; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0004753 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0004753
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationLG03:7395408..7396368
RNA-Seq ExpressionSed0004753
SyntenySed0004753
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601790.1 hypothetical protein SDJN03_07023, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.1e-5573.05Show/hide
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XP_022938336.1 uncharacterized protein LOC111444467 [Cucurbita moschata]3.7e-5572.46Show/hide
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XP_022993320.1 uncharacterized protein LOC111489362 [Cucurbita maxima]3.3e-5674.85Show/hide
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        MED SS KRLR DSADSESDSPEVKRLKDDL+  LDDADPDP V DLDSVIQSFADEISPV SPP           ELGYLLLASDDELGLPPS DA  S
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XP_023538923.1 uncharacterized protein LOC111799678 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.3e-5673.65Show/hide
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XP_038885926.1 uncharacterized protein LOC120076234 [Benincasa hispida]8.1e-5573.94Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K873 Uncharacterized protein3.5e-5169.51Show/hide
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A0A1S3BDY1 uncharacterized protein LOC1034886144.1e-5270.73Show/hide
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A0A6J1FGC2 uncharacterized protein LOC1114451647.7e-5172.46Show/hide
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        MED SSNKRLR    DSESDSPEVKRLKDDL+  LD ADPDP V DLDSVIQSFADEISPV SPP           ELGYLLLASDDELGLPPS DA  S
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          G +  A+L  A SESSG+GE WGFEDAIP   SFELGEGE+FY+D+E+VAFDGLFEHSD+YSVFS
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A0A6J1H3R7 uncharacterized protein LOC1114444671.8e-5572.46Show/hide
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        H G    A+L  A SESSG+GE WGFEDAIP Y+SFELGEG +FYNDTE+VA DGLFEHSD+YSVFS
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A0A6J1JY78 uncharacterized protein LOC1114893621.6e-5674.85Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G13360.1 unknown protein1.4e-2546.39Show/hide
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AT1G13360.2 unknown protein1.4e-2344.24Show/hide
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AT1G13360.3 unknown protein1.4e-2345.78Show/hide
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AT3G25870.1 unknown protein5.0e-1839.41Show/hide
Query:  MEDISSNKRLRFDSADS-------ESDSPEVKRLKDDLISFLDDADPDPAVLDLDSVIQSFADEISPVCSPPHSAE----LGYLLLASDDELGLPPSADA
        MED+   +  R DS  +       + DSP+VKRL+DDL    DD+  DP   DLDSV++SF +E+S   +   S E    LGYL  ASDDELGLPP    
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        P   +  S      +L  A S+SS +GE  GFED + ++   +LG+      D  F  FDG  +  D++S
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGATATTTCCTCAAACAAACGCCTCCGGTTCGACTCGGCCGACTCCGAATCCGACTCGCCGGAGGTCAAGCGCCTCAAAGACGACCTGATTTCTTTCCTCGACGA
CGCCGACCCCGATCCGGCCGTCCTGGATCTGGATTCCGTCATCCAGAGTTTCGCCGACGAGATATCCCCCGTCTGTTCTCCCCCCCACTCGGCGGAGCTCGGGTACCTTC
TCCTGGCCTCCGACGACGAGCTCGGCCTCCCGCCGTCCGCCGACGCCCCCGTCAGCCACTCCGGTAATACCGGGACGGCGGATCTGGCGCCGGCCGAGTCGGAATCGTCC
GGGATCGGAGAGACTTGGGGATTTGAAGATGCGATTCCGAAATACGACTCGTTCGAGTTGGGGGAAGGAGAGAAGTTTTATAACGACACGGAATTTGTGGCGTTTGATGG
ACTGTTTGAACATTCCGATATGTACTCTGTTTTCTCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTATTATTTATGATGGACAGACTGAGCCGGTGGGTCCGGTTTTCCGGACTTCAAAATATTATACAAAGCAATTAATTCTCACAAAATGATATTTATTTATATAAAAAAAA
AGTAAATCCAAAAAGTAGATTGACAAAAAAATAAAAAAGACGAGGCGTCCGTGATGTAGACGCGCCTGGTGTCACTATCATTACCCAAACTTCTCTCTTTAACTTTCTCT
CTCTCTACTTTGTCCCCTTTATATATCCCTCTTCTCCGCTCTGCCGCCGCACCTTCACCTCCGTTCTTCCCCCCTTCACATTTTCCGATCATCTCATGGAGGATATTTCC
TCAAACAAACGCCTCCGGTTCGACTCGGCCGACTCCGAATCCGACTCGCCGGAGGTCAAGCGCCTCAAAGACGACCTGATTTCTTTCCTCGACGACGCCGACCCCGATCC
GGCCGTCCTGGATCTGGATTCCGTCATCCAGAGTTTCGCCGACGAGATATCCCCCGTCTGTTCTCCCCCCCACTCGGCGGAGCTCGGGTACCTTCTCCTGGCCTCCGACG
ACGAGCTCGGCCTCCCGCCGTCCGCCGACGCCCCCGTCAGCCACTCCGGTAATACCGGGACGGCGGATCTGGCGCCGGCCGAGTCGGAATCGTCCGGGATCGGAGAGACT
TGGGGATTTGAAGATGCGATTCCGAAATACGACTCGTTCGAGTTGGGGGAAGGAGAGAAGTTTTATAACGACACGGAATTTGTGGCGTTTGATGGACTGTTTGAACATTC
CGATATGTACTCTGTTTTCTCTTGACGGCGGCGAACGAAGTTCCGCCGGCGAAGAGGAAAGGGAAAGAAAAAAAAAAAAAAAACTTTCCTTTTCTCTAAAATGGATATTA
AAGAAACACCCCATTTGTAATTTTTTTTCCCTTTTTTTCTTCCATTAATTCCATCATAAGATAATGAAAATAGGAGTAGGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEDISSNKRLRFDSADSESDSPEVKRLKDDLISFLDDADPDPAVLDLDSVIQSFADEISPVCSPPHSAELGYLLLASDDELGLPPSADAPVSHSGNTGTADLAPAESESS
GIGETWGFEDAIPKYDSFELGEGEKFYNDTEFVAFDGLFEHSDMYSVFS