| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_022953734.1 nuclear pore complex protein NUP50B-like [Cucurbita moschata] | 7.5e-181 | 78.41 | Show/hide |
Query: MGDAEN-TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRSQAASAPSSNPFAGIRLVPPPEKSGSASEVKIDAQVVGEKIG
MGDAEN TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQ GTFKRAS++VLATRRIVKVRR Q ASAPSSNPFAGIRLVPP E SGSASEVK DAQ GEK G
Subjt: MGDAEN-TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRSQAASAPSSNPFAGIRLVPPPEKSGSASEVKIDAQVVGEKIG
Query: SVEADGKDVSHEETRK-----EPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRDDKAENDDCINGG
S EA KDVSHE+ +K EPAE K++TSE ESVPNVQNVDQNST V SES IS++DD V E NK E+E P EDK NEELVRD+KAEND+C++GG
Subjt: SVEADGKDVSHEETRK-----EPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRDDKAENDDCINGG
Query: RNENENENPEINGENKDPARD-KNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDESEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTFSFGNIPK
+N+N + EN+DPARD KNENEEP EGN IQ KETGD+EKT+NEE KE+ SE +PSK+A PLSSFQQLSSSQNAFTGL GTG +TSTFSFGNIPK
Subjt: RNENENENPEINGENKDPARD-KNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDESEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTFSFGNIPK
Query: DGLGLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRARGNY
DG+GL++SFGLS NGSSALFGTSG SSIVSKS KSGFPSMQEVAVETGEENE+VVF+ADSI+FEFIDGSWKERGKGELKVNVPTS TGRARILMRARGNY
Subjt: DGLGLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRARGNY
Query: RLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
RLILNA LYPDMKLTNMDK+GITFAC+NS + KD LST+ LKF+D SIV +FRAA+TEHKGKA STVLKTPENSP
Subjt: RLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
|
|
| XP_022992245.1 nuclear pore complex protein NUP50B-like [Cucurbita maxima] | 1.4e-179 | 77.92 | Show/hide |
Query: MGDAEN-TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRSQAASAPSSNPFAGIRLVPPPEKSGSASEVKIDAQVVGEKIG
MGDAEN TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQ GTFKRAS++VLATRRIVKVRR Q ASAPSSNPFAGIRLVPP E +GSASEVK DAQ GEK G
Subjt: MGDAEN-TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRSQAASAPSSNPFAGIRLVPPPEKSGSASEVKIDAQVVGEKIG
Query: SVEADGKDVSHEETRK-----EPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRDDKAENDDCINGG
S EA KDVSHE+ +K EPAE K++TSE ESVPNVQNVDQNST V SES IS++DD V E NK E+E P EDK NEELVRD+KAEND+C++GG
Subjt: SVEADGKDVSHEETRK-----EPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRDDKAENDDCINGG
Query: RNENENENPEINGENKDPARD-KNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDE---SEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTFSFGN
+N+N + EN+DPARD KNENEEPIEGN IQ KETGD+EK +NEE KE++ SE +PSK+A PLSSFQQLSSSQNAFTGL GTG TSTFSFGN
Subjt: RNENENENPEINGENKDPARD-KNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDE---SEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTFSFGN
Query: IPKDGLGLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRAR
IPKDG+GL++SFGLS NGSSALFGTSG SSIVSKS KSGFPSMQEVAVETGEENE+VVFNADSI+FEFIDGSWKERGKGELKVNVPTS TGRARILMRAR
Subjt: IPKDGLGLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRAR
Query: GNYRLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
GNYRLILNA LYPDMKLTNMDK+GITFAC+NS + KD LST+ LKF+D SIV +FRAA+TEHKGKA STVLKTPENSP
Subjt: GNYRLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
|
|
| XP_023000356.1 nuclear pore complex protein NUP50A-like [Cucurbita maxima] | 4.8e-180 | 79.25 | Show/hide |
Query: MGDAEN-TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRSQAASAPSSNPFAGIRLVPPPEKSGSASEVKIDAQVVGEKIG
MGDAEN TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDE+DVSEQATGTFKRASD+VLA RRIVKVRR Q AS PSSNPFAGIRLVPP + SGSASE K +AQ VGEK G
Subjt: MGDAEN-TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRSQAASAPSSNPFAGIRLVPPPEKSGSASEVKIDAQVVGEKIG
Query: SVEADGKDVSHEETR-----KEPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRDDKAENDDCINGG
S EA+GKDVSHEE + EPAE+KI+TSE ES NVQNVDQNST +VSES I KVDDN+VAESNK E+E EDKT+NEEL+ + AEND C++GG
Subjt: SVEADGKDVSHEETR-----KEPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRDDKAENDDCINGG
Query: RNENENENPEINGENKDPAR-DKNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDESEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTFSFGNIPK
+NENE DPA+ ++NENEEP EGN IQ KETGD+EK +NEEKKE SEA+ SKEA+PLSSFQQLSSSQNAFTGL GTGFST+TFSFGNI K
Subjt: RNENENENPEINGENKDPAR-DKNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDESEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTFSFGNIPK
Query: DGLGLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRARGNY
DG GLSSSFGLSNNGSSALF T SS VSKS KSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEF+DGSWKERGKGELKVNVPT TGRARILMRARGNY
Subjt: DGLGLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRARGNY
Query: RLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
RLILNA LYPDMKLTNMDKKGITFAC+NST + KD LSTFALKFKDASIV +FRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
Subjt: RLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
|
|
| XP_023548163.1 nuclear pore complex protein NUP50B-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 1.3e-180 | 78.41 | Show/hide |
Query: MGDAEN-TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRSQAASAPSSNPFAGIRLVPPPEKSGSASEVKIDAQVVGEKIG
MGDAEN TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQ TGTFKRAS++VLATRRIVKVRR QAASAPSSNPFAGIRLVPP E SGSASEVK DAQ GEK G
Subjt: MGDAEN-TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRSQAASAPSSNPFAGIRLVPPPEKSGSASEVKIDAQVVGEKIG
Query: SVEADGKDVSHEETRK-----EPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRDDKAENDDCINGG
S EA+ KDVSHE+ +K EPAE K++TSE ESVPNV +VDQNST V SES IS++DD V E NK E+E EDK NEELVRD+KAEND+C++GG
Subjt: SVEADGKDVSHEETRK-----EPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRDDKAENDDCINGG
Query: RNENENENPEINGENKDPARD-KNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDESEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTFSFGNIPK
+N+N + EN+DPARD KNENEEP EGN IQ KETGD+EKT+NEE KE+ SE +PSK+A PLSSFQQLSSSQNAFTGL GTG +TSTFSFGNIPK
Subjt: RNENENENPEINGENKDPARD-KNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDESEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTFSFGNIPK
Query: DGLGLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRARGNY
DG+GL++SFGLS NGSSALFGTSG SSIVSKS KSGFPSMQEVAVETGEENE+VVFNADSI+FEFIDGSWKERGKGELKVNVPTS TGRARILMRARGNY
Subjt: DGLGLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRARGNY
Query: RLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
RLILNA LYPDMKLTNMDK+GITFAC+NS + KD LST+ LKF+D SIV +FRAA+TEHKGKA STVLKTPENSP
Subjt: RLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
|
|
| XP_038898125.1 nuclear pore complex protein NUP50A-like [Benincasa hispida] | 1.9e-184 | 80.21 | Show/hide |
Query: MGDAEN-TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRSQAASAPSSNPFAGIRLVPPPEKSGSASEVKIDAQVVGEKIG
MGDAEN TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQ TGTFKRAS++VLATRRIVKVRR ASAPSSNPFAGIRLVPP E SGS +EVK D Q GEK
Subjt: MGDAEN-TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRSQAASAPSSNPFAGIRLVPPPEKSGSASEVKIDAQVVGEKIG
Query: SVEADGKDVSHEETRK------EPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRD--DKAENDDCI
S EA+GKDVS+E T+K EPAE K +TSE ESVPNVQNVDQNST VVSES ISKVDDN VAESNK E+EEP DKT NEE+VRD +AEND+C+
Subjt: SVEADGKDVSHEETRK------EPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRD--DKAENDDCI
Query: NGGRNENENENPEINGENKDPAR-DKNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDESEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTFSFGN
+GG+NENE+ EN+D AR DKNENEEP GN I+ KETG++EKT+NE KE +SEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGL GTGFSTSTFSFGN
Subjt: NGGRNENENENPEINGENKDPAR-DKNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDESEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTFSFGN
Query: IPKDGLGLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRAR
IPKDG GL++SFGLSNNGSSALFGTSG SSIVSKS KSGFPSMQEVAVETGEENE+VVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTS TGRARILMRAR
Subjt: IPKDGLGLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRAR
Query: GNYRLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
GNYRLILNA LYPDMKLTNMDK+GITFAC+NST + KD LSTF +KFKD SIV +FRAAVTEHKGKA+STVLKTPENSP
Subjt: GNYRLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S4E3Q0 nuclear pore complex protein NUP50A isoform X1 | 9.2e-177 | 77.08 | Show/hide |
Query: MGDAEN-TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRSQAASAPSSNPFAGIRLVPPPEKSGSASEVKIDAQVVGEKIG
MGDAEN TSTKKRAAGRELSRDNPG DD+EDVSEQ TGTFKRAS++VLATRRIVKVRR ASAPSSNPFAGIRLVPP E SGS +EV+ D + EK G
Subjt: MGDAEN-TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRSQAASAPSSNPFAGIRLVPPPEKSGSASEVKIDAQVVGEKIG
Query: SVEADGKDVSHEETRK------EPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRD--DKAENDDCI
S EA+GKD+ HE T+K EP + KI+TSE +SVP VQ VDQNST V+SES ISKVDDN+V ESNK E+EEP DKT NEELVRD ++END+C+
Subjt: SVEADGKDVSHEETRK------EPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRD--DKAENDDCI
Query: NGGRNENENENPEINGENKDPAR-DKNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDESEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTFSFGN
+ +NE+E PAR DKNENEEP EGN IQ KETG++EKT+NEE KED+SE EPSKEAAPL+SFQQLSSSQNAFTGL GTGFSTSTFSFGN
Subjt: NGGRNENENENPEINGENKDPAR-DKNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDESEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTFSFGN
Query: IPKDGLGLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRAR
IPKDG+GL++SFGLSNNGSSALFGTSGSS+ VSKS +SGFPSMQEVAVETGEENE+VVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTS TGR RILMRAR
Subjt: IPKDGLGLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRAR
Query: GNYRLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
GNYRLILNA LYPDMKLTNMDK+GITFAC+NST D KD LSTF +KFKD SIV +FRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
Subjt: GNYRLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
|
|
| A0A6J1GQJ1 nuclear pore complex protein NUP50B-like | 3.6e-181 | 78.41 | Show/hide |
Query: MGDAEN-TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRSQAASAPSSNPFAGIRLVPPPEKSGSASEVKIDAQVVGEKIG
MGDAEN TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQ GTFKRAS++VLATRRIVKVRR Q ASAPSSNPFAGIRLVPP E SGSASEVK DAQ GEK G
Subjt: MGDAEN-TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRSQAASAPSSNPFAGIRLVPPPEKSGSASEVKIDAQVVGEKIG
Query: SVEADGKDVSHEETRK-----EPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRDDKAENDDCINGG
S EA KDVSHE+ +K EPAE K++TSE ESVPNVQNVDQNST V SES IS++DD V E NK E+E P EDK NEELVRD+KAEND+C++GG
Subjt: SVEADGKDVSHEETRK-----EPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRDDKAENDDCINGG
Query: RNENENENPEINGENKDPARD-KNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDESEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTFSFGNIPK
+N+N + EN+DPARD KNENEEP EGN IQ KETGD+EKT+NEE KE+ SE +PSK+A PLSSFQQLSSSQNAFTGL GTG +TSTFSFGNIPK
Subjt: RNENENENPEINGENKDPARD-KNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDESEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTFSFGNIPK
Query: DGLGLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRARGNY
DG+GL++SFGLS NGSSALFGTSG SSIVSKS KSGFPSMQEVAVETGEENE+VVF+ADSI+FEFIDGSWKERGKGELKVNVPTS TGRARILMRARGNY
Subjt: DGLGLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRARGNY
Query: RLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
RLILNA LYPDMKLTNMDK+GITFAC+NS + KD LST+ LKF+D SIV +FRAA+TEHKGKA STVLKTPENSP
Subjt: RLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
|
|
| A0A6J1HNF6 nuclear pore complex protein NUP50A-like | 2.0e-179 | 78.83 | Show/hide |
Query: MGDAEN-TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRSQAASAPSSNPFAGIRLVPPPEKSGSASEVKIDAQVVGEKIG
MGDAEN TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDE+DVSEQATGTFKRASD+VLA RRIVKVRR Q AS PSSNPFAGIRLVPP + SGSASE K AQ VGEK G
Subjt: MGDAEN-TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRSQAASAPSSNPFAGIRLVPPPEKSGSASEVKIDAQVVGEKIG
Query: SVEADGKDVSHEETR-----KEPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRDDKAENDDCINGG
S EA+GKDVSHEE + EPAE+KI+TSE ES NVQNVDQNST VSES I KVDDN+VAESNK E+E EDKT+NEEL+ D AEND C++GG
Subjt: SVEADGKDVSHEETR-----KEPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRDDKAENDDCINGG
Query: RNENENENPEINGENKDPAR-DKNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDESEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTFSFGNIPK
+NENE DPAR ++NENEEP EGN + KETGD+EK ++EEKKE+ SEA+ SKEA+PLSSFQQLSSSQNAFTGL GTGFST+TFSFGN+ K
Subjt: RNENENENPEINGENKDPAR-DKNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDESEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTFSFGNIPK
Query: DGLGLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRARGNY
DG GLSSSFGLSNNGSSALF T SS VSKS KSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEF+DGSWKERGKGELKVNVPT TGRARILMRARGNY
Subjt: DGLGLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRARGNY
Query: RLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
RLILNA LYPDMKLTNMDKKGITFAC+NST + KD LSTFALKFKDASIV +FRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
Subjt: RLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
|
|
| A0A6J1JV59 nuclear pore complex protein NUP50B-like | 6.8e-180 | 77.92 | Show/hide |
Query: MGDAEN-TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRSQAASAPSSNPFAGIRLVPPPEKSGSASEVKIDAQVVGEKIG
MGDAEN TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQ GTFKRAS++VLATRRIVKVRR Q ASAPSSNPFAGIRLVPP E +GSASEVK DAQ GEK G
Subjt: MGDAEN-TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRSQAASAPSSNPFAGIRLVPPPEKSGSASEVKIDAQVVGEKIG
Query: SVEADGKDVSHEETRK-----EPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRDDKAENDDCINGG
S EA KDVSHE+ +K EPAE K++TSE ESVPNVQNVDQNST V SES IS++DD V E NK E+E P EDK NEELVRD+KAEND+C++GG
Subjt: SVEADGKDVSHEETRK-----EPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRDDKAENDDCINGG
Query: RNENENENPEINGENKDPARD-KNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDE---SEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTFSFGN
+N+N + EN+DPARD KNENEEPIEGN IQ KETGD+EK +NEE KE++ SE +PSK+A PLSSFQQLSSSQNAFTGL GTG TSTFSFGN
Subjt: RNENENENPEINGENKDPARD-KNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDE---SEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTFSFGN
Query: IPKDGLGLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRAR
IPKDG+GL++SFGLS NGSSALFGTSG SSIVSKS KSGFPSMQEVAVETGEENE+VVFNADSI+FEFIDGSWKERGKGELKVNVPTS TGRARILMRAR
Subjt: IPKDGLGLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRAR
Query: GNYRLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
GNYRLILNA LYPDMKLTNMDK+GITFAC+NS + KD LST+ LKF+D SIV +FRAA+TEHKGKA STVLKTPENSP
Subjt: GNYRLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
|
|
| A0A6J1KFN4 nuclear pore complex protein NUP50A-like | 2.3e-180 | 79.25 | Show/hide |
Query: MGDAEN-TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRSQAASAPSSNPFAGIRLVPPPEKSGSASEVKIDAQVVGEKIG
MGDAEN TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDE+DVSEQATGTFKRASD+VLA RRIVKVRR Q AS PSSNPFAGIRLVPP + SGSASE K +AQ VGEK G
Subjt: MGDAEN-TSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRSQAASAPSSNPFAGIRLVPPPEKSGSASEVKIDAQVVGEKIG
Query: SVEADGKDVSHEETR-----KEPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRDDKAENDDCINGG
S EA+GKDVSHEE + EPAE+KI+TSE ES NVQNVDQNST +VSES I KVDDN+VAESNK E+E EDKT+NEEL+ + AEND C++GG
Subjt: SVEADGKDVSHEETR-----KEPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRDDKAENDDCINGG
Query: RNENENENPEINGENKDPAR-DKNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDESEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTFSFGNIPK
+NENE DPA+ ++NENEEP EGN IQ KETGD+EK +NEEKKE SEA+ SKEA+PLSSFQQLSSSQNAFTGL GTGFST+TFSFGNI K
Subjt: RNENENENPEINGENKDPAR-DKNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDESEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTFSFGNIPK
Query: DGLGLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRARGNY
DG GLSSSFGLSNNGSSALF T SS VSKS KSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEF+DGSWKERGKGELKVNVPT TGRARILMRARGNY
Subjt: DGLGLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRARGNY
Query: RLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
RLILNA LYPDMKLTNMDKKGITFAC+NST + KD LSTFALKFKDASIV +FRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
Subjt: RLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0B4K7J2 E3 SUMO-protein ligase RanBP2 | 2.2e-10 | 32.84 | Show/hide |
Query: PSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRARGNYRLILNAGLYPDMKLT----NMDKKGITFACINSTGDS
P EV V TGEE E + F + + LF ++D WKERG G +K+ + TG +R+LMR +++ N + D+ + + DKK + +A N D
Subjt: PSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRARGNYRLILNAGLYPDMKLT----NMDKKGITFACINSTGDS
Query: KDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASS
+ L F ++FK + +FR A T+ A S
Subjt: KDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASS
|
|
| Q9C829 Nuclear pore complex protein NUP50A | 5.0e-79 | 44.54 | Show/hide |
Query: MGDAENTS--TKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRSQAASAP--SSNPFAGIRLVPPPEKSGSASEVKIDAQVVGE
MGD+EN +KKR A ++LSRDNPGLDD++D +E +GTFK+ASD+VLA+RRIV+V+R + ++AP +SNPFAGI+LV P + +++ V +A +
Subjt: MGDAENTS--TKKRAAGRELSRDNPGLDDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRSQAASAP--SSNPFAGIRLVPPPEKSGSASEVKIDAQVVGE
Query: KIGSVEADGKDVSHEETRKEPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRDDKAENDDCINGGRN
K+ EA +D + A + E EV+S + VD V DDN +S V TE ++V D ++ + G
Subjt: KIGSVEADGKDVSHEETRKEPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRDDKAENDDCINGGRN
Query: ENENENPEINGENKDPARDKNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDESEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTFSFGNIPKD--
++ + P+E K++G ++ K E++ EA+ + + SSFQQ SS++NAFTGL T S S+FSFG + +D
Subjt: ENENENPEINGENKDPARDKNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDESEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTFSFGNIPKD--
Query: -GLGLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRARGNY
G G FGL ++ SS++FG +G SSI+ KS SGFP QEV+ ETGEENE+V F+ADSI+FE++DG WKERGKGELKVNV +S G+AR++MRA+GNY
Subjt: -GLGLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSRTGRARILMRARGNY
Query: RLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHK--------GKASSTVLKTPENSP
RLILNA LYP+MKL NMDKKGITFAC+NS + K+ LSTFALKFKD +IV +FR A+ +HK + S+ LKTPENSP
Subjt: RLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHK--------GKASSTVLKTPENSP
|
|
| Q9LW88 Nuclear pore complex protein NUP50B | 1.1e-81 | 43.26 | Show/hide |
Query: MGDAENT--STKKRAAGRELSRDNPGL-DDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRS--QAASAPSSNPFAGIRLVP--PPEKSGSASEV------
MGD++N ++KR A +ELSRDNPGL DD+ED S +GTF AS +VLA+RRI++VRR+ A + P+SNPF GIRLVP P S +A+E
Subjt: MGDAENT--STKKRAAGRELSRDNPGL-DDEEDVSEQATGTFKRASDDVLATRRIVKVRRS--QAASAPSSNPFAGIRLVP--PPEKSGSASEV------
Query: -KIDAQVVGEKIGSVEADGKDVSHEETRKEPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRDDKAE
K + G + E DG S E++ A K ET E +++ +SE+ ++ V+ N++E + +V + EE V+DD
Subjt: -KIDAQVVGEKIGSVEADGKDVSHEETRKEPAENKIETSEVESVPNVQNVDQNSTVVVSESTISKVDDNVVAESNKNEHEEPVVEDKTENEELVRDDKAE
Query: NDDCINGGRNENENENPEINGENKDPARDKNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDESEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTF
N N +EG+ K+TG + K ++ + + E + ++ LSSF Q SSS+NAFTGL TGFS S+F
Subjt: NDDCINGGRNENENENPEINGENKDPARDKNENEEPIEGNAIQTKETGDEEKTKNEEKKEDESEAEPSKEAAPLSSFQQLSSSQNAFTGLVGTGFSTSTF
Query: SFGNIPKDGL------GLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAK--SGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTS
SFG +P++G S SFG +NNG+S+LFG S ++SI +KS + + FPS Q+V+VETGEENE+ F ADS++FE+++G WKERGKGELKVN+ T+
Subjt: SFGNIPKDGL------GLSSSFGLSNNGSSALFGTSGSSSIVSKSAK--SGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTS
Query: RTGRARILMRARGNYRLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASSTV-----LKTPENSP
+AR++MR++GNYRL LNA LYP+MKL MDKKGITFAC+NS D+KD LST ALKFKD ++V +FRA + EHK S LKTPENSP
Subjt: RTGRARILMRARGNYRLILNAGLYPDMKLTNMDKKGITFACINSTGDSKDDVLSTFALKFKDASIVYDFRAAVTEHKGKASSTV-----LKTPENSP
|
|
