; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0005182 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0005182
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationLG08:32319921..32321808
RNA-Seq ExpressionSed0005182
SyntenySed0005182
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6599029.1 hypothetical protein SDJN03_08807, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-7078.92Show/hide
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KAG6599044.1 hypothetical protein SDJN03_08822, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-7078.92Show/hide
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KAG7029989.1 hypothetical protein SDJN02_08333, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.3e-7179.46Show/hide
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XP_022946374.1 uncharacterized protein LOC111450455 [Cucurbita moschata]2.1e-7078.38Show/hide
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XP_022999560.1 uncharacterized protein LOC111493888 [Cucurbita maxima]5.6e-7179.46Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KTZ2 Uncharacterized protein6.9e-6775.4Show/hide
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A0A1S3CPH3 uncharacterized protein LOC1035033239.1e-6775.4Show/hide
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        +SSSL  LPQPFARIP  T +  Q SSNLHNN+RF S + K P   ++P  SSSS  SP L KSIA AASISLL+ P PANAG LSGFSGIESVPGP+LP
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A0A5A7TEV5 Uncharacterized protein9.1e-6775.4Show/hide
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A0A6J1G3L6 uncharacterized protein LOC1114504551.0e-7078.38Show/hide
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A0A6J1KFQ6 uncharacterized protein LOC1114938882.7e-7179.46Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G03420.1 unknown protein2.5e-4564.38Show/hide
Query:  PSSPFASSSSLPSPVLH----KSIALAASISLLVSPIPANAGILSGFSGIESVPGPQLPQIDFLNRFNDENQKKYAEDDARFKSSPLLKELLERSKLNKQ
        P    A SSS PSP  H     +  LAAS++LL+SP  A AG++SG  GIESVPGP+LP+I+FL+RFN +NQK YAE+DARFK SPLLK+LLE SKLNK+
Subjt:  PSSPFASSSSLPSPVLH----KSIALAASISLLVSPIPANAGILSGFSGIESVPGPQLPQIDFLNRFNDENQKKYAEDDARFKSSPLLKELLERSKLNKQ

Query:  KNRQEILDKYCIRGAEWGVGDCSADGMSAVDREKFIEMLKKKAGVD
        KN +EI DKYC+RGAEWGVGDCS  GM+  ++EKFI MLKKK GV+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGAGTTCCTCATCTCTTTCGTTTCTTCCTCAACCATTTGCTCGAATTCCATTCCCAACTTCAAAGATCCCTCAAAATTCCTCCAACCTTCACAACAATGTCCGATT
CACTTCCATGGACAAGCCTCCAATTCCTCCTTCTTCTCCGTTCGCGTCGTCTTCTTCACTGCCATCGCCAGTTCTTCACAAATCCATCGCGTTAGCCGCCTCGATCTCCC
TCCTCGTGTCGCCGATTCCAGCCAATGCCGGAATTCTATCAGGATTCTCCGGAATCGAATCGGTTCCTGGTCCGCAATTGCCTCAAATCGACTTTCTCAATCGATTCAAC
GACGAAAACCAGAAGAAATACGCGGAGGATGATGCCAGATTCAAATCTTCTCCATTGCTGAAGGAGCTTCTGGAGCGATCGAAGTTGAACAAGCAAAAGAACCGACAGGA
AATTCTTGACAAATATTGCATCCGCGGTGCGGAATGGGGAGTTGGAGACTGCTCGGCTGATGGCATGTCGGCTGTTGATAGGGAAAAATTCATCGAAATGTTGAAGAAAA
AGGCTGGAGTGGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATCAAAATGATTTTTGTTTATTTTTTATTTTGAAATCAGCGGTTCAGTTGAGTGAAGAAAAGAGAGACAATGGCGAGTTCCTCATCTCTTTCGTTTCTTCCTCAACCATT
TGCTCGAATTCCATTCCCAACTTCAAAGATCCCTCAAAATTCCTCCAACCTTCACAACAATGTCCGATTCACTTCCATGGACAAGCCTCCAATTCCTCCTTCTTCTCCGT
TCGCGTCGTCTTCTTCACTGCCATCGCCAGTTCTTCACAAATCCATCGCGTTAGCCGCCTCGATCTCCCTCCTCGTGTCGCCGATTCCAGCCAATGCCGGAATTCTATCA
GGATTCTCCGGAATCGAATCGGTTCCTGGTCCGCAATTGCCTCAAATCGACTTTCTCAATCGATTCAACGACGAAAACCAGAAGAAATACGCGGAGGATGATGCCAGATT
CAAATCTTCTCCATTGCTGAAGGAGCTTCTGGAGCGATCGAAGTTGAACAAGCAAAAGAACCGACAGGAAATTCTTGACAAATATTGCATCCGCGGTGCGGAATGGGGAG
TTGGAGACTGCTCGGCTGATGGCATGTCGGCTGTTGATAGGGAAAAATTCATCGAAATGTTGAAGAAAAAGGCTGGAGTGGATTGATTCTTGCATTGAAGCTTTGGCATT
CAGAGCAAGCCATTTTTATTTGGAGAAACCAAAACCAGGTCTTGTTACTTTTTGTTTCCCAATTTGATCTTTATTGCTTCTGAATTTAATTTCTGTTATGGTTCTGTTCT
TGAAGCTTAATTTACACTATGCAAAATTTTTCTAGAAGCTTATTAGGATTGTGATGCAATTTTTTGTTGGTTTTAGTGAATATTTGAATCTCCTTTTAGTTTTTTTTTTT
TTTTGAGATTATAATAATTAAAGTGGGAGTTTGGAACA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASSSSLSFLPQPFARIPFPTSKIPQNSSNLHNNVRFTSMDKPPIPPSSPFASSSSLPSPVLHKSIALAASISLLVSPIPANAGILSGFSGIESVPGPQLPQIDFLNRFN
DENQKKYAEDDARFKSSPLLKELLERSKLNKQKNRQEILDKYCIRGAEWGVGDCSADGMSAVDREKFIEMLKKKAGVD