; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0008596 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0008596
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionchlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic
Genome locationLG11:30112712..30121085
RNA-Seq ExpressionSed0008596
SyntenySed0008596
Gene Ontology termsGO:0015996 - chlorophyll catabolic process (biological process)
GO:0034256 - chlorophyll(ide) b reductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002347 - Short-chain dehydrogenase/reductase SDR
IPR020904 - Short-chain dehydrogenase/reductase, conserved site
IPR036291 - NAD(P)-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004140918.1 chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus]1.3e-16988.32Show/hide
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XP_022992660.1 chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic [Cucurbita maxima]4.2e-16888.39Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KE83 Uncharacterized protein6.2e-17088.32Show/hide
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A0A1S3C3P2 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic isoform X14.5e-16887.75Show/hide
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A0A6J1BXF3 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic6.7e-17289.52Show/hide
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A0A6J1FGR3 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic1.5e-16888.39Show/hide
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A0A6J1JWB8 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic2.0e-16888.39Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
C8WJW0 3beta-hydroxysteroid dehydrogenase 17.0e-1733.51Show/hide
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         E+   V+  N  G+   CR AI   L++   G I N+     +  P P FA Y A+K  V  LTK+L  E   + ++   V+ ++PG + T +
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Q5N800 Probable chlorophyll(ide) b reductase NYC1, chloroplastic1.9e-5444.06Show/hide
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        P NV+ITGST+G+G ALA++FL +GD VVI SRS E V  ++  L E   E                 V GT CDV K EDVK LVNF +  L  IDIWI
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        NNAG+N   F+PLV  SDED+ ++V+TN +G ++C REA+ +M +Q +GGH+FN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     SL  E R      V VH
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          SPGMV TDLL+SG++ +  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +       I +LT  +    + + +    RR ++F E+
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Q84ST4 Chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic5.9e-13384.31Show/hide
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        MVPPYNVLITGSTKGIGYALAK+FLKAGDNVVICSRSAERVES+V  L++EFGEQHVWG  CDVR+G+DVK LV+F +  +KYIDIWINNAGSNAYS+KP
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        LVE SDE L+EV+TTN LGLMICCREAI MM NQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAEL+M +V NV+VHNLSPGMVTTDLL
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        MSGA TKQAKFFIN+LAEP  VVA+YLVPNIR+IPTN S +PTYIRFLTGLKAYS+IFSR+AFGARRNKY  ED
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Q8LEU3 Chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic6.3e-13571.84Show/hide
Query:  SSSVSLFFPSPFISNNHGFLFISPHSGPRLSFCKSQSFNLPIAHSRKLLNIPRNGVANPKSVSTKAEVFQNNEPMVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLK
        SSS  L   S  +SN     F+SP    RL    ++ F L       ++   +N    P S + +A +    EPM PPYN+LITGSTKGIGYALA++FLK
Subjt:  SSSVSLFFPSPFISNNHGFLFISPHSGPRLSFCKSQSFNLPIAHSRKLLNIPRNGVANPKSVSTKAEVFQNNEPMVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLK

Query:  AGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVRKGEDVKNLVNFVQQNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCRE
        AGDNVVICSRSAERVE++VQSL+EEFGE HVWGTKCDV +G+DV+ LV + Q+NLKYIDIWINNAGSNAYSFKPL EASDEDLIEVV TN LGLM+CCRE
Subjt:  AGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVRKGEDVKNLVNFVQQNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCRE

Query:  AIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEY
        A+ MML Q RGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAEL+MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGA TKQAKFFINVLAEP EVVAEY
Subjt:  AIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEY

Query:  LVPNIRSIPTNNSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNKYFLED
        LVPNIR+IP + S +PTYIRFLTG+KAY++IFSR+A GAR+N+Y  E+
Subjt:  LVPNIRSIPTNNSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNKYFLED

Q93ZA0 Probable chlorophyll(ide) b reductase NYC1, chloroplastic1.1e-4944.31Show/hide
Query:  PYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVRKGEDVKNLVNFVQQNLKYIDIWI
        P NV+ITGST+G+G ALA++FL +GD V++ SRS+E V+ +V               +S R++  +  V G  CDV K EDV+ L NF  + L  I+IWI
Subjt:  PYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVRKGEDVKNLVNFVQQNLKYIDIWI

Query:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH
        NNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +M  Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E       NV +H
Subjt:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH

Query:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSI
          SPGMV T+LL+SG++ K  + F N++ E PE VA  LVP +R +
Subjt:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G10310.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein3.0e-1531.19Show/hide
Query:  MVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVRKGEDVKNLVNFVQQNLKYIDIWINNAGSNAYSFKP
        +V    VLITG +KG+G ALA +  K G  V+ C+RS E++ +    L       H+  T  DV+    V+ + + + +     DI +NNAG+   + K 
Subjt:  MVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVRKGEDVKNLVNFVQQNLKYIDIWINNAGSNAYSFKP

Query:  LVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLL
        + E S ED   V+ TN  G+    R  I +ML + +G  +    G G  G      A Y A+K ++  L++++  E+    V+ + V  L+PG++ T+LL
Subjt:  LVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLL

Query:  MS
         S
Subjt:  MS

AT1G24360.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein1.9e-1430.19Show/hide
Query:  EVFQNNEPMVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVI-CSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVRKGEDVKNLVNFVQQNLKYIDIWINNA
        EV Q  E  V    V+ITG+++GIG A+A    KAG  V++  +RSA+  E   + + E  G+   +G   DV K  DV  ++         ID+ +NNA
Subjt:  EVFQNNEPMVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVI-CSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVRKGEDVKNLVNFVQQNLKYIDIWINNA

Query:  GSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGA----GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVV
        G    +   L+        EV+  N  G+ +C + A+K+M+ + R G I NI       G+ G+     A Y A K  V+  +K+   E      +N+ V
Subjt:  GSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGA----GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVV

Query:  HNLSPGMVTTDL
        + + PG + +D+
Subjt:  HNLSPGMVTTDL

AT4G13250.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein7.6e-5144.31Show/hide
Query:  PYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVRKGEDVKNLVNFVQQNLKYIDIWI
        P NV+ITGST+G+G ALA++FL +GD V++ SRS+E V+ +V               +S R++  +  V G  CDV K EDV+ L NF  + L  I+IWI
Subjt:  PYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVRKGEDVKNLVNFVQQNLKYIDIWI

Query:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH
        NNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +M  Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E       NV +H
Subjt:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH

Query:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSI
          SPGMV T+LL+SG++ K  + F N++ E PE VA  LVP +R +
Subjt:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSI

AT4G13250.2 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein2.7e-4843.5Show/hide
Query:  PYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVRKGEDVKNLVNFVQQNLKYIDIWI
        P NV+ITG  +G+G ALA++FL +GD V++ SRS+E V+ +V               +S R++  +  V G  CDV K EDV+ L NF  + L  I+IWI
Subjt:  PYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVRKGEDVKNLVNFVQQNLKYIDIWI

Query:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH
        NNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +M  Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E       NV +H
Subjt:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH

Query:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSI
          SPGMV T+LL+SG++ K  + F N++ E PE VA  LVP +R +
Subjt:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSI

AT5G04900.1 NYC1-like4.5e-13671.84Show/hide
Query:  SSSVSLFFPSPFISNNHGFLFISPHSGPRLSFCKSQSFNLPIAHSRKLLNIPRNGVANPKSVSTKAEVFQNNEPMVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLK
        SSS  L   S  +SN     F+SP    RL    ++ F L       ++   +N    P S + +A +    EPM PPYN+LITGSTKGIGYALA++FLK
Subjt:  SSSVSLFFPSPFISNNHGFLFISPHSGPRLSFCKSQSFNLPIAHSRKLLNIPRNGVANPKSVSTKAEVFQNNEPMVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLK

Query:  AGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVRKGEDVKNLVNFVQQNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCRE
        AGDNVVICSRSAERVE++VQSL+EEFGE HVWGTKCDV +G+DV+ LV + Q+NLKYIDIWINNAGSNAYSFKPL EASDEDLIEVV TN LGLM+CCRE
Subjt:  AGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVRKGEDVKNLVNFVQQNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCRE

Query:  AIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEY
        A+ MML Q RGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAEL+MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGA TKQAKFFINVLAEP EVVAEY
Subjt:  AIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEY

Query:  LVPNIRSIPTNNSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNKYFLED
        LVPNIR+IP + S +PTYIRFLTG+KAY++IFSR+A GAR+N+Y  E+
Subjt:  LVPNIRSIPTNNSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNKYFLED


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCATCTTCTTCTTCTGTTTCCCTCTTCTTTCCATCTCCGTTCATCTCCAACAACCATGGCTTCTTATTCATCTCTCCTCATTCTGGACCACGCTTATCATTCTG
CAAATCGCAGAGTTTCAATCTTCCAATCGCTCATTCACGCAAGCTACTCAACATTCCCAGGAATGGCGTTGCGAATCCGAAGTCCGTATCCACAAAGGCCGAGGTGTTTC
AGAACAACGAGCCCATGGTTCCTCCTTACAACGTTTTGATCACCGGCTCTACCAAAGGAATAGGATATGCGTTGGCCAAACAGTTTCTGAAAGCAGGCGACAATGTTGTT
ATATGTTCACGATCAGCTGAAAGGGTAGAGTCTTCTGTTCAGAGCTTGAGAGAAGAATTTGGGGAGCAGCATGTGTGGGGTACTAAATGTGACGTGCGAAAAGGAGAGGA
TGTAAAGAATTTAGTCAATTTTGTGCAGCAAAATCTTAAATACATTGACATATGGATCAATAATGCAGGGTCAAATGCTTATAGTTTTAAGCCTTTGGTCGAGGCCTCAG
ATGAAGATCTCATTGAAGTTGTCACTACAAATGCTCTTGGTTTGATGATATGTTGCCGAGAGGCAATAAAGATGATGTTAAACCAACCTCGAGGGGGTCATATTTTCAAC
ATTGACGGTGCTGGCTCTGATGGACGACCCACCCCTAGGTTTGCTGCATACGGGGCAACTAAAAGAAGTGTTGTCCATTTAACGAAGTCATTACAGGCTGAGTTGCGGAT
GCAGGATGTGAAAAATGTTGTAGTGCACAATCTTTCGCCTGGAATGGTTACAACTGATCTTCTCATGTCTGGTGCTAATACAAAACAGGCAAAATTTTTCATCAATGTTT
TGGCGGAACCACCTGAAGTGGTTGCAGAATACCTCGTCCCAAACATTAGATCTATCCCAACCAATAATTCAACAAGGCCCACGTACATCCGTTTCCTCACCGGATTAAAA
GCTTATTCCCAGATATTCTCAAGACTTGCTTTTGGTGCAAGAAGAAACAAATATTTTCTAGAAGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATCCACGGCGCGAAATGGCTTCATCTTCTTCTTCTGTTTCCCTCTTCTTTCCATCTCCGTTCATCTCCAACAACCATGGCTTCTTATTCATCTCTCCTCATTCTGGACCA
CGCTTATCATTCTGCAAATCGCAGAGTTTCAATCTTCCAATCGCTCATTCACGCAAGCTACTCAACATTCCCAGGAATGGCGTTGCGAATCCGAAGTCCGTATCCACAAA
GGCCGAGGTGTTTCAGAACAACGAGCCCATGGTTCCTCCTTACAACGTTTTGATCACCGGCTCTACCAAAGGAATAGGATATGCGTTGGCCAAACAGTTTCTGAAAGCAG
GCGACAATGTTGTTATATGTTCACGATCAGCTGAAAGGGTAGAGTCTTCTGTTCAGAGCTTGAGAGAAGAATTTGGGGAGCAGCATGTGTGGGGTACTAAATGTGACGTG
CGAAAAGGAGAGGATGTAAAGAATTTAGTCAATTTTGTGCAGCAAAATCTTAAATACATTGACATATGGATCAATAATGCAGGGTCAAATGCTTATAGTTTTAAGCCTTT
GGTCGAGGCCTCAGATGAAGATCTCATTGAAGTTGTCACTACAAATGCTCTTGGTTTGATGATATGTTGCCGAGAGGCAATAAAGATGATGTTAAACCAACCTCGAGGGG
GTCATATTTTCAACATTGACGGTGCTGGCTCTGATGGACGACCCACCCCTAGGTTTGCTGCATACGGGGCAACTAAAAGAAGTGTTGTCCATTTAACGAAGTCATTACAG
GCTGAGTTGCGGATGCAGGATGTGAAAAATGTTGTAGTGCACAATCTTTCGCCTGGAATGGTTACAACTGATCTTCTCATGTCTGGTGCTAATACAAAACAGGCAAAATT
TTTCATCAATGTTTTGGCGGAACCACCTGAAGTGGTTGCAGAATACCTCGTCCCAAACATTAGATCTATCCCAACCAATAATTCAACAAGGCCCACGTACATCCGTTTCC
TCACCGGATTAAAAGCTTATTCCCAGATATTCTCAAGACTTGCTTTTGGTGCAAGAAGAAACAAATATTTTCTAGAAGATTGATAAGGACTTTGGTGTGTAAGTTTCCAT
CTTGTAAGTTCATGGTGGAGGTACCATGTTAAATATAGGTTAATTTTGGGTAAATTTTTAGATTAGTTGGTTTTACCTTCATTTACTAATTTATAAATAGAAAGCTACCC
TCTTTTGGTTGATATAATTAAATTTATCTCAATCCATCGGCTTAAACTTTTGGGTTGATTGGTGATTTAATATAATCCAACACTTTTGTATTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASSSSSVSLFFPSPFISNNHGFLFISPHSGPRLSFCKSQSFNLPIAHSRKLLNIPRNGVANPKSVSTKAEVFQNNEPMVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVV
ICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVRKGEDVKNLVNFVQQNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFN
IDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNNSTRPTYIRFLTGLK
AYSQIFSRLAFGARRNKYFLED