; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0009290 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0009290
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionTranscription initiation factor IIF subunit beta
Genome locationLG03:11231998..11236561
RNA-Seq ExpressionSed0009290
SyntenySed0009290
Gene Ontology termsGO:0006367 - transcription initiation from RNA polymerase II promoter (biological process)
GO:0006413 - translational initiation (biological process)
GO:0005674 - transcription factor TFIIF complex (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0003743 - translation initiation factor activity (molecular function)
GO:0008168 - methyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR003196 - Transcription initiation factor IIF, beta subunit
IPR011039 - Transcription Factor IIF, Rap30/Rap74, interaction
IPR036388 - Winged helix-like DNA-binding domain superfamily
IPR036390 - Winged helix DNA-binding domain superfamily
IPR040450 - TFIIF beta subunit, HTH domain
IPR040504 - TFIIF, beta subunit, N-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004152667.1 transcription initiation factor IIF subunit beta [Cucumis sativus]2.9e-13493.13Show/hide
Query:  MEDENGGGGSSGSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFS
        MEDE+G GGS  SSNLDTGKADRSVWLMKCPL+VAKSWQ+HPPSD LPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTE+GNVP+SFSLNMFKDFVPMCVFS
Subjt:  MEDENGGGGSSGSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFS

Query:  EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIM
        EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPH ENLEMYGKLCRERTNKSM+KNRQIQ+IDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEK+KVAP+KQSDVKRTRRDRGEL+DIM
Subjt:  EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIM

Query:  FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGGE
        FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRG NQGTYELKPEYKKS ED GGE
Subjt:  FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGGE

XP_008444765.1 PREDICTED: transcription initiation factor IIF subunit beta-like [Cucumis melo]7.7e-13593.13Show/hide
Query:  MEDENGGGGSSGSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFS
        MED++G GGS  SSNLDTGKADRSVWLMKCPL+VAKSWQ+HPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTE+GNVP+SFSLNMFKDFVPMCVFS
Subjt:  MEDENGGGGSSGSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFS

Query:  EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIM
        EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPH ENLEMYGKLCRERTNKSM+KNRQIQ+IDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEK+KVAP+KQSDVKRTRRDRGEL+DIM
Subjt:  EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIM

Query:  FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGGE
        FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRG NQGTYELKPEYKKS ED GGE
Subjt:  FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGGE

XP_022144312.1 transcription initiation factor IIF subunit beta [Momordica charantia]2.2e-13493.13Show/hide
Query:  MEDENGGGGSSGSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFS
        MEDE+GGGGS  SSNLDTGKADRSVWLMKCPL+VAKSWQSHPPSD LPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTE+GNVP+SFSLNMFKDFVPMCVFS
Subjt:  MEDENGGGGSSGSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFS

Query:  EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIM
        EASQGK+SMEGKVEHKFDMKPH ENLEMYGKLCRERTNKSM+KNRQIQ+IDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEK+KVAP+KQSDVKRTRRDRGEL+DIM
Subjt:  EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIM

Query:  FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGGE
        FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRG NQGTYELKPEYKKS E+ GGE
Subjt:  FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGGE

XP_023002475.1 transcription initiation factor IIF subunit beta [Cucurbita maxima]2.9e-13492.75Show/hide
Query:  MEDENGGGGSSGSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFS
        MEDENGGG    SSNLDTGKADRSVWLMKCPL+VAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTE+GNVP+SFSLNMFKDFVPMCVFS
Subjt:  MEDENGGGGSSGSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFS

Query:  EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIM
        EASQGK+SMEGKVEHKFDMKPH ENLEMYGKLCRERTNKSM+KNRQIQ+IDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSK+KRKVAP+KQ +VKRTRRDRGEL+DIM
Subjt:  EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIM

Query:  FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGGE
        FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRG NQGTYELKPEYKKS ED GGE
Subjt:  FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGGE

XP_038884084.1 transcription initiation factor IIF subunit beta-like [Benincasa hispida]5.9e-13593.13Show/hide
Query:  MEDENGGGGSSGSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFS
        MEDENGGG    SSNLDTGKADRSVWLMKCPL+VAKSWQ+HPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTE+GNVP+SFSLNMFKDFVPMCVFS
Subjt:  MEDENGGGGSSGSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFS

Query:  EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIM
        EASQGK+SMEGKVEHKFDMKPH ENLEMYGKLCRERTNKSM+KNRQIQ+IDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEK+KVAP+KQSDVKRTRRDRGEL+DIM
Subjt:  EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIM

Query:  FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGGE
        FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRG NQGTYELKPEYKKS ED GGE
Subjt:  FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGGE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LRL0 Transcription initiation factor IIF subunit beta1.4e-13493.13Show/hide
Query:  MEDENGGGGSSGSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFS
        MEDE+G GGS  SSNLDTGKADRSVWLMKCPL+VAKSWQ+HPPSD LPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTE+GNVP+SFSLNMFKDFVPMCVFS
Subjt:  MEDENGGGGSSGSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFS

Query:  EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIM
        EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPH ENLEMYGKLCRERTNKSM+KNRQIQ+IDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEK+KVAP+KQSDVKRTRRDRGEL+DIM
Subjt:  EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIM

Query:  FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGGE
        FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRG NQGTYELKPEYKKS ED GGE
Subjt:  FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGGE

A0A1S3BBV5 Transcription initiation factor IIF subunit beta3.7e-13593.13Show/hide
Query:  MEDENGGGGSSGSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFS
        MED++G GGS  SSNLDTGKADRSVWLMKCPL+VAKSWQ+HPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTE+GNVP+SFSLNMFKDFVPMCVFS
Subjt:  MEDENGGGGSSGSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFS

Query:  EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIM
        EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPH ENLEMYGKLCRERTNKSM+KNRQIQ+IDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEK+KVAP+KQSDVKRTRRDRGEL+DIM
Subjt:  EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIM

Query:  FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGGE
        FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRG NQGTYELKPEYKKS ED GGE
Subjt:  FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGGE

A0A5A7VAJ9 Transcription initiation factor IIF subunit beta3.7e-13593.13Show/hide
Query:  MEDENGGGGSSGSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFS
        MED++G GGS  SSNLDTGKADRSVWLMKCPL+VAKSWQ+HPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTE+GNVP+SFSLNMFKDFVPMCVFS
Subjt:  MEDENGGGGSSGSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFS

Query:  EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIM
        EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPH ENLEMYGKLCRERTNKSM+KNRQIQ+IDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEK+KVAP+KQSDVKRTRRDRGEL+DIM
Subjt:  EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIM

Query:  FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGGE
        FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRG NQGTYELKPEYKKS ED GGE
Subjt:  FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGGE

A0A6J1CTB7 Transcription initiation factor IIF subunit beta1.1e-13493.13Show/hide
Query:  MEDENGGGGSSGSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFS
        MEDE+GGGGS  SSNLDTGKADRSVWLMKCPL+VAKSWQSHPPSD LPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTE+GNVP+SFSLNMFKDFVPMCVFS
Subjt:  MEDENGGGGSSGSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFS

Query:  EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIM
        EASQGK+SMEGKVEHKFDMKPH ENLEMYGKLCRERTNKSM+KNRQIQ+IDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEK+KVAP+KQSDVKRTRRDRGEL+DIM
Subjt:  EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIM

Query:  FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGGE
        FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRG NQGTYELKPEYKKS E+ GGE
Subjt:  FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGGE

A0A6J1KP21 Transcription initiation factor IIF subunit beta1.4e-13492.75Show/hide
Query:  MEDENGGGGSSGSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFS
        MEDENGGG    SSNLDTGKADRSVWLMKCPL+VAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTE+GNVP+SFSLNMFKDFVPMCVFS
Subjt:  MEDENGGGGSSGSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFS

Query:  EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIM
        EASQGK+SMEGKVEHKFDMKPH ENLEMYGKLCRERTNKSM+KNRQIQ+IDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSK+KRKVAP+KQ +VKRTRRDRGEL+DIM
Subjt:  EASQGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIM

Query:  FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGGE
        FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRG NQGTYELKPEYKKS ED GGE
Subjt:  FKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGGE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O94424 Transcription initiation factor IIF subunit beta2.7e-2132.42Show/hide
Query:  SSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFV-PMCVFSE----ASQGKV
        + +LD G+    VWL+K P  +   W S P  D   L  V +  D +Q    +S          E+ +VP+ ++L +   FV    VF E    +S    
Subjt:  SSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFV-PMCVFSE----ASQGKV

Query:  SMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLIS-STSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIMFKLFER
        ++ G V H+ ++ P     + Y ++ ++R   +    R++Q+ID DRG  +   PG +G  S ST+   R V P     +K +R  R EL DI+FK FE 
Subjt:  SMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLIS-STSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIMFKLFER

Query:  QPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGGE
           W LK L +   QP  +LKE+L+ + + NKRG     Y LKPEYK + + A  E
Subjt:  QPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGGE

P41900 General transcription factor IIF subunit 27.5e-1626.54Show/hide
Query:  NLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPS----------DPLPLAKVILSLDP----LQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVP-----
        +LD   A R VWL+K P  +A+ W+  P +           P   A+V LSL P    L  +E    +  ++++           +L +F    P     
Subjt:  NLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPS----------DPLPLAKVILSLDP----LQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVP-----

Query:  --MCVFSEASQGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDR
              ++    K+ MEG++  K + +P  +N   Y KL  E   K+    R++Q ID     + +P+      I    +        K+++ K+ R D+
Subjt:  --MCVFSEASQGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDR

Query:  GELQDIMFKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYK
          + D++F  FE+   + +K LV+ T+QP  +LKEIL ++C YN +  ++  +ELK EY+
Subjt:  GELQDIMFKLFERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYK

Q01750 General transcription factor IIF subunit 21.2e-1629.2Show/hide
Query:  GSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGT-ESGNVPRSFSLNMFKDFV-------PMCVFSEAS
        G  +L   K +  VWL+K P  +++ W   P    +   ++  +    Q     S     ++A   + G  P S S      FV        + VF+E+S
Subjt:  GSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGT-ESGNVPRSFSLNMFKDFV-------PMCVFSEAS

Query:  QGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIMFKL
          K+S+EG V  + + +P     E Y KL R +  +S    R  Q  D     + +P+      I    K        K+ D KR R D+  + D++F  
Subjt:  QGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIMFKL

Query:  FERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYK
        FE+   + LK LV  T QP  +LKEIL E+ + N +G ++ T+ELKPEY+
Subjt:  FERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYK

Q2T9L9 General transcription factor IIF subunit 21.2e-1628.8Show/hide
Query:  GSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGT-ESGNVPRSFSLNMFKDFV-------PMCVFSEAS
        G  +L   K +  VWL+K P  +++ W   P    +   ++  +    Q     S     ++A   + G  P S S      FV        + VF+E+S
Subjt:  GSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGT-ESGNVPRSFSLNMFKDFV-------PMCVFSEAS

Query:  QGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIMFKL
          K+S+EG V  + + +P     E Y +L R +  +S    R  Q +D     + +P+      I    K        K+ D KR R D+  + D++F  
Subjt:  QGKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIMFKL

Query:  FERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYK
        FE+   + LK LV  T QP  +LK+IL E+ V N +G ++ T+ELKPEY+
Subjt:  FERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYK

Q8R0A0 General transcription factor IIF subunit 25.7e-1629.32Show/hide
Query:  GSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFV-------PMCVFSEASQ
        G  +L   K +  VWL+K P  +++ W     S    + K+ ++ +  +++ S +L   +     + G  P S S      FV        + VF+E+S 
Subjt:  GSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFV-------PMCVFSEASQ

Query:  GKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIMFKLF
         K+S+EG V  + + +P     E Y KL R +  +S    R  Q +D     + +P+      I    K        K+ D KR R D+  + D++F  F
Subjt:  GKVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIMFKLF

Query:  ERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYK
        E+   + LK LV  T QP  +LKEIL E+ + N +G ++ T+ELKPEY+
Subjt:  ERQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G75510.1 Transcription initiation factor IIF, beta subunit9.8e-9668.36Show/hide
Query:  NLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSW--------QSHPPSD-PLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFSEASQG
        NLD  K+DRS+WLMKCP+VV K+W         S   SD P  +AK++  +DPL+ D  S  +FKM M G E GN+P+ ++LNMF DFVPM  FS+ +QG
Subjt:  NLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSW--------QSHPPSD-PLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFSEASQG

Query:  KVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIMFKLFE
          + EGKV+HKFDMKP+ E +E Y +LCRERT+K+M+KNRQIQ+IDNDRGVHMRPMPGM+GL+SS SKEKRK  P+KQ++VKRTRRDRGEL+ IMFKLFE
Subjt:  KVSMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIMFKLFE

Query:  RQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGG
         QPNW LKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRG+NQGTYELKPEYKKSAED  G
Subjt:  RQPNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGG

AT3G52270.1 Transcription initiation factor IIF, beta subunit3.7e-7958.96Show/hide
Query:  LDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHP-------PSDPL-PLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFSEASQGKV
        L+TG A+RS+ LMK P +VA S QSH        P DP  P AKVIL +DPL + E    QF ME+A  +SGN+PR ++L+M KDF+PM VF E+S GK+
Subjt:  LDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHP-------PSDPL-PLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFSEASQGKV

Query:  SMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIMFKLFERQ
        S+EGK+++KFDM+PH EN+E YG+LCRERTNK M KNRQIQ+IDN RG+HMRPMPGM+  I + + EK+K+   + S++KRTRRDR E++++MF LFERQ
Subjt:  SMEGKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIMFKLFERQ

Query:  PNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAED
         NW L+ L+QETDQP QFLK++L +LC+YN +G+NQGTYELKPEYKK+ ++
Subjt:  PNWALKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAED


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGACGAGAACGGCGGCGGCGGAAGTAGCGGCAGCAGCAACTTGGATACAGGGAAGGCGGATAGATCAGTGTGGCTGATGAAGTGCCCGTTGGTGGTCGCTAAGTC
ATGGCAGTCTCATCCTCCTTCCGATCCTCTTCCGCTCGCTAAGGTCATCCTCTCTCTCGATCCTCTTCAATCCGACGAATCCTCTTCTCTCCAGTTCAAGATGGAGATGG
CGGGAACTGAGAGTGGAAATGTGCCAAGAAGCTTTTCCTTAAACATGTTTAAAGACTTTGTTCCTATGTGTGTCTTTTCAGAGGCAAGTCAAGGTAAGGTGTCAATGGAA
GGGAAAGTGGAGCATAAATTTGACATGAAGCCTCACAGAGAAAATCTTGAAATGTATGGGAAGCTGTGCCGTGAGAGGACTAACAAGTCCATGATTAAGAATAGACAAAT
TCAACTGATAGACAATGACCGTGGAGTGCATATGAGGCCGATGCCTGGCATGGTTGGTTTGATCAGTTCAACTTCAAAGGAAAAGAGGAAGGTTGCTCCTCTTAAACAGT
CGGATGTGAAAAGAACTAGAAGGGATCGTGGGGAACTGCAAGATATAATGTTCAAGCTATTTGAAAGACAGCCAAACTGGGCACTAAAGCAGCTAGTTCAAGAGACTGAT
CAACCCGCACAATTCTTGAAAGAGATATTGAATGAACTTTGTGTCTACAACAAAAGAGGGGCTAATCAAGGGACCTATGAGCTTAAGCCCGAATACAAGAAATCGGCTGA
GGATGCTGGCGGAGAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCCAGGACATACCGTATATCTAGCATAAATGTTATTTTATTTTATTTTTTGAAGCCATATTTAGCATAAATCTGAGAGGAATAATCAGAAGCGGTGAGTAGCACGATAAT
TCATCATCTCATCTCAATCAGATCAGTTGTACAACAATCTTCTGCTCTCGAACTGCGTAATATCAAAGCTCCGTTCCAGTTCTTCAGGCCTCCGTCGTCGGCGAAAGTTC
AGAGCAGCCAGACATGGAAGACGAGAACGGCGGCGGCGGAAGTAGCGGCAGCAGCAACTTGGATACAGGGAAGGCGGATAGATCAGTGTGGCTGATGAAGTGCCCGTTGG
TGGTCGCTAAGTCATGGCAGTCTCATCCTCCTTCCGATCCTCTTCCGCTCGCTAAGGTCATCCTCTCTCTCGATCCTCTTCAATCCGACGAATCCTCTTCTCTCCAGTTC
AAGATGGAGATGGCGGGAACTGAGAGTGGAAATGTGCCAAGAAGCTTTTCCTTAAACATGTTTAAAGACTTTGTTCCTATGTGTGTCTTTTCAGAGGCAAGTCAAGGTAA
GGTGTCAATGGAAGGGAAAGTGGAGCATAAATTTGACATGAAGCCTCACAGAGAAAATCTTGAAATGTATGGGAAGCTGTGCCGTGAGAGGACTAACAAGTCCATGATTA
AGAATAGACAAATTCAACTGATAGACAATGACCGTGGAGTGCATATGAGGCCGATGCCTGGCATGGTTGGTTTGATCAGTTCAACTTCAAAGGAAAAGAGGAAGGTTGCT
CCTCTTAAACAGTCGGATGTGAAAAGAACTAGAAGGGATCGTGGGGAACTGCAAGATATAATGTTCAAGCTATTTGAAAGACAGCCAAACTGGGCACTAAAGCAGCTAGT
TCAAGAGACTGATCAACCCGCACAATTCTTGAAAGAGATATTGAATGAACTTTGTGTCTACAACAAAAGAGGGGCTAATCAAGGGACCTATGAGCTTAAGCCCGAATACA
AGAAATCGGCTGAGGATGCTGGCGGAGAGTAGGGGTTAGTCTTTGACTGTATCATTTTATATTTTCCCTAATTATTTTTTTGGATTAGATTATATTTCCCTAATTAAGAA
GAAAAATGATCTTGTTTTTGTTATATTTTCATGGGAGGGAGGAATGTGAAGATGAAAAGAAAGATGGTTTAAAATAATTGCTAGGTAGATTTATACTAAAGTGAAATGAA
AGTAGGGGGAAGTTATTTTGTCATGCTTATTCAATTATGTACAAGTTCGAAGTTGCTAAGTGTATCTGTATAATGAAATTTATGAGCTTGGAAATGTTGAGAATTCCAAG
ATCGAGGATATCTATTAATAGGTGAACCATTTCTCTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEDENGGGGSSGSSNLDTGKADRSVWLMKCPLVVAKSWQSHPPSDPLPLAKVILSLDPLQSDESSSLQFKMEMAGTESGNVPRSFSLNMFKDFVPMCVFSEASQGKVSME
GKVEHKFDMKPHRENLEMYGKLCRERTNKSMIKNRQIQLIDNDRGVHMRPMPGMVGLISSTSKEKRKVAPLKQSDVKRTRRDRGELQDIMFKLFERQPNWALKQLVQETD
QPAQFLKEILNELCVYNKRGANQGTYELKPEYKKSAEDAGGE