; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0009648 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0009648
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionCalcium-binding EF-hand
Genome locationLG10:27652820..27653458
RNA-Seq ExpressionSed0009648
SyntenySed0009648
Gene Ontology termsGO:0005509 - calcium ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002048 - EF-hand domain
IPR011992 - EF-hand domain pair
IPR018247 - EF-Hand 1, calcium-binding site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0060897.1 putative calcium-binding protein CML10 [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-1967.5Show/hide
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KAE8652092.1 hypothetical protein Csa_021918 [Cucumis sativus]3.6e-1965Show/hide
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        MGN+YSSLSEE++A +FK+HD D+DRKL+KEEL RAF YL SR +A R   A+RAVD + DG+IS DEM  LI+YVKG R
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KAG6585661.1 putative calcium-binding protein CML15, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-1361.97Show/hide
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        +SEE++  +FK HD D D KLSKEELK+AF YL SR SAFRA  ALR VD + DG++S DEM  LI Y KG
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KAG7020566.1 hypothetical protein SDJN02_17252, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.5e-1463.38Show/hide
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        +EE++A +FK HD D D KLSKEELK+AF YL SR S+FR   ALRA DT+ DG IS DEM  LI Y KGL
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KAG7020569.1 hypothetical protein SDJN02_17255, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.0e-1362.86Show/hide
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        +EE++A +FK HD D D KLSKEELK+AF YL SR S+FR   ALRA DT+ DG IS DEM  LI Y KG
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LL93 Uncharacterized protein1.8e-1965Show/hide
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A0A0A0LP43 Uncharacterized protein7.4e-1052.05Show/hide
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        +SL+E E+A VFK HD D D +L+KEELK AFKYL  + + FR + AL A D + D +IS +EM  LI+Y  G
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A0A0A0LRB6 Uncharacterized protein1.3e-1160.87Show/hide
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        SEE++A VFK HD D D  L+KEELK+AF+YL SR   FR   ALRA DT+ DG+IS DEM  LI Y K
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A0A5A7V219 Putative calcium-binding protein CML107.9e-2067.5Show/hide
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A0A5A7V5B0 Putative Calcium-binding EF-hand family protein2.7e-1262.32Show/hide
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        SEE++A VFK HD D D  L+KEELK+AF+YL SR S FR   ALRA DT+ DG+IS DEM  LI Y K
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9LE22 Probable calcium-binding protein CML275.8e-0441.94Show/hide
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        EE+  VF Q D + D K+S  EL   FK + +  +    N  L  VDTDRDG I+ DE   L
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Q9SRE6 Calcium-binding protein CML384.5e-0438.71Show/hide
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        E+  VF   D ++D ++S EEL+++F  L  + S   A AA+R  DTD DG++  +E   LI
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18210.1 Calcium-binding EF-hand family protein4.1e-0541.94Show/hide
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AT1G18210.2 Calcium-binding EF-hand family protein4.1e-0541.94Show/hide
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        EE+  VF Q D + D K+S  EL   FK + +  +    N  L  VDTDRDG I+ DE   L
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AT1G76640.1 Calcium-binding EF-hand family protein9.2e-0537.1Show/hide
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        ++  VF   D ++D ++S EELK++FK L  + S   A AA++  D D DG++  +E   LI
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AT1G76650.1 calmodulin-like 383.2e-0538.71Show/hide
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        E+  VF   D ++D ++S EEL+++F  L  + S   A AA+R  DTD DG++  +E   LI
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AT1G76650.3 calmodulin-like 383.2e-0538.71Show/hide
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        E+  VF   D ++D ++S EEL+++F  L  + S   A AA+R  DTD DG++  +E   LI
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAAATCAGTACAGTTCGTTGAGTGAAGAAGAGATTGCCTTGGTTTTCAAGCAACACGATGGGGACAAAGACAGGAAGCTGAGCAAAGAAGAGTTGAAGAGGGCTTT
CAAGTACTTGAATTCGAGGTGTAGCGCCTTCCGAGCCAACGCAGCACTTCGTGCGGTCGATACTGACAGAGATGGCCTCATCAGTTCCGACGAGATGCGTAATCTCATTT
TGTATGTTAAAGGCCTTCGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAACACAAAGCAACTTGGGTGGGAATTTGTTCTTGTTTGTGTGCATGGGAAATCAGTACAGTTCGTTGAGTGAAGAAGAGATTGCCTTGGTTTTCAAGCAACACGATGG
GGACAAAGACAGGAAGCTGAGCAAAGAAGAGTTGAAGAGGGCTTTCAAGTACTTGAATTCGAGGTGTAGCGCCTTCCGAGCCAACGCAGCACTTCGTGCGGTCGATACTG
ACAGAGATGGCCTCATCAGTTCCGACGAGATGCGTAATCTCATTTTGTATGTTAAAGGCCTTCGTTGATAAAACTGCACTCTTCTACATACACTTATAGTATGTATTTGA
AGTGAAACAAAAACCTTTATTGTCCAAAAATAATACCTGGAATGTCGACCTTCTAAATTACGTCGTAGGTCTGAATATTTATCTTTAAGTTTTTTTTTTAATAAGAATGC
TTATCTTTAAGTTGGGGCGTTATGTTTTAGTAAAACTAAAAGTATTGTTATGTATTTTCCTCTCTTGTGTGTCTATTAGAGTATGCTTGATAATAACTTTTCTGCTATAT
CCTATAATTTTTTTTTTTTTAATCAAGAAAAGTATATGTGAAATTCTAATTAGATTTCAAAACAACCACAAAGAGGTATCCATTTCCAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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