; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0008324 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0008324
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionC2H2-type domain-containing protein
Genome locationLG01:69856620..69857486
RNA-Seq ExpressionSed0008324
SyntenySed0008324
Gene Ontology termsGO:0019058 - viral life cycle (biological process)
GO:0022610 - biological adhesion (biological process)
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR036236 - Zinc finger C2H2 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606245.1 Zinc finger protein 10, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-8169.14Show/hide
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        S ++EQ     +ME+ NQE+DLELRLG  PST TLMEK  KISN EAACLRKRSSD
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KAG7036187.1 Zinc finger protein 10, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.7e-8370.04Show/hide
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        QA  N IKP      S+SS SSTSNSFIIP+ DFNGGGLCVLY FPNP       Y   SP SSLFSM HHSFNN +PST      PI + RAGAS+F +
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         S ++EQ     +ME+ NQE+DLELRLG  PSTQTLMEK  KISN EAACLRKRSSD
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XP_022931230.1 zinc finger protein 10-like [Cucurbita moschata]1.3e-8370.47Show/hide
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        MA  L+L FQY  SSS L L++ TRDG   +  +PMQTPDVVD+DDSWEVRAFAEDTA+VMGTTWPPRSYTCT+CRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLH
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        QA  N IKP   S+SS SSTSNSFIIP+ DFNGGGLCVLY FPNP       Y   SP SSLFSM HHSFNN +PST      PI + RAGAS+F + S 
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        ++EQ     +ME+ NQE+DLELRLG  PSTQTLMEKG KISN EAACLRKRSSD
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XP_022995519.1 transcriptional regulator SUPERMAN-like [Cucurbita maxima]1.8e-8270.08Show/hide
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        MA  L+L FQY SSS L L++ TR G   + L+PMQTPDVVD+DDSWEVRAFAEDTA+VMGTTWPPRSYTCT+CRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQ
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        A  N IKP       S+SS S TSNSFIIP+ DFNGGGLCVLY FPNP       Y   SP SSLFSM HHSFNN +PST   PI + RAGAS+F + S 
Subjt:  AVPNTIKP-------SNSSPSSTSNSFIIPSPDFNGGGLCVLYQFPNPNCFHQNAYIHHSPNSSLFSMPHHSFNNCLPSTG--PITDLRAGASTFSRPSF

Query:  TEEQPFSTTSMENGNQELDLELRLGHGPSTQTLMEKGQKISNLEAACLRKRSSD
        ++EQ     +ME+ NQE+DLELRLG  PSTQTLMEKG KISN EAACLRKRSSD
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XP_038888762.1 transcriptional regulator SUPERMAN-like [Benincasa hispida]6.6e-8872.08Show/hide
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        MA +LELGFQY SSL HLAE TRDGQN + LNPMQ PD VVD+DDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQ
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        A P++  P   S SS SNSFIIP+PDFNGGG LC+LYQFPNPN  +         NAYI HSP SSLFSM HHSFN   PS+  ++       D R   S
Subjt:  AVPNTIKPSNSSPSSTSNSFIIPSPDFNGGG-LCVLYQFPNPNCFH--------QNAYIHHSPNSSLFSMPHHSFNNCLPSTGPIT-------DLRAGAS

Query:  TFSRPSFTEEQPFSTTSM--ENGNQELDLELRLGHGP--STQTLMEKGQKISNLEAACLRKRSSD
        TFS+   +++Q FS+TS    NG+QELDLELRLGHGP  STQTLMEKGQKISNLEAACLRKRSSD
Subjt:  TFSRPSFTEEQPFSTTSM--ENGNQELDLELRLGHGP--STQTLMEKGQKISNLEAACLRKRSSD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LF36 C2H2-type domain-containing protein5.4e-8067.15Show/hide
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        MA +L LGFQYSSSL HL+ETTRDGQN +G+NPMQTPD VVD+DDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLH 
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Query:  AVP----NTIKPSNSSPSSTSNSFIIPSPDFNGGG-LCVLYQFPNPNCFH---------QNAYIHHSPNSSLFSMPHHSFNNCLPSTG-----PITD---
          P    N +KPS++S SS SNSFIIP+PDFNGGG LC+LYQFPNPN  +          NAYI HSP SSLFSMPHHSFN    ST      P+ D   
Subjt:  AVP----NTIKPSNSSPSSTSNSFIIPSPDFNGGG-LCVLYQFPNPNCFH---------QNAYIHHSPNSSLFSMPHHSFNNCLPSTG-----PITD---

Query:  LRAGASTFSRPSFTEEQPFSTTSMENGN----QELDLELRLGHGP--STQTLMEKGQ-KISNLEAACLRKRSSD
         R   ST+S             SMEN N    + LDLELRLGHGP  STQ LMEKG+ KIS+ EAACL++RSSD
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A0A1S3CRJ1 transcriptional regulator SUPERMAN-like1.4e-8068.54Show/hide
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        MA +L LGFQYSSSL HL+ETTRDGQN +G+NPMQTPD VVD+DDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLH 
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Query:  AVP----NTIKPSNSSPSSTSNSFIIPSPDFNGGG-LCVLYQFPNPNCFH---------QNAYIHHSPNSSLFSMPHHSFNNCLPSTGPITDLRAGASTF
          P    N +KPS++S SS SNSFIIP+PDFNGGG LC+LYQFPNPN  +          NAYI HSP SSLFSMPHHSFN   PS+   T L A     
Subjt:  AVP----NTIKPSNSSPSSTSNSFIIPSPDFNGGG-LCVLYQFPNPNCFH---------QNAYIHHSPNSSLFSMPHHSFNNCLPSTGPITDLRAGASTF

Query:  SRPSFTEEQPFSTTSMENGN-----QELDLELRLGHGP--STQTLMEKGQ-KISNLEAACLRKRSSD
               E    + SMEN N     + LDLELRLGHGP  STQ LMEKG+ K+SN EAACL+KRSSD
Subjt:  SRPSFTEEQPFSTTSMENGN-----QELDLELRLGHGP--STQTLMEKGQ-KISNLEAACLRKRSSD

A0A5D3E693 Transcriptional regulator SUPERMAN-like1.4e-8068.54Show/hide
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        MA +L LGFQYSSSL HL+ETTRDGQN +G+NPMQTPD VVD+DDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLH 
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Query:  AVP----NTIKPSNSSPSSTSNSFIIPSPDFNGGG-LCVLYQFPNPNCFH---------QNAYIHHSPNSSLFSMPHHSFNNCLPSTGPITDLRAGASTF
          P    N +KPS++S SS SNSFIIP+PDFNGGG LC+LYQFPNPN  +          NAYI HSP SSLFSMPHHSFN   PS+   T L A     
Subjt:  AVP----NTIKPSNSSPSSTSNSFIIPSPDFNGGG-LCVLYQFPNPNCFH---------QNAYIHHSPNSSLFSMPHHSFNNCLPSTGPITDLRAGASTF

Query:  SRPSFTEEQPFSTTSMENGN-----QELDLELRLGHGP--STQTLMEKGQ-KISNLEAACLRKRSSD
               E    + SMEN N     + LDLELRLGHGP  STQ LMEKG+ K+SN EAACL+KRSSD
Subjt:  SRPSFTEEQPFSTTSMENGN-----QELDLELRLGHGP--STQTLMEKGQ-KISNLEAACLRKRSSD

A0A6J1EYW0 zinc finger protein 10-like6.2e-8470.47Show/hide
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        MA  L+L FQY  SSS L L++ TRDG   +  +PMQTPDVVD+DDSWEVRAFAEDTA+VMGTTWPPRSYTCT+CRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLH
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Query:  QAVPNTIKP---SNSSPSSTSNSFIIPSPDFNGGGLCVLYQFPNPNCFHQNAYIHHSPNSSLFSMPHHSFNNCLPSTG-----PITDLRAGASTFSRPSF
        QA  N IKP   S+SS SSTSNSFIIP+ DFNGGGLCVLY FPNP       Y   SP SSLFSM HHSFNN +PST      PI + RAGAS+F + S 
Subjt:  QAVPNTIKP---SNSSPSSTSNSFIIPSPDFNGGGLCVLYQFPNPNCFHQNAYIHHSPNSSLFSMPHHSFNNCLPSTG-----PITDLRAGASTFSRPSF

Query:  TEEQPFSTTSMENGNQELDLELRLGHGPSTQTLMEKGQKISNLEAACLRKRSSD
        ++EQ     +ME+ NQE+DLELRLG  PSTQTLMEKG KISN EAACLRKRSSD
Subjt:  TEEQPFSTTSMENGNQELDLELRLGHGPSTQTLMEKGQKISNLEAACLRKRSSD

A0A6J1K623 transcriptional regulator SUPERMAN-like9.0e-8370.08Show/hide
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        MA  L+L FQY SSS L L++ TR G   + L+PMQTPDVVD+DDSWEVRAFAEDTA+VMGTTWPPRSYTCT+CRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQ
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        A  N IKP       S+SS S TSNSFIIP+ DFNGGGLCVLY FPNP       Y   SP SSLFSM HHSFNN +PST   PI + RAGAS+F + S 
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Query:  TEEQPFSTTSMENGNQELDLELRLGHGPSTQTLMEKGQKISNLEAACLRKRSSD
        ++EQ     +ME+ NQE+DLELRLG  PSTQTLMEKG KISN EAACLRKRSSD
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80942 Zinc finger protein 103.0e-1962.2Show/hide
Query:  PDVVDEDDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAVPNTIKP-SNSSPSSTSN
        P   +++ SWE  AFAED A   G+ WPPRSYTC++CRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL QA    + P S+SSP   S+
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Q38895 Transcriptional regulator SUPERMAN2.6e-1537.08Show/hide
Query:  EDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAVPNTIKPSNSSPSSTSNSFIIPSPDFNGGGLCVLYQFPNPNCFHQNAYIHHS
        +D   ++G +WPPRSYTC++C+REFRSAQALGGHMNVHRRDRARL             SPSS+S     PSP            +PNPN  +  + + +S
Subjt:  EDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAVPNTIKPSNSSPSSTSNSFIIPSPDFNGGGLCVLYQFPNPNCFHQNAYIHHS

Query:  PNSSLFSMPHHSFNNCLPSTGPITDLRAGASTFSRPSFTEEQPFSTTSMENGNQELDLELRLGHGPSTQTLMEKGQKI
        P       PHHS     P+  P +  R  A      S     P S  + EN  +     L +  G +T+   +   KI
Subjt:  PNSSLFSMPHHSFNNCLPSTGPITDLRAGASTFSRPSFTEEQPFSTTSMENGNQELDLELRLGHGPSTQTLMEKGQKI

Q9LHS9 Probable transcriptional regulator RABBIT EARS2.9e-1452.69Show/hide
Query:  LNPMQTPDVVDEDDSW---EVRAF--AEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAVPNTIKPSNSSPSSTSNS
        L PM T    D    W   E RAF  AE+     G  WPPRSY+C++C REF+SAQALGGHMNVHRRDRARL        K  + SPSST  +
Subjt:  LNPMQTPDVVDEDDSW---EVRAF--AEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAVPNTIKPSNSSPSSTSNS

Q9SLB8 Zinc finger protein 111.9e-1355.38Show/hide
Query:  WPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAVPNTIKPSNSSPSSTSNSFIIPSPDFN
        WPP++YTC++CRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA+L Q      +P + +P +       P+P+F+
Subjt:  WPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAVPNTIKPSNSSPSSTSNSFIIPSPDFN

Q9SR34 Transcriptional regulator TAC17.7e-0752.94Show/hide
Query:  RSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAVPNTIKPSNSSPSSTS
        RSY C++C R F +AQALGGHMN+HRRDRA+L Q +    K    + S  S
Subjt:  RSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAVPNTIKPSNSSPSSTS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37740.1 zinc-finger protein 102.1e-2062.2Show/hide
Query:  PDVVDEDDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAVPNTIKP-SNSSPSSTSN
        P   +++ SWE  AFAED A   G+ WPPRSYTC++CRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL QA    + P S+SSP   S+
Subjt:  PDVVDEDDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAVPNTIKP-SNSSPSSTSN

AT2G42410.1 zinc finger protein 111.3e-1455.38Show/hide
Query:  WPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAVPNTIKPSNSSPSSTSNSFIIPSPDFN
        WPP++YTC++CRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA+L Q      +P + +P +       P+P+F+
Subjt:  WPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAVPNTIKPSNSSPSSTSNSFIIPSPDFN

AT3G23130.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein1.9e-1637.08Show/hide
Query:  EDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAVPNTIKPSNSSPSSTSNSFIIPSPDFNGGGLCVLYQFPNPNCFHQNAYIHHS
        +D   ++G +WPPRSYTC++C+REFRSAQALGGHMNVHRRDRARL             SPSS+S     PSP            +PNPN  +  + + +S
Subjt:  EDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAVPNTIKPSNSSPSSTSNSFIIPSPDFNGGGLCVLYQFPNPNCFHQNAYIHHS

Query:  PNSSLFSMPHHSFNNCLPSTGPITDLRAGASTFSRPSFTEEQPFSTTSMENGNQELDLELRLGHGPSTQTLMEKGQKI
        P       PHHS     P+  P +  R  A      S     P S  + EN  +     L +  G +T+   +   KI
Subjt:  PNSSLFSMPHHSFNNCLPSTGPITDLRAGASTFSRPSFTEEQPFSTTSMENGNQELDLELRLGHGPSTQTLMEKGQKI

AT4G17810.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein1.2e-2640.8Show/hide
Query:  NPMQTPDVVDEDDSWEVRAFAEDT-ANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHQAVPNTIKP-----------SNSSPSSTSN
        NP +  ++ D+D+SWEV+AF +DT  N+ GTTWPPRSYTC +CRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA  R HQ   +T+             ++ +P   + 
Subjt:  NPMQTPDVVDEDDSWEVRAFAEDT-ANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHQAVPNTIKP-----------SNSSPSSTSN

Query:  SFIIPSPDFNGGGLCVLYQFPNPNCFHQNAYIHHSPNSSLFSMPHHSFNNCLPSTGPITDLRAGASTFSRPSFTEEQPFSTTSMENGNQELDLELRLGHG
        + II S   N  GL   YQ  NP+    N+    +   +    P +   + L S   +       ST    S    +  + TS++    ELDLELRLGH 
Subjt:  SFIIPSPDFNGGGLCVLYQFPNPNCFHQNAYIHHSPNSSLFSMPHHSFNNCLPSTGPITDLRAGASTFSRPSFTEEQPFSTTSMENGNQELDLELRLGHG

Query:  P
        P
Subjt:  P

AT5G06070.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein2.1e-1552.69Show/hide
Query:  LNPMQTPDVVDEDDSW---EVRAF--AEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAVPNTIKPSNSSPSSTSNS
        L PM T    D    W   E RAF  AE+     G  WPPRSY+C++C REF+SAQALGGHMNVHRRDRARL        K  + SPSST  +
Subjt:  LNPMQTPDVVDEDDSW---EVRAF--AEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAVPNTIKPSNSSPSSTSNS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTACTCAGCTTGAGCTTGGATTTCAATATTCATCTTCTCTTCTTCATCTTGCCGAAACGACTCGCGACGGGCAGAATCAACACGGTTTAAACCCGATGCAAACGCC
GGACGTTGTCGACGAGGATGACTCTTGGGAAGTCAGGGCTTTCGCCGAGGACACGGCTAATGTCATGGGAACTACTTGGCCTCCTAGGTCTTACACTTGCACTTATTGTA
GAAGAGAGTTCAGATCGGCTCAAGCCCTAGGCGGTCATATGAATGTTCACCGCCGCGACCGAGCTCGGCTCCACCAAGCCGTACCGAACACGATCAAACCCTCTAATTCC
TCTCCATCCTCTACTTCCAATTCTTTCATCATCCCATCTCCTGATTTTAATGGTGGAGGATTGTGTGTTCTCTACCAATTCCCAAACCCTAATTGTTTTCATCAAAATGC
CTACATTCATCACTCACCCAATTCTTCTCTTTTCTCCATGCCCCATCATTCCTTCAACAACTGCTTGCCCTCAACCGGCCCGATCACTGACCTCCGTGCCGGAGCGAGTA
CTTTCTCTCGACCGTCATTCACCGAAGAACAACCCTTCTCAACAACATCCATGGAAAATGGCAACCAAGAGCTTGATCTAGAGCTGAGGCTTGGACATGGTCCTTCAACT
CAAACTCTAATGGAAAAGGGACAAAAGATCTCAAATCTTGAAGCTGCATGTTTGAGGAAGAGATCATCAGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTCAATGTCAGTTCACTATAATTGCCCCTTCTTCCATGGCTACTCAGCTTGAGCTTGGATTTCAATATTCATCTTCTCTTCTTCATCTTGCCGAAACGACTCGCGACGG
GCAGAATCAACACGGTTTAAACCCGATGCAAACGCCGGACGTTGTCGACGAGGATGACTCTTGGGAAGTCAGGGCTTTCGCCGAGGACACGGCTAATGTCATGGGAACTA
CTTGGCCTCCTAGGTCTTACACTTGCACTTATTGTAGAAGAGAGTTCAGATCGGCTCAAGCCCTAGGCGGTCATATGAATGTTCACCGCCGCGACCGAGCTCGGCTCCAC
CAAGCCGTACCGAACACGATCAAACCCTCTAATTCCTCTCCATCCTCTACTTCCAATTCTTTCATCATCCCATCTCCTGATTTTAATGGTGGAGGATTGTGTGTTCTCTA
CCAATTCCCAAACCCTAATTGTTTTCATCAAAATGCCTACATTCATCACTCACCCAATTCTTCTCTTTTCTCCATGCCCCATCATTCCTTCAACAACTGCTTGCCCTCAA
CCGGCCCGATCACTGACCTCCGTGCCGGAGCGAGTACTTTCTCTCGACCGTCATTCACCGAAGAACAACCCTTCTCAACAACATCCATGGAAAATGGCAACCAAGAGCTT
GATCTAGAGCTGAGGCTTGGACATGGTCCTTCAACTCAAACTCTAATGGAAAAGGGACAAAAGATCTCAAATCTTGAAGCTGCATGTTTGAGGAAGAGATCATCAGATTG
ATCAATTTGTAAGATATATATACATTAATTTCATCAAGCCTTTTTATTAGTCTTTTTTTTTCATCATCATAAGGGCAATTTCTTTTTTTAATTTTGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SPSSTSNSFIIPSPDFNGGGLCVLYQFPNPNCFHQNAYIHHSPNSSLFSMPHHSFNNCLPSTGPITDLRAGASTFSRPSFTEEQPFSTTSMENGNQELDLELRLGHGPST
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