; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0007467 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0007467
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionTetratricopeptide repeat protein 1
Genome locationLG03:46019748..46026759
RNA-Seq ExpressionSed0007467
SyntenySed0007467
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
GO:0016740 - transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001440 - Tetratricopeptide repeat 1
IPR011990 - Tetratricopeptide-like helical domain superfamily
IPR013105 - Tetratricopeptide repeat 2
IPR019734 - Tetratricopeptide repeat


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0043100.1 tetratricopeptide repeat protein 1 [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-10883.27Show/hide
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XP_008452420.1 PREDICTED: tetratricopeptide repeat protein 1 [Cucumis melo]1.3e-10782.89Show/hide
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XP_022999753.1 tetratricopeptide repeat protein 1 [Cucurbita maxima]1.6e-10581.75Show/hide
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XP_023522143.1 tetratricopeptide repeat protein 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.6e-10581.75Show/hide
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XP_038889502.1 tetratricopeptide repeat protein 1 [Benincasa hispida]1.5e-10681.37Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LJ51 TPR_REGION domain-containing protein2.3e-10581.75Show/hide
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A0A1S3BTU1 tetratricopeptide repeat protein 16.4e-10882.89Show/hide
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A0A5A7TIE6 Tetratricopeptide repeat protein 17.5e-10983.27Show/hide
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A0A6J1G423 tetratricopeptide repeat protein 11.0e-10581.75Show/hide
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A0A6J1KKL8 tetratricopeptide repeat protein 17.8e-10681.75Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q3ZBR5 Tetratricopeptide repeat protein 11.2e-3138.39Show/hide
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        AS S  +++P  D  E   + ++  S  E  ++    +     DE  ++   E++  K  GN+ F +G Y EA   Y RAL   P      + +S+  +N
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Query:  RGACFLKLEKYDETIKACSKAIELNPAYVKALSRRGEAHEKLEHFEEAINDMKKILELDPSNDQAKKVIRLLEPLAEQKREKMKEEMIGKMKDMGNSLLG
        R A  +K EK +  I  CSKAI+LNP+Y++A+ RR E +EK +  +EA+ D K ILE DPS  QA++    L    E++ E++KEEM+GK+KD+GN +L 
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         FG+S +NF+  +D +TGSYSI+F
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Q75Q39 Mitochondrial import receptor subunit TOM703.8e-1738.67Show/hide
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        D +   +L  A  AK  GNK F  GKYE+AI  Y  A+++ P    A    S  + NR A F +L+K+ E  + C+KA+ELNP YVKAL RR +AHEKL+
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Query:  HFEEAINDMKKILELDP-SNDQ----AKKVIRLLEPLAEQKREKMKEEMI
        + +E + D+  +  L+   N+Q    A KV++LL     +++ K +E ++
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Q91Z38 Tetratricopeptide repeat protein 16.1e-3138.69Show/hide
Query:  SGDECPDQQQERISSPNEDEINEKALVEANNAKLAGNKLFGEGKYEEAILEYDRALNIAPDMPTAAELQSICHANRGACFLKLEKYDETIKACSKAIELN
        S  E  ++    +     +E  +K   E+   K  GN+ F  G Y EA   Y +AL + P      + +S+  +NR A  +K +K +  I  CSKAI+LN
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Query:  PAYVKALSRRGEAHEKLEHFEEAINDMKKILELDPSNDQAKKVIRLLEPLAEQKREKMKEEMIGKMKDMGNSLLGRFGMSMDNFKAVKDPNTGSYSISF
        P Y++A+ RR E +EK +  +EA+ D K +LE DPS  QA++    L    E++ E++KEEM+GK+KD+GN +L  FG+S +NF+  +D +TGSYSI+F
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Q99614 Tetratricopeptide repeat protein 15.5e-3238.74Show/hide
Query:  STSNASKDPLDGYETASDGELGRSGDECPDQQQERISSPNEDEINEKALVEANNAKLAGNKLFGEGKYEEAILEYDRALNIAPDMPTAAELQSICHANRG
        S S   +   D  E  S+ ++  S  E  ++    +     DE  +K   E+   K  GN+ F +G Y EA   Y RAL + P      + +SI  +NR 
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Query:  ACFLKLEKYDETIKACSKAIELNPAYVKALSRRGEAHEKLEHFEEAINDMKKILELDPSNDQAKKVIRLLEPLAEQKREKMKEEMIGKMKDMGNSLLGRF
        A  +K +K +  I  CSKAI+LNP+Y++A+ RR E +EK +  +EA+ D K ILE DPS  QA++    L    E++ E++KEEM+GK+KD+GN +L  F
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Query:  GMSMDNFKAVKDPNTGSYSISF
        G+S +NF+  +D +TGSYSI+F
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Q9CZW5 Mitochondrial import receptor subunit TOM701.1e-1638Show/hide
Query:  DEINEKALVEANNAKLAGNKLFGEGKYEEAILEYDRALNIAPDMPTAAELQSICHANRGACFLKLEKYDETIKACSKAIELNPAYVKALSRRGEAHEKLE
        D +   +L  A  AK  GNK F  GKYE+AI  Y  A+++ P         S  + NR A F +L+K+ E  + C+KA+ELNP YVKAL RR +AHEKL+
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Query:  HFEEAINDMKKILELDP-SNDQ----AKKVIRLLEPLAEQKREKMKEEMI
        + +E + D+  +  L+   N+Q    A KV++LL     +++ K +E ++
Subjt:  HFEEAINDMKKILELDP-SNDQ----AKKVIRLLEPLAEQKREKMKEEMI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G12400.1 stress-inducible protein, putative1.1e-1438.05Show/hide
Query:  ANNAKLAGNKLFGEGKYEEAILEYDRALNIAPDMPTAAELQSICHANRGACFLKLEKYDETIKACSKAIELNPAYVKALSRRGEAHEKLEHFEEAINDMK
        A  AK  GN  F  G Y  AI  +  A+N++P          I ++NR A +  L +Y+E +    K IEL P + K  SR G A   L  F+EA++  K
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Query:  KILELDPSNDQAK
        K LE+DPSN+  K
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AT4G12400.2 stress-inducible protein, putative1.1e-1438.05Show/hide
Query:  ANNAKLAGNKLFGEGKYEEAILEYDRALNIAPDMPTAAELQSICHANRGACFLKLEKYDETIKACSKAIELNPAYVKALSRRGEAHEKLEHFEEAINDMK
        A  AK  GN  F  G Y  AI  +  A+N++P          I ++NR A +  L +Y+E +    K IEL P + K  SR G A   L  F+EA++  K
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Query:  KILELDPSNDQAK
        K LE+DPSN+  K
Subjt:  KILELDPSNDQAK

AT4G30480.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein3.8e-3644.33Show/hide
Query:  MVQIEMAESENE--VQNPPNVSATADSSGASTSNASKDPLDGYETASDGEL--------GRSGDECPDQQQERISSPNEDEI---------------NEK
        MV IE +ESE+E  ++N P  ++++      T     D  DG+ETAS+ E+        G   D    Q++ + S   E++I                EK
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Query:  ALVEANNAKLAGNKLFGEGKYEEAILEYDRALNIAPDMPTAAELQSICHANRGACFLKLEKYDETIKACSKAIELNPAYVKALSRRGEAHEKLEHFEEAI
        AL EAN AK  GNKLF  G YEEA+ +Y  AL +  ++P + EL+SIC+ NRG CFLKL K +ETIK C+KA+ELNP Y KAL RR EAHEKLEHFE+A+
Subjt:  ALVEANNAKLAGNKLFGEGKYEEAILEYDRALNIAPDMPTAAELQSICHANRGACFLKLEKYDETIKACSKAIELNPAYVKALSRRGEAHEKLEHFEEAI

Query:  NDM
          +
Subjt:  NDM

AT4G30480.2 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein7.3e-7255.07Show/hide
Query:  MVQIEMAESENE--VQNPPNVSATADSSGASTSNASKDPLDGYETASDGEL--------GRSGDECPDQQQERISSPNEDEI---------------NEK
        MV IE +ESE+E  ++N P  ++++      T     D  DG+ETAS+ E+        G   D    Q++ + S   E++I                EK
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Query:  ALVEANNAKLAGNKLFGEGKYEEAILEYDRALNIAPDMPTAAELQSICHANRGACFLKLEKYDETIKACSKAIELNPAYVKALSRRGEAHEKLEHFEEAI
        AL EAN AK  GNKLF  G YEEA+ +Y  AL +  ++P + EL+SIC+ NRG CFLKL K +ETIK C+KA+ELNP Y KAL RR EAHEKLEHFE+A+
Subjt:  ALVEANNAKLAGNKLFGEGKYEEAILEYDRALNIAPDMPTAAELQSICHANRGACFLKLEKYDETIKACSKAIELNPAYVKALSRRGEAHEKLEHFEEAI

Query:  NDMKKILELDPSNDQAKKVIRLLEPLAEQKREKMKEEMIGKMKDMGNSLLGRFGMSMDNFKAVKDPNTGSYSISFQ
         D+KKILELDPSNDQA+K IR LEPLA +KREKMKEE I K+K+MGNS+LGRFGMS+DNFKAVKDPNTGSYS+SFQ
Subjt:  NDMKKILELDPSNDQAKKVIRLLEPLAEQKREKMKEEMIGKMKDMGNSLLGRFGMSMDNFKAVKDPNTGSYSISFQ

AT4G30480.3 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein1.6e-1838.36Show/hide
Query:  MVQIEMAESENE--VQNPPNVSATADSSGASTSNASKDPLDGYETASDGEL--------GRSGDECPDQQQERISSPNEDEI---------------NEK
        MV IE +ESE+E  ++N P  ++++      T     D  DG+ETAS+ E+        G   D    Q++ + S   E++I                EK
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Query:  ALVEANNAKLAGNKLFGEGKYEEAILEYDRALNIAPDMPTAAELQSICHANRGACFLKL
        AL EAN AK  GNKLF  G YEEA+ +Y  AL +  ++P + EL+SIC+ NRG CFLKL
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTTCAGATAGAAATGGCGGAATCTGAGAACGAAGTTCAAAACCCTCCAAACGTCTCTGCAACGGCGGATTCAAGCGGCGCGTCAACATCAAATGCGAGCAAAGATCC
TTTGGACGGCTACGAGACTGCCAGCGACGGGGAGCTTGGCCGTAGTGGTGATGAGTGTCCTGATCAACAGCAGGAACGGATTTCCTCGCCCAATGAGGATGAGATTAACG
AGAAAGCCCTGGTCGAAGCAAATAATGCAAAGTTGGCGGGCAATAAACTCTTTGGAGAAGGGAAATATGAGGAGGCAATATTAGAGTATGATCGTGCTTTGAACATTGCT
CCGGACATGCCCACTGCAGCTGAGTTACAGTCGATATGCCATGCAAACCGTGGCGCGTGTTTTCTAAAACTAGAAAAATATGATGAAACAATAAAAGCATGCTCTAAGGC
AATTGAGCTGAATCCTGCTTATGTCAAAGCTTTGTCTAGAAGAGGAGAGGCTCATGAAAAGCTTGAACACTTTGAGGAGGCTATTAATGATATGAAAAAGATATTGGAAT
TGGATCCATCAAATGACCAAGCTAAGAAGGTCATCCGTCTTCTTGAACCACTCGCCGAACAAAAACGAGAAAAGATGAAAGAAGAGATGATTGGAAAGATGAAAGACATG
GGCAATTCTTTGCTGGGTCGTTTTGGTATGAGCATGGACAACTTCAAAGCTGTCAAAGACCCAAATACTGGTTCCTATTCAATTTCATTCCAAAAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTGGAAGCAAAAATAACAATTCTTCTTTCAATTTTACAGAAACCAGAAATCTTTCTTCTTCTCTTCCTAAAACCCAGAATCTCAGGAACCAAATCAATTCATTGGCGAAG
AAAATGGTTCAGATAGAAATGGCGGAATCTGAGAACGAAGTTCAAAACCCTCCAAACGTCTCTGCAACGGCGGATTCAAGCGGCGCGTCAACATCAAATGCGAGCAAAGA
TCCTTTGGACGGCTACGAGACTGCCAGCGACGGGGAGCTTGGCCGTAGTGGTGATGAGTGTCCTGATCAACAGCAGGAACGGATTTCCTCGCCCAATGAGGATGAGATTA
ACGAGAAAGCCCTGGTCGAAGCAAATAATGCAAAGTTGGCGGGCAATAAACTCTTTGGAGAAGGGAAATATGAGGAGGCAATATTAGAGTATGATCGTGCTTTGAACATT
GCTCCGGACATGCCCACTGCAGCTGAGTTACAGTCGATATGCCATGCAAACCGTGGCGCGTGTTTTCTAAAACTAGAAAAATATGATGAAACAATAAAAGCATGCTCTAA
GGCAATTGAGCTGAATCCTGCTTATGTCAAAGCTTTGTCTAGAAGAGGAGAGGCTCATGAAAAGCTTGAACACTTTGAGGAGGCTATTAATGATATGAAAAAGATATTGG
AATTGGATCCATCAAATGACCAAGCTAAGAAGGTCATCCGTCTTCTTGAACCACTCGCCGAACAAAAACGAGAAAAGATGAAAGAAGAGATGATTGGAAAGATGAAAGAC
ATGGGCAATTCTTTGCTGGGTCGTTTTGGTATGAGCATGGACAACTTCAAAGCTGTCAAAGACCCAAATACTGGTTCCTATTCAATTTCATTCCAAAAATAGCTTGGCTA
TACAACGTTTGTATTTAGGTCCAATATACCAAAAACTATATCTGTGATATTCCAGGTTACGTACATTTTGAATATCCTTTAACCTTATTATATTTGGTTGCCAAGGAAAT
TTATAGAAAATTCGTAGACACCCAACTATCATAGATTGAACTCATTCCTTTTAAACCGTTTATGATTTTATTGTAAGTGTAAATTTTGAGCTATGGTGTATTTCATTCTT
CATATGGCAAACTGCTGCTTTTTTTTTTTCTGTGAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVQIEMAESENEVQNPPNVSATADSSGASTSNASKDPLDGYETASDGELGRSGDECPDQQQERISSPNEDEINEKALVEANNAKLAGNKLFGEGKYEEAILEYDRALNIA
PDMPTAAELQSICHANRGACFLKLEKYDETIKACSKAIELNPAYVKALSRRGEAHEKLEHFEEAINDMKKILELDPSNDQAKKVIRLLEPLAEQKREKMKEEMIGKMKDM
GNSLLGRFGMSMDNFKAVKDPNTGSYSISFQK