; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0010591 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0010591
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionsirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic
Genome locationLG11:33564083..33567374
RNA-Seq ExpressionSed0010591
SyntenySed0010591
Gene Ontology termsGO:0006979 - response to oxidative stress (biological process)
GO:0019354 - siroheme biosynthetic process (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0016829 - lyase activity (molecular function)
GO:0042802 - identical protein binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0051266 - sirohydrochlorin ferrochelatase activity (molecular function)
GO:0051536 - iron-sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002762 - Sirohydrochlorin cobaltochelatase CbiX-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7033101.1 Sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.4e-9383.33Show/hide
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XP_022134499.1 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic [Momordica charantia]9.6e-8879.33Show/hide
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XP_022993758.1 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]2.8e-8780.09Show/hide
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XP_023548507.1 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.9e-9282.38Show/hide
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XP_038890885.1 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]1.9e-9183.81Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C8S9 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic3.0e-8779.9Show/hide
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A0A5D3BY55 Sirohydrochlorin ferrochelatase3.0e-8779.9Show/hide
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A0A6J1BYW9 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic4.6e-8879.33Show/hide
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A0A6J1FHT5 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like1.5e-8679.15Show/hide
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A0A6J1K384 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like1.4e-8780.09Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O34632 Sirohydrochlorin ferrochelatase4.3e-1433.62Show/hide
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        + A++ V HGSR +++      F+   +     P+ E + +EL EP+I+  F +CVKQGA HI V P  L    H + DIP      A  YP +      
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        P+G+ E++V  V  R+
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O87690 Sirohydrochlorin cobaltochelatase4.7e-1331.3Show/hide
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        +V+ V HGSR  E N    EF++  +   D  I VE   +E   P++     +CV +GA+ ++V P  L P  H +  IP+   EA ++YP ++++   P
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        +G+HE+ ++++  R+
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P61817 Sirohydrochlorin ferrochelatase4.6e-1635.34Show/hide
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        DAV+ V HGSR +E       F+   +   D PI E   +ELA P+I+  F +C++QGA  I + P  L    H + DIP    +  + YP +  +   P
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         G+ E++VD++ +RIN
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P61819 Sirohydrochlorin cobaltochelatase1.8e-1229.79Show/hide
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        +A+++V HGSR   S  ++ E     + +  Y IVE   ME  EP+I  +    +  GAK +IV+P FL PG H ++DIP +                  
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Query:  --------EAAKEYP-GISYIITAPLGLHEKLVDVVNDRIN
                  A E P G+  +   P+G  ++++D+V DR N
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Q84JH7 Sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic8.8e-6073.29Show/hide
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        ++ IG  D +IIVDHGSRRRESNLML EFV +F++KT YPIVEPAHMELAEPSIK +F+ CV+QGAK ++VSPFFLFPGRHW  DIPSL A+AAKE+ GI
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        SY+ITAPLG H  L+DVVNDRI HCLSH  G ADEC VCAGT KC+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G50170.1 sirohydrochlorin ferrochelatase B6.2e-6173.29Show/hide
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        ++ IG  D +IIVDHGSRRRESNLML EFV +F++KT YPIVEPAHMELAEPSIK +F+ CV+QGAK ++VSPFFLFPGRHW  DIPSL A+AAKE+ GI
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        SY+ITAPLG H  L+DVVNDRI HCLSH  G ADEC VCAGT KC+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGATCGTTAACAATCGCGCCTCAAATTACAGCAAAAAGTTTCTCAGCAGGCGAAACGAGAAGAACACACACAATCAGTTCATCTCAGAAATCTCCCATTTCGATCGA
ATGGCCGCCGAGATTCATGAATTTCACATCGCGATTCCGCATGAGTGTTGATAATGGAGGTCCTAATCGTAGCCGAGATCGGATTGGTGCCGAAGATGCCGTCATCATCG
TCGACCATGGCTCTCGCCGCCGGGAATCTAACCTCATGCTCAATGAATTCGTTGCTATATTTAGGGATAAGACTGATTACCCTATTGTGGAGCCTGCTCATATGGAGCTG
GCCGAACCGTCAATTAAAGCCTCGTTTGCATCGTGCGTCAAACAAGGGGCCAAACATATCATTGTTAGCCCGTTCTTCCTCTTCCCTGGTCGACATTGGCAACAGGATAT
TCCTTCCTTAGCAGCTGAAGCAGCAAAGGAATACCCAGGAATATCATATATAATAACTGCTCCTCTTGGTCTTCATGAAAAGCTTGTGGATGTTGTGAATGATCGGATAA
ACCACTGCTTAAGCCATGCTGCTGGAGTTGCAGATGAATGTGAAGTTTGTGCAGGAACAGGCAAATGCAGATTTAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATATTTCCAAAAACGAGATCAAATTTTTAATTCTCCATACAAATAGGTCAAATTTGTAAAATCTGTCAATTTTCTATTCTTTCAGTTGGGTTCATAAGAATCAGAAACCA
TGAGATCGTTAACAATCGCGCCTCAAATTACAGCAAAAAGTTTCTCAGCAGGCGAAACGAGAAGAACACACACAATCAGTTCATCTCAGAAATCTCCCATTTCGATCGAA
TGGCCGCCGAGATTCATGAATTTCACATCGCGATTCCGCATGAGTGTTGATAATGGAGGTCCTAATCGTAGCCGAGATCGGATTGGTGCCGAAGATGCCGTCATCATCGT
CGACCATGGCTCTCGCCGCCGGGAATCTAACCTCATGCTCAATGAATTCGTTGCTATATTTAGGGATAAGACTGATTACCCTATTGTGGAGCCTGCTCATATGGAGCTGG
CCGAACCGTCAATTAAAGCCTCGTTTGCATCGTGCGTCAAACAAGGGGCCAAACATATCATTGTTAGCCCGTTCTTCCTCTTCCCTGGTCGACATTGGCAACAGGATATT
CCTTCCTTAGCAGCTGAAGCAGCAAAGGAATACCCAGGAATATCATATATAATAACTGCTCCTCTTGGTCTTCATGAAAAGCTTGTGGATGTTGTGAATGATCGGATAAA
CCACTGCTTAAGCCATGCTGCTGGAGTTGCAGATGAATGTGAAGTTTGTGCAGGAACAGGCAAATGCAGATTTAATTAGTACGTGAAAGTAGGGACTTGGGATACAATGG
TGTAGTTTCTCGAGGAATTCGATTTATAGTGGCTGTAACGGTGTCGAAAGGAAGAGAAGCTACAGGAAAGAATAGTTTGTATATCAATGACTACTGAAGGGTTGAGAATC
TATCTATGTTTGTTGTGTTTGGTATCTATCCTTTGTATAACTTGTCCTTTTTGGTTGTTTTTCTTTTATGTATTTTCACAGATGACTACAATATGCACAATAGTTTCAGC
TCTCAAAATGGTTTTGAGAACAGTTTTCCAAACAACTCTTGGTTGTAATGAATGGAACTCAGCTTTTCATGAATCTACCCCACGTGTCTTAAAAACTTTTATTTACCCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRSLTIAPQITAKSFSAGETRRTHTISSSQKSPISIEWPPRFMNFTSRFRMSVDNGGPNRSRDRIGAEDAVIIVDHGSRRRESNLMLNEFVAIFRDKTDYPIVEPAHMEL
AEPSIKASFASCVKQGAKHIIVSPFFLFPGRHWQQDIPSLAAEAAKEYPGISYIITAPLGLHEKLVDVVNDRINHCLSHAAGVADECEVCAGTGKCRFN