subjt:  VANPSANYNKRTCCSN

XP_022990563.1 ras-related protein Rab2BV-like [Cucurbita maxima]8.9e-11398.15Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQ+LAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPG+PHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANPSANYNKRTCCSN
        VAN S NYNKRTCCSN
Subjt:  VANPSANYNKRTCCSN

XP_038884346.1 ras-related protein Rab2BV-like [Benincasa hispida]1.5e-11298.15Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAA+TPGLPHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANPSANYNKRTCCSN
        VAN S NYNKR+CCSN
Subjt:  VANPSANYNKRTCCSN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1C222 ras-related protein Rab2BV-like7.3e-11398.15Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQ+LAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANPSANYNKRTCCSN
        VAN S NYNKR+CCSN
Subjt:  VANPSANYNKRTCCSN

A0A6J1FEC9 ras-related protein Rab2BV-like7.3e-11398.15Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQ+LAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANPSANYNKRTCCSN
        VAN S NYNKR+CCSN
Subjt:  VANPSANYNKRTCCSN

A0A6J1HFM9 ras-related protein Rab2BV-like4.3e-11398.15Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQ+LAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPG+PHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANPSANYNKRTCCSN
        VAN S NYNKRTCCSN
Subjt:  VANPSANYNKRTCCSN

A0A6J1JTM8 ras-related protein Rab2BV-like4.3e-11398.15Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQ+LAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPG+PHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANPSANYNKRTCCSN
        VAN S NYNKRTCCSN
Subjt:  VANPSANYNKRTCCSN

A0A6J1K193 ras-related protein Rab2BV-like1.3e-11297.69Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQ+LAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPG+PHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANPSANYNKRTCCSN
        VAN S NYNKR+CCSN
Subjt:  VANPSANYNKRTCCSN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q39434 Ras-related protein Rab2BV2.4e-10089.35Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MA +VDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST-PGLPHGTTI
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNK+DL HLRAVS ED Q LAEKEGLSFLETSALEA+N+EKAFQTIL +IYHIISKKALAAQEA+S  PG   GTTI
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST-PGLPHGTTI

Query:  NVANPSANYNKRTCCS
        NVA+ SAN  +R+CCS
Subjt:  NVANPSANYNKRTCCS

Q40193 Ras-related protein Rab11C5.8e-9986.57Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MA++VDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLP-HGTTI
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNK+DLNHLRAVS +D   L+EKEGLSFLETSALEA N+EKAFQTIL +IYHI+SKKALAAQEA +   +P  GTTI
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLP-HGTTI

Query:  NVANPSANYNKRTCCS
        NVA+ S N  K+ CCS
Subjt:  NVANPSANYNKRTCCS

Q40523 Ras-related protein Rab11A4.9e-9886.57Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MA +VDHEYDYLFK+VLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALL YDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLP-HGTTI
        DNVQRWLRELRDH DSNIVI++AGNK+DL HLRAVS +D Q L +KEGLSFLETSALEALNV+KAFQTIL DIYHIISKKALAAQEAA++  LP  GTTI
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLP-HGTTI

Query:  NVANPSANYNKRTCCS
        NV++ SAN  KR CCS
Subjt:  NVANPSANYNKRTCCS

Q96283 Ras-related protein RABA2c3.9e-9584.55Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        M ++VD EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRT QVEGKT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST----PGLPHG
        DNV RWLRELRDHADSNIVIMMAGNK+DLNHLR+V+ ED Q LAEKEGLSFLETSALEA NVEKAFQTIL +IYHIISKKALAAQEAA+     PG   G
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST----PGLPHG

Query:  TTINVANPSANYNKRTCCSN
        TTINV + S    KR CCS+
Subjt:  TTINVANPSANYNKRTCCSN

Q9LNW1 Ras-related protein RABA2b4.6e-9685.19Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MA ++DHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAA-STPGLPHGTTI
        +NV RWLRELRDHADSNIVIMMAGNK+DLNHLR+V+ ED + LAEKEGLSFLETSALEA N+EKAFQTIL +IYHIISKKALAAQEAA + PG   GT I
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAA-STPGLPHGTTI

Query:  NVANPSANYNKRTCCS
        N+++ SA  N++ CCS
Subjt:  NVANPSANYNKRTCCS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07410.1 RAB GTPase homolog A2B3.3e-9785.19Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MA ++DHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAA-STPGLPHGTTI
        +NV RWLRELRDHADSNIVIMMAGNK+DLNHLR+V+ ED + LAEKEGLSFLETSALEA N+EKAFQTIL +IYHIISKKALAAQEAA + PG   GT I
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAA-STPGLPHGTTI

Query:  NVANPSANYNKRTCCS
        N+++ SA  N++ CCS
Subjt:  NVANPSANYNKRTCCS

AT1G09630.1 RAB GTPase 11C1.1e-8975.46Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MA + D EYDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        +NV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK DL HLRAV+ EDAQ  AEKEGLSF+ETSALEALNVEKAFQTIL ++Y IISKK++++ +  +   +  G TI+
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANPSANYNKRTCCSN
        VA  S +  K+ CCS+
Subjt:  VANPSANYNKRTCCSN

AT3G46830.1 RAB GTPase homolog A2C2.8e-9684.55Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        M ++VD EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRT QVEGKT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST----PGLPHG
        DNV RWLRELRDHADSNIVIMMAGNK+DLNHLR+V+ ED Q LAEKEGLSFLETSALEA NVEKAFQTIL +IYHIISKKALAAQEAA+     PG   G
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST----PGLPHG

Query:  TTINVANPSANYNKRTCCSN
        TTINV + S    KR CCS+
Subjt:  TTINVANPSANYNKRTCCSN

AT5G59150.1 RAB GTPase homolog A2D2.8e-9684.47Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MA++V+ +YDYLFKIVLIGDSGVGK+NILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST----PGLPHG
        DNV RWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLR+V+ ED Q LAE EGLSFLETSALEA NVEKAFQT+L +IYHIISKKALAAQEAA+     PG   G
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST----PGLPHG

Query:  TTINVANPSANYNKRTCCS
        TTINV + S    KR CCS
Subjt:  TTINVANPSANYNKRTCCS

AT5G60860.1 RAB GTPase homolog A1F2.6e-7868.2Show/hide
Query:  AYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTFD
        AY+ D EYDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEF LESKSTIGVEFATR++ V+ K VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+T+  TF+
Subjt:  AYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTFD

Query:  NVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTINV
        NV+RWL+ELRDH D+NIVIM  GNKADL HLRAVS EDA+  AE+E   F+ETSALE++NVE AF  +L  IY ++S+KAL   +      LP G TINV
Subjt:  NVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTINV

Query:  ANPS--ANYNKRTCCSN
         +    +   K  CCSN
Subjt:  ANPS--ANYNKRTCCSN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTACAAGGTCGATCATGAATACGATTATCTCTTCAAGATCGTTTTGATCGGTGATTCCGGCGTTGGAAAGTCCAATATTCTCTCCAGGTTTACGCGTAACGAGTT
CTGTTTGGAGTCCAAATCCACAATCGGAGTCGAATTCGCTACCAGGACTTTGCAGGTAGAGGGGAAGACAGTGAAGGCTCAAATATGGGACACAGCAGGGCAAGAGAGAT
ACCGAGCCATTACCAGTGCATATTACAGGGGAGCAGTGGGTGCACTTTTGGTATATGATATTACCAAGAGACAAACCTTTGACAATGTTCAAAGATGGCTACGCGAACTG
AGAGACCATGCCGATTCCAACATTGTGATCATGATGGCTGGAAACAAGGCTGATCTGAACCATCTTCGGGCAGTTTCCGCCGAAGATGCTCAGCTTTTGGCAGAGAAAGA
AGGTTTGTCATTTCTAGAGACCTCAGCTTTAGAGGCCTTGAATGTTGAGAAGGCTTTTCAGACCATTTTGCTTGACATTTACCATATCATTAGCAAGAAAGCTTTGGCTG
CTCAGGAAGCAGCTTCCACCCCTGGCCTCCCTCATGGCACCACCATCAATGTGGCCAATCCATCAGCCAATTACAACAAGAGAACTTGTTGCTCTAATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAAAACAAACAAAAATCCTAATCCAATTACCACTCCCCCTTTGCCAAATTCATTCACCATTTTTCTTTATGGTGTTTAGGCTCGGAATTTGATTAGGAATTTGATCA
AATGGCTTACAAGGTCGATCATGAATACGATTATCTCTTCAAGATCGTTTTGATCGGTGATTCCGGCGTTGGAAAGTCCAATATTCTCTCCAGGTTTACGCGTAACGAGT
TCTGTTTGGAGTCCAAATCCACAATCGGAGTCGAATTCGCTACCAGGACTTTGCAGGTAGAGGGGAAGACAGTGAAGGCTCAAATATGGGACACAGCAGGGCAAGAGAGA
TACCGAGCCATTACCAGTGCATATTACAGGGGAGCAGTGGGTGCACTTTTGGTATATGATATTACCAAGAGACAAACCTTTGACAATGTTCAAAGATGGCTACGCGAACT
GAGAGACCATGCCGATTCCAACATTGTGATCATGATGGCTGGAAACAAGGCTGATCTGAACCATCTTCGGGCAGTTTCCGCCGAAGATGCTCAGCTTTTGGCAGAGAAAG
AAGGTTTGTCATTTCTAGAGACCTCAGCTTTAGAGGCCTTGAATGTTGAGAAGGCTTTTCAGACCATTTTGCTTGACATTTACCATATCATTAGCAAGAAAGCTTTGGCT
GCTCAGGAAGCAGCTTCCACCCCTGGCCTCCCTCATGGCACCACCATCAATGTGGCCAATCCATCAGCCAATTACAACAAGAGAACTTGTTGCTCTAATTGATGTTGACA
ATCATCATGATTTGAGGAAAACAAAACAAAACAAAAAGGGGGGCTGCTGGTAGAAAGTTTTAACAAGAGTTACTTTTTTTGTTGTAAAAGGTACCATGAGTAGAGAGAGA
TAACCCTTTCAATATTTTTTTTATAGATGGAAAAAAATCAGACTGCTTCTTCATTTTCTATCTGAACTTTCTGTTTGTTTATGTGGAAAATGGGAGATTTTTCATCCTGG
ATATAGCTTCGTTATTAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTFDNVQRWLREL
RDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQLLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTINVANPSANYNKRTCCSN