; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0004695 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0004695
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionRING/U-box superfamily protein
Genome locationLG13:3580591..3582708
RNA-Seq ExpressionSed0004695
SyntenySed0004695
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A6J1FSA6 E3 ubiquitin-protein ligase RNF126-like isoform X32.7e-6032.88Show/hide
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A0A6J1FWW3 uncharacterized protein LOC111447704 isoform X12.7e-6032.88Show/hide
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A0A6J1IWF5 uncharacterized protein LOC111481213 isoform X12.7e-6033.08Show/hide
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        M+QN RPRI FN GIPRTR   TVHYYWCRICRRI+RISLGN L +SI CPFCSRNLR ELDV  ARF  DPS+FL DS                     
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                                    N + N            T+SRR+IPRW+ E+D  HSLDSWITL+F           +S  EAI RV+ITE H
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        L +DSSCAICKEEFEIGGEV ELPC+HFYHSDCIVPWLRIHNTCPVCR+ LQN  A+ G        E  EE  EE D R +GWWN V  WWP RVIGD 
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        ARRL FAD+GD+   +E
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A0A6J1IZ58 uncharacterized protein LOC111481213 isoform X22.7e-6033.08Show/hide
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        M+QN RPRI FN GIPRTR   TVHYYWCRICRRI+RISLGN L +SI CPFCSRNLR ELDV  ARF  DPS+FL DS                     
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                                    N + N            T+SRR+IPRW+ E+D  HSLDSWITL+F           +S  EAI RV+ITE H
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        L +DSSCAICKEEFEIGGEV ELPC+HFYHSDCIVPWLRIHNTCPVCR+ LQN  A+ G        E  EE  EE D R +GWWN V  WWP RVIGD 
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        ARRL FAD+GD+   +E
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22197 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC1A2.6e-2040.8Show/hide
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        S I+A+P ++I +RHL   DS+C +CK+EFE+G E  ++PC H YHSDCIVPWL  HN+CPVCR   Q + + SG      R                  
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Query:  AEEDDERRDGWWNAVCCWWPLRVIG
         E  +ERR    N    +WP R  G
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Q6DIP3 E3 ubiquitin-protein ligase RNF1267.1e-1843.88Show/hide
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        G + LD+ IT    +FE++G        I+A+P ++ITE H+     C +CKE++ +G  V +LPC H +H+DCI+PWL  H+TCPVCR  L  QN A
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Q940T5 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF21.9e-1856.06Show/hide
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        S IE++PRV I++ H+  +++CA+C E FE   E  E+PCKH +H DCIVPWL I N+CPVCRF L
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Q94AK4 E3 ubiquitin-protein ligase RZF12.9e-1943.24Show/hide
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        S I+A+P ++IT++HL   DS C +CK+EFE+  E  ++PC H YHSDCIVPWL  HN+CPVCR  L +  + S       R   G     E+  RR+ +
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Query:  WNAVCCWWPLR
         N     WP R
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Q9SNB6 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF11.1e-1857.58Show/hide
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        S IE++PRV I++ H   +++CA+C E FE G E  E+PCKH +H DCIVPWL I N+CPVCRF L
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G60360.1 RING/U-box superfamily protein1.4e-2143.12Show/hide
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        I ++P V+IT +HL  D S C +C EEF +GG+  ELPCKH YH DCIVPWLR++N+CP+CR  L  +  V+         E    + ++  ERR   W 
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Query:  AVCCWWPLR
         +   WP R
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AT1G68180.1 RING/U-box superfamily protein2.1e-2546.22Show/hide
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        S IEA+  V IT+  L+++  CAICKEEFE+G E  EL C H YHS CIV WL IHNTCP+CRF +    + S  D GG  +         D++R + + 
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Query:  NAVCCWWPLRVIGDWARRL
          VC  WPLR++ DW   L
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AT2G40830.1 RING-H2 finger C1A1.9e-2140.8Show/hide
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        S I+A+P ++I +RHL   DS+C +CK+EFE+G E  ++PC H YHSDCIVPWL  HN+CPVCR   Q + + SG      R                  
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Query:  AEEDDERRDGWWNAVCCWWPLRVIG
         E  +ERR    N    +WP R  G
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AT2G40830.2 RING-H2 finger C1A1.9e-2140.8Show/hide
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        S I+A+P ++I +RHL   DS+C +CK+EFE+G E  ++PC H YHSDCIVPWL  HN+CPVCR   Q + + SG      R                  
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Query:  AEEDDERRDGWWNAVCCWWPLRVIG
         E  +ERR    N    +WP R  G
Subjt:  AEEDDERRDGWWNAVCCWWPLRVIG

AT2G40830.3 RING-H2 finger C1A1.9e-2140.8Show/hide
Query:  SGIEAIPRVRITERHL-LQDSSCAICKEEFEIGGEVMELPCKHFYHSDCIVPWLRIHNTCPVCRFRLQNIAAVSGGDGGGGR-----------DEFGEEV
        S I+A+P ++I +RHL   DS+C +CK+EFE+G E  ++PC H YHSDCIVPWL  HN+CPVCR   Q + + SG      R                  
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Query:  AEEDDERRDGWWNAVCCWWPLRVIG
         E  +ERR    N    +WP R  G
Subjt:  AEEDDERRDGWWNAVCCWWPLRVIG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCAAAACCCTAGACCTCGAATCGTCTTCAATGGCGGAATCCCCAGAACCAGAACCAGAACCACCGTCCATTACTACTGGTGCCGGATCTGCCGGAGAATCGTCCG
AATCAGCCTCGGCAACGCCCTTCACGTTTCCATCGCTTGTCCTTTCTGCTCCAGAAATCTCCGCCGTGAACTGGACGTCGCCACCGCTCGATTCGACTCCGATCCTTCCG
ATTTTCTCTCGGATTCCTCAACCACGGCTCGATTCGGCGGCGATTCTTCCACATTTCTCCCTAATTCCTCGGCTACGGCTCGATTCGGCGGCGATTCTTCCAGATTTCTC
CCAAATTCCTCAGCTAGGGCTCGCTTCGGCGGCGATTCTTCCACATTTCTCCCTAATTCCTCGGCTACGGCTCGATTCGATGGCGACTCTTCGAATTTTCGCTGGAATTC
CTCAGCTACGGCTGGATTCGACGGCGATCCTTCCAATTTTCTCCCTAATTCCTCAGCTACAACTCGATTCGACGGTGATTCTTCCGGTTTTCTACCAAATTCCTCAGCTA
GGGCTGGATTCGACGGCGATCCTTCCAATTTTCTCTTGAATTCCTCAGCCACGGCTCGATTCGGCGGTGATTCTTCCAGGTTTGTCCCAAATTCCTCAGCTAGGGCTGGA
TCCGACGGCGATTCTTCCAATTTTCTCCCAAATTCCTCAGCTACGGCTCGATTCGACGGCGATTCTTCCAATTTTCTCCAAACTTCCTCGGCTAGGGCTCGATCCGACGG
CGTTTCTTCCAATTTTCGCCCTAATTCCTCTGCTAGGGCTCGATTTGACGGCGATCCTTCTAATTTGCGCCTGAATTCCTCAACTAGGGCTCGATTCGATGGAGATTCGC
CTAATTTTCTCCCAAATTCCTCAGTTAGGGCTCGATTCGACGGCGTTTCTTTTTATTTTCCCCAAAATTCCTCAGCTAGGGCTAGATTCGACGGAGATCGTTCTAATTCT
CTCCTAAATTTCTCTCGCCTCCCTATTCCAGGTGCCGGAAACAGCACGAGTTCCCGCCGGATTATCCCGCGGTGGAGCGTCGAATCCGACGGCGATCATTCGCTGGACTC
ATGGATCACTCTCCGATTCGAGGATTCCGGCATCGAGGCGATTCCGAGGGTGAGGATTACGGAGAGGCATTTACTCCAGGATTCGAGCTGTGCGATTTGCAAAGAGGAAT
TCGAGATCGGAGGGGAAGTGATGGAGTTGCCGTGCAAACACTTTTACCATTCCGATTGTATTGTTCCTTGGCTGAGAATCCATAACACTTGCCCTGTTTGCCGGTTTAGG
CTGCAGAATATCGCCGCCGTTAGCGGCGGCGACGGCGGCGGAGGTAGAGACGAGTTTGGTGAGGAAGTTGCGGAAGAAGACGATGAGAGAAGGGATGGGTGGTGGAATGC
GGTCTGTTGTTGGTGGCCGTTACGTGTGATCGGCGATTGGGCTCGCCGGCTCCGGTTTGCTGATTCCGGTGACAGTTTCTTCATGGTTGAACTTTATAACACGTTATCAG
CACGAAGTTCTAATCGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTCAAAACCCTAGACCTCGAATCGTCTTCAATGGCGGAATCCCCAGAACCAGAACCAGAACCACCGTCCATTACTACTGGTGCCGGATCTGCCGGAGAATCGTCCG
AATCAGCCTCGGCAACGCCCTTCACGTTTCCATCGCTTGTCCTTTCTGCTCCAGAAATCTCCGCCGTGAACTGGACGTCGCCACCGCTCGATTCGACTCCGATCCTTCCG
ATTTTCTCTCGGATTCCTCAACCACGGCTCGATTCGGCGGCGATTCTTCCACATTTCTCCCTAATTCCTCGGCTACGGCTCGATTCGGCGGCGATTCTTCCAGATTTCTC
CCAAATTCCTCAGCTAGGGCTCGCTTCGGCGGCGATTCTTCCACATTTCTCCCTAATTCCTCGGCTACGGCTCGATTCGATGGCGACTCTTCGAATTTTCGCTGGAATTC
CTCAGCTACGGCTGGATTCGACGGCGATCCTTCCAATTTTCTCCCTAATTCCTCAGCTACAACTCGATTCGACGGTGATTCTTCCGGTTTTCTACCAAATTCCTCAGCTA
GGGCTGGATTCGACGGCGATCCTTCCAATTTTCTCTTGAATTCCTCAGCCACGGCTCGATTCGGCGGTGATTCTTCCAGGTTTGTCCCAAATTCCTCAGCTAGGGCTGGA
TCCGACGGCGATTCTTCCAATTTTCTCCCAAATTCCTCAGCTACGGCTCGATTCGACGGCGATTCTTCCAATTTTCTCCAAACTTCCTCGGCTAGGGCTCGATCCGACGG
CGTTTCTTCCAATTTTCGCCCTAATTCCTCTGCTAGGGCTCGATTTGACGGCGATCCTTCTAATTTGCGCCTGAATTCCTCAACTAGGGCTCGATTCGATGGAGATTCGC
CTAATTTTCTCCCAAATTCCTCAGTTAGGGCTCGATTCGACGGCGTTTCTTTTTATTTTCCCCAAAATTCCTCAGCTAGGGCTAGATTCGACGGAGATCGTTCTAATTCT
CTCCTAAATTTCTCTCGCCTCCCTATTCCAGGTGCCGGAAACAGCACGAGTTCCCGCCGGATTATCCCGCGGTGGAGCGTCGAATCCGACGGCGATCATTCGCTGGACTC
ATGGATCACTCTCCGATTCGAGGATTCCGGCATCGAGGCGATTCCGAGGGTGAGGATTACGGAGAGGCATTTACTCCAGGATTCGAGCTGTGCGATTTGCAAAGAGGAAT
TCGAGATCGGAGGGGAAGTGATGGAGTTGCCGTGCAAACACTTTTACCATTCCGATTGTATTGTTCCTTGGCTGAGAATCCATAACACTTGCCCTGTTTGCCGGTTTAGG
CTGCAGAATATCGCCGCCGTTAGCGGCGGCGACGGCGGCGGAGGTAGAGACGAGTTTGGTGAGGAAGTTGCGGAAGAAGACGATGAGAGAAGGGATGGGTGGTGGAATGC
GGTCTGTTGTTGGTGGCCGTTACGTGTGATCGGCGATTGGGCTCGCCGGCTCCGGTTTGCTGATTCCGGTGACAGTTTCTTCATGGTTGAACTTTATAACACGTTATCAG
CACGAAGTTCTAATCGCTGAGATCTTCATTTCATAAGAGAAAGAGACATGACACATGATCAATTGGATGGAAAGGAAAAACATCCGTTGAAGATATATGGTATTTTATTC
ATTTGTTAAAAAACATATCAATTGTTTTGAAAAAATTTCTTCACAATGATGTGCGGCAATAGATCGACAATACTATGGAGGTTATTTTTTTACCCGTGGAGAACAATGAG
TTCAAGCTAAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAQNPRPRIVFNGGIPRTRTRTTVHYYWCRICRRIVRISLGNALHVSIACPFCSRNLRRELDVATARFDSDPSDFLSDSSTTARFGGDSSTFLPNSSATARFGGDSSRFL
PNSSARARFGGDSSTFLPNSSATARFDGDSSNFRWNSSATAGFDGDPSNFLPNSSATTRFDGDSSGFLPNSSARAGFDGDPSNFLLNSSATARFGGDSSRFVPNSSARAG
SDGDSSNFLPNSSATARFDGDSSNFLQTSSARARSDGVSSNFRPNSSARARFDGDPSNLRLNSSTRARFDGDSPNFLPNSSVRARFDGVSFYFPQNSSARARFDGDRSNS
LLNFSRLPIPGAGNSTSSRRIIPRWSVESDGDHSLDSWITLRFEDSGIEAIPRVRITERHLLQDSSCAICKEEFEIGGEVMELPCKHFYHSDCIVPWLRIHNTCPVCRFR
LQNIAAVSGGDGGGGRDEFGEEVAEEDDERRDGWWNAVCCWWPLRVIGDWARRLRFADSGDSFFMVELYNTLSARSSNR