; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0009875 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0009875
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionRas-related protein Rab-6A
Genome locationLG01:69655070..69660414
RNA-Seq ExpressionSed0009875
SyntenySed0009875
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0006890 - retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum (biological process)
GO:0006891 - intra-Golgi vesicle-mediated transport (biological process)
GO:0042147 - retrograde transport, endosome to Golgi (biological process)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7036170.1 Ras-related protein RABH1b, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.7e-10397.6Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG-AQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EE EAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG AQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG-AQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

XP_022159735.1 ras-related protein RABH1b [Momordica charantia]1.0e-10297.6Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG-AQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEE EAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG AQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG-AQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

XP_022958673.1 ras-related protein RABH1b [Cucurbita moschata]2.7e-10397.6Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG-AQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EE EAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG AQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG-AQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

XP_022996115.1 ras-related protein RABH1b [Cucurbita maxima]6.1e-10397.12Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG-AQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EE EAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+GSG AQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG-AQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

XP_038889006.1 ras-related protein RABH1b [Benincasa hispida]6.1e-10397.6Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG-AQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEE EAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+GSG AQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG-AQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI95 Uncharacterized protein1.5e-10297.12Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG-AQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEE EAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+GSG AQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG-AQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQS GCAC
Subjt:  PQSGGCAC

A0A5A7TB19 Ras-related protein RABH1b-like isoform X11.5e-10297.12Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG-AQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEE EAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+GSG AQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG-AQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQS GCAC
Subjt:  PQSGGCAC

A0A6J1DZL5 ras-related protein RABH1b5.1e-10397.6Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG-AQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEE EAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG AQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG-AQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

A0A6J1H3Q8 ras-related protein RABH1b1.3e-10397.6Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG-AQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EE EAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG AQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG-AQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

A0A6J1K5U1 ras-related protein RABH1b3.0e-10397.12Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG-AQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EE EAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+GSG AQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSG-AQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80501 Ras-related protein RABH1b1.7e-10092.31Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQ+F+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAQ-SQ
        +KWI+EVRTERGSDVI+VLVGNKTDLV+KRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSS + A  +Q
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAQ-SQ

Query:  PQSGGCAC
         QSGGC+C
Subjt:  PQSGGCAC

P20340 Ras-related protein Rab-6A9.9e-8074.75Show/hide
Query:  LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINTSKWIEE
        L K+KLVFLG+QSVGKTS+ITRFMYD FD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDS+VAV+VYD+ +  +F  T+KWI++
Subjt:  LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINTSKWIEE

Query:  VRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAQSQPQS-GGC
        VRTERGSDVII+LVGNKTDL +KRQVSIEE E KA+ELNVMFIETSAKAG+N+K LFR++AAALPGME+     +EDM+D+ L+      Q QP S GGC
Subjt:  VRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAQSQPQS-GGC

Query:  AC
        +C
Subjt:  AC

Q9LFT9 Ras-related protein RABH1e2.0e-9688.41Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT
        MA  S LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVA+RQ+F+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAQSQP
        SKWIE+VRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSIEE + KAR+  V+FIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLK+S + AQ + 
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAQSQP

Query:  QSGGCAC
        Q GGCAC
Subjt:  QSGGCAC

Q9SID8 Ras-related protein RABH1d4.3e-9183.57Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT
        MA  S LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDVA+R +F+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAQSQP
        SKWIEEVR ER  DVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEE ++K RE  VMFIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGME+ S+TK EDMVDVNLK + + +Q   
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAQSQP

Query:  QSGGCAC
        Q G C+C
Subjt:  QSGGCAC

Q9SMR4 Ras-related protein RABH1c3.9e-8477.57Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT
        MA  S LAK+KLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQ TIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVA++VYDV++RQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT

Query:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLS-STKQEDMVDVNLKSSGSGAQS
        SKWIE+V  ERG S+VIIVLVGNKTDLVEKRQVSI E E K +E  VMFIETSAK  FNIKALFRKIAAALPG+++ S +TK +DMVDVNLK++ + +Q 
Subjt:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLS-STKQEDMVDVNLKSSGSGAQS

Query:  QPQ-----SGGCAC
        + Q      GGC+C
Subjt:  QPQ-----SGGCAC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G22290.1 RAB GTPase homolog H1D3.0e-9283.57Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT
        MA  S LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDVA+R +F+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAQSQP
        SKWIEEVR ER  DVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEE ++K RE  VMFIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGME+ S+TK EDMVDVNLK + + +Q   
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAQSQP

Query:  QSGGCAC
        Q G C+C
Subjt:  QSGGCAC

AT2G44610.1 Ras-related small GTP-binding family protein1.2e-10192.31Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQ+F+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAQ-SQ
        +KWI+EVRTERGSDVI+VLVGNKTDLV+KRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSS + A  +Q
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAQ-SQ

Query:  PQSGGCAC
         QSGGC+C
Subjt:  PQSGGCAC

AT4G39890.1 RAB GTPase homolog H1C2.8e-8577.57Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT
        MA  S LAK+KLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQ TIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVA++VYDV++RQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT

Query:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLS-STKQEDMVDVNLKSSGSGAQS
        SKWIE+V  ERG S+VIIVLVGNKTDLVEKRQVSI E E K +E  VMFIETSAK  FNIKALFRKIAAALPG+++ S +TK +DMVDVNLK++ + +Q 
Subjt:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLS-STKQEDMVDVNLKSSGSGAQS

Query:  QPQ-----SGGCAC
        + Q      GGC+C
Subjt:  QPQ-----SGGCAC

AT5G10260.1 RAB GTPase homolog H1E1.4e-9788.41Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT
        MA  S LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVA+RQ+F+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAQSQP
        SKWIE+VRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSIEE + KAR+  V+FIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLK+S + AQ + 
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAQSQP

Query:  QSGGCAC
        Q GGCAC
Subjt:  QSGGCAC

AT5G64990.1 RAB GTPase homolog H1A6.2e-7776.88Show/hide
Query:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINTSKWIEEVRT
        YKLVFLGDQ VGKTSIIT FMY KFDT+YQATIGIDFLSKT   EDRT RLQLWDTAGQERF+SL+PSYIRDSSVAVIVYDVAS+Q+FINTSKWIEEVR 
Subjt:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINTSKWIEEVRT

Query:  ERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAQ-SQPQSGGCAC
        ERGS VIIVLVGNKTDLV KRQVSIEE E KARE   +F+ETSAKAGFNIK LF KI +AL G E +S TKQED+VDVNLK     +Q +  Q   C+C
Subjt:  ERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAQ-SQPQSGGCAC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCACCGACGTCGGCTCTGGCGAAGTATAAGCTGGTTTTTCTCGGAGACCAGTCCGTCGGAAAAACCAGCATCATCACACGCTTCATGTACGATAAATTCGATACTAC
ATATCAGGCTACGATTGGAATTGATTTTCTCTCAAAAACTATGTATCTTGAAGATCGCACTGTTCGACTGCAGTTGTGGGACACTGCTGGACAGGAAAGATTCAGAAGTC
TAATACCAAGCTATATCAGGGACTCATCTGTTGCTGTCATCGTTTATGATGTTGCTAGCAGGCAGACTTTCATAAACACTTCAAAATGGATTGAGGAGGTGCGTACTGAG
AGGGGCAGTGATGTTATTATAGTGCTTGTTGGGAACAAAACGGATCTTGTGGAGAAGAGGCAAGTCTCTATAGAAGAAGCAGAAGCCAAAGCCCGTGAACTAAATGTCAT
GTTTATAGAAACAAGTGCAAAAGCTGGATTCAATATTAAGGCACTATTCCGAAAAATTGCTGCAGCGTTGCCGGGAATGGAAACTCTCTCTTCAACAAAGCAAGAAGACA
TGGTTGATGTTAACCTGAAGTCCTCAGGCAGTGGTGCACAATCCCAGCCACAGTCCGGTGGATGCGCCTGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTTCGAAACTGAAAGGCAAAATCCAGATCGAAGAAAAAGAGAGACACAAACTGGGCCAAAGGCCAGAGTTTCCATTGCAACCAAACCACGGCCTCATCATCGTCTCCTTC
ACAAATCTCCATCTTCATCCAATAATTCTTCCCCAATCGGAAACGCAGATCGGAGATCTCTGCAGCAATGGCACCGACGTCGGCTCTGGCGAAGTATAAGCTGGTTTTTC
TCGGAGACCAGTCCGTCGGAAAAACCAGCATCATCACACGCTTCATGTACGATAAATTCGATACTACATATCAGGCTACGATTGGAATTGATTTTCTCTCAAAAACTATG
TATCTTGAAGATCGCACTGTTCGACTGCAGTTGTGGGACACTGCTGGACAGGAAAGATTCAGAAGTCTAATACCAAGCTATATCAGGGACTCATCTGTTGCTGTCATCGT
TTATGATGTTGCTAGCAGGCAGACTTTCATAAACACTTCAAAATGGATTGAGGAGGTGCGTACTGAGAGGGGCAGTGATGTTATTATAGTGCTTGTTGGGAACAAAACGG
ATCTTGTGGAGAAGAGGCAAGTCTCTATAGAAGAAGCAGAAGCCAAAGCCCGTGAACTAAATGTCATGTTTATAGAAACAAGTGCAAAAGCTGGATTCAATATTAAGGCA
CTATTCCGAAAAATTGCTGCAGCGTTGCCGGGAATGGAAACTCTCTCTTCAACAAAGCAAGAAGACATGGTTGATGTTAACCTGAAGTCCTCAGGCAGTGGTGCACAATC
CCAGCCACAGTCCGGTGGATGCGCCTGCTGATGAAACTCGACGACTCGAGGAATCGCTCTTTCTTGACTTTTGAATTTCAACTTCTCGACCTCTTCTATGAACTTAAGAG
CAATGCAGGTACAGGATGTGGTGAGTATCTTTCAATGTCTGCTTGAGCAAACTATATGTGATTGGTGGCAAGGGTAGACAACTGTTATTTTATGGAGTAGTTTGATGTAT
TATTGGGGAGTCATTATTAATTTGGGTTTTGGGATTTGGATGTGTAAAAAATAGAAAATTATCTTGGACTCGATTTTAGAATTTTTGCCTGTCTCAGTAAAGTTGTAATT
CGCCTCTAGAAATTCTGAAACTTTCATCTCTTTTTTTTTTTACAACGGATGGTTGCGTTGGTTCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFINTSKWIEEVRTE
RGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEAEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAQSQPQSGGCAC