; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0009092 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0009092
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionMADS-box transcription factor 6
Genome locationLG09:753468..759549
RNA-Seq ExpressionSed0009092
SyntenySed0009092
Gene Ontology termsGO:0009908 - flower development (biological process)
GO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000978 - RNA polymerase II proximal promoter sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ABE03878.1 AGAMOUS LIKE6-like protein [Momordica charantia]9.5e-11186.23Show/hide
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KAG7026038.1 MADS-box transcription factor 6 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.3e-10788.65Show/hide
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XP_022146242.1 agamous-like MADS-box protein AGL6 [Momordica charantia]4.3e-11186.64Show/hide
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XP_022964202.1 MADS-box transcription factor 6 [Cucurbita moschata]1.1e-10688.65Show/hide
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XP_038877325.1 agamous-like MADS-box protein MADS3 isoform X1 [Benincasa hispida]4.4e-10884.62Show/hide
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        P Q +PIE QH+P+LQIGYQNY SEEGPSV+KSM TCETNFIQGWVI
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KCU5 Uncharacterized protein1.2e-10683.47Show/hide
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        P QP PI+ QH+P+LQIGYQNYFSEEGPS VQK+M TCETNFIQGWVI
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A0A6J1CZ22 agamous-like MADS-box protein AGL62.1e-11186.64Show/hide
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A0A6J1HH75 MADS-box transcription factor 65.3e-10788.65Show/hide
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A0A6J1KE81 MADS-box transcription factor 65.3e-10788.65Show/hide
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Q1KTF3 AGAMOUS LIKE6-like protein4.6e-11186.23Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P29386 Agamous-like MADS-box protein AGL69.0e-8062.3Show/hide
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        ESL RT+R+LLGEDLG + VKELQ LE+QLE AL   RQRK+Q+M+E++E+LR+KERQLGD+N +LK+K ET G  F+  Q  W++++A+     + + F
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        P+ PS P+ ++   EP LQIG+Q   Y   EG SV KS    ETNF+QGWV+
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Q38837 Agamous-like MADS-box protein AGL137.2e-6155.69Show/hide
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        MGRG+VE+KRIENKI RQVTFSKR++GLLKKAYELSVLCDAEV+LIIFS+ GKLYEF + G   T+ERY RC     DN +  +TQ   QE++KLK KYE
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        SL RTHR+L+GEDL  +S+KELQ LE+QLE AL+  R++K+Q+M+EQ+E LRRKER+LGD+N   KLKLET   +F+  Q    +   TA     F L  
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Query:  SQPSPI-EFQHEPVLQIGYQNYFSE-EGPSVQKS--MNTCETNFIQ
        +  + I +      LQIG+Q ++ + EG SV KS   +  ETNF+Q
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Q6EU39 MADS-box transcription factor 68.4e-7865.87Show/hide
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        MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEFGSAG T TLERYQ C + +QD N +  ETQ+W+ E+SKLKAK+
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Query:  ESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLETALAQARQRKSQIMIEQVENLRRKERQLGDLNTELKLKLETGG--QNFRAIQGFWSSNSATAEHGNTFP
        E+L RT RHLLGEDLGPLSVKELQ LEKQLE AL+QARQRK+Q+M+EQVE LRRKERQLG++N +LK KLE  G   N+RA+Q    +  A  E+G  + 
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          P  P       EP LQIGY + F   E  ++Q+S      E NF+ GWV+
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Q7XUN2 MADS-box transcription factor 177.9e-6860.32Show/hide
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        MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEFGSAG   TLE+Y  C + +Q + S     E Q+W+QE+S+LK 
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Query:  KYESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLETALAQARQRKSQIMIEQVENLRRKERQLGDLNTELKLKL--ETGGQNFR-AIQGFWSSNSATAEHGN
        K E L R+ RH+LGEDLGPLS+KELQ LEKQLE +L+QARQRK+QIM+EQV++LRRKERQLG+LN +LK KL  E    N R AIQ  W  +      G 
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Query:  TFPLHPSQPSPIEFQHEPVLQIGYQNYFSEE--GPSVQKSMNTCETNFIQGW
             P    P +   EP LQIGY  +   E   P           NF+ GW
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Q8LLR1 Agamous-like MADS-box protein MADS33.0e-9977.64Show/hide
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        MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEFGSAGTT TLERYQR  +T QDN  E ETQ+W+QE+SKLKAKYE
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Query:  SLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLETALAQARQRKSQIMIEQVENLRRKERQLGDLNTELKLKLETGGQNFRAIQGFWSSNSATAEHGNTFPLHP
        SL RT RHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLE ALAQARQRK+Q+MIEQ+E+LRRKERQLGDLN +LKLKLE  GQ+ +AIQG W+ ++ATA + ++FP+HP
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        SQ +P++ + EP+LQIGY +Y   EGPSV KSM   E+NFIQGWV+
Subjt:  SQPSPIEFQHEPVLQIGYQNYFSEEGPSVQKSMNTCETNFIQGWVI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G24260.1 K-box region and MADS-box transcription factor family protein1.9e-5351.38Show/hide
Query:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEF-GSAGTTTTLERYQRCSF-TSQDNCSERET---QNWFQEISKL
        MGRGRVELKRIENKINRQVTF+KRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFS+RGKLYEF  S+    TLERYQ+C++   + N   RE     +  QE  KL
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Query:  KAKYESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLETALAQARQRKSQIMIEQVENLRRKERQLGDLNTELKLKLETGGQNFRAIQGFWSSNSATAEHGNT
        K +Y++L RT R+LLGEDLGPLS KEL++LE+QL+++L Q R  ++Q M++Q+ +L+ KER L + N  L+L+L  G Q    +    + N    +H   
Subjt:  KAKYESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLETALAQARQRKSQIMIEQVENLRRKERQLGDLNTELKLKLETGGQNFRAIQGFWSSNSATAEHGNT

Query:  FPLHPSQPSPIEFQH---EPVLQIGYQNYFSEEGPSVQKSMNTCETNFIQGWV
              Q S   FQ    EP+LQIGYQ    ++G     S+N    N++ GW+
Subjt:  FPLHPSQPSPIEFQH---EPVLQIGYQNYFSEEGPSVQKSMNTCETNFIQGWV

AT1G24260.2 K-box region and MADS-box transcription factor family protein2.5e-5351.18Show/hide
Query:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEF-GSAGTTTTLERYQRCSF-TSQDNCSERET----QNWFQEISK
        MGRGRVELKRIENKINRQVTF+KRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFS+RGKLYEF  S+    TLERYQ+C++   + N   RE      +  QE  K
Subjt:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEF-GSAGTTTTLERYQRCSF-TSQDNCSERET----QNWFQEISK

Query:  LKAKYESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLETALAQARQRKSQIMIEQVENLRRKERQLGDLNTELKLKLETGGQNFRAIQGFWSSNSATAEHGN
        LK +Y++L RT R+LLGEDLGPLS KEL++LE+QL+++L Q R  ++Q M++Q+ +L+ KER L + N  L+L+L  G Q    +    + N    +H  
Subjt:  LKAKYESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLETALAQARQRKSQIMIEQVENLRRKERQLGDLNTELKLKLETGGQNFRAIQGFWSSNSATAEHGN

Query:  TFPLHPSQPSPIEFQH---EPVLQIGYQNYFSEEGPSVQKSMNTCETNFIQGWV
               Q S   FQ    EP+LQIGYQ    ++G     S+N    N++ GW+
Subjt:  TFPLHPSQPSPIEFQH---EPVLQIGYQNYFSEEGPSVQKSMNTCETNFIQGWV

AT2G45650.1 AGAMOUS-like 66.4e-8162.3Show/hide
Query:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEFGSAGTTTTLERYQRC-SFTSQDNCSERETQNWFQEISKLKAKY
        MGRGRVE+KRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEFGS G  +T+ERY RC + +  +N  E  TQ+W QE++KLK+KY
Subjt:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEFGSAGTTTTLERYQRC-SFTSQDNCSERETQNWFQEISKLKAKY

Query:  ESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLETALAQARQRKSQIMIEQVENLRRKERQLGDLNTELKLKLETGGQNFRAIQGFWSSNSATA---EHGNTF
        ESL RT+R+LLGEDLG + VKELQ LE+QLE AL   RQRK+Q+M+E++E+LR+KERQLGD+N +LK+K ET G  F+  Q  W++++A+     + + F
Subjt:  ESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLETALAQARQRKSQIMIEQVENLRRKERQLGDLNTELKLKLETGGQNFRAIQGFWSSNSATA---EHGNTF

Query:  PLHPSQPSPIEFQHEPVLQIGYQN--YFSEEGPSVQKSMNTCETNFIQGWVI
        P+ PS P+ ++   EP LQIG+Q   Y   EG SV KS    ETNF+QGWV+
Subjt:  PLHPSQPSPIEFQHEPVLQIGYQN--YFSEEGPSVQKSMNTCETNFIQGWVI

AT3G02310.1 K-box region and MADS-box transcription factor family protein2.8e-5250.39Show/hide
Query:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEF-GSAGTTTTLERYQRCSFTS--QDNCSERETQNWFQEISKLKA
        MGRGRVELKRIENKINRQVTF+KRRNGLLKKAYELSVLCDAEV+LI+FS+RGKLYEF  ++    TLERYQ+CS+ S   +N   +E +N ++E  KLK 
Subjt:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEF-GSAGTTTTLERYQRCSFTS--QDNCSERETQNWFQEISKLKA

Query:  KYESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLETALAQARQRKSQIMIEQVENLRRKERQLGDLNTELKLKLETG-GQNFRAIQGFWSSNSATAEHGNTF
        +YE+L R  R+LLGEDLGPL+ KEL+ LE+QL+ +L Q R  K+Q M++Q+ +L+ KE  L D N  L +KLE   G     I G W       +  N  
Subjt:  KYESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLETALAQARQRKSQIMIEQVENLRRKERQLGDLNTELKLKLETG-GQNFRAIQGFWSSNSATAEHGNTF

Query:  PLHPSQPSPIEFQH---EPVLQIGYQNYFSEEGPSVQKSMNTCETN-FIQGWVI
          HP   S   +Q    +P LQIGY +    E  +V     + + N +I GW++
Subjt:  PLHPSQPSPIEFQH---EPVLQIGYQNYFSEEGPSVQKSMNTCETN-FIQGWVI

AT3G61120.1 AGAMOUS-like 135.1e-6255.69Show/hide
Query:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEFGSAGTTTTLERYQRCSFTSQDNCSERETQNWFQEISKLKAKYE
        MGRG+VE+KRIENKI RQVTFSKR++GLLKKAYELSVLCDAEV+LIIFS+ GKLYEF + G   T+ERY RC     DN +  +TQ   QE++KLK KYE
Subjt:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEFGSAGTTTTLERYQRCSFTSQDNCSERETQNWFQEISKLKAKYE

Query:  SLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLETALAQARQRKSQIMIEQVENLRRKERQLGDLNTELKLKLETGGQNFRAIQGFWSSNSATAEHGNTFPLHP
        SL RTHR+L+GEDL  +S+KELQ LE+QLE AL+  R++K+Q+M+EQ+E LRRKER+LGD+N   KLKLET   +F+  Q    +   TA     F L  
Subjt:  SLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLETALAQARQRKSQIMIEQVENLRRKERQLGDLNTELKLKLETGGQNFRAIQGFWSSNSATAEHGNTFPLHP

Query:  SQPSPI-EFQHEPVLQIGYQNYFSE-EGPSVQKS--MNTCETNFIQ
        +  + I +      LQIG+Q ++ + EG SV KS   +  ETNF+Q
Subjt:  SQPSPI-EFQHEPVLQIGYQNYFSE-EGPSVQKS--MNTCETNFIQ


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAAGAGGAAGAGTAGAACTAAAGCGAATAGAGAACAAAATCAACCGTCAAGTCACGTTCTCGAAACGCCGAAACGGGCTCCTCAAAAAAGCTTACGAGCTCTCCGT
TCTATGCGATGCCGAAGTCGCTTTGATCATCTTCTCCAGCCGAGGCAAGCTCTATGAATTTGGCAGTGCAGGTACGACCACAACCTTGGAGAGGTACCAACGTTGTAGCT
TCACTTCTCAAGATAATTGCAGTGAACGAGAAACACAGAATTGGTTCCAGGAAATCTCAAAGTTGAAAGCTAAATATGAATCTCTTTGTCGGACTCATAGGCATTTACTT
GGGGAAGATCTTGGACCATTAAGTGTAAAGGAGCTCCAAAATCTTGAAAAGCAACTTGAAACAGCCCTTGCTCAAGCTAGACAAAGGAAGAGTCAGATCATGATTGAACA
GGTGGAAAATCTACGCAGAAAGGAACGTCAACTTGGGGATCTCAACACAGAGCTTAAGCTCAAGCTTGAGACAGGGGGACAAAACTTTAGAGCCATCCAAGGTTTTTGGA
GCTCTAACTCTGCAACTGCTGAACATGGCAACACTTTCCCATTGCATCCTTCACAACCTAGCCCTATCGAATTCCAACACGAACCCGTCTTACAAATCGGGTACCAAAAT
TATTTCTCAGAAGAGGGGCCATCTGTTCAAAAGAGCATGAATACATGTGAGACAAACTTCATACAAGGATGGGTTATTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GATCAAGAGAGTTTCTTGACCACAATTTGTTCAAAAAAATGGGAAGAGGAAGAGTAGAACTAAAGCGAATAGAGAACAAAATCAACCGTCAAGTCACGTTCTCGAAACGC
CGAAACGGGCTCCTCAAAAAAGCTTACGAGCTCTCCGTTCTATGCGATGCCGAAGTCGCTTTGATCATCTTCTCCAGCCGAGGCAAGCTCTATGAATTTGGCAGTGCAGG
TACGACCACAACCTTGGAGAGGTACCAACGTTGTAGCTTCACTTCTCAAGATAATTGCAGTGAACGAGAAACACAGAATTGGTTCCAGGAAATCTCAAAGTTGAAAGCTA
AATATGAATCTCTTTGTCGGACTCATAGGCATTTACTTGGGGAAGATCTTGGACCATTAAGTGTAAAGGAGCTCCAAAATCTTGAAAAGCAACTTGAAACAGCCCTTGCT
CAAGCTAGACAAAGGAAGAGTCAGATCATGATTGAACAGGTGGAAAATCTACGCAGAAAGGAACGTCAACTTGGGGATCTCAACACAGAGCTTAAGCTCAAGCTTGAGAC
AGGGGGACAAAACTTTAGAGCCATCCAAGGTTTTTGGAGCTCTAACTCTGCAACTGCTGAACATGGCAACACTTTCCCATTGCATCCTTCACAACCTAGCCCTATCGAAT
TCCAACACGAACCCGTCTTACAAATCGGGTACCAAAATTATTTCTCAGAAGAGGGGCCATCTGTTCAAAAGAGCATGAATACATGTGAGACAAACTTCATACAAGGATGG
GTTATTTGAATTCCATTTCAAAAACATACAACTTTAATAACATAGTATTTTAATTGTTTTGTTTTGTGTTTCTTTTTCCTTCTTTTAATGAATGTTTGGACTAAATATAT
TGCTGTCTATATTTTCTCTATTTTAAAGTATTGGGATCGTCTGTTAATTACGTTTTTAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEFGSAGTTTTLERYQRCSFTSQDNCSERETQNWFQEISKLKAKYESLCRTHRHLL
GEDLGPLSVKELQNLEKQLETALAQARQRKSQIMIEQVENLRRKERQLGDLNTELKLKLETGGQNFRAIQGFWSSNSATAEHGNTFPLHPSQPSPIEFQHEPVLQIGYQN
YFSEEGPSVQKSMNTCETNFIQGWVI