CuGenDBv2

Gene ID	Sed0005164
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	AWPM-19-like family protein
Genome location	LG01:16514170..16515819
RNA-Seq Expression	Sed0005164
Synteny	Sed0005164
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR008390 - AWPM-19-like

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_008443837.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487332 [Cucumis melo]

5.3e-70

89.31

Show/hide

Query:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA+TQMK IATLLL LNFCMYVIIL IGGWAMN AIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLA VFGAASAISGLNHIRSWS ESLGAA
Subjt:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGVVSTR
        SSAA+ AWTLT+LAMGFACKEI LDFRN+RL+TMEAF IILSATQLVYI+AIHGV+STR
Subjt:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGVVSTR

XP_022140126.1 uncharacterized protein LOC111010860 [Momordica charantia]

4.2e-67

85.53

Show/hide

Query:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MANTQMK IATLLL LNFCMY +IL IGGWAMNTAIDHGF+IGP  RLPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLAAVFGAASAISGLNHIRSWS +SLGAA
Subjt:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGVVSTR
        SSAA+ AWTLT+LAMGFACKEIELDFR++RLITMEAF IILS TQL+YI+AIHG  S R
Subjt:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGVVSTR

XP_022955000.1 uncharacterized protein LOC111457088 [Cucurbita moschata]

5.4e-67

86.16

Show/hide

Query:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MAN+QMK IAT+LL LNFCMYVIIL IGGWAMN AIDHGFIIGPGL+LPAHFSPIYFP+GNAATGFFVIFALLAAVFGAAS ISGLNHIRSWSAES GAA
Subjt:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGVVSTR
        SSAA+ AWTLT+LAMGFA KEI+LD RNSRL+TMEAF IILSATQLVYI+AIHG V+T+
Subjt:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGVVSTR

XP_022994911.1 uncharacterized protein LOC111490495 [Cucurbita maxima]

1.4e-67

87.42

Show/hide

Query:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MAN+QMK IATLLL LNFCMYVIIL IGGWAMN AIDHGFIIGPGL+LPAHFSPIYFP+GNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAES GAA
Subjt:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGVVSTR
        SSAA+ AWTLT+LAMGFA KEI+LD RNSRL+TMEAF +ILSATQLVYI+AIHG V+TR
Subjt:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGVVSTR

XP_038895378.1 membrane protein PM19L-like [Benincasa hispida]

4.0e-70

89.31

Show/hide

Query:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA+TQMK +ATLLL LNFCMY IIL IGGWAMN AIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
Subjt:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGVVSTR
        S+AA+ AWTLT+LAMGFACKEI LDFRN+RL+TMEAF IILSATQLVYI+AIHG VSTR
Subjt:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGVVSTR

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LV01 AWPM19-like protein

2.0e-67

86.79

Show/hide

Query:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA+TQMK  ATLLL LNFCMYVIIL IGGWAMN AIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFV+FALLA VFGAASAISGLNHIRSWS ESL AA
Subjt:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGVVSTR
        SSAA+ AWTLT+LAMGFA KEI LDFRN+RL+TMEAF IILSATQLVYI+AIHG +STR
Subjt:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGVVSTR

A0A6J1CEV9 uncharacterized protein LOC111010860

2.0e-67

85.53

Show/hide

Query:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MANTQMK IATLLL LNFCMY +IL IGGWAMNTAIDHGF+IGP  RLPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLAAVFGAASAISGLNHIRSWS +SLGAA
Subjt:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGVVSTR
        SSAA+ AWTLT+LAMGFACKEIELDFR++RLITMEAF IILS TQL+YI+AIHG  S R
Subjt:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGVVSTR

A0A6J1GTY5 uncharacterized protein LOC111457088

2.6e-67

86.16

Show/hide

Query:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MAN+QMK IAT+LL LNFCMYVIIL IGGWAMN AIDHGFIIGPGL+LPAHFSPIYFP+GNAATGFFVIFALLAAVFGAAS ISGLNHIRSWSAES GAA
Subjt:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGVVSTR
        SSAA+ AWTLT+LAMGFA KEI+LD RNSRL+TMEAF IILSATQLVYI+AIHG V+T+
Subjt:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGVVSTR

A0A6J1K0L0 uncharacterized protein LOC111490495

6.9e-68

87.42

Show/hide

Query:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MAN+QMK IATLLL LNFCMYVIIL IGGWAMN AIDHGFIIGPGL+LPAHFSPIYFP+GNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAES GAA
Subjt:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGVVSTR
        SSAA+ AWTLT+LAMGFA KEI+LD RNSRL+TMEAF +ILSATQLVYI+AIHG V+TR
Subjt:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGVVSTR

A5Y734 AWPM19-like protein

2.5e-70

89.31

Show/hide

Query:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA+TQMK IATLLL LNFCMYVIIL IGGWAMN AIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLA VFGAASAISGLNHIRSWS ESLGAA
Subjt:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGVVSTR
        SSAA+ AWTLT+LAMGFACKEI LDFRN+RL+TMEAF IILSATQLVYI+AIHGV+STR
Subjt:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGVVSTR

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q6L4D2 Membrane protein PM19L

1.9e-22

44.06

Show/hide

Query:  LLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAILAWTLTV
        LL LN  MY+I++    W +N  I +G    PG+             GN AT +F++FA+LA V GAAS ++G++H+RSW A SL A +++A++AW +T 
Subjt:  LLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAILAWTLTV

Query:  LAMGFACKEIEL-DFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHG
        LA G ACKEI +  +R  RL  +EAF IIL+ TQL+Y+  +HG
Subjt:  LAMGFACKEIEL-DFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHG

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G04560.1 AWPM-19-like family protein

1.6e-24

45.45

Show/hide

Query:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA T  + IA  LLFLN  MY+I+L    W +N  I+       G      F       GN AT FF+ F++LAAV G AS ++G NHIR W  +SL AA
Subjt:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIEL-DFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIH
         +++I+AW +T LAMG ACK+I +  +R  RL  +EAF IIL+ TQL+Y++ IH
Subjt:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIEL-DFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIH

AT1G29520.1 AWPM-19-like family protein

3.4e-59

76.13

Show/hide

Query:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA  Q+KP+A+ LL LNFCMYVI+L IGGWAMN AIDHGF +GP L LPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLA V GAAS ISGL+HIRSW+  SL AA
Subjt:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGV
        ++AA +AWTLTVLAMGFA KEIEL  RN++L TMEAF IILS TQL+YI A+HGV
Subjt:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGV

AT5G18970.1 AWPM-19-like family protein

8.2e-29

44.23

Show/hide

Query:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA+   K  A +LL LN  +Y +I  I  WA+N  I+        L LPA   PIYFP+GN ATGFFVIF L+A V G A++++G+ ++  W + +L +A
Subjt:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGVV
        +++++++W+LT+LAMG ACKEI + +  + L T+E  +II+SATQL+   AIH  V
Subjt:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGVV

AT5G46530.1 AWPM-19-like family protein

1.9e-54

69.03

Show/hide

Query:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        M   QMKP+A+ LL LNFCMY I+L IG W+MN AI+HGF+IG    LPAHFSPI+FPMGNAATGFF++FAL+A V GAAS ISG++H++SW+  SL AA
Subjt:  MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGV
         SAA +AW+LT+LAMGF CKEIEL  RN+RL TMEAF IILSATQL+YI AI+GV
Subjt:  SSAAILAWTLTVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGV

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTAATACACAGATGAAGCCCATTGCCACTTTGCTTCTGTTCCTTAACTTCTGCATGTATGTAATTATCTTGGCCATTGGTGGATGGGCAATGAACACTGCCATTGA
TCATGGCTTCATTATTGGTCCCGGGTTACGATTACCGGCACATTTTTCGCCAATTTACTTCCCCATGGGGAACGCAGCTACTGGCTTCTTTGTGATATTTGCTTTGTTGG
CTGCTGTGTTTGGAGCTGCCTCAGCAATCTCAGGGCTTAACCATATTCGTTCATGGAGTGCTGAAAGCTTAGGTGCTGCCTCCTCTGCTGCTATTCTTGCTTGGACTCTC
ACTGTCCTTGCCATGGGCTTTGCTTGCAAAGAGATTGAACTGGATTTCAGAAACTCAAGACTGATAACAATGGAAGCTTTCTCCATTATTCTCTCTGCTACACAGCTCGT
TTACATCTTGGCCATTCATGGTGTAGTTTCCACACGATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MANTQMKPIATLLLFLNFCMYVIILAIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVIFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAILAWTL
TVLAMGFACKEIELDFRNSRLITMEAFSIILSATQLVYILAIHGVVSTR

Sed0005164 (gene) of Chayote v1 genome