| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6588985.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 3.9e-51 | 47.53 | Show/hide |
Query: SSIYLLSNIYNLVSIRLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESSTDSTEYDLWFEKDQTLITLLNATLSQTTLSFAIGCKTSKD
S I LLSNI NL+SI+LDSTNY+LW++Q+++LLKAHKL+G+IDG P P S YD WF KDQ L+T++NATLS L++ +G TSK
Subjt: SSIYLLSNIYNLVSIRLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESSTDSTEYDLWFEKDQTLITLLNATLSQTTLSFAIGCKTSKD
Query: LWETMRKYYSSTTRMNIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRATVVSFDELHMLLKTEE
+W + K YSS++R N++NLK +LQ+ISKK ESID YI+ I I +LA V ++ ED++IY +NGLP+ YN F+TS+RTR+T V+F+ELH+LLK EE
Subjt: LWETMRKYYSSTTRMNIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRATVVSFDELHMLLKTEE
Query: TAIDLHTKKED-----------SASLQVLAMNNSRGGWRGSNRGRGRNSG-------NRGGRS
+A+ +K++D S SL A + RG RGRG G RGG S
Subjt: TAIDLHTKKED-----------SASLQVLAMNNSRGGWRGSNRGRGRNSG-------NRGGRS
|
|
| KAG7015254.1 hypothetical protein SDJN02_22888, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 3.9e-51 | 47.53 | Show/hide |
Query: SSIYLLSNIYNLVSIRLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESSTDSTEYDLWFEKDQTLITLLNATLSQTTLSFAIGCKTSKD
S I LLSNI NL+SI+LDSTNY+LW++Q+++LLKAHKL+G+IDG P P S YD WF KDQ L+T++NATLS L++ +G TSK
Subjt: SSIYLLSNIYNLVSIRLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESSTDSTEYDLWFEKDQTLITLLNATLSQTTLSFAIGCKTSKD
Query: LWETMRKYYSSTTRMNIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRATVVSFDELHMLLKTEE
+W + K YSS++R N++NLK +LQ+ISKK ESID YI+ I I +LA V ++ ED++IY +NGLP+ YN F+TS+RTR+T V+F+ELH+LLK EE
Subjt: LWETMRKYYSSTTRMNIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRATVVSFDELHMLLKTEE
Query: TAIDLHTKKED-----------SASLQVLAMNNSRGGWRGSNRGRGRNSG-------NRGGRS
+A+ +K++D S SL A + RG RGRG G RGG S
Subjt: TAIDLHTKKED-----------SASLQVLAMNNSRGGWRGSNRGRGRNSG-------NRGGRS
|
|
| TYK17989.1 uncharacterized protein E5676_scaffold306G002980 [Cucumis melo var. makuwa] | 2.3e-51 | 48.09 | Show/hide |
Query: NSSIYLLSNIYNLVSIRLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESSTDST--------------EYDLWFEKDQTLITLLNATLS
+S ++LL+NI NL+SIRLDSTNY LW++Q +LKAHKLYG+ID IP P + S +S+ +T Y+ W KDQ + L+NATLS
Subjt: NSSIYLLSNIYNLVSIRLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESSTDST--------------EYDLWFEKDQTLITLLNATLS
Query: QTTLSFAIGCKTSKDLWETMRKYYSSTTRMNIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRAT
L++ +GCK+S +W+T+ ++YSS TR NI+NLK +LQ ISKKP E I +YI+ I + +LA ++ ED+VIY +NGLP YN F+TS++TR+
Subjt: QTTLSFAIGCKTSKDLWETMRKYYSSTTRMNIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRAT
Query: VVSFDELHMLLKTEETAIDLHTKKEDSASLQVLAM
VSF ELH+LLK+EE+A++ TK+ED S+Q AM
Subjt: VVSFDELHMLLKTEETAIDLHTKKEDSASLQVLAM
|
|
| XP_008448007.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103490319 isoform X2 [Cucumis melo] | 2.6e-50 | 44.57 | Show/hide |
Query: SNSSIYLLSNIYNLVSIRLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESST---DSTEYDLWFEKDQTLITLLNATLSQTTLSFAIGC
S S I+LLSNI NL+S+RLDSTN++LW++Q++++LKAHKLYG+IDG P P + ++ S+ + Y+ W KDQ L+T++NATLS L++ +G
Subjt: SNSSIYLLSNIYNLVSIRLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESST---DSTEYDLWFEKDQTLITLLNATLSQTTLSFAIGC
Query: KTSKDLWETMRKYYSSTTRMNIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRATVVSFDELHML
+SK +W+ + K YSS +R N++NLK +LQ+I KKP ESID YI+ I I +LA V I++ED++IY +NGLP+ YN F+TS+RTR+ V+F+ELH+L
Subjt: KTSKDLWETMRKYYSSTTRMNIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRATVVSFDELHML
Query: LKTEETAIDLHTKKEDSASLQVLAMNNS---------------RGGWRGSNRGRGRNS
L+ EE+A+ +K +DS + + +++S RG G + G GR S
Subjt: LKTEETAIDLHTKKEDSASLQVLAMNNS---------------RGGWRGSNRGRGRNS
|
|
| XP_022158689.1 uncharacterized protein LOC111025150 [Momordica charantia] | 6.1e-52 | 50.95 | Show/hide |
Query: NSSIYLLSNIYNLVSIRLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESSTD-----STEYDLWFEKDQTLITLLNATLSQTTLSFAIG
+S I+LLSNI NLVS+RLDS+N++LW++Q++++LKAHKLYG+IDG P+P + + + S+ + + W KD L+TLLNA LS + L++ +G
Subjt: NSSIYLLSNIYNLVSIRLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESSTD-----STEYDLWFEKDQTLITLLNATLSQTTLSFAIG
Query: CKTSKDLWETMRKYYSSTTRMNIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRATVVSFDELHM
C +S+ +W+T+ K+YSS++R N++NLK +LQSISKKPG SID Y+Q I + +LA V V +D ED++IYT+N LP +N F+TS+RTR+ VSF+ELH+
Subjt: CKTSKDLWETMRKYYSSTTRMNIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRATVVSFDELHM
Query: LLKTEETAID
LL +EE AID
Subjt: LLKTEETAID
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3BI58 uncharacterized protein LOC103490319 isoform X2 | 1.2e-50 | 44.57 | Show/hide |
Query: SNSSIYLLSNIYNLVSIRLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESST---DSTEYDLWFEKDQTLITLLNATLSQTTLSFAIGC
S S I+LLSNI NL+S+RLDSTN++LW++Q++++LKAHKLYG+IDG P P + ++ S+ + Y+ W KDQ L+T++NATLS L++ +G
Subjt: SNSSIYLLSNIYNLVSIRLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESST---DSTEYDLWFEKDQTLITLLNATLSQTTLSFAIGC
Query: KTSKDLWETMRKYYSSTTRMNIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRATVVSFDELHML
+SK +W+ + K YSS +R N++NLK +LQ+I KKP ESID YI+ I I +LA V I++ED++IY +NGLP+ YN F+TS+RTR+ V+F+ELH+L
Subjt: KTSKDLWETMRKYYSSTTRMNIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRATVVSFDELHML
Query: LKTEETAIDLHTKKEDSASLQVLAMNNS---------------RGGWRGSNRGRGRNS
L+ EE+A+ +K +DS + + +++S RG G + G GR S
Subjt: LKTEETAIDLHTKKEDSASLQVLAMNNS---------------RGGWRGSNRGRGRNS
|
|
| A0A1S4DWT9 uncharacterized protein LOC103490319 isoform X1 | 1.2e-50 | 44.57 | Show/hide |
Query: SNSSIYLLSNIYNLVSIRLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESST---DSTEYDLWFEKDQTLITLLNATLSQTTLSFAIGC
S S I+LLSNI NL+S+RLDSTN++LW++Q++++LKAHKLYG+IDG P P + ++ S+ + Y+ W KDQ L+T++NATLS L++ +G
Subjt: SNSSIYLLSNIYNLVSIRLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESST---DSTEYDLWFEKDQTLITLLNATLSQTTLSFAIGC
Query: KTSKDLWETMRKYYSSTTRMNIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRATVVSFDELHML
+SK +W+ + K YSS +R N++NLK +LQ+I KKP ESID YI+ I I +LA V I++ED++IY +NGLP+ YN F+TS+RTR+ V+F+ELH+L
Subjt: KTSKDLWETMRKYYSSTTRMNIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRATVVSFDELHML
Query: LKTEETAIDLHTKKEDSASLQVLAMNNS---------------RGGWRGSNRGRGRNS
L+ EE+A+ +K +DS + + +++S RG G + G GR S
Subjt: LKTEETAIDLHTKKEDSASLQVLAMNNS---------------RGGWRGSNRGRGRNS
|
|
| A0A5D3CLI6 T4.5 | 1.2e-50 | 44.57 | Show/hide |
Query: SNSSIYLLSNIYNLVSIRLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESST---DSTEYDLWFEKDQTLITLLNATLSQTTLSFAIGC
S S I+LLSNI NL+S+RLDSTN++LW++Q++++LKAHKLYG+IDG P P + ++ S+ + Y+ W KDQ L+T++NATLS L++ +G
Subjt: SNSSIYLLSNIYNLVSIRLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESST---DSTEYDLWFEKDQTLITLLNATLSQTTLSFAIGC
Query: KTSKDLWETMRKYYSSTTRMNIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRATVVSFDELHML
+SK +W+ + K YSS +R N++NLK +LQ+I KKP ESID YI+ I I +LA V I++ED++IY +NGLP+ YN F+TS+RTR+ V+F+ELH+L
Subjt: KTSKDLWETMRKYYSSTTRMNIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRATVVSFDELHML
Query: LKTEETAIDLHTKKEDSASLQVLAMNNS---------------RGGWRGSNRGRGRNS
L+ EE+A+ +K +DS + + +++S RG G + G GR S
Subjt: LKTEETAIDLHTKKEDSASLQVLAMNNS---------------RGGWRGSNRGRGRNS
|
|
| A0A5D3D3T6 Retrotran_gag_3 domain-containing protein | 1.1e-51 | 48.09 | Show/hide |
Query: NSSIYLLSNIYNLVSIRLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESSTDST--------------EYDLWFEKDQTLITLLNATLS
+S ++LL+NI NL+SIRLDSTNY LW++Q +LKAHKLYG+ID IP P + S +S+ +T Y+ W KDQ + L+NATLS
Subjt: NSSIYLLSNIYNLVSIRLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESSTDST--------------EYDLWFEKDQTLITLLNATLS
Query: QTTLSFAIGCKTSKDLWETMRKYYSSTTRMNIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRAT
L++ +GCK+S +W+T+ ++YSS TR NI+NLK +LQ ISKKP E I +YI+ I + +LA ++ ED+VIY +NGLP YN F+TS++TR+
Subjt: QTTLSFAIGCKTSKDLWETMRKYYSSTTRMNIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRAT
Query: VVSFDELHMLLKTEETAIDLHTKKEDSASLQVLAM
VSF ELH+LLK+EE+A++ TK+ED S+Q AM
Subjt: VVSFDELHMLLKTEETAIDLHTKKEDSASLQVLAM
|
|
| A0A6J1E049 uncharacterized protein LOC111025150 | 2.9e-52 | 50.95 | Show/hide |
Query: NSSIYLLSNIYNLVSIRLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESSTD-----STEYDLWFEKDQTLITLLNATLSQTTLSFAIG
+S I+LLSNI NLVS+RLDS+N++LW++Q++++LKAHKLYG+IDG P+P + + + S+ + + W KD L+TLLNA LS + L++ +G
Subjt: NSSIYLLSNIYNLVSIRLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESSTD-----STEYDLWFEKDQTLITLLNATLSQTTLSFAIG
Query: CKTSKDLWETMRKYYSSTTRMNIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRATVVSFDELHM
C +S+ +W+T+ K+YSS++R N++NLK +LQSISKKPG SID Y+Q I + +LA V V +D ED++IYT+N LP +N F+TS+RTR+ VSF+ELH+
Subjt: CKTSKDLWETMRKYYSSTTRMNIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRATVVSFDELHM
Query: LLKTEETAID
LL +EE AID
Subjt: LLKTEETAID
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P10978 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 8.9e-06 | 24.55 | Show/hide |
Query: WRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESSTDSTEYDLWFEKDQTLITLLNATLSQTTLSFAIGCKTSKDLWETMRKYYSSTTRMNIINLKLEL
W+ ++ LL L+ +D +P D+ + + W + D+ + + LS ++ I T++ +W + Y S T N + LK +L
Subjt: WRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESSTDSTEYDLWFEKDQTLITLLNATLSQTTLSFAIGCKTSKDLWETMRKYYSSTTRMNIINLKLEL
Query: QSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVY-NIFKTSLRTRATVVSFDELHMLLKTEETAIDLHTKKEDSASLQVLAMNNS
++ G + ++ + + +I +LA + VKI++ED I +N LPS Y N+ T L + T+ D LL E+ KK ++ ++
Subjt: QSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVY-NIFKTSLRTRATVVSFDELHMLLKTEETAIDLHTKKEDSASLQVLAMNNS
Query: RGGWRGSNR-GRGRNSGNRGGRSQ
R R SN GR G RS+
Subjt: RGGWRGSNR-GRGRNSGNRGGRSQ
|
|
| Q94HW2 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE1 | 2.7e-10 | 24.08 | Show/hide |
Query: NSSIYLLSNIYNLVSIRLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESSTDSTEYDLWFEKDQTLITLLNATLSQTTLSFAIGCKTSK
N++ L N+ N+ +L STNY++W Q+ +L ++L G++DG P TD + +Y W +D+ + + + +S + T+
Subjt: NSSIYLLSNIYNLVSIRLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESSTDSTEYDLWFEKDQTLITLLNATLSQTTLSFAIGCKTSK
Query: DLWETMRKYYSSTTRMNIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRATVVSFDELHMLLKTE
+WET+RK Y++ + ++ L+ +L+ +K ++ID Y+Q + T +LA + +D ++ V + LP Y + + T + E+H L
Subjt: DLWETMRKYYSSTTRMNIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRATVVSFDELHMLLKTE
Query: ETAIDLHTKKEDSASLQVLAMNNSRGGWRGSNRGRGRNSGNRGGR
E+ I +S V+ + + R + N+GNR R
Subjt: ETAIDLHTKKEDSASLQVLAMNNSRGGWRGSNRGRGRNSGNRGGR
|
|
| Q9ZT94 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE2 | 3.9e-09 | 22.94 | Show/hide |
Query: RLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESSTDSTEYDLWFEKDQTLITLLNATLSQTTLSFAIGCKTSKDLWETMRKYYSSTTRM
+L STNY++W Q+ +L ++L G++DG P P TD + +Y W +D+ + + + +S + T+ +WET+RK Y++ +
Subjt: RLDSTNYILWRYQISSLLKAHKLYGYIDGKIPEPKQETSTDGESSTDSTEYDLWFEKDQTLITLLNATLSQTTLSFAIGCKTSKDLWETMRKYYSSTTRM
Query: NIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRATVVSFDELH-MLLKTEETAIDLHTKKEDSAS
++ L+ T +LA + +D ++ V + LP Y + + T S E+H L+ E + L++ + +
Subjt: NIINLKLELQSISKKPGESIDVYIQIISTIIHRLAAVDVKIDQEDVVIYTVNGLPSVYNIFKTSLRTRATVVSFDELH-MLLKTEETAIDLHTKKEDSAS
Query: LQVLAMNNSRGGWRGSNRGRGRNSGNRGGRS
V+ N+ +NRG RN N RS
Subjt: LQVLAMNNSRGGWRGSNRGRGRNSGNRGGRS
|
|
