CuGenDBv2

Gene ID	Sed0006798
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	Derlin
Genome location	LG14:22369523..22373852
RNA-Seq Expression	Sed0006798
Synteny	Sed0006798
Gene Ontology terms	GO:0030433 - ubiquitin-dependent ERAD pathway (biological process) GO:0030968 - endoplasmic reticulum unfolded protein response (biological process) GO:0000839 - Hrd1p ubiquitin ligase ERAD-L complex (cellular component) GO:0030176 - integral component of endoplasmic reticulum membrane (cellular component) GO:0051787 - misfolded protein binding (molecular function) GO:1990381 - ubiquitin-specific protease binding (molecular function)
InterPro domains	IPR007599 - Derlin IPR035952 - Rhomboid-like superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_004134757.1 derlin-2.2 [Cucumis sativus]

6.5e-128

95.49

Show/hide

Query:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML
        MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAA+ATTIGCSL+IISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFR+MDLDF+FHMFFL RYCKLLEENSFRGRTADFFYML
Subjt:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML

Query:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
        LFGATVLT IVLVGG IPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
Subjt:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP

Query:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD
        RMTGRRPL+TPSFI+ALFADEAVVVARP DLRFAAPA EDIHQD
Subjt:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD

XP_008439977.1 PREDICTED: derlin-2.2 [Cucumis melo]

1.9e-127

95.08

Show/hide

Query:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML
        MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAA+ TTIGCSL+IISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFR+MDLDF+FHMFFL RYCKLLEENSFRGRTADFFYML
Subjt:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML

Query:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
        LFGATVLT IVLVGG IPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
Subjt:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP

Query:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD
        RMTGRRPL+TPSFI+ALFADEAVVVARP DLRFAAPA EDIHQD
Subjt:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD

XP_022926636.1 derlin-2.2-like [Cucurbita moschata]

2.7e-126

94.26

Show/hide

Query:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML
        MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAA+ TTIGCSL+II PHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFR+MDLDF+FHMFFL RYCKLLEENSFRGRTADF YML
Subjt:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML

Query:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
        LFGATVLT IVLVGG IPYLSESIAEV+FLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
Subjt:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP

Query:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD
        RMTGRRPL+TPSFIRALFA+EAVVVARPVDLRFAAPA EDIHQD
Subjt:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD

XP_022950204.1 derlin-2.2 [Cucurbita moschata]

1.2e-129

97.13

Show/hide

Query:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML
        MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAA+ATTIGCSL+IISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFR+MDLDF+FHMFFL RYCKLLEENSFRGRTADFFYML
Subjt:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML

Query:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
        LFGATVLTAIVLVGG IPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
Subjt:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP

Query:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD
        RMTGRRPL+TPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD
Subjt:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD

XP_038882799.1 derlin-2.2 [Benincasa hispida]

2.2e-128

95.9

Show/hide

Query:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML
        MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAA+ATTIGCSL+IISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFR+MDLDF+FHMFFL RYCKLLEENSFRGRTADFFYML
Subjt:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML

Query:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
        LFGATVLT IVLVGG IPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
Subjt:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP

Query:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD
        RMTGRRPL+TPSFI+ALFADEAVVVARPVDLRFAAPA EDIHQD
Subjt:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KHD5 Derlin

3.1e-128

95.49

Show/hide

Query:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML
        MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAA+ATTIGCSL+IISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFR+MDLDF+FHMFFL RYCKLLEENSFRGRTADFFYML
Subjt:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML

Query:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
        LFGATVLT IVLVGG IPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
Subjt:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP

Query:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD
        RMTGRRPL+TPSFI+ALFADEAVVVARP DLRFAAPA EDIHQD
Subjt:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD

A0A1S3B028 Derlin

9.1e-128

95.08

Show/hide

Query:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML
        MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAA+ TTIGCSL+IISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFR+MDLDF+FHMFFL RYCKLLEENSFRGRTADFFYML
Subjt:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML

Query:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
        LFGATVLT IVLVGG IPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
Subjt:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP

Query:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD
        RMTGRRPL+TPSFI+ALFADEAVVVARP DLRFAAPA EDIHQD
Subjt:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD

A0A5D3CPU8 Derlin

9.1e-128

95.08

Show/hide

Query:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML
        MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAA+ TTIGCSL+IISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFR+MDLDF+FHMFFL RYCKLLEENSFRGRTADFFYML
Subjt:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML

Query:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
        LFGATVLT IVLVGG IPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
Subjt:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP

Query:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD
        RMTGRRPL+TPSFI+ALFADEAVVVARP DLRFAAPA EDIHQD
Subjt:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD

A0A6J1GF48 Derlin

5.7e-130

97.13

Show/hide

Query:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML
        MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAA+ATTIGCSL+IISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFR+MDLDF+FHMFFL RYCKLLEENSFRGRTADFFYML
Subjt:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML

Query:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
        LFGATVLTAIVLVGG IPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
Subjt:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP

Query:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD
        RMTGRRPL+TPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD
Subjt:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD

A0A6J1IN59 Derlin

5.7e-130

97.13

Show/hide

Query:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML
        MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAA+ATTIGCSL+IISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFR+MDLDF+FHMFFL RYCKLLEENSFRGRTADFFYML
Subjt:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML

Query:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
        LFGATVLTAIVLVGG IPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
Subjt:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP

Query:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD
        RMTGRRPL+TPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD
Subjt:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q4G2J3 Derlin-2.2

2.6e-111

81.86

Show/hide

Query:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML
        MAQAVEEWY+QMPIITRSYLTAAV TT+GC+LEIISP+HLYLNP LV + Y+ WRL+TNFL+FR+MDLDF+FHMFFL RYCKLLEENSFRGRTADFFYML
Subjt:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML

Query:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
        LFGATVLT IVL+GG IPY+SE+ A ++FLSNSLTFMMVYVWSK NPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFS+LVG+S WVDLLGM+AGH YYFLEDVYP
Subjt:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP

Query:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPA
        RMTGRRPL+TPSFI+ALFAD+ VVVA+P +    A A
Subjt:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPA

Q4G2J4 Derlin-2.1

2.0e-111

81.86

Show/hide

Query:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML
        MAQAVEEWY+QMPIITRSYLTAAV TT+GC+LEIISP+HLYLNP LV + Y+ WRL+TNFL+FR+MDLDF+FHMFFL RYCKLLEENSFRGRTADFFYML
Subjt:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML

Query:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
        LFGATVLT+IVL+GG IPY+SE+ A ++FLSNSLTFMMVYVWSK NPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFS+LVG+S WVDLLGM+AGH YYFLEDVYP
Subjt:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP

Query:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPA
        RMTGRRPL+TPSFI+ALFAD+ VVVA+P +    A A
Subjt:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPA

Q851X7 Derlin-2

8.8e-112

82.28

Show/hide

Query:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML
        MAQAVEEWY+QMPIITRSYLTAAV TT+GC+LEIISP+HLYLNP LV + Y+ WRL+TNFL+FR+MDLDF+FHMFFL RYCKLLEENSFRGRTADFFYML
Subjt:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML

Query:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
        LFGATVLT IVL+GG IPY+SE+ A ++FLSNSLTFMMVYVWSK NPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFS+LVG+S WVDLLGM+AGH YYFLEDVYP
Subjt:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP

Query:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPA
        RMTGRRPL+TPSFI+ALFAD+ VVVARP +    A A
Subjt:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPA

Q8VZ96 Derlin-2.1

8.5e-115

82.38

Show/hide

Query:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML
        MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAV TT+GCSLEIISP++LYLNP LV K+YQFWRL+TNFL+FR+MDLDF+FHMFFL RYCKLLEENSFRG+TADF YML
Subjt:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML

Query:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
        LFGATVLT IVL+GG IPYLS S +++IFLSNSLTFMMVYVWSKQNP+IHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFS+LVGASAW D LGM+AGHAYYFL  VYP
Subjt:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP

Query:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD
        RMT RRPL+TPSF++ALFADE VV+ARP D+RFA    ++IHQD
Subjt:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD

Q9ZS88 Derlin-2.2

4.1e-117

83.61

Show/hide

Query:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML
        MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAV TT+GCSL+IISP++LYLNP LV K+YQ+WRL+TNFL+FR+MDLDFMFHMFFL RYCKLLEENSFRG+TADF YML
Subjt:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML

Query:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
        LFGA+VLT IVL+GG IPYLS S A++IFLSNSLTFMMVYVWSKQNP+IHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFS+LVGASAWVDLLGM+AGHAYYFL +VYP
Subjt:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP

Query:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD
        RMT RRPL+TPSF++ALFADE VVVARP D+RFAA   ++IHQD
Subjt:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G04860.1 DERLIN-2.2

2.9e-118

83.61

Show/hide

Query:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML
        MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAV TT+GCSL+IISP++LYLNP LV K+YQ+WRL+TNFL+FR+MDLDFMFHMFFL RYCKLLEENSFRG+TADF YML
Subjt:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML

Query:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
        LFGA+VLT IVL+GG IPYLS S A++IFLSNSLTFMMVYVWSKQNP+IHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFS+LVGASAWVDLLGM+AGHAYYFL +VYP
Subjt:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP

Query:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD
        RMT RRPL+TPSF++ALFADE VVVARP D+RFAA   ++IHQD
Subjt:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD

AT4G21810.1 DERLIN-2.1

6.1e-116

82.38

Show/hide

Query:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML
        MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAV TT+GCSLEIISP++LYLNP LV K+YQFWRL+TNFL+FR+MDLDF+FHMFFL RYCKLLEENSFRG+TADF YML
Subjt:  MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYML

Query:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP
        LFGATVLT IVL+GG IPYLS S +++IFLSNSLTFMMVYVWSKQNP+IHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFS+LVGASAW D LGM+AGHAYYFL  VYP
Subjt:  LFGATVLTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYP

Query:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD
        RMT RRPL+TPSF++ALFADE VV+ARP D+RFA    ++IHQD
Subjt:  RMTGRRPLRTPSFIRALFADEAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD

AT4G29330.1 DERLIN-1

6.6e-38

39.44

Show/hide

Query:  EWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYMLLFGATV
        E+Y  +P IT++Y T    TT+   L +++P H+ L P LV K++Q WRLITN  F     ++F   +  + RY   LE+  F  RTADF +M++FG+  
Subjt:  EWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYMLLFGATV

Query:  LTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYPRMTGRR
        L    LV   IP+         FL  SL FM++Y+WS++ P  ++S  GL T  A YLPW +L   V+ G+    DLLG++AGH YYFL  ++P  TG+ 
Subjt:  LTAIVLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYPRMTGRR

Query:  PLRTPSFIRALFA
         L+TP ++  + A
Subjt:  PLRTPSFIRALFA

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTCAAGCTGTTGAAGAATGGTACAAGCAAATGCCTATTATCACCCGCTCCTATCTCACTGCCGCTGTTGCAACCACAATCGGCTGTTCCCTTGAAATTATCTCTCC
ACACCATCTCTACTTGAACCCTATCCTTGTGGCCAAGAAGTATCAGTTCTGGCGTCTCATTACCAACTTCCTGTTCTTCCGTAGAATGGATTTGGACTTTATGTTTCACA
TGTTTTTTCTGGGCCGATACTGTAAACTTCTGGAAGAGAACTCTTTTAGGGGAAGAACAGCTGATTTCTTTTATATGCTCTTATTTGGGGCCACGGTGCTAACTGCAATT
GTTTTGGTTGGGGGAACGATACCATACTTGTCCGAGTCAATCGCCGAAGTTATATTCCTTAGCAACTCGTTGACATTCATGATGGTTTATGTGTGGAGCAAGCAAAACCC
ATTCATCCATATGAGCTTTTTAGGCCTCTTTACTTTTACGGCAGCTTACCTGCCATGGGTTCTTCTAGGATTCTCCGTACTTGTTGGGGCAAGTGCTTGGGTGGATCTAC
TGGGTATGGTTGCTGGCCACGCTTATTATTTTCTTGAAGACGTGTACCCACGAATGACAGGCCGACGACCATTGAGAACCCCATCCTTTATCAGAGCATTATTTGCTGAT
GAAGCCGTCGTAGTGGCACGGCCGGTGGATTTGAGATTTGCAGCCCCTGCTGTGGAGGATATTCATCAAGATTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

GCGCCAAATCGTCACCTTCCCCGTAAAAGAGCAGATATCTGATTCCTTCTCCTTCGAACTTGCGGATCTCTCTGTGTGTGATTGTGCCGGAGAATCTCATCGCTCCAAGC
TCCGATCGTTTTTTTCCGGCGGCCAATCATTAGCTCCGATCTTCAACTGACGTTTTTCTTGATCGGAAAATCAACTTTCCGAGATTCGATGGCTCAAGCTGTTGAAGAAT
GGTACAAGCAAATGCCTATTATCACCCGCTCCTATCTCACTGCCGCTGTTGCAACCACAATCGGCTGTTCCCTTGAAATTATCTCTCCACACCATCTCTACTTGAACCCT
ATCCTTGTGGCCAAGAAGTATCAGTTCTGGCGTCTCATTACCAACTTCCTGTTCTTCCGTAGAATGGATTTGGACTTTATGTTTCACATGTTTTTTCTGGGCCGATACTG
TAAACTTCTGGAAGAGAACTCTTTTAGGGGAAGAACAGCTGATTTCTTTTATATGCTCTTATTTGGGGCCACGGTGCTAACTGCAATTGTTTTGGTTGGGGGAACGATAC
CATACTTGTCCGAGTCAATCGCCGAAGTTATATTCCTTAGCAACTCGTTGACATTCATGATGGTTTATGTGTGGAGCAAGCAAAACCCATTCATCCATATGAGCTTTTTA
GGCCTCTTTACTTTTACGGCAGCTTACCTGCCATGGGTTCTTCTAGGATTCTCCGTACTTGTTGGGGCAAGTGCTTGGGTGGATCTACTGGGTATGGTTGCTGGCCACGC
TTATTATTTTCTTGAAGACGTGTACCCACGAATGACAGGCCGACGACCATTGAGAACCCCATCCTTTATCAGAGCATTATTTGCTGATGAAGCCGTCGTAGTGGCACGGC
CGGTGGATTTGAGATTTGCAGCCCCTGCTGTGGAGGATATTCATCAAGATTAGCTATTAGAACATTCAAGCAATCTAGTGAACTGGAGGAAGAAGTAAATTCTGATGACA
AGGAATGTAATTTTCATCTGTAACATAGCACACACAAATTTGGCTTGATTTCCCCCCTTTCAAGTTTTATGATTGCCTTAGTGTGATTGTGAATCTAAATTGCCCATTTT
GTTTGCACTGGAATTTCTTGATTCAAAATGTTACTTCTGAAGAAGATAGATTTAACCCATTTCATGGCTCGTTCCTTAGTCCTTACTAGACAGTGCTCTGACTCGAACAA
AAGCATATTGAGTATACAAATTGGTTGTGATCTGATTATACTTCTTGTATACAAATACTGTTCAATTGATCAAG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAQAVEEWYKQMPIITRSYLTAAVATTIGCSLEIISPHHLYLNPILVAKKYQFWRLITNFLFFRRMDLDFMFHMFFLGRYCKLLEENSFRGRTADFFYMLLFGATVLTAI
VLVGGTIPYLSESIAEVIFLSNSLTFMMVYVWSKQNPFIHMSFLGLFTFTAAYLPWVLLGFSVLVGASAWVDLLGMVAGHAYYFLEDVYPRMTGRRPLRTPSFIRALFAD
EAVVVARPVDLRFAAPAVEDIHQD

Sed0006798 (gene) of Chayote v1 genome