| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_008457020.1 PREDICTED: THO complex subunit 4D [Cucumis melo] | 7.3e-118 | 81.91 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
MTTPLDMSLED+IKKNNREK RARGRA RGRGA GSFNGGRGV IG VRR PLGINAR S+YSI KPP RMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTGVNGRNKRTVVLM
VSNLDYGVTKED+RELFSEIGDLK F+IH+DKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKP+KIE+LG NAEMP+SARINVTG NGRN+RTVVL
Subjt: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTGVNGRNKRTVVLM
Query: SESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHAEAMQT
ESGR +FN PF G +RGG RN GRGRG W GLGG GG GRGRGRG GRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: SESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_022935328.1 THO complex subunit 4D-like [Cucurbita moschata] | 1.5e-118 | 81 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
M TPLDMSLED+IKKNNREK RARGRA RGRGA GS+NGGR V IG VRR PLGINARPS++SISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTGVNGRNKRTVVLM
VSNLDYGVTKED+RELFSEIGDLK F+IH+DKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKP+KIE+LG NA+ P+SARINVTGVNGR++RTVVL
Subjt: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTGVNGRNKRTVVLM
Query: SESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRN--GHGRGRGGWN-GVGGLGGR----GGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHAEAMQT
SESGR TGS +A PF G +RGG R+ G GRGRGGW+ G+GG GGR GG GRGRG G GRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: SESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRN--GHGRGRGGWN-GVGGLGGR----GGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_022982649.1 THO complex subunit 4D-like [Cucurbita maxima] | 1.7e-119 | 79.35 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
M TPLDMSLED+IKKNNREK RARGRA RGRGA GS+NGGR V IG VRR PLGINARPS++SISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTGVNGRNKRTVVLM
VSNLDYGVTKED+RELFSEIGDLK F+IH+DKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKP+KIE+LG NA+ P+SARINVTGVNGR++RTVVL
Subjt: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTGVNGRNKRTVVLM
Query: SESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWN-GVGGLGGRG-GNGRGRGRGGRG---------------GRGQGRKKPVEKSSVELDKEL
SESGR TGS NA PF G +RGG R+G GRGRGGW+ G+GG GGRG G G GRG GGRG GRGQGRKKPVEKSS ELDKEL
Subjt: SESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWN-GVGGLGGRG-GNGRGRGRGGRG---------------GRGQGRKKPVEKSSVELDKEL
Query: ENYHAEAMQT
ENYHAEAMQT
Subjt: ENYHAEAMQT
|
|
| XP_023527122.1 THO complex subunit 4D [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 3.9e-119 | 81.33 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
M TPLDMSLED+IKKNNREK RARGRA RGRGA GS+NGGR V IG VRR PLGINARPS++SISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTGVNGRNKRTVVLM
VSNLDYGVTKED+RELFSEIGDLK F+IH+DKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKP+KIE+LG NA+ P+SARINVTGVNGR++RTVVL
Subjt: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTGVNGRNKRTVVLM
Query: SESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRN--GHGRGRGGWN-GVGGLGGR----GGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHAEAMQT
SESGR TGS NA PF G +RGG R+ G GRGRGGW+ G+GG GGR GG GRGRG G GRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: SESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRN--GHGRGRGGWN-GVGGLGGR----GGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_038896761.1 THO complex subunit 4D-like [Benincasa hispida] | 1.5e-118 | 81.91 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
M TPLDMSLED+IKK+NREK RARGRA RGRGA GSFNGGRGV +G VRR PLGINAR S+YSI KPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTGVNGRNKRTVVLM
VSNLDYGV+KED+RELFSEIGDLK F+IH+DKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDG+P+KIE+LG NAEMP+SARINVTGVNGR++RTVVL
Subjt: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTGVNGRNKRTVVLM
Query: SESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHAEAMQT
ESGR T S N PF G +RGG RNG GRGRGGWN G+GG GG GRGRGRG GRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: SESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHAEAMQT
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0L717 RRM domain-containing protein | 5.1e-93 | 87.94 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
MTTPLDMSLED+IKKNNREK RARGRA RGRGA GSFNGGRGV IG VRR PLGINAR S+YSI KPP RMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTGVNGRNKRTVVL
VSNLDYGVTKED++ELFSEIGD+K F+IH+DKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKP+KIE+LG NAEMP+SARINVTG NGRN+RTVVL
Subjt: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTGVNGRNKRTVVL
|
|
| A0A1S3C452 THO complex subunit 4D | 3.5e-118 | 81.91 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
MTTPLDMSLED+IKKNNREK RARGRA RGRGA GSFNGGRGV IG VRR PLGINAR S+YSI KPP RMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTGVNGRNKRTVVLM
VSNLDYGVTKED+RELFSEIGDLK F+IH+DKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKP+KIE+LG NAEMP+SARINVTG NGRN+RTVVL
Subjt: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTGVNGRNKRTVVLM
Query: SESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHAEAMQT
ESGR +FN PF G +RGG RN GRGRG W GLGG GG GRGRGRG GRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: SESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1CP51 THO complex subunit 4D-like | 1.1e-111 | 79.59 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
M TPLDMSLEDMIKKNNREK RARGRA RGRGA GSFNGGR V IG +RR PL IN RPS++SISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTGVNGRNKRTVVLM
VSNLDYGVTKED+RELFSEIGDLK F+IH+DKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKP+KIE+LG NAEMP+SARINVTG+NGR++RTVVL
Subjt: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTGVNGRNKRTVVLM
Query: SESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWN-GVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHAEAMQT
SESGR T S F G NRG R G GRGRGGW+ G G +G GG GRGRGR GRG GRKK VEKSS ELDK+LENYHAEAMQT
Subjt: SESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWN-GVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1FAB9 THO complex subunit 4D-like | 7.1e-119 | 81 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
M TPLDMSLED+IKKNNREK RARGRA RGRGA GS+NGGR V IG VRR PLGINARPS++SISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTGVNGRNKRTVVLM
VSNLDYGVTKED+RELFSEIGDLK F+IH+DKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKP+KIE+LG NA+ P+SARINVTGVNGR++RTVVL
Subjt: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTGVNGRNKRTVVLM
Query: SESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRN--GHGRGRGGWN-GVGGLGGR----GGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHAEAMQT
SESGR TGS +A PF G +RGG R+ G GRGRGGW+ G+GG GGR GG GRGRG G GRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: SESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRN--GHGRGRGGWN-GVGGLGGR----GGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1J564 THO complex subunit 4D-like | 8.4e-120 | 79.35 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
M TPLDMSLED+IKKNNREK RARGRA RGRGA GS+NGGR V IG VRR PLGINARPS++SISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTGVNGRNKRTVVLM
VSNLDYGVTKED+RELFSEIGDLK F+IH+DKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKP+KIE+LG NA+ P+SARINVTGVNGR++RTVVL
Subjt: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTGVNGRNKRTVVLM
Query: SESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWN-GVGGLGGRG-GNGRGRGRGGRG---------------GRGQGRKKPVEKSSVELDKEL
SESGR TGS NA PF G +RGG R+G GRGRGGW+ G+GG GGRG G G GRG GGRG GRGQGRKKPVEKSS ELDKEL
Subjt: SESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWN-GVGGLGGRG-GNGRGRGRGGRG---------------GRGQGRKKPVEKSSVELDKEL
Query: ENYHAEAMQT
ENYHAEAMQT
Subjt: ENYHAEAMQT
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| B5FXN8 THO complex subunit 4 | 5.0e-29 | 37.09 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRAR-GRAHRGRG--------ARGSFNGGRGVGIGLVRRAPL----GINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRA
M +DMSL+D+IK N ++ +R GR RGRG RG GGR G G VR P+ G RP+ YS P+++ +WQHDLF+ A
Subjt: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRAR-GRAHRGRG--------ARGSFNGGRGVGIGLVRRAPL----GINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRA
Query: SGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVT
+G+E G KL VSNLD+GV+ D++ELF+E G LK ++H+D++GR G+A+V + R++DA A+K+YN V LDG+P+ I++ VT
Subjt: SGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVT
Query: GVNGRNKRTVVLMSESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRG-GRGQGRKKPVEKSSVELDKELENY
+R ++ G T RNRG +GG GG GGN RG G RG GRG GR + S+ ELD +L+ Y
Subjt: GVNGRNKRTVVLMSESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRG-GRGQGRKKPVEKSSVELDKELENY
Query: HA
+A
Subjt: HA
|
|
| Q6NQ72 THO complex subunit 4D | 8.5e-69 | 53.87 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
M+ L+M+L++++K+ + RG RGRG RG GGRG G RR PL +NARPSS++I+KP RR++++ WQ LFED LRA+G SG+E+GT+L+
Subjt: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHN--AEMPISAR--INVTGVNGRNKRT
V+NLD GVT ED+RELFSEIG+++ ++IH+DKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+P+++E+LG N +E P+S R +NVTG+NGR KRT
Subjt: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHN--AEMPISAR--INVTGVNGRNKRT
Query: VVLMSESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHAEAMQT
VV+ G G G P + R N G G G G GRG GRGRG GGRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt: VVLMSESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHAEAMQT
|
|
| Q8L719 THO complex subunit 4B | 1.9e-44 | 45.57 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------
M+ LDMSL+D+I K+NR+ +RGR G G GG G G RR + AR + YS ++ + WQ+D+F + S+ A+
Subjt: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------
Query: GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTG
G S IE GTKLY+SNLDYGV+ ED++ELFSE+GDLK + IH+D++GR G+AEVV++RR DA AA+KRYNNV LDGK +KIE++G N P +
Subjt: GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTG
Query: VNGRNKRTVVLMSESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHA
+ + +E+ G+FN G+FN F G R RGGF GR RGG G GG RGG G RGRGGRG G+GR + V S+ +LD EL+ YH
Subjt: VNGRNKRTVVLMSESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHA
Query: EAMQT
EAM+T
Subjt: EAMQT
|
|
| Q8L773 THO complex subunit 4A | 8.3e-40 | 41.81 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRR-APLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLF----EDSLRASGISGIEI
M+T LDMSL+DMI KN ++RG A RG G G G G RR P + R + Y +K P W HD+F ED +GIE
Subjt: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRR-APLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLF----EDSLRASGISGIEI
Query: GTKLYVSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTGVNGRNKR
GTKLY+SNLDYGV ED++ELF+E+G+LK +++HFD++GR G+AEVVY+RR DA AA+K+YN+V LDGKP+KIE++G N +
Subjt: GTKLYVSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTGVNGRNKR
Query: TVVLMSESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVE-LDKELENYHAEAMQT
T + + RP G N +R G GRG G G GGRGG GRGR R G+G P EK S E LD +L+ YH+ M+T
Subjt: TVVLMSESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVE-LDKELENYHAEAMQT
|
|
| Q94EH8 THO complex subunit 4C | 1.2e-62 | 49.84 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRA-----RGRAHRGRGARGSFNG--GRGVGIGLVRRAPLGINARP-SSYSISKPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRASGI
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G + + RG NG G G G G VRR PL +N RP SS+SI+K RR +++ W Q+DL+E++LRA G+
Subjt: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRA-----RGRAHRGRGARGSFNG--GRGVGIGLVRRAPLGINARP-SSYSISKPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRASGI
Query: SGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAE-MPISARINVTGV
SG+E+GT +Y++NLD GVT ED+REL++EIG+LK ++IH+DKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+P+K+E+LG N E P++AR+NVTG+
Subjt: SGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAE-MPISARINVTGV
Query: NGRNKRTVVLMSESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRG--------GWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGR-----GQGRKKPVEKSS
NGR KR+V F G RGG R G GRG G N GG+ G RGRGRG GGR G+G KKPVEKS+
Subjt: NGRNKRTVVLMSESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRG--------GWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGR-----GQGRKKPVEKSS
Query: VELDKELENYHAEAM
+LDK+LE+YHAEAM
Subjt: VELDKELENYHAEAM
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G66260.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 8.5e-64 | 49.84 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRA-----RGRAHRGRGARGSFNG--GRGVGIGLVRRAPLGINARP-SSYSISKPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRASGI
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G + + RG NG G G G G VRR PL +N RP SS+SI+K RR +++ W Q+DL+E++LRA G+
Subjt: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRA-----RGRAHRGRGARGSFNG--GRGVGIGLVRRAPLGINARP-SSYSISKPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRASGI
Query: SGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAE-MPISARINVTGV
SG+E+GT +Y++NLD GVT ED+REL++EIG+LK ++IH+DKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+P+K+E+LG N E P++AR+NVTG+
Subjt: SGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAE-MPISARINVTGV
Query: NGRNKRTVVLMSESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRG--------GWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGR-----GQGRKKPVEKSS
NGR KR+V F G RGG R G GRG G N GG+ G RGRGRG GGR G+G KKPVEKS+
Subjt: NGRNKRTVVLMSESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRG--------GWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGR-----GQGRKKPVEKSS
Query: VELDKELENYHAEAM
+LDK+LE+YHAEAM
Subjt: VELDKELENYHAEAM
|
|
| AT1G66260.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 8.5e-64 | 49.84 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRA-----RGRAHRGRGARGSFNG--GRGVGIGLVRRAPLGINARP-SSYSISKPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRASGI
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G + + RG NG G G G G VRR PL +N RP SS+SI+K RR +++ W Q+DL+E++LRA G+
Subjt: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRA-----RGRAHRGRGARGSFNG--GRGVGIGLVRRAPLGINARP-SSYSISKPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRASGI
Query: SGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAE-MPISARINVTGV
SG+E+GT +Y++NLD GVT ED+REL++EIG+LK ++IH+DKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+P+K+E+LG N E P++AR+NVTG+
Subjt: SGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAE-MPISARINVTGV
Query: NGRNKRTVVLMSESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRG--------GWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGR-----GQGRKKPVEKSS
NGR KR+V F G RGG R G GRG G N GG+ G RGRGRG GGR G+G KKPVEKS+
Subjt: NGRNKRTVVLMSESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRG--------GWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGR-----GQGRKKPVEKSS
Query: VELDKELENYHAEAM
+LDK+LE+YHAEAM
Subjt: VELDKELENYHAEAM
|
|
| AT5G02530.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 8.0e-46 | 44.92 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------
M+ LDMSL+D+I K+NR+ +RGR G G GG G G RR + AR + YS ++ + WQ+D+F + S+ A+
Subjt: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------
Query: GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTG
G S IE GTKLY+SNLDYGV+ ED++ELFSE+GDLK + IH+D++GR G+AEVV++RR DA AA+KRYNNV LDGK +KIE++G N P +
Subjt: GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHNAEMPISARINVTG
Query: VNGRNKRTVVLMSESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHA
+ + +E+ G+FN G+FN R RGGF GR RGG G GG RGG G RGRGGRG G+GR + V S+ +LD EL+ YH
Subjt: VNGRNKRTVVLMSESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHA
Query: EAMQT
EAM+T
Subjt: EAMQT
|
|
| AT5G37720.1 ALWAYS EARLY 4 | 6.0e-70 | 53.87 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
M+ L+M+L++++K+ + RG RGRG RG GGRG G RR PL +NARPSS++I+KP RR++++ WQ LFED LRA+G SG+E+GT+L+
Subjt: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHN--AEMPISAR--INVTGVNGRNKRT
V+NLD GVT ED+RELFSEIG+++ ++IH+DKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+P+++E+LG N +E P+S R +NVTG+NGR KRT
Subjt: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHN--AEMPISAR--INVTGVNGRNKRT
Query: VVLMSESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHAEAMQT
VV+ G G G P + R N G G G G GRG GRGRG GGRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt: VVLMSESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHAEAMQT
|
|
| AT5G37720.2 ALWAYS EARLY 4 | 1.9e-71 | 54.21 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
M+ L+M+L++++K+ + RG RGRG RG GGRG G RR PL +NARPSS++I+KP RR++++ WQ LFED LRA+G SG+E+GT+L+
Subjt: MTTPLDMSLEDMIKKNNREKFRARGRAHRGRGARGSFNGGRGVGIGLVRRAPLGINARPSSYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHN--AEMPISAR--INVTGVNGRNKRT
V+NLD GVT ED+RELFSEIG+++ ++IH+DKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+P+++E+LG N +E P+S R +NVTG+NGR KRT
Subjt: VSNLDYGVTKEDLRELFSEIGDLKIFSIHFDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPIKIEVLGHN--AEMPISAR--INVTGVNGRNKRT
Query: VVLMSESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHAEAMQT
VV+ GR G + + P + + GG R GRGG+ GRG GRGRG GGRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt: VVLMSESGRTGSFNTGSFNAARPFYGLRNRGGFRNGHGRGRGGWNGVGGLGGRGGNGRGRGRGGRGGRGQGRKKPVEKSSVELDKELENYHAEAMQT
|
|
