; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0005654 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0005654
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationLG06:17105269..17113606
RNA-Seq ExpressionSed0005654
SyntenySed0005654
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7024718.1 hypothetical protein SDJN02_13536, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.7e-14079.08Show/hide
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KAG7031639.1 hypothetical protein SDJN02_05680, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.3e-12875.79Show/hide
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XP_022137881.1 uncharacterized protein LOC111009200 isoform X1 [Momordica charantia]4.4e-13376.64Show/hide
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XP_031740628.1 uncharacterized protein LOC101204571 isoform X1 [Cucumis sativus]2.3e-14279.17Show/hide
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XP_038898361.1 uncharacterized protein LOC120086031 isoform X1 [Benincasa hispida]3.5e-14681.39Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1C7X7 uncharacterized protein LOC111009200 isoform X12.1e-13376.64Show/hide
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A0A6J1F5N4 uncharacterized protein LOC111442593 isoform X11.9e-12674.21Show/hide
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A0A6J1F6D4 uncharacterized protein LOC111442593 isoform X21.9e-12674.21Show/hide
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A0A6J1IHW7 uncharacterized protein LOC111477072 isoform X22.4e-12473.35Show/hide
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A0A6J1IN80 uncharacterized protein LOC111477072 isoform X12.4e-12473.35Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G45310.1 unknown protein8.2e-5337.39Show/hide
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        L+S  ++++++++TRPF F + AC F L+T +V      +++ +++  +L++ W  +   +W  +   + P R  A++ RER L Q++  L  E E+L W
Subjt:  LLSEFLNTTIFVVTRPFLFFMRACSFILKTFVVVVQTWLELLKTSVNLHLNIFWTTL---MW-IIAFVSLPGRILAALQRERQLRQNLQFLEIEFENLLW

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         RKE++K+ + A+KE +++E  LDELE  H++A +KI  LE+ELQ L+ ENL+L E+ GK Y + KG    SE                      S ++ 
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Query:  LFQSGAWKDGSISKENFIKILESGLKSGLLVCSRTSEIPSKDEDVTEILAKQRDVAISRSLFSTVLSLLVGVIIWKAEEPHLC--LVMALLFVVCISLKS
        + +       S  K  F     + +KS L   ++ S IP  +E    +L  ++++A+SRS+FS +L+L+VG+++++A+E  LC  L+ AL  VV ISLKS
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Query:  VVEFFTTIKNKPALDAVALLSFNWFLLGILAYPTLPNIARLLAPLASRFVGQI
        VV+FF+T+KNKPALDAVAL+S NWF++G L YPTLP +AR++ P     VG +
Subjt:  VVEFFTTIKNKPALDAVALLSFNWFLLGILAYPTLPNIARLLAPLASRFVGQI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCTTGCTTTCTGAGTTTCTGAATACCACAATATTTGTGGTCACGAGGCCTTTCTTATTTTTCATGCGTGCATGCTCATTTATCTTGAAAACCTTTGTTGTTGTTGT
TCAAACTTGGTTGGAGCTGTTGAAGACCTCGGTCAATCTTCACTTGAACATATTTTGGACCACTTTGATGTGGATAATCGCCTTTGTTTCTCTTCCCGGACGAATTTTAG
CTGCTTTACAGAGGGAAAGGCAGTTACGACAAAATTTGCAATTTCTAGAAATTGAATTCGAAAATCTTTTGTGGGAAAGAAAGGAACTTCAAAAACATTTCCAGGTTGCT
ATGAAAGAGCAGAAGGTGATCGAATTGATGTTGGACGAACTTGAAATGATACATGAAAAGGCGACCAACAAGATTGCACTCTTAGAAAGTGAGCTGCAGAATTTGAGAAA
TGAAAATCTTCGACTGCAAGAAATTAAGGGTAAGACATATTGGACCTTAAAGGGTTTTGATCACAAAAGTGAAGCACAAAATGTTGGCAGAGTTGACAGCAGCATTACCT
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TCCGGGTTAAAATCGGGTCTACTCGTATGCTCTCGTACTTCTGAAATCCCATCAAAAGATGAAGATGTCACTGAAATTCTTGCTAAACAAAGAGATGTTGCAATTTCACG
AAGTCTATTCAGTACTGTATTGTCACTTTTGGTTGGAGTGATTATATGGAAAGCTGAAGAGCCGCATTTGTGCCTCGTAATGGCTCTCTTGTTTGTGGTTTGCATCTCAT
TGAAGAGCGTCGTTGAGTTTTTCACGACTATTAAGAACAAACCTGCTTTGGATGCTGTGGCTCTCTTAAGCTTCAACTGGTTTTTACTTGGAATTCTTGCTTACCCAACG
CTGCCAAACATTGCTCGTTTGCTTGCTCCTCTGGCCTCGAGGTTTGTGGGACAAATAGTAGAAGGGTTTGGTTTCTCCATTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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