CuGenDBv2

Gene ID	Sed0008181
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	WEB family protein At3g51220
Genome location	LG04:1973430..1974761
RNA-Seq Expression	Sed0008181
Synteny	Sed0008181
Gene Ontology terms	GO:0005488 - binding (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_004135525.2 WEB family protein At1g75720 [Cucumis sativus]

6.2e-65

67.74

Show/hide

Query:  NQSSNIQISSHTSSMHFNSPSMEDPAMPNPNLGSSVDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCAHVTFPEPGGSRDQSMPSFTTEVKEEKE-VL
        +  +N QI   T     NSP+MEDP +P+    S+VDTSRPF SVKEAVAVFGERLLVG+AYSSSPKP      PE G    ++MPS TT +KEEKE VL
Subjt:  NQSSNIQISSHTSSMHFNSPSMEDPAMPNPNLGSSVDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCAHVTFPEPGGSRDQSMPSFTTEVKEEKE-VL

Query:  DSLKKLEAELEETKQELRLLKEREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAAEAAAAKAVATRRITMGSENGRVGEEMKKS-----MSNGKESPSLAQILS
         SLKKLEAELEETK+ELRLLKEREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEA  AAA KA A RRI     +GR+ EEMK+S          +SP+LAQILS
Subjt:  DSLKKLEAELEETKQELRLLKEREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAAEAAAAKAVATRRITMGSENGRVGEEMKKS-----MSNGKESPSLAQILS

Query:  FGDNIAYFGGKREKKKIKKKPIIPLVGDLL--FRKKGS----LLSSFN
        FGD I YFGGK+EKKKIKKKPIIPLVGDLL   RKKGS    L SSFN
Subjt:  FGDNIAYFGGKREKKKIKKKPIIPLVGDLL--FRKKGS----LLSSFN

XP_008445978.1 PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: WEB family protein At1g75720 [Cucumis melo]

8.6e-67

72.93

Show/hide

Query:  MEDPAMPNPNLGSSVDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCAHVTFPEPGGSRDQSMPSFTTEVKEEKE-VLDSLKKLEAELEETKQELRLLK
        MEDP +P+ +  S+VDTSRPF SVKEAVAVFGERLLVG+AYSSSPKP      PE G    ++MPS TT +KEEKE VLDSLKKLEAELEETK+ELRLLK
Subjt:  MEDPAMPNPNLGSSVDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCAHVTFPEPGGSRDQSMPSFTTEVKEEKE-VLDSLKKLEAELEETKQELRLLK

Query:  EREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAAEAAAAKAVATRRITMGSENGRVGEEMKKS-----MSNGKESPSLAQILSFGDNIAYFGGKREKKKIKKKP
        EREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEA  AAAAKA ATRRI  G E GR+ EEMK+S          ESP+LAQILSFGD I YFGGK+EKKK K+KP
Subjt:  EREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAAEAAAAKAVATRRITMGSENGRVGEEMKKS-----MSNGKESPSLAQILSFGDNIAYFGGKREKKKIKKKP

Query:  IIPLVGDLL--FRKKGS----LLSSFNSF
        IIPLVGDLL   RKKGS    L SSFNSF
Subjt:  IIPLVGDLL--FRKKGS----LLSSFNSF

XP_022998394.1 WEB family protein At3g51220 [Cucurbita maxima]

7.3e-66

73.76

Show/hide

Query:  MEDPAMPNPNLGSSVDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCAHVTFPEPGGSRDQSMPSFTTEVKEEK--EVLDSLKKLEAELEETKQELRLL
        MEDP MPN +  S VDTSRPF SVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCA+    E G     S+ S TT VKEEK  EVLD+LKKLEAELEETK+ELRLL
Subjt:  MEDPAMPNPNLGSSVDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCAHVTFPEPGGSRDQSMPSFTTEVKEEK--EVLDSLKKLEAELEETKQELRLL

Query:  KEREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAAEAAAAKAVATRRITMGSENGRVGEEMKKSMSNGKESPSLAQILSFGDNIAYFGGKREKKKIKKKPIIPL
        KEREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEA  AAAAKAVATRRITMG ENGR+ EEMK+       + +LAQIL        FGGK+EKKK+KKKPIIPL
Subjt:  KEREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAAEAAAAKAVATRRITMGSENGRVGEEMKKSMSNGKESPSLAQILSFGDNIAYFGGKREKKKIKKKPIIPL

Query:  VGDLL--FRKKGSLLSSFNSF
        VGDLL   R+KGSL SSF SF
Subjt:  VGDLL--FRKKGSLLSSFNSF

XP_023544273.1 WEB family protein At3g51220 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.8e-64

72.4

Show/hide

Query:  MEDPAMPNPNLGSSVDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCAHVTFPEPGGSRDQSMPSFTTEVKEEK--EVLDSLKKLEAELEETKQELRLL
        MEDP MPN +  S VDTSRPF SVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCA+    E G     S+ S TT +KEEK  EVLD+LKKLEAELEETK+ELRLL
Subjt:  MEDPAMPNPNLGSSVDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCAHVTFPEPGGSRDQSMPSFTTEVKEEK--EVLDSLKKLEAELEETKQELRLL

Query:  KEREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAAEAAAAKAVATRRITMGSENGRVGEEMKKSMSNGKESPSLAQILSFGDNIAYFGGKREKKKIKKKPIIPL
        KEREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEA  AAAAKAVATRRITMG E+GR+ EEMK+       + +L QIL        FGGK+EKKK+KKKPIIPL
Subjt:  KEREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAAEAAAAKAVATRRITMGSENGRVGEEMKKSMSNGKESPSLAQILSFGDNIAYFGGKREKKKIKKKPIIPL

Query:  VGDLL--FRKKGSLLSSFNSF
        VGDLL   R+KGSL SSF SF
Subjt:  VGDLL--FRKKGSLLSSFNSF

XP_038877864.1 WEB family protein At1g75720 [Benincasa hispida]

9.2e-69

75.11

Show/hide

Query:  MEDPAMPNPNLGSSVDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCAHVTFPEPGGSRDQSMPSFTTEVKEEKE-VLDSLKKLEAELEETKQELRLLK
        ME   MPN + GS VDTSRPF SVKEAVAVFGERLLVG+AYSS PKP A V  PE G    +S+PS TT  KEEKE VLDSLKKLEAELEETK+ELRLLK
Subjt:  MEDPAMPNPNLGSSVDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCAHVTFPEPGGSRDQSMPSFTTEVKEEKE-VLDSLKKLEAELEETKQELRLLK

Query:  EREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAAEAAAAKAVATRRITMGSENGRVGEEMKKS-----MSNGKESPSLAQILSFGDNIAYFGGKREKKKIKKKP
        E+EEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEA  AAAAKAVATRRI MG E+ R  EEMK+S          ESP+LAQILSFGD I YFGGK+EKKKIKKKP
Subjt:  EREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAAEAAAAKAVATRRITMGSENGRVGEEMKKS-----MSNGKESPSLAQILSFGDNIAYFGGKREKKKIKKKP

Query:  IIPLVGDLL--FRKKGS----LLSSFNSF
        IIPLVGDLL  FRKKGS    L SSFNSF
Subjt:  IIPLVGDLL--FRKKGS----LLSSFNSF

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KPW0 Uncharacterized protein

2.8e-63

70.93

Show/hide

Query:  MEDPAMPNPNLGSSVDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCAHVTFPEPGGSRDQSMPSFTTEVKEEKE-VLDSLKKLEAELEETKQELRLLK
        MEDP +P+    S+VDTSRPF SVKEAVAVFGERLLVG+AYSSSPKP      PE G    ++MPS TT +KEEKE VL SLKKLEAELEETK+ELRLLK
Subjt:  MEDPAMPNPNLGSSVDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCAHVTFPEPGGSRDQSMPSFTTEVKEEKE-VLDSLKKLEAELEETKQELRLLK

Query:  EREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAAEAAAAKAVATRRITMGSENGRVGEEMKKS-----MSNGKESPSLAQILSFGDNIAYFGGKREKKKIKKKP
        EREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEA  AAA KA A RRI     +GR+ EEMK+S          +SP+LAQILSFGD I YFGGK+EKKKIKKKP
Subjt:  EREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAAEAAAAKAVATRRITMGSENGRVGEEMKKS-----MSNGKESPSLAQILSFGDNIAYFGGKREKKKIKKKP

Query:  IIPLVGDLL--FRKKGS----LLSSFN
        IIPLVGDLL   RKKGS    L SSFN
Subjt:  IIPLVGDLL--FRKKGS----LLSSFN

A0A1S3BDZ1 LOW QUALITY PROTEIN: WEB family protein At1g75720

4.2e-67

72.93

Show/hide

Query:  MEDPAMPNPNLGSSVDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCAHVTFPEPGGSRDQSMPSFTTEVKEEKE-VLDSLKKLEAELEETKQELRLLK
        MEDP +P+ +  S+VDTSRPF SVKEAVAVFGERLLVG+AYSSSPKP      PE G    ++MPS TT +KEEKE VLDSLKKLEAELEETK+ELRLLK
Subjt:  MEDPAMPNPNLGSSVDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCAHVTFPEPGGSRDQSMPSFTTEVKEEKE-VLDSLKKLEAELEETKQELRLLK

Query:  EREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAAEAAAAKAVATRRITMGSENGRVGEEMKKS-----MSNGKESPSLAQILSFGDNIAYFGGKREKKKIKKKP
        EREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEA  AAAAKA ATRRI  G E GR+ EEMK+S          ESP+LAQILSFGD I YFGGK+EKKK K+KP
Subjt:  EREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAAEAAAAKAVATRRITMGSENGRVGEEMKKS-----MSNGKESPSLAQILSFGDNIAYFGGKREKKKIKKKP

Query:  IIPLVGDLL--FRKKGS----LLSSFNSF
        IIPLVGDLL   RKKGS    L SSFNSF
Subjt:  IIPLVGDLL--FRKKGS----LLSSFNSF

A0A5A7SSG4 NifU-like protein 2

1.6e-63

70.78

Show/hide

Query:  MEDPAMPNPNLGSSVDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCAHVTFPEPGGSRDQSMPSFTTEVKEEKE-VLDSLKKLEAELEETKQELRLLK
        MEDP +P+ +  S+VDTSRPF SVKEAVAVFGERLLVG+AYSSSPKP      PE G    ++MPS TT +KEEKE VLDSLKKLEAELEETK+ELRLLK
Subjt:  MEDPAMPNPNLGSSVDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCAHVTFPEPGGSRDQSMPSFTTEVKEEKE-VLDSLKKLEAELEETKQELRLLK

Query:  EREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAAEAAAAKAVATRRITMGSENGRVGEEMKKS-----MSNGKESPSLAQILSFGDNIAYFGGKREKKKIKKKP
        EREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEA  AAAAKA ATRRI  G E GR+ EEMK+S          ESP+LAQILSFGD I YFGGK+EKKKIKKKP
Subjt:  EREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAAEAAAAKAVATRRITMGSENGRVGEEMKKS-----MSNGKESPSLAQILSFGDNIAYFGGKREKKKIKKKP

Query:  IIPLVGDLLFRKKGSLLSS
        IIPL    +  KK   L +
Subjt:  IIPLVGDLLFRKKGSLLSS

A0A6J1GY99 WEB family protein At3g51220

5.3e-62

70.59

Show/hide

Query:  MEDPAMPNPNLGSSVDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCAHVTFPEPGGSRDQSMPSFTTEVKEEK--EVLDSLKKLEAELEETKQELRLL
        MEDP MPN +  S VDTSRPF SVKEAVAVFGERLLV EAYSS PKPC +    E G     S+ S TT +KEEK  EVLD+LKKLEAELEETK+ELRLL
Subjt:  MEDPAMPNPNLGSSVDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCAHVTFPEPGGSRDQSMPSFTTEVKEEK--EVLDSLKKLEAELEETKQELRLL

Query:  KEREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAAEAAAAKAVATRRITMGSENGRVGEEMKKSMSNGKESPSLAQILSFGDNIAYFGGKREKKKIKKKPIIPL
        KEREEDTEVALASLNAELHKNMS LAEAEA  AAAAKAVATRRITMG E+GR+ EEM++       +  LAQIL        FGGK+EKKK+KKKPIIPL
Subjt:  KEREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAAEAAAAKAVATRRITMGSENGRVGEEMKKSMSNGKESPSLAQILSFGDNIAYFGGKREKKKIKKKPIIPL

Query:  VGDLL--FRKKGSLLSSFNSF
        VGDLL   R+KGSL SSF SF
Subjt:  VGDLL--FRKKGSLLSSFNSF

A0A6J1KE80 WEB family protein At3g51220

3.5e-66

73.76

Show/hide

Query:  MEDPAMPNPNLGSSVDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCAHVTFPEPGGSRDQSMPSFTTEVKEEK--EVLDSLKKLEAELEETKQELRLL
        MEDP MPN +  S VDTSRPF SVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCA+    E G     S+ S TT VKEEK  EVLD+LKKLEAELEETK+ELRLL
Subjt:  MEDPAMPNPNLGSSVDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCAHVTFPEPGGSRDQSMPSFTTEVKEEK--EVLDSLKKLEAELEETKQELRLL

Query:  KEREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAAEAAAAKAVATRRITMGSENGRVGEEMKKSMSNGKESPSLAQILSFGDNIAYFGGKREKKKIKKKPIIPL
        KEREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEA  AAAAKAVATRRITMG ENGR+ EEMK+       + +LAQIL        FGGK+EKKK+KKKPIIPL
Subjt:  KEREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAAEAAAAKAVATRRITMGSENGRVGEEMKKSMSNGKESPSLAQILSFGDNIAYFGGKREKKKIKKKPIIPL

Query:  VGDLL--FRKKGSLLSSFNSF
        VGDLL   R+KGSL SSF SF
Subjt:  VGDLL--FRKKGSLLSSFNSF

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G58070.1 unknown protein

5.8e-29

41.27

Show/hide

Query:  VDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVG------EAYSSSP-----------KP----------------------CAHVTFPEPGGSRDQSMPSFTTEVKE--
        VDTSRPFSSVKEAVA+FG+R+++        + S+SP           KP                       A +  P    S  Q+  S ++  K+  
Subjt:  VDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVG------EAYSSSP-----------KP----------------------CAHVTFPEPGGSRDQSMPSFTTEVKE--

Query:  ---------EKEVLDSLKKLEAELEETKQELRLLKEREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAAEAAAAKAVATRRI----TMGSENGRVGEEMKKSMS
                 ++E++D LKKLEAE+ ETK E+++LKERE +TEVALA+LNAELHKN SK+A+AEA  A  + A  T+ +    T   ENG      +    
Subjt:  ---------EKEVLDSLKKLEAELEETKQELRLLKEREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAAEAAAAKAVATRRI----TMGSENGRVGEEMKKSMS

Query:  NGKESPSLAQIL--SFGDNIAYFGGKREKKKIKKKPIIPLVGD-LLFRKKGS
          KE PSLAQIL  + G+   YF   ++ KK KKKPIIPLVGD   F+KKGS
Subjt:  NGKESPSLAQIL--SFGDNIAYFGGKREKKKIKKKPIIPLVGD-LLFRKKGS

AT1G75720.2 Plant protein of unknown function (DUF827)

6.5e-04

27.75

Show/hide

Query:  SSVDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCAHVTFPEPGGSR---DQSMPSFTTEVKEEKEVLDSLKKLEAELEETKQELRLLKEREEDTEVAL
        + +DT+ PF +VKEAVA+FGER+L  + YS+  K      + +P G +    ++        +E  ++ +SL  L+ ELE TKQEL+ L+    D  V  
Subjt:  SSVDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCAHVTFPEPGGSR---DQSMPSFTTEVKEEKEVLDSLKKLEAELEETKQELRLLKEREEDTEVAL

Query:  ASLNAELHKNMSKL----AEAEAAEAAAAKAVATRRITM----GSENGRVGEEMKKSMSNGKESPSLAQILSFGDNIAYFGGKREK--KKIKKKPIIPL-
          L+  + K   ++     + E   +   ++++ +R          NG V  E   SM                        K+EK  K  KKK +IPL 
Subjt:  ASLNAELHKNMSKL----AEAEAAEAAAAKAVATRRITM----GSENGRVGEEMKKSMSNGKESPSLAQILSFGDNIAYFGGKREK--KKIKKKPIIPL-

Query:  VGDLLFRKK
        +G +  +KK
Subjt:  VGDLLFRKK

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAAAAGTACTGCTAAAGCAAAGAGCTCAATTCTCCCACCTAACCAATCATCAAATATACAAATATCCTCCCACACATCCTCAATGCACTTCAACTCTCCAAGCATGGA
AGACCCTGCAATGCCTAATCCAAATCTTGGCTCCTCCGTCGACACCTCCCGCCCCTTTAGCTCCGTCAAAGAGGCCGTTGCAGTGTTCGGCGAGCGGCTTCTAGTTGGAG
AAGCTTACTCGTCATCGCCAAAACCGTGTGCTCATGTCACATTTCCCGAACCAGGAGGATCGCGGGATCAGTCTATGCCAAGCTTTACAACCGAAGTAAAAGAAGAAAAA
GAAGTTCTGGATAGCCTGAAGAAACTTGAGGCAGAACTGGAAGAGACCAAGCAAGAGTTGAGGTTGCTGAAGGAGAGGGAAGAAGATACAGAAGTGGCATTGGCATCATT
GAATGCAGAGCTGCACAAGAACATGTCGAAGTTGGCCGAGGCCGAGGCAGCGGAAGCAGCAGCAGCAAAAGCCGTAGCGACGAGAAGAATTACGATGGGATCCGAGAATG
GAAGGGTAGGGGAAGAAATGAAGAAATCAATGTCAAATGGGAAAGAGTCACCTTCATTAGCTCAAATATTGAGCTTTGGAGACAATATAGCCTATTTTGGAGGGAAAAGG
GAAAAGAAAAAGATAAAGAAAAAACCAATAATTCCATTGGTTGGAGATTTATTGTTCAGGAAAAAAGGGTCTCTACTTTCATCTTTCAACTCCTTCAAATAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MKSTAKAKSSILPPNQSSNIQISSHTSSMHFNSPSMEDPAMPNPNLGSSVDTSRPFSSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCAHVTFPEPGGSRDQSMPSFTTEVKEEK
EVLDSLKKLEAELEETKQELRLLKEREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAAEAAAAKAVATRRITMGSENGRVGEEMKKSMSNGKESPSLAQILSFGDNIAYFGGKR
EKKKIKKKPIIPLVGDLLFRKKGSLLSSFNSFK

Sed0008181 (gene) of Chayote v1 genome