; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0010246 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0010246
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionphotosystem I reaction center subunit N, chloroplastic
Genome locationLG10:9870270..9872163
RNA-Seq ExpressionSed0010246
SyntenySed0010246
Gene Ontology termsGO:0015979 - photosynthesis (biological process)
GO:0030093 - chloroplast photosystem I (cellular component)
InterPro domainsIPR008796 - Photosystem I reaction centre subunit N, chloroplastic
IPR044907 - Photosystem I reaction centre subunit N superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6595132.1 Photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.2e-7387.86Show/hide
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XP_023003251.1 photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic isoform X1 [Cucurbita maxima]7.0e-7387.28Show/hide
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XP_023518442.1 photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.2e-7387.86Show/hide
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XP_038883748.1 photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]2.4e-7387.79Show/hide
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A0A0A0KFM1 Uncharacterized protein2.2e-7286.05Show/hide
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A0A1S3B240 photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic2.6e-7387.21Show/hide
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A0A5D3DQX9 Photosystem I reaction center subunit N2.6e-7387.21Show/hide
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A0A6J1HHG7 photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic-like isoform X14.5e-7387.28Show/hide
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A0A6J1KNN3 photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic isoform X13.4e-7387.28Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65107 Photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic (Fragment)1.9e-4182.8Show/hide
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P31093 Photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic2.9e-4564.52Show/hide
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P49107 Photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic1.5e-5467.05Show/hide
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Q9SBN5 Photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic7.4e-2559.18Show/hide
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        LLG  +L  A++   +ANAGV++D L KS ANK LN+KKRLATS AN AR+ TV  GTC+FPENF GC++LA  K V +I++DL++ECEGKD   CGS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G64040.1 photosystem I reaction center subunit PSI-N, chloroplast, putative / PSI-N, putative (PSAN)1.1e-5567.05Show/hide
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AT5G64040.2 photosystem I reaction center subunit PSI-N, chloroplast, putative / PSI-N, putative (PSAN)3.9e-3762.5Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGACCATGAATTCCACCGTCCTGGCCTGCAACTACGCCATTTCCGGCGCTGGGTCGCCCGAGCTTAGCTCGAAGCTCACCGCCGCCGTGCCGTCGTCCGTTGCGCC
GCCTGGTTACAAGTTGCCTGCGATCAGGGCTCAACAGGCCAGGGCTCCTGAACCCAAGAATGAAGGAAGAAGAACTGCGCTTCTGCTCCTTGGAGCTTCCCTCTTGGCTG
CGGCTTCATCGTCCAACTCTTCGGCTAATGCCGGAGTCATTGATGACTACCTTGAGAAGAGTAAAGCTAACAAGGAATTGAATGACAAGAAAAGATTGGCAACAAGTGGA
GCAAACTTTGCAAGGGCATACACTGTTCAGTTTGGAACATGCAAGTTCCCAGAGAACTTCACAGGGTGCCAAGATCTTGCAAAACAAAAGAAAGTTCCATTTATCTCTGA
TGATTTGGAATTGGAGTGTGAGGGGAAGGACAAGTACAAGTGTGGTTCCAATGTCTTCTGGAAGTGGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACAAGATGGAACAGAAATTTGAAGCACTCATTCAGATTTTCAAAGTGGGTCCAAAATGGAAGCTCGCCACACGCAATTCCATGTCCAAAAACCCTAATCACAGCGCCAAT
TGGGAACGAGGAAATCTCACCTTATCCACAATCCCTTATCCAAATCCCTCTTTTATCAGATTCCCCAATAATCCCTTTTCCCCCATTAACAACCCTCCGCCATTAATCCC
TCCTTCAGAGCTCCCATTTCCTCTAACCAATGGCGACCATGAATTCCACCGTCCTGGCCTGCAACTACGCCATTTCCGGCGCTGGGTCGCCCGAGCTTAGCTCGAAGCTC
ACCGCCGCCGTGCCGTCGTCCGTTGCGCCGCCTGGTTACAAGTTGCCTGCGATCAGGGCTCAACAGGCCAGGGCTCCTGAACCCAAGAATGAAGGAAGAAGAACTGCGCT
TCTGCTCCTTGGAGCTTCCCTCTTGGCTGCGGCTTCATCGTCCAACTCTTCGGCTAATGCCGGAGTCATTGATGACTACCTTGAGAAGAGTAAAGCTAACAAGGAATTGA
ATGACAAGAAAAGATTGGCAACAAGTGGAGCAAACTTTGCAAGGGCATACACTGTTCAGTTTGGAACATGCAAGTTCCCAGAGAACTTCACAGGGTGCCAAGATCTTGCA
AAACAAAAGAAAGTTCCATTTATCTCTGATGATTTGGAATTGGAGTGTGAGGGGAAGGACAAGTACAAGTGTGGTTCCAATGTCTTCTGGAAGTGGTGAAGAAGAGAACA
ATTTAAAGTTTTTATATCCCTCACCACCATTGGTCACTCACTCTTCCCTTGTATCTAATTTTCAACTTTTAAAAAGTGTGAAATTTTATTATGTCTTTTTGGGGTCATTT
GTTCCAATTCCATTGCTTTCTTTGCTCTTTGAGACAAAAAGAAGCCAAGTGAAATAGTAGAAACCCTAGACATTTATTGCATTAGCATTTGTTAATGTTCTTCCTCAATG
GACATCACACTTCCAGTTAATATATTATCTAAAAGAAATAGCCTTTTGAAAGAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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