; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0006991 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0006991
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptiontranscription factor HY5-like
Genome locationLG11:34085072..34085773
RNA-Seq ExpressionSed0006991
SyntenySed0006991
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR044280 - Transcriptional activator Hac1/HY5


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAF3447136.1 hypothetical protein FNV43_RR12316 [Rhamnella rubrinervis]1.1e-3191.4Show/hide
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KAG6598576.1 Transcription factor HY5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.6e-3291.4Show/hide
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NP_001284656.1 Transcription factor HY5-like [Cucumis melo]7.0e-3495.7Show/hide
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XP_022996780.1 transcription factor HY5-like [Cucurbita maxima]6.6e-3291.4Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LPK1 BZIP domain-containing protein3.4e-3495.7Show/hide
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A0A5A7VGC0 Transcription factor HY53.4e-3495.7Show/hide
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A0A6J1BRS2 transcription factor HY5-like3.4e-3495.7Show/hide
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A0A6J1K7Q9 transcription factor HY5-like3.2e-3291.4Show/hide
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F1DQG1 BZIP23.4e-3495.7Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O24646 Transcription factor HY55.2e-2472.34Show/hide
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Q9SM50 Transcription factor HY52.6e-2377.66Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G11260.1 Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein3.7e-2572.34Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAGGAGCAGGCGACGAGTTCAGCAGCTGCTAGTTCTTTGCCTTCGAGCAGTGAAAGATCCTCCAGCTCTGCTCTTAATCTCGAAGTTAAAGAAGGTATGGAGAGCGA
TGAGGAGATCCGGAGAGTACCGGAGATAGGCGGCGAATCAGCCGGAACTTCAGCCTCCGGTCGGGACAACGGCTCAATAGCCGGTCCAGACCGAGTTCAGGTGTCTCGGG
AGGGTCAAAGGAAGAGAGGAAGAAGTCCGGCTGACAAAGAATGCAAGAGACTGAAGAGGTCATACTTCAGTAGACCAATCTACTATAAAGACTCTCTTGATCACTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTTTTTCTTCTTTTAACGGCAACAAAATTTATGTCAAATCTTTATTAAAAGAGATTAAAGAAAAACTACGAAATGCAGGAGCAGGCGACGAGTTCAGCAGCTGCTAGTTC
TTTGCCTTCGAGCAGTGAAAGATCCTCCAGCTCTGCTCTTAATCTCGAAGTTAAAGAAGGTATGGAGAGCGATGAGGAGATCCGGAGAGTACCGGAGATAGGCGGCGAAT
CAGCCGGAACTTCAGCCTCCGGTCGGGACAACGGCTCAATAGCCGGTCCAGACCGAGTTCAGGTGTCTCGGGAGGGTCAAAGGAAGAGAGGAAGAAGTCCGGCTGACAAA
GAATGCAAGAGACTGAAGAGGTCATACTTCAGTAGACCAATCTACTATAAAGACTCTCTTGATCACTAGACCAATCTACTATAATGTCCCATGACTATTTAGTTGAGAGT
CTCAATCGCCGAGGGTTTTGTTGAGGACTTGGGAGCAATGCCTAAGAAATTTGGATAAAATATATAATTGAGTTTATGTTTTCATATATATTTAAAAATATATATATTCA
AC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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