; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0006042 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0006042
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionglutaredoxin
Genome locationLG11:33584430..33586712
RNA-Seq ExpressionSed0006042
SyntenySed0006042
Gene Ontology termsGO:0034599 - cellular response to oxidative stress (biological process)
GO:0098869 - cellular oxidant detoxification (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0004362 - glutathione-disulfide reductase activity (molecular function)
GO:0097573 - glutathione oxidoreductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002109 - Glutaredoxin
IPR011767 - Glutaredoxin active site
IPR011899 - Glutaredoxin, eukaryotic/virial
IPR014025 - Glutaredoxin subgroup
IPR036249 - Thioredoxin-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578661.1 Isocitrate dehydrogenase [NADP], chloroplastic/mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.4e-4789.72Show/hide
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KAG7016200.1 hypothetical protein SDJN02_21305 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.4e-4789.72Show/hide
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XP_022938379.1 glutaredoxin [Cucurbita moschata]2.7e-4688.79Show/hide
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XP_022993774.1 glutaredoxin isoform X1 [Cucurbita maxima]3.2e-4790.65Show/hide
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XP_038889541.1 glutaredoxin-like [Benincasa hispida]2.2e-4386.92Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KR45 Glutaredoxin6.8e-4385.05Show/hide
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A0A5A7T277 Glutaredoxin-C61.5e-4285.05Show/hide
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A0A6J1BY96 glutaredoxin1.0e-4384.11Show/hide
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A0A6J1FDX0 glutaredoxin1.3e-4688.79Show/hide
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A0A6J1K114 glutaredoxin isoform X11.6e-4790.65Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P55142 Glutaredoxin-C67.5e-3975.73Show/hide
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P55143 Glutaredoxin4.1e-3770.59Show/hide
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Q6K953 Glutaredoxin-C4, chloroplastic6.3e-3875.73Show/hide
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Q9FNE2 Glutaredoxin-C24.8e-3873.83Show/hide
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Q9ZR41 Glutaredoxin1.4e-4076.42Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20270.1 Thioredoxin superfamily protein1.0e-1953.61Show/hide
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        E  K  VA NPV V+SKT C +  QVK L   L      VELD   S+G  +Q  L + TGQ TVPNVFIGGKHIGGC  T+ L+NKG L  +L EA
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AT4G28730.1 Glutaredoxin family protein3.3e-1848.45Show/hide
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        E  ++ V  N V ++SKT C +C +VK L   LG     VELD     G  +Q  L + TGQ TVPNVF+ GKHIGGC  TV LN KG L  +L EA
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AT5G40370.1 Glutaredoxin family protein3.4e-3973.83Show/hide
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AT5G40370.2 Glutaredoxin family protein6.3e-3373.63Show/hide
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        + SKT CP+CV+VK LL  LGA FKAVELDTESDG  +Q+ LA+WTGQRTVPNVFIGG HIGGCDAT  L+  G LVPLLTEAGAIA  TA
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AT5G63030.1 Thioredoxin superfamily protein6.3e-3364.08Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTTGGAAAAGGCTAAAGAGATCGTCGCTTCAAATCCCGTCGCCGTCTTCAGCAAGACTTCATGTCCGTTCTGCGTTCAGGTGAAGAGGCTTTTGACTGGTCTCGG
AGCCTCTTTTAAGGCTGTTGAATTGGATACTGAGAGTGATGGAAAAGATGTACAAGCAGCACTTGCTCAGTGGACTGGACAGCGGACCGTGCCCAATGTGTTCATAGGTG
GAAAGCACATTGGTGGCTGTGATGCAACCGTAGCACTGAATAATAAAGGGGGGTTGGTTCCTCTGTTGACTGAAGCGGGAGCAATTGCCAAAGTTACTGCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TATTCTCACGCGATGCCATGGACCATGCCGTCTTGATTTATTTATTAACAATAATATTTTCATTTTGAATTCGTGTTTCTTTCTTGACTGTCATTTCCTTAAGAGCTCGC
ACCGTTAGGGGTTCAGATTTTGTGCAGATTCGATCGATAATGGCGTTGGAAAAGGCTAAAGAGATCGTCGCTTCAAATCCCGTCGCCGTCTTCAGCAAGACTTCATGTCC
GTTCTGCGTTCAGGTGAAGAGGCTTTTGACTGGTCTCGGAGCCTCTTTTAAGGCTGTTGAATTGGATACTGAGAGTGATGGAAAAGATGTACAAGCAGCACTTGCTCAGT
GGACTGGACAGCGGACCGTGCCCAATGTGTTCATAGGTGGAAAGCACATTGGTGGCTGTGATGCAACCGTAGCACTGAATAATAAAGGGGGGTTGGTTCCTCTGTTGACT
GAAGCGGGAGCAATTGCCAAAGTTACTGCTTAGAGAAGAAGTCTGTTATCACATAAATAAACGTTCTACTTATGATTTTCTAGTTGCATTATTGTCTTTTCTTCTAAAAA
AAATGCTTTTACAGTGGAATTTTAGTTTGTATAAATAACTGGAAGGAACTTGTGCTTCCTTTGCATCTATGGTAAATGTCCCAAGTTTCCTATAGCCGGATTGTTTCTAT
ATTTTTAAACAAAATTCTAGTTCAGCCTTGGAGTCTTGGATGCCTGGATTTTGATTTTTTTTCATTGTTGCAGTAATCCAAATGCCCATCTCATGAGAATTTTGGATTAC
CAAGAAGTGAACGACCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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