; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0007211 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0007211
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionRAB GTPase homolog A1C
Genome locationLG08:35859308..35863086
RNA-Seq ExpressionSed0007211
SyntenySed0007211
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7012493.1 Ras-related protein RABA1c [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.5e-11296.79Show/hide
Query:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST
        MAGY+AEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVD KVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVTRHST
Subjt:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST

Query:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK
        FENVERWL+ELRDHTDPNIVVML+GNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAG++AAAASVPSKGEK
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK

Query:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS
        IDVGKDVSAVKKGGCCSS
Subjt:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS

XP_007025321.1 PREDICTED: ras-related protein RABA1c [Theobroma cacao]9.3e-11094.04Show/hide
Query:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST
        MAGY+AEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFT+NEFSLESKSTIGVEFATRSLNVD KV+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVTRHST
Subjt:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST

Query:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK
        FENVERWL+ELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLY+METSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAME GDE AA++VPSKGEK
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK

Query:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS
        IDV KDVSA+KKGGCCSS
Subjt:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS

XP_022954901.1 ras-related protein RABA1c [Cucurbita moschata]1.5e-11296.79Show/hide
Query:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST
        MAGY+AEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVD KVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVTRHST
Subjt:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST

Query:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK
        FENVERWL+ELRDHTDPNIVVML+GNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAG++AAAASVPSKGEK
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK

Query:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS
        IDVGKDVSAVKKGGCCSS
Subjt:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS

XP_022994888.1 ras-related protein RABA1c [Cucurbita maxima]4.5e-11296.33Show/hide
Query:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST
        MAGY+AEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVD KVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVTRHST
Subjt:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST

Query:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK
        FENVERWL+ELRDHTDPNIVVML+GNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKK MEAG++AAAASVPSKGEK
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK

Query:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS
        IDVGKDVSAVKKGGCCSS
Subjt:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS

XP_038895845.1 ras-related protein RABA1c [Benincasa hispida]8.4e-11195.41Show/hide
Query:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST
        MAGY+AEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVD KVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVTRHST
Subjt:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST

Query:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK
        FENVERWL+ELRDHTDPNIVVML+GNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLY+METSALEATNVEN+FAEVLTQIYHIVSKKAMEAGD AAAAS+PSKGEK
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK

Query:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS
        IDVGKDVSAVKK GCCSS
Subjt:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A061GEU5 RAB GTPase A1C4.5e-11094.04Show/hide
Query:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST
        MAGY+AEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFT+NEFSLESKSTIGVEFATRSLNVD KV+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVTRHST
Subjt:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST

Query:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK
        FENVERWL+ELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLY+METSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAME GDE AA++VPSKGEK
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK

Query:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS
        IDV KDVSA+KKGGCCSS
Subjt:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS

A0A6J1B5U0 ras-related protein RABA1c4.5e-11094.04Show/hide
Query:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST
        MAGY+AEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFT+NEFSLESKSTIGVEFATRSLNVD KV+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVTRHST
Subjt:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST

Query:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK
        FENVERWL+ELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLY+METSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAME GDE AA++VPSKGEK
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK

Query:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS
        IDV KDVSA+KKGGCCSS
Subjt:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS

A0A6J1GS83 ras-related protein RABA1c7.4e-11396.79Show/hide
Query:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST
        MAGY+AEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVD KVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVTRHST
Subjt:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST

Query:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK
        FENVERWL+ELRDHTDPNIVVML+GNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAG++AAAASVPSKGEK
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK

Query:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS
        IDVGKDVSAVKKGGCCSS
Subjt:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS

A0A6J1K6C3 ras-related protein RABA1c2.2e-11296.33Show/hide
Query:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST
        MAGY+AEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVD KVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVTRHST
Subjt:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST

Query:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK
        FENVERWL+ELRDHTDPNIVVML+GNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKK MEAG++AAAASVPSKGEK
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK

Query:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS
        IDVGKDVSAVKKGGCCSS
Subjt:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS

A0A6P5X6Y8 ras-related protein RABA1d5.9e-11094.04Show/hide
Query:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST
        MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFT+NEFSLESKSTIGVEFATRSLNVD KV+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVTRHST
Subjt:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST

Query:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK
        FENVERWL+ELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLY+METSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAME GDE  A++VPSKGEK
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK

Query:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS
        IDV KDVSA+KKGGCCSS
Subjt:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P40393 Ras-related protein RIC28.8e-10387.5Show/hide
Query:  AGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHSTF
        AGY+AEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFT+NEFSLESKSTIGVEFATRSL VD KVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVTRHSTF
Subjt:  AGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHSTF

Query:  ENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEKI
        ENVERWLKELRDHTDPNIVVML+GNKSDLRHLVAV T++GK+FAE+ESLY+METSALE+TNVENAFAEVLTQIY IVSK+++EAGD+  A S P KGEKI
Subjt:  ENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEKI

Query:  DVGKDVSAVKKGGCCS
        ++  DVSAVKKGGCCS
Subjt:  DVGKDVSAVKKGGCCS

Q01111 Ras-related protein YPT36.5e-9881.65Show/hide
Query:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST
        MAGY+A+D+YDYLFK+VLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEF+LESKSTIGVEFAT+SLN+D+KV+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVTRH T
Subjt:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST

Query:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK
        +ENV RWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVST++ K  AE+E LY+METSALEATNVENAF E LTQIY IVSKKA+EAGDE A +S P KGE 
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK

Query:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS
        I++  + S+ KK GCCSS
Subjt:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS

Q40194 Ras-related protein Rab11D3.8e-9881.65Show/hide
Query:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST
        M GY+ +D+YDYLFK+VLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEF+LESKSTIGVEFAT++LNVD KVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVTR +T
Subjt:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST

Query:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK
        FEN  RWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAV TEDGKSFAE+ESLY+METSALEATNVENAF EVLTQIY IVSK+A+EAGD  +++ +PSKG+ 
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK

Query:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS
        I+V +D S +K+ GCCS+
Subjt:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS

Q9FK68 Ras-related protein RABA1c1.2e-10790.37Show/hide
Query:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST
        MAGY+A+D+YDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKV+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVTRHST
Subjt:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST

Query:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK
        FENVE WLKELR+HTDPNIVVML+GNKSDLRHLVAV TED KSFAEKESLY+METSALEATNVENAFAEVLTQI+HIVSKKAMEA  E  +A+VPSKG+K
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK

Query:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS
        ID+GKDVSAVKKGGCCS+
Subjt:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS

Q9SN35 Ras-related protein RABA1d6.1e-10487.61Show/hide
Query:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST
        MAGY+A+DDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFT+NEFSLESKSTIGVEFATRSLNV++KV+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVTRHST
Subjt:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST

Query:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK
        FENVERWL+ELRDHTDPNIVVML+GNKSDLRHLVAV TED KSFAE ESLY+METSALE+TNVENAF+EVLTQIYH+VSKKAMEAG++  + +VPSKGEK
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK

Query:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS
        IDV  DVSAVKK GCCS+
Subjt:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G16920.1 RAB GTPase homolog A1B1.5e-9783.49Show/hide
Query:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST
        MAGY+ EDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEF+LESKSTIGVEFATR+L VD KVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVTR +T
Subjt:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST

Query:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK
        FENV+RWLKEL++HTDPNIVVML+GNKSDLRHL+AV TEDGKS+AE+ESL +METSALEATNVE+AFAEVLTQIY I SKK +EAG++   ASVP KGEK
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK

Query:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS
        I+V  DVSA+KK GCCS+
Subjt:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS

AT3G15060.1 RAB GTPase homolog A1G3.2e-9276.82Show/hide
Query:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST
        MA Y+A+DDYD+L+KVVLIGDSGVGKSNLLSRFT+NEFSLESKSTIGVEFATRS++VD+K+VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVTRH T
Subjt:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST

Query:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK
        FENVERWLKELRDHT+ NIV+ML+GNK+DLRHL AVSTED K+FAE+E+ ++METSALEA NVENAF EVL+QIY + SKKA++ GD+        KG+ 
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK

Query:  IDVGK--DVSAVKKGGCCSS
        I+VG   DVS VKK GCCSS
Subjt:  IDVGK--DVSAVKKGGCCSS

AT4G18800.1 RAB GTPase homolog A1D4.3e-10587.61Show/hide
Query:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST
        MAGY+A+DDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFT+NEFSLESKSTIGVEFATRSLNV++KV+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVTRHST
Subjt:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST

Query:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK
        FENVERWL+ELRDHTDPNIVVML+GNKSDLRHLVAV TED KSFAE ESLY+METSALE+TNVENAF+EVLTQIYH+VSKKAMEAG++  + +VPSKGEK
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK

Query:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS
        IDV  DVSAVKK GCCS+
Subjt:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS

AT5G45750.1 RAB GTPase homolog A1C8.4e-10990.37Show/hide
Query:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST
        MAGY+A+D+YDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKV+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVTRHST
Subjt:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST

Query:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK
        FENVE WLKELR+HTDPNIVVML+GNKSDLRHLVAV TED KSFAEKESLY+METSALEATNVENAFAEVLTQI+HIVSKKAMEA  E  +A+VPSKG+K
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK

Query:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS
        ID+GKDVSAVKKGGCCS+
Subjt:  IDVGKDVSAVKKGGCCSS

AT5G60860.1 RAB GTPase homolog A1F5.8e-9478.18Show/hide
Query:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST
        MA Y+A+D+YDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFT+NEFSLESKSTIGVEFATRS++VDDK+VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVTRH T
Subjt:  MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHST

Query:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK
        FENVERWLKELRDHTD NIV+M +GNK+DLRHL AVSTED K+FAE+E+ ++METSALE+ NVENAF EVL+QIY +VS+KA++ GD+ AA     KG+ 
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEK

Query:  IDVGK--DVSAVKKGGCCSS
        I+VG   DVSAVKK GCCS+
Subjt:  IDVGK--DVSAVKKGGCCSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGGTTACAAAGCTGAAGATGACTATGACTACCTCTTCAAGGTGGTTCTGATCGGAGATTCCGGTGTGGGCAAGTCCAATTTGCTCTCCAGGTTCACCAAAAACGA
GTTCAGTCTTGAATCCAAGTCCACCATTGGGGTTGAGTTCGCTACTCGGAGCTTGAATGTCGATGACAAGGTCGTTAAGGCCCAGATTTGGGATACTGCTGGCCAGGAAA
GGTATCGTGCAATAACCAGTGCTTACTATCGAGGCGCCATAGGTGCATTGCTTGTCTATGATGTCACACGACATTCCACTTTTGAAAACGTCGAGAGGTGGTTAAAGGAG
TTGCGAGACCATACAGATCCCAACATTGTCGTCATGCTCATTGGTAACAAGTCAGATCTTCGACACCTTGTTGCAGTCTCAACAGAGGATGGGAAATCCTTTGCTGAGAA
GGAGTCTCTGTATTACATGGAAACATCAGCACTCGAAGCAACCAATGTCGAGAACGCGTTTGCCGAAGTCCTTACTCAAATCTATCACATTGTAAGCAAGAAGGCCATGG
AGGCTGGTGATGAGGCAGCTGCTGCCTCGGTTCCTTCGAAAGGAGAAAAAATCGATGTCGGTAAGGATGTTTCTGCTGTAAAGAAAGGTGGCTGCTGTTCAAGTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGTCAATTCAACAACCTCTAGGGCTAAGAAACCAAATAAAAAAACAAATTACCAAATCCAAAATTTGAAAAATAGACTTTGTCGTCCTCCTTGTCTAAGGAATTTTTTGT
TCCAACATCACAATCTTCAACACACAGAAAAAAACAGGACCCCTAAAAAAGCGCACACTCACACAGAGATCTGATACTACCAATTCCACATTCCTCTCTTCACACTCCAA
ACGAAATTTGCAATGGCCGGTTACAAAGCTGAAGATGACTATGACTACCTCTTCAAGGTGGTTCTGATCGGAGATTCCGGTGTGGGCAAGTCCAATTTGCTCTCCAGGTT
CACCAAAAACGAGTTCAGTCTTGAATCCAAGTCCACCATTGGGGTTGAGTTCGCTACTCGGAGCTTGAATGTCGATGACAAGGTCGTTAAGGCCCAGATTTGGGATACTG
CTGGCCAGGAAAGGTATCGTGCAATAACCAGTGCTTACTATCGAGGCGCCATAGGTGCATTGCTTGTCTATGATGTCACACGACATTCCACTTTTGAAAACGTCGAGAGG
TGGTTAAAGGAGTTGCGAGACCATACAGATCCCAACATTGTCGTCATGCTCATTGGTAACAAGTCAGATCTTCGACACCTTGTTGCAGTCTCAACAGAGGATGGGAAATC
CTTTGCTGAGAAGGAGTCTCTGTATTACATGGAAACATCAGCACTCGAAGCAACCAATGTCGAGAACGCGTTTGCCGAAGTCCTTACTCAAATCTATCACATTGTAAGCA
AGAAGGCCATGGAGGCTGGTGATGAGGCAGCTGCTGCCTCGGTTCCTTCGAAAGGAGAAAAAATCGATGTCGGTAAGGATGTTTCTGCTGTAAAGAAAGGTGGCTGCTGT
TCAAGTTAGGCTTTTGATTTGCATTTGTTTGATGTGGCTGCTTTGATATTGCTGCATCCTCATGTGCCCCCATAGTTCAGTAGAAATTCTTCAGAGATGTCTTTTATATG
AATCATTGATGCTGTATGGATTGGATTGCGTTTACATTAAAATATTTTTTAGGCCTGAAAATTTACAGTTTGAGCCGAGAGAGAGCTTGGTTAGGATGGATTACTATCAT
TAAACCAATTGTTAAGGTGACACATTCGTCTAATTCAAATTAACCCAATTAATTTAAATATTGACA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGYKAEDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTKNEFSLESKSTIGVEFATRSLNVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAIGALLVYDVTRHSTFENVERWLKE
LRDHTDPNIVVMLIGNKSDLRHLVAVSTEDGKSFAEKESLYYMETSALEATNVENAFAEVLTQIYHIVSKKAMEAGDEAAAASVPSKGEKIDVGKDVSAVKKGGCCSS