; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0009907 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0009907
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionProtein-serine/threonine phosphatase
Genome locationLG07:10955097..10967829
RNA-Seq ExpressionSed0009907
SyntenySed0009907
Gene Ontology termsGO:0006470 - protein dephosphorylation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0004722 - protein serine/threonine phosphatase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001932 - PPM-type phosphatase domain
IPR036457 - PPM-type phosphatase domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6593490.1 putative protein phosphatase 2C 6, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.6e-8487.08Show/hide
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XP_022964465.1 probable protein phosphatase 2C 6 isoform X1 [Cucurbita moschata]2.5e-8588.2Show/hide
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XP_022964466.1 probable protein phosphatase 2C 6 isoform X2 [Cucurbita moschata]2.5e-8588.2Show/hide
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XP_023514699.1 probable protein phosphatase 2C 6 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.6e-8587.64Show/hide
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XP_023514700.1 probable protein phosphatase 2C 6 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.6e-8587.64Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A438CZ88 Protein phosphatase 2C 564.8e-5864.2Show/hide
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        +AL R+Y R DDA KD+ LAPYSVGST+LVV++SP QII ANCGDSRA+LCRG QAIPLTVDHK+ R DE AR+ + G +IL+   PRVEGVL+MTRAIG
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        DHYLKPWI SEPEVTF +R++ED+CLILASDG+WDVLSN+ V+K+  + LR +RRK       +++ PA  AA+ +
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A0A6J1D3B9 Protein-serine/threonine phosphatase2.5e-8385.56Show/hide
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        HYLKPW+ SEPEVTFMSRTEED+CLILASDGVWDVLSNDDVMKM CSILRR+RRKLA GG  NAI PAQ  AN+IRKV +
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A0A6J1HIZ5 probable protein phosphatase 2C 6 isoform X21.2e-8588.2Show/hide
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        DHYLKPWI  EPE+TF SRTEED+CLILASDGVWDVLSNDDVMKM CS+L+RQR+KLA GGT N IYPAQCAAN+IRK
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A0A6J1HKW1 Protein-serine/threonine phosphatase1.2e-8588.2Show/hide
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        DHYLKPWI  EPE+TF SRTEED+CLILASDGVWDVLSNDDVMKM CS+L+RQR+KLA GGT N IYPAQCAAN+IRK
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A0A6J1KDH4 Protein-serine/threonine phosphatase8.7e-8485.96Show/hide
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        DHYLKPWI  EPE+TF SR+EED+CLI+ASDGVWDVLSNDDVMKM CS+LRRQR+KL  GG  N IYPAQCAAN+IRK
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P49597 Protein phosphatase 2C 561.8e-3850.62Show/hide
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        AL  S+ RVD     +++AP +VGST++V ++ PS I VANCGDSRA+LCRG  A+PL+VDHK  R DE AR+   G +++     RV GVL M+R+IGD
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         YLKP I  +PEVT + R +EDDCLILASDGVWDV+++++  +M    +    +K A  G
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P49598 Protein phosphatase 2C 372.4e-3852.38Show/hide
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        +VGSTA+V +++P +IIV+NCGDSRA+LCR G AIPL+VDHK  RPDE  R+ + G R+++    RV GVL M+RAIGD+YLKP++  +PEVT   RT+E
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Query:  DDCLILASDGVWDVLSNDDVMKMTCSILRRQRRKLAFGGTRNAIYPA
        D+CLILASDG+WDV+ N+      C + R   R    G   +A + A
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Q0JLP9 Probable protein phosphatase 2C 67.4e-4050.32Show/hide
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        A    + RVD+     A + + +AP +VGSTA+V ++  S IIVANCGDSRA+LCRG Q +PL+VDHK +R DEYAR+   G +++     RV GVL M+
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Query:  RAIGDHYLKPWITSEPEVTFMSRTEEDDCLILASDGVWDVLSNDDVMKMTCSILRRQ
        R+IGD YLKPWI   PE+T + R ++D+CL+LASDG+WDV+SN++V    C + R++
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Q9LNW3 Protein phosphatase 2C 34.8e-3957.25Show/hide
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        +VGSTA+V +++P +IIVANCGDSRA+LCR G+A+PL+ DHK  RPDE  R+ + G R+++    RV GVL M+RAIGD+YLKP++TSEPEVT   RTEE
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        D+ LILA+DG+WDV++N+    M    L R+
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Q9ZW21 Probable protein phosphatase 2C 243.7e-3957.04Show/hide
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        +T A  SVGSTA+V +++P +I+VANCGDSRA+LCR G+ +PL+ DHK  RPDE  R+   G R+++  CPRV GVL M+RAIGD+YLKP+++ EPEVT 
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Query:  MSRTEEDDCLILASDGVWDVLSNDDVMKMTCSILR
          R  +DDCLILASDG+WDV+SN+      CS+ R
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07430.1 highly ABA-induced PP2C gene 23.4e-4057.25Show/hide
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        +VGSTA+V +++P +IIVANCGDSRA+LCR G+A+PL+ DHK  RPDE  R+ + G R+++    RV GVL M+RAIGD+YLKP++TSEPEVT   RTEE
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Query:  DDCLILASDGVWDVLSNDDVMKMTCSILRRQ
        D+ LILA+DG+WDV++N+    M    L R+
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AT2G29380.1 highly ABA-induced PP2C gene 32.6e-4057.04Show/hide
Query:  KTLAPYSVGSTALVVLLSPSQIIVANCGDSRALLCRGGQAIPLTVDHKISRPDEYARLAKGGARILFVGCPRVEGVLTMTRAIGDHYLKPWITSEPEVTF
        +T A  SVGSTA+V +++P +I+VANCGDSRA+LCR G+ +PL+ DHK  RPDE  R+   G R+++  CPRV GVL M+RAIGD+YLKP+++ EPEVT 
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Query:  MSRTEEDDCLILASDGVWDVLSNDDVMKMTCSILR
          R  +DDCLILASDG+WDV+SN+      CS+ R
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AT3G11410.1 protein phosphatase 2CA1.7e-3952.38Show/hide
Query:  SVGSTALVVLLSPSQIIVANCGDSRALLCRGGQAIPLTVDHKISRPDEYARLAKGGARILFVGCPRVEGVLTMTRAIGDHYLKPWITSEPEVTFMSRTEE
        +VGSTA+V +++P +IIV+NCGDSRA+LCR G AIPL+VDHK  RPDE  R+ + G R+++    RV GVL M+RAIGD+YLKP++  +PEVT   RT+E
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Query:  DDCLILASDGVWDVLSNDDVMKMTCSILRRQRRKLAFGGTRNAIYPA
        D+CLILASDG+WDV+ N+      C + R   R    G   +A + A
Subjt:  DDCLILASDGVWDVLSNDDVMKMTCSILRRQRRKLAFGGTRNAIYPA

AT4G26080.1 Protein phosphatase 2C family protein1.3e-3950.62Show/hide
Query:  ALARSYERVDDAFKDKTLAPYSVGSTALVVLLSPSQIIVANCGDSRALLCRGGQAIPLTVDHKISRPDEYARLAKGGARILFVGCPRVEGVLTMTRAIGD
        AL  S+ RVD     +++AP +VGST++V ++ PS I VANCGDSRA+LCRG  A+PL+VDHK  R DE AR+   G +++     RV GVL M+R+IGD
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         YLKP I  +PEVT + R +EDDCLILASDGVWDV+++++  +M    +    +K A  G
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AT5G57050.1 Protein phosphatase 2C family protein2.9e-3947.34Show/hide
Query:  ALARSYERVDDAFKDKTLAPYSVGSTALVVLLSPSQIIVANCGDSRALLCRGGQAIPLTVDHKISRPDEYARLAKGGARILFVGCPRVEGVLTMTRAIGD
        AL  S+ RVD   +    AP +VGST++V ++ P+ I VANCGDSRA+LCRG   + L+VDHK  R DE AR+   G +++     RV GVL M+R+IGD
Subjt:  ALARSYERVDDAFKDKTLAPYSVGSTALVVLLSPSQIIVANCGDSRALLCRGGQAIPLTVDHKISRPDEYARLAKGGARILFVGCPRVEGVLTMTRAIGD

Query:  HYLKPWITSEPEVTFMSRTEEDDCLILASDGVWDVLSNDDVMKMTCSILRRQRRKLAFGGTRNAIYPAQ
         YLKP +  +PEVT + R +EDDCLILASDG+WDV++N++V  +    +    +K A  G   A+ PA+
Subjt:  HYLKPWITSEPEVTFMSRTEEDDCLILASDGVWDVLSNDDVMKMTCSILRRQRRKLAFGGTRNAIYPAQ


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCATTGGCAAGGTCTTATGAGAGAGTTGATGATGCCTTCAAGGACAAAACTCTGGCACCATACTCGGTTGGATCTACAGCTTTGGTTGTACTTTTGTCACCTTCCCA
AATAATTGTTGCCAACTGTGGTGACTCTAGAGCATTGCTTTGTCGTGGGGGTCAAGCCATCCCTTTGACGGTTGACCACAAGATTAGTAGGCCAGATGAATATGCTAGAC
TTGCCAAGGGAGGAGCAAGAATTCTGTTTGTGGGCTGCCCTAGGGTCGAGGGAGTGCTGACTATGACCAGAGCAATAGGTGATCATTACTTAAAACCATGGATTACATCT
GAGCCGGAGGTTACATTTATGTCAAGGACTGAAGAGGATGACTGTTTGATTCTGGCAAGTGATGGAGTATGGGATGTCTTGTCAAATGATGATGTGATGAAGATGACTTG
CAGCATTCTGAGGAGGCAACGCAGGAAGTTGGCGTTTGGTGGAACTCGTAATGCAATTTATCCAGCACAATGTGCTGCAAATCAAATCCGCAAGGTTACTACGAGGACTT
GTATGGGGGCTAATGTGGACAATACTTTGGCGAATGGAGCAAAAAGCTACCCATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGGGGCATAATTGTCATATTGTCAAAAAAATATTAAGAGCAGAACGGAAAAGCGAGCGAAAACGCCTGCTTCAATGTTCTACGTTCGAGTTGAGCATTTTGTTATCATTT
TTGTCCTTCACAAATATTCTTATGATCGCAATAATCGCAATGCGAATGGATTGAGGTGAGTACATATTGTTCAAGGAAGTTGCATGAATTATTAGCAGAAGAGTGGATTA
GAGGGGACTCTGACAATGGTCAGAATCGACGGTGGGAAATGGCATTGGCAAGGTCTTATGAGAGAGTTGATGATGCCTTCAAGGACAAAACTCTGGCACCATACTCGGTT
GGATCTACAGCTTTGGTTGTACTTTTGTCACCTTCCCAAATAATTGTTGCCAACTGTGGTGACTCTAGAGCATTGCTTTGTCGTGGGGGTCAAGCCATCCCTTTGACGGT
TGACCACAAGATTAGTAGGCCAGATGAATATGCTAGACTTGCCAAGGGAGGAGCAAGAATTCTGTTTGTGGGCTGCCCTAGGGTCGAGGGAGTGCTGACTATGACCAGAG
CAATAGGTGATCATTACTTAAAACCATGGATTACATCTGAGCCGGAGGTTACATTTATGTCAAGGACTGAAGAGGATGACTGTTTGATTCTGGCAAGTGATGGAGTATGG
GATGTCTTGTCAAATGATGATGTGATGAAGATGACTTGCAGCATTCTGAGGAGGCAACGCAGGAAGTTGGCGTTTGGTGGAACTCGTAATGCAATTTATCCAGCACAATG
TGCTGCAAATCAAATCCGCAAGGTTACTACGAGGACTTGTATGGGGGCTAATGTGGACAATACTTTGGCGAATGGAGCAAAAAGCTACCCATAGTGGAGAATGCTGCTTT
CAATAAAGTCATATTTGATTATTATGAGGGAACAGAATTTTGATGCTGCAAGTGGAGGAATATCTGCTTAAAAGCAAACTTTGAAAGCAACTTTCTTAAAGGTAGGACTT
TTATCGACATTGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MALARSYERVDDAFKDKTLAPYSVGSTALVVLLSPSQIIVANCGDSRALLCRGGQAIPLTVDHKISRPDEYARLAKGGARILFVGCPRVEGVLTMTRAIGDHYLKPWITS
EPEVTFMSRTEEDDCLILASDGVWDVLSNDDVMKMTCSILRRQRRKLAFGGTRNAIYPAQCAANQIRKVTTRTCMGANVDNTLANGAKSYP