; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0005553 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0005553
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionserine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28
Genome locationLG12:5413855..5420984
RNA-Seq ExpressionSed0005553
SyntenySed0005553
Gene Ontology termsGO:0007283 - spermatogenesis (biological process)
GO:0009987 - cellular process (biological process)
GO:0000786 - nucleosome (cellular component)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000221 - Protamine P1
IPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7018652.1 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.3e-5162.5Show/hide
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        MARYRSRSRSYSPRRRSR+ PPRGRKRYD  DD RDR RE+RS RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKD+YLPKNYYTGE R      
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           AE    A Q+       G    IV    +   P               ++      +  ARD Y SPARSRSISRSHSPRD R YSRSP+ KENGRS
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        P   ++ARSRSRSPRA
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XP_022955785.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita moschata]9.0e-5057.87Show/hide
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        MA+YRSRSRSYSPRRRSR+ PPRGRKRYD  DD RDR RE+RS RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKD+YLPKNYYTGE R      
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Query:  --LAESPEGAHQE-------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHR---------------------------------ARDGYFSPARSRSISRSHS
           AE    A Q+       G    IV    +   P   +V    + R                                 ARD Y SPARSRSISRSHS
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Query:  PRDGRKYSRSPSLKENGRSPHEENVARSRSRSPRA
        PRD R YSRSP+ KENGRSP   + ARSRSRSPRA
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XP_022979912.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita maxima]1.8e-5058.3Show/hide
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        MARYRSRSRSYSPRRRSR+ PPRGRKRYD  DD RDR RE+RS RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKD+YLPKNYYTGE R      
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Query:  --LAESPEGAHQE-------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHR---------------------------------ARDGYFSPARSRSISRSHS
           AE    A Q+       G    IV    +   P   +V    + R                                 ARD Y SPARSRSISRSHS
Subjt:  --LAESPEGAHQE-------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHR---------------------------------ARDGYFSPARSRSISRSHS

Query:  PRDGRKYSRSPSLKENGRSPHEENVARSRSRSPRA
        PRD R YSRSP+ KENGRSP   ++ARSRSRSPRA
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XP_023527505.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.8e-5058.3Show/hide
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        MARYRSRSRSYSPRRRSR+ PPRGRKRYD  DD RDR RE+RS RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKD+YLPKNYYTGE R      
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Query:  --LAESPEGAHQE-------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHR---------------------------------ARDGYFSPARSRSISRSHS
           AE    A Q+       G    IV    +   P   +V    + R                                 ARD Y SPARSRSISRSHS
Subjt:  --LAESPEGAHQE-------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHR---------------------------------ARDGYFSPARSRSISRSHS

Query:  PRDGRKYSRSPSLKENGRSPHEENVARSRSRSPRA
        PRD R YSRSP+ KENGRSP   ++ARSRSRSPRA
Subjt:  PRDGRKYSRSPSLKENGRSPHEENVARSRSRSPRA

XP_038878233.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Benincasa hispida]4.9e-4857.02Show/hide
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        M RYRSRSRSYSPRRRSR+ PPRGRKR+D  DD RDR RE+RS RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKD+YLPKNYYTGE R      
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Query:  --LAESPEGAHQE-------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHR---------------------------------ARDGYFSPARSRSISRSHS
           AE    A Q+       G    IV    +   P   +V    + R                                 AR+ Y SPARSRSISRS S
Subjt:  --LAESPEGAHQE-------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHR---------------------------------ARDGYFSPARSRSISRSHS

Query:  PRDGRKYSRSPSLKENGRSPHEENVARSRSRSPRA
        PRD R YSRSP+ KENGRSP E + ARSRSRSPRA
Subjt:  PRDGRKYSRSPSLKENGRSPHEENVARSRSRSPRA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3AXW0 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL281.5e-4756.41Show/hide
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        MARYRSRSRSYSPRRRSR+ PPRGRKRYD  DD RDR RE+RS RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKD+YLPKNYYTGE R      
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Query:  --LAESPEGAHQE-------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHR---------------------------------ARDGYFSPARSRSISRSHS
           AE    A Q+       G    IV    +   P   +V    + R                                 ARD Y SPARSRSIS S S
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Query:  PRDGRKYSRSPSLKENGRSPHEENVARSRSRSPR
        PRD + YSRSP+ K+NGRSP E + ARSRSRSP+
Subjt:  PRDGRKYSRSPSLKENGRSPHEENVARSRSRSPR

A0A5D3CXM8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL281.5e-4756.41Show/hide
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        MARYRSRSRSYSPRRRSR+ PPRGRKRYD  DD RDR RE+RS RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKD+YLPKNYYTGE R      
Subjt:  MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENRD-----

Query:  --LAESPEGAHQE-------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHR---------------------------------ARDGYFSPARSRSISRSHS
           AE    A Q+       G    IV    +   P   +V    + R                                 ARD Y SPARSRSIS S S
Subjt:  --LAESPEGAHQE-------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHR---------------------------------ARDGYFSPARSRSISRSHS

Query:  PRDGRKYSRSPSLKENGRSPHEENVARSRSRSPR
        PRD + YSRSP+ K+NGRSP E + ARSRSRSP+
Subjt:  PRDGRKYSRSPSLKENGRSPHEENVARSRSRSPR

A0A6J1C7W4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL287.0e-4856.36Show/hide
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        MARYRSRSRSYSPRRRSRS PPRGRKRYD  DD RDR  E+RS RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR PFERFGPVKD+YLPKNYYTGE R      
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Query:  -----DLAESPE----------------GAHQEGLPEDIVLT---------------------RAHLHLPGMAQVIEHWNHRARDGYFSPARSRSISRSH
             D AE+ +                       P+++ +T                     R++   P  A+  +  N  ARD Y SPARSRSISRS 
Subjt:  -----DLAESPE----------------GAHQEGLPEDIVLT---------------------RAHLHLPGMAQVIEHWNHRARDGYFSPARSRSISRSH

Query:  SPRDGRKYSRSPSLKENGRSPHEENVARSRSRSPRA
        SP D R YSRSPS KENGRSP E ++ RSRSRS RA
Subjt:  SPRDGRKYSRSPSLKENGRSPHEENVARSRSRSPRA

A0A6J1GW11 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL284.4e-5057.87Show/hide
Query:  MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENRD-----
        MA+YRSRSRSYSPRRRSR+ PPRGRKRYD  DD RDR RE+RS RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKD+YLPKNYYTGE R      
Subjt:  MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENRD-----

Query:  --LAESPEGAHQE-------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHR---------------------------------ARDGYFSPARSRSISRSHS
           AE    A Q+       G    IV    +   P   +V    + R                                 ARD Y SPARSRSISRSHS
Subjt:  --LAESPEGAHQE-------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHR---------------------------------ARDGYFSPARSRSISRSHS

Query:  PRDGRKYSRSPSLKENGRSPHEENVARSRSRSPRA
        PRD R YSRSP+ KENGRSP   + ARSRSRSPRA
Subjt:  PRDGRKYSRSPSLKENGRSPHEENVARSRSRSPRA

A0A6J1IQ05 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL288.8e-5158.3Show/hide
Query:  MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENRD-----
        MARYRSRSRSYSPRRRSR+ PPRGRKRYD  DD RDR RE+RS RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKD+YLPKNYYTGE R      
Subjt:  MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENRD-----

Query:  --LAESPEGAHQE-------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHR---------------------------------ARDGYFSPARSRSISRSHS
           AE    A Q+       G    IV    +   P   +V    + R                                 ARD Y SPARSRSISRSHS
Subjt:  --LAESPEGAHQE-------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHR---------------------------------ARDGYFSPARSRSISRSHS

Query:  PRDGRKYSRSPSLKENGRSPHEENVARSRSRSPRA
        PRD R YSRSP+ KENGRSP   ++ARSRSRSPRA
Subjt:  PRDGRKYSRSPSLKENGRSPHEENVARSRSRSPRA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q1PDV2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL281.1e-2642.62Show/hide
Query:  MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENR------
        MAR RSRSRSYSPR R RS PPR RK YDD     +R RE  S RD  S  PSGLL+RNLPLDARP DLR  FERFGP+KDIYLP+NYYTGE R      
Subjt:  MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENR------

Query:  -----DLAESPEGAHQEGL----------------PEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHRAR----------------------DGYFSP-ARSRSISR
             D AE+ +  + + +                P+++  T       G  +   H + R R                      D  +SP  RSRSISR
Subjt:  -----DLAESPEGAHQEGL----------------PEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHRAR----------------------DGYFSP-ARSRSISR

Query:  SHSPRDGRKYSRSPSLKENGRSPHEENV---------ARSRSRS
        S  PR+ R+Y        N RSP EE V         +RSRSRS
Subjt:  SHSPRDGRKYSRSPSLKENGRSPHEENV---------ARSRSRS

Q8L3X8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL307.7e-1233.82Show/hide
Query:  YRSRSRSYSPRRRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENR---------
        Y    R Y  R RS  PPP  R+ Y                  RR  +   LLVRN+PLD RPE+LR PFERFGPV+D+Y+P++YY+G+ R         
Subjt:  YRSRSRSYSPRRRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENR---------

Query:  --DLAESPEGAHQE---GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHR----ARDGYFSPARSRSISRSHSPRDG-------RKYSRSPSLKENGRSPHEENV
          D  E+    ++    G    +V+       P   +V      R    +RD     +RSRSISRS SPR         R  S SP+ +  G  P  E  
Subjt:  --DLAESPEGAHQE---GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHR----ARDGYFSPARSRSISRSHSPRDG-------RKYSRSPSLKENGRSPHEENV

Query:  ARSRSRS
             RS
Subjt:  ARSRSRS

Q8WXF0 Serine/arginine-rich splicing factor 121.7e-0629.33Show/hide
Query:  PAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENR--------DLAESPEGAHQE------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHRA
        P  + L +RN+    RPEDLR  F R+GP+ D+Y+P ++YT   R        D+ ++ +  +        G   +I   +     PG  +  E      
Subjt:  PAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENR--------DLAESPEGAHQE------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHRA

Query:  RDGYFSPARSRSISRSHSPRDGRKYSRSPSLKENGRSPHEENVARSRSRS
         D   S + S+  +RS S   GR   RS SLKE+       + ++SRS+S
Subjt:  RDGYFSPARSRSISRSHSPRDGRKYSRSPSLKENGRSPHEENVARSRSRS

Q9LHP2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A6.3e-1436.62Show/hide
Query:  RSRSYSPR------RRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENR------
        R RSY+P       RR RSP PRGR        +RD            S  P+ LLVRNL  D R EDLR PFE+FGPVKDIYLP++YYTG+ R      
Subjt:  RSRSYSPR------RRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENR------

Query:  --DLAESPEGAHQE------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHW--NHRARDGYFSPARSRSISRSHSPRDGRK-------YSRSPSLKENGRSPHEEN
          D A++ E  HQ       G    +V    +   P   +  +    ++R +D   SP R    SRS  PR GR+       Y+  P+ +   RS   ++
Subjt:  --DLAESPEGAHQE------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHW--NHRARDGYFSPARSRSISRSHSPRDGRK-------YSRSPSLKENGRSPHEEN

Query:  ----VARSRSRSP
              RS SRSP
Subjt:  ----VARSRSRSP

Q9SEU4 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL337.5e-1538.1Show/hide
Query:  RSRSYSPR------RRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENR------
        R RSY+P       RR RSP PRGR                     R    P+ LLVRNL  D R EDLR  FE+FGPVKDIYLP++YYTG+ R      
Subjt:  RSRSYSPR------RRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENR------

Query:  --DLAESPEGAHQE------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHRARDGYFSPARSRSISRSHSPRDGRKYSRS------PSLKENGR--SPHEENV
          D A++ +  H        G    +V    +   P   +  E    R RD   +P R  S SRS  PR GR  SRS      P  + + R  SP EE  
Subjt:  --DLAESPEGAHQE------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHRARDGYFSPARSRSISRSHSPRDGRKYSRS------PSLKENGR--SPHEENV

Query:  --ARSRSRSP
           RS SRSP
Subjt:  --ARSRSRSP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 335.3e-1638.1Show/hide
Query:  RSRSYSPR------RRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENR------
        R RSY+P       RR RSP PRGR                     R    P+ LLVRNL  D R EDLR  FE+FGPVKDIYLP++YYTG+ R      
Subjt:  RSRSYSPR------RRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENR------

Query:  --DLAESPEGAHQE------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHRARDGYFSPARSRSISRSHSPRDGRKYSRS------PSLKENGR--SPHEENV
          D A++ +  H        G    +V    +   P   +  E    R RD   +P R  S SRS  PR GR  SRS      P  + + R  SP EE  
Subjt:  --DLAESPEGAHQE------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHRARDGYFSPARSRSISRSHSPRDGRKYSRS------PSLKENGR--SPHEENV

Query:  --ARSRSRSP
           RS SRSP
Subjt:  --ARSRSRSP

AT1G55310.2 SC35-like splicing factor 335.3e-1638.1Show/hide
Query:  RSRSYSPR------RRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENR------
        R RSY+P       RR RSP PRGR                     R    P+ LLVRNL  D R EDLR  FE+FGPVKDIYLP++YYTG+ R      
Subjt:  RSRSYSPR------RRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENR------

Query:  --DLAESPEGAHQE------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHRARDGYFSPARSRSISRSHSPRDGRKYSRS------PSLKENGR--SPHEENV
          D A++ +  H        G    +V    +   P   +  E    R RD   +P R  S SRS  PR GR  SRS      P  + + R  SP EE  
Subjt:  --DLAESPEGAHQE------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHRARDGYFSPARSRSISRSHSPRDGRKYSRS------PSLKENGR--SPHEENV

Query:  --ARSRSRSP
           RS SRSP
Subjt:  --ARSRSRSP

AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A4.5e-1536.62Show/hide
Query:  RSRSYSPR------RRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENR------
        R RSY+P       RR RSP PRGR        +RD            S  P+ LLVRNL  D R EDLR PFE+FGPVKDIYLP++YYTG+ R      
Subjt:  RSRSYSPR------RRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENR------

Query:  --DLAESPEGAHQE------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHW--NHRARDGYFSPARSRSISRSHSPRDGRK-------YSRSPSLKENGRSPHEEN
          D A++ E  HQ       G    +V    +   P   +  +    ++R +D   SP R    SRS  PR GR+       Y+  P+ +   RS   ++
Subjt:  --DLAESPEGAHQE------GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHW--NHRARDGYFSPARSRSISRSHSPRDGRK-------YSRSPSLKENGRSPHEEN

Query:  ----VARSRSRSP
              RS SRSP
Subjt:  ----VARSRSRSP

AT3G55460.1 SC35-like splicing factor 305.5e-1333.82Show/hide
Query:  YRSRSRSYSPRRRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENR---------
        Y    R Y  R RS  PPP  R+ Y                  RR  +   LLVRN+PLD RPE+LR PFERFGPV+D+Y+P++YY+G+ R         
Subjt:  YRSRSRSYSPRRRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENR---------

Query:  --DLAESPEGAHQE---GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHR----ARDGYFSPARSRSISRSHSPRDG-------RKYSRSPSLKENGRSPHEENV
          D  E+    ++    G    +V+       P   +V      R    +RD     +RSRSISRS SPR         R  S SP+ +  G  P  E  
Subjt:  --DLAESPEGAHQE---GLPEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHR----ARDGYFSPARSRSISRSHSPRDG-------RKYSRSPSLKENGRSPHEENV

Query:  ARSRSRS
             RS
Subjt:  ARSRSRS

AT5G18810.1 SC35-like splicing factor 287.9e-2842.62Show/hide
Query:  MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENR------
        MAR RSRSRSYSPR R RS PPR RK YDD     +R RE  S RD  S  PSGLL+RNLPLDARP DLR  FERFGP+KDIYLP+NYYTGE R      
Subjt:  MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENR------

Query:  -----DLAESPEGAHQEGL----------------PEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHRAR----------------------DGYFSP-ARSRSISR
             D AE+ +  + + +                P+++  T       G  +   H + R R                      D  +SP  RSRSISR
Subjt:  -----DLAESPEGAHQEGL----------------PEDIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHRAR----------------------DGYFSP-ARSRSISR

Query:  SHSPRDGRKYSRSPSLKENGRSPHEENV---------ARSRSRS
        S  PR+ R+Y        N RSP EE V         +RSRSRS
Subjt:  SHSPRDGRKYSRSPSLKENGRSPHEENV---------ARSRSRS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGAGGTATCGGAGCCGGAGCAGAAGCTACAGCCCTCGTCGGCGTAGCAGAAGCCCGCCACCACGCGGGCGGAAACGCTACGACGACGTCGACGACACTCGGGACCG
GTGCCGCGAAACCAGGTCTCGTAGGGACCGCCGCTCTCCCGCTCCTTCTGGATTGCTCGTTCGCAATCTTCCCCTTGATGCTAGGCCAGAAGATCTTAGGATCCCCTTCG
AGCGATTTGGTCCTGTTAAGGATATTTATCTGCCGAAGAACTACTACACAGGAGAGAATAGGGATCTGGCAGAGTCTCCAGAAGGCGCTCACCAGGAAGGTCTCCCAGAA
GATATCGTTCTTACTCGCGCTCACCTTCACCTGCCAGGCATGGCTCAAGTAATTGAGCATTGGAACCATAGGGCAAGGGATGGATATTTTTCTCCTGCACGATCTAGATC
GATTTCACGATCTCATTCCCCTCGTGATGGGCGGAAATACAGCCGATCTCCAAGTCTGAAGGAGAATGGCAGGAGCCCTCATGAAGAGAATGTTGCACGCAGTAGATCAA
GGAGTCCAAGGGCTACGAAGAATTATATGCTATTCCATCCCGATAGTTGTGGGTTGAAGAATAATGAGTGTAATCTTTGGTGTTCTCAAACACTCGATTCTCTCTTCCCT
CGCTCTCTTTTGATCGTATTTACGGTTTCTCGATTTCGTAATCTGAAACCCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGAGGTATCGGAGCCGGAGCAGAAGCTACAGCCCTCGTCGGCGTAGCAGAAGCCCGCCACCACGCGGGCGGAAACGCTACGACGACGTCGACGACACTCGGGACCG
GTGCCGCGAAACCAGGTCTCGTAGGGACCGCCGCTCTCCCGCTCCTTCTGGATTGCTCGTTCGCAATCTTCCCCTTGATGCTAGGCCAGAAGATCTTAGGATCCCCTTCG
AGCGATTTGGTCCTGTTAAGGATATTTATCTGCCGAAGAACTACTACACAGGAGAGAATAGGGATCTGGCAGAGTCTCCAGAAGGCGCTCACCAGGAAGGTCTCCCAGAA
GATATCGTTCTTACTCGCGCTCACCTTCACCTGCCAGGCATGGCTCAAGTAATTGAGCATTGGAACCATAGGGCAAGGGATGGATATTTTTCTCCTGCACGATCTAGATC
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CGCTCTCTTTTGATCGTATTTACGGTTTCTCGATTTCGTAATCTGAAACCCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPPRGRKRYDDVDDTRDRCRETRSRRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDIYLPKNYYTGENRDLAESPEGAHQEGLPE
DIVLTRAHLHLPGMAQVIEHWNHRARDGYFSPARSRSISRSHSPRDGRKYSRSPSLKENGRSPHEENVARSRSRSPRATKNYMLFHPDSCGLKNNECNLWCSQTLDSLFP
RSLLIVFTVSRFRNLKP