; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0006867 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0006867
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationLG08:35013748..35016078
RNA-Seq ExpressionSed0006867
SyntenySed0006867
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607465.1 hypothetical protein SDJN03_00807, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.3e-8477.97Show/hide
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XP_022137016.1 uncharacterized protein LOC111008581 [Momordica charantia]7.0e-8476.11Show/hide
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XP_022948859.1 uncharacterized protein LOC111452392 [Cucurbita moschata]4.1e-8477.97Show/hide
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XP_022997987.1 uncharacterized protein LOC111492777 [Cucurbita maxima]2.1e-8075.22Show/hide
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XP_023524923.1 uncharacterized protein LOC111788705 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.6e-8377.09Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LVK1 Uncharacterized protein5.8e-6867.84Show/hide
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A0A1S3BA65 uncharacterized protein LOC1034878353.7e-6768.28Show/hide
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        FSDDE SH  SPKP+  +I+K M  S W+ +GVQILR RI +MAS++WSNA    AFW+FSPAGRIGLLVTL WLYKRAR RR  RST QLKMM+++KDE
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A0A6J1C560 uncharacterized protein LOC1110085813.4e-8476.11Show/hide
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A0A6J1GB64 uncharacterized protein LOC1114523922.0e-8477.97Show/hide
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A0A6J1K6L4 uncharacterized protein LOC1114927771.0e-8075.22Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G61360.1 unknown protein2.1e-0630.88Show/hide
Query:  EWSMVVIRDS--LPNGDFSVFPPSNHEN-----LQPPSIEQRERGSPASFLSDSPPSSFRSSQSSSSFSSLSFSDDETSHSLSPKPADCRIRKSMAVSSW
        ++ MV +R+S      D ++FPP NHEN     L+ PS+      S +S LSD   SSF  S S   F     S  + S  +   P    I   +    W
Subjt:  EWSMVVIRDS--LPNGDFSVFPPSNHEN-----LQPPSIEQRERGSPASFLSDSPPSSFRSSQSSSSFSSLSFSDDETSHSLSPKPADCRIRKSMAVSSW

Query:  MAFGVQILRSRIASMASSVWSNAARRTAFWVFSPAGR--IGLLVTLWWLYKRARSRRRHRS----TKQLKMMIRDKDEKINQLLQQVAQLNRLLLAQQKV
             +IL +R+ S   ++      R +   FS   R    ++V   W +KR R+RRR          L+  I+++DE+I QLL Q+ Q+N LL+   K+
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Query:  LPSN
          SN
Subjt:  LPSN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGGTGATGAACCCAGATCGGTTTTCGACTTGGAAAACTTCCCTTTTCTCAGTTCCCATCACTCGTCTTCTTCATCTCCGCAACGCACAATCGAATTGAAAGAATG
GTCCATGGTGGTGATTAGGGATTCTCTTCCCAATGGCGATTTCTCCGTTTTCCCGCCTTCGAATCACGAGAATCTTCAGCCCCCGTCGATCGAACAACGCGAACGAGGAA
GCCCGGCTTCGTTTCTGTCGGATTCGCCGCCGTCGTCGTTTAGGTCGTCCCAATCGTCGTCGTCGTTCTCGTCGTTGTCATTTTCTGATGATGAGACTTCGCATTCACTG
TCGCCGAAGCCGGCCGATTGTCGAATTCGAAAATCCATGGCGGTTTCGAGTTGGATGGCTTTTGGGGTTCAGATTCTACGCTCACGGATTGCTTCAATGGCTTCCTCAGT
TTGGTCCAATGCTGCGCGTAGAACGGCGTTTTGGGTGTTTTCCCCTGCTGGAAGGATTGGGTTATTGGTGACTCTTTGGTGGTTGTATAAGAGAGCTCGTTCGCGCCGCC
GGCATCGGAGTACAAAACAATTGAAGATGATGATCAGGGACAAAGACGAGAAGATCAATCAACTGCTGCAACAAGTAGCACAATTGAATAGATTACTGTTAGCTCAACAG
AAAGTACTGCCATCAAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTTGATCTTGAAAGTAAACAAGGAATAACTAGAATGGGACTGTTTGTCATCTGTAATTCTGATGGACCTTGTTTTGTTTGGGCCTTTTGTGATATCCTCACATGGATAT
GGACATTTAGGGCAACCAAAAAAGCACAAATCTTCAATGGCAAAATTTTGGATTTCAATTATGGATAGACTCCAGGATTTGGCCCCAAATTGGAAGTTCAATCTTACAAG
CAAACGAACAACAAAGCCCACCTCAAATCTTCTCTTCATCTTCCATTTCCTCCAATTCTTCTTCTTTATGTTGAATCAACAACTGGGTCTTCGCGTTCATGGCCGGTGAT
GAACCCAGATCGGTTTTCGACTTGGAAAACTTCCCTTTTCTCAGTTCCCATCACTCGTCTTCTTCATCTCCGCAACGCACAATCGAATTGAAAGAATGGTCCATGGTGGT
GATTAGGGATTCTCTTCCCAATGGCGATTTCTCCGTTTTCCCGCCTTCGAATCACGAGAATCTTCAGCCCCCGTCGATCGAACAACGCGAACGAGGAAGCCCGGCTTCGT
TTCTGTCGGATTCGCCGCCGTCGTCGTTTAGGTCGTCCCAATCGTCGTCGTCGTTCTCGTCGTTGTCATTTTCTGATGATGAGACTTCGCATTCACTGTCGCCGAAGCCG
GCCGATTGTCGAATTCGAAAATCCATGGCGGTTTCGAGTTGGATGGCTTTTGGGGTTCAGATTCTACGCTCACGGATTGCTTCAATGGCTTCCTCAGTTTGGTCCAATGC
TGCGCGTAGAACGGCGTTTTGGGTGTTTTCCCCTGCTGGAAGGATTGGGTTATTGGTGACTCTTTGGTGGTTGTATAAGAGAGCTCGTTCGCGCCGCCGGCATCGGAGTA
CAAAACAATTGAAGATGATGATCAGGGACAAAGACGAGAAGATCAATCAACTGCTGCAACAAGTAGCACAATTGAATAGATTACTGTTAGCTCAACAGAAAGTACTGCCA
TCAAATTAGAAAATGTGTCAAGATGGGAATTGTTTAGCTTATATCACAGGGATGAGGCAACAAGAAGTATTGCAGCTATTCTGAGTGTCTTGCTCATCCAATTACAACAA
TATTCATTATATTATAGCTAGATTCCTGTAGCTGCAGATTTGAACTAGGGACAGAAGCTCAAGCCTTTGCAGCGCAAGAACATAAGACACCATATCATGTATGCCTCAAA
TAACATGATGTGTTTGTGTTGCAGAAAAAGAGATTATCAGTTCAGAGCTGGAATGTATAAAGATGATTTGTATTGATTTTTTTTCAGTATTTGTTCTAATATATATATTC
CATCAGAATCGCTTGTATTGTCTTTACTAACTGGGAAGACACCTAATGATAATGCGTATGCACCAGAATATTGGATTTGTAAATAGATACGATTTGGCCTGCAATGTTGA
AACTGAAGCTTGTATTTCTTGCAACAGCACACTCCAACTAAGTAAATTATATATTATCAATGTAGAAGAGTTGGATCAAATCAGAAACCAAAAAGAACAAAAAACTATGT
ACTTCTTGATAAGCATCCCTTCCAATGGAAACTGATCAGAGGGCACTACCTGAATGAATCATGATGAATGAGGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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KVLPSN