; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0010654 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0010654
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionprotein POLYCHOME
Genome locationLG03:17016082..17019516
RNA-Seq ExpressionSed0010654
SyntenySed0010654
Gene Ontology termsGO:0051783 - regulation of nuclear division (biological process)
GO:1904667 - negative regulation of ubiquitin protein ligase activity (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR034590 - POLYCHOME/GIGAS CELL1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6595661.1 Ras-related protein RABA4d, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.4e-8473.64Show/hide
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XP_022925136.1 protein POLYCHOME-like [Cucurbita moschata]2.8e-8373.73Show/hide
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         AGS RR RSR R+SVLPIWYPRTPLRDITA VRAIERTRARLRENEG+G D NSPAPS+ERAL+ +  V+G  QEP +S+VTPKP VGKV KILR I  
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XP_022966440.1 protein POLYCHOME [Cucurbita maxima]2.2e-8373.44Show/hide
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XP_023518760.1 protein POLYCHOME-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.8e-8273.05Show/hide
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XP_038881398.1 protein POLYCHOME [Benincasa hispida]1.1e-7972.51Show/hide
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        MSE+RDRLERQVD+AEVFARRRS    DE EM++  +GTPIA       A++R TN GP       RR F SP S  GIG +RF+YRSPVL+REN+ AGS
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         RR RSR RNSVLPIWYPRTPLRDITA VRAIERTRARLRENEG+G D NSPAPS+ERAL+ T  VAGD QEPSIS+VTPKP VGKV KILR I N    
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KY99 Uncharacterized protein1.0e-7871.15Show/hide
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        GS RR RSR RNSVLPIWYPRTPLRDITA VRAIERTRARLRENEG+G D +SPAPS+ERAL+ +  VA D QEP IS++TPKP VGKV KILR I N  
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A0A1S3CDA1 protein POLYCHOME1.9e-7770.92Show/hide
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        MSE+RDRLERQVDYAEVFARRRS    DE EM ++ +GTPI       AA++R TN GP       RR F SP S  GIG +RF+YR+PVLSREN  AGS
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         RR RSR RNSVLPIWYPRTPLRDITA VRAIERTRARLRENEG+G D +SPAPS+ERAL+ +  VA D QEP IS++TPKP VGKV KILR I N    
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A0A5D3BM43 Protein POLYCHOME1.9e-7770.92Show/hide
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        MSE+RDRLERQVDYAEVFARRRS    DE EM ++ +GTPI       AA++R TN GP       RR F SP S  GIG +RF+YR+PVLSREN  AGS
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         RR RSR RNSVLPIWYPRTPLRDITA VRAIERTRARLRENEG+G D +SPAPS+ERAL+ +  VA D QEP IS++TPKP VGKV KILR I N    
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A0A6J1EBD1 protein POLYCHOME-like1.4e-8373.73Show/hide
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         AGS RR RSR R+SVLPIWYPRTPLRDITA VRAIERTRARLRENEG+G D NSPAPS+ERAL+ +  V+G  QEP +S+VTPKP VGKV KILR I  
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A0A6J1HRM8 protein POLYCHOME1.1e-8373.44Show/hide
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        MSESRDRLERQVDYAEVFARRRS     DE EMST+ +GTPIA       A++R TNLG           PRR F SP S  GIG +RF+YRSPVLSREN
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        + AGS RR RSR R+SVLPIWYPRTPLRDITA VRAIERTRARLRENEG+G D NSPAPS+ERAL+ +  V+G  QEP +S+VTPKP VGKV KILR I 
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O48533 Protein POLYCHOME6.7e-4348.09Show/hide
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        M E+RDR+ERQVDY   F  RRS     DEP    +  G+P+     E    LG              RG        G    +  +RSP   REN   G
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          RR R+R  NSVLP WYPRTPLRDI+A VRAIER RAR+   EG G D  +P P     LD    ++G   E   S+VTP P +G          KV +
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        IL  IT  N  E + LTP+KKLLNSIDKVEKVV EE+QK++ TPSAKRAEREKRVRTLMS R
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Q9M2R1 Protein GIGAS CELL19.3e-2942.58Show/hide
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        M E+RDR ER VDY+ +FA RR      DEP+   S + +P+         T    R  F +     G G     +R P   REN    + RR R     
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Query:  SVLPIWYPRTPLRDITAFVRAIERTRARLRENEGEGDDNNS----PAPSNERALDLTTFVAGDDQEPSISVVTPKPKVG----------KVIKILRRITN
         +LP WYPRTPLRDIT  VRAIER     R   G G D+      P       L+    ++G   E   S+VTP P VG          KV K+L  IT 
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Query:  ---VEESELLTPQKKLLNSIDKVEKVVREELQKLRRTPSAKRAEREKRVRTLMSFR
            EE+  +TP+KKLLNSIDKVEK+V  E+QKL+ TP AKR EREKRVRTLM+ R
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42260.1 uv-b-insensitive 44.7e-4448.09Show/hide
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        M E+RDR+ERQVDY   F  RRS     DEP    +  G+P+     E    LG              RG        G    +  +RSP   REN   G
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Query:  SFRRCRSRRRNSVLPIWYPRTPLRDITAFVRAIERTRARLRENEGEGDDNNSPAPSNERALDLTTFVAGDDQEPSISVVTPKPKVG----------KVIK
          RR R+R  NSVLP WYPRTPLRDI+A VRAIER RAR+   EG G D  +P P     LD    ++G   E   S+VTP P +G          KV +
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Query:  ILRRIT--NVEESELLTPQKKLLNSIDKVEKVVREELQKLRRTPSAKRAEREKRVRTLMSFR
        IL  IT  N  E + LTP+KKLLNSIDKVEKVV EE+QK++ TPSAKRAEREKRVRTLMS R
Subjt:  ILRRIT--NVEESELLTPQKKLLNSIDKVEKVVREELQKLRRTPSAKRAEREKRVRTLMSFR

AT3G57860.1 UV-B-insensitive 4-like6.6e-3042.58Show/hide
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        M E+RDR ER VDY+ +FA RR      DEP+   S + +P+         T    R  F +     G G     +R P   REN    + RR R     
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Query:  SVLPIWYPRTPLRDITAFVRAIERTRARLRENEGEGDDNNS----PAPSNERALDLTTFVAGDDQEPSISVVTPKPKVG----------KVIKILRRITN
         +LP WYPRTPLRDIT  VRAIER     R   G G D+      P       L+    ++G   E   S+VTP P VG          KV K+L  IT 
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Query:  ---VEESELLTPQKKLLNSIDKVEKVVREELQKLRRTPSAKRAEREKRVRTLMSFR
            EE+  +TP+KKLLNSIDKVEK+V  E+QKL+ TP AKR EREKRVRTLM+ R
Subjt:  ---VEESELLTPQKKLLNSIDKVEKVVREELQKLRRTPSAKRAEREKRVRTLMSFR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTCTCATTGTTTGTTTGCTTCCAAAGTTCCATAATGTCGGAATCAAGGGATAGATTGGAGAGGCAAGTGGACTATGCGGAGGTTTTTGCTCGTCGGAGATCGGACGA
GCCAGAAATGAGCACCAGTTTCGTAGGAACTCCGATTGCGGCTCGAGAAAGAGCTACGAATCTCGGACCGCGACGCGGTTTTGATTCTCCAGCATCTGTTGTTGGAATTG
GGCTTAGTAGATTTATGTACAGATCTCCAGTTTTGAGTCGCGAGAATTCTGGGGCTGGGAGTTTTAGGAGGTGTAGATCACGGAGGAGGAATAGTGTTTTGCCCATTTGG
TATCCAAGAACCCCACTTCGTGATATTACTGCTTTTGTGAGGGCAATTGAAAGAACAAGAGCTCGATTGAGAGAAAATGAAGGCGAAGGAGATGATAATAATAGTCCAGC
TCCCTCCAACGAAAGAGCTTTAGATTTGACCACATTTGTTGCAGGTGATGATCAAGAGCCTAGTATTTCTGTGGTGACCCCAAAACCAAAGGTAGGCAAAGTAATAAAGA
TTCTTCGCAGAATCACAAATGTGGAAGAATCCGAGCTGCTTACACCGCAGAAGAAGCTGTTGAACTCCATTGACAAAGTGGAGAAAGTAGTAAGGGAAGAGTTGCAGAAA
CTGAGAAGGACACCGAGTGCCAAGAGGGCCGAGAGGGAAAAAAGAGTTCGCACTTTGATGTCATTTCGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATCAATTCCAGTCTTCTTTATTTCCATTTCACTGTAGAGATTCTAGGAACGAAATTTATTTTTCATTGTAGTTTTCTTGTAATTTGAAATGAAATGAATGTTCTCATTGT
TTGTTTGCTTCCAAAGTTCCATAATGTCGGAATCAAGGGATAGATTGGAGAGGCAAGTGGACTATGCGGAGGTTTTTGCTCGTCGGAGATCGGACGAGCCAGAAATGAGC
ACCAGTTTCGTAGGAACTCCGATTGCGGCTCGAGAAAGAGCTACGAATCTCGGACCGCGACGCGGTTTTGATTCTCCAGCATCTGTTGTTGGAATTGGGCTTAGTAGATT
TATGTACAGATCTCCAGTTTTGAGTCGCGAGAATTCTGGGGCTGGGAGTTTTAGGAGGTGTAGATCACGGAGGAGGAATAGTGTTTTGCCCATTTGGTATCCAAGAACCC
CACTTCGTGATATTACTGCTTTTGTGAGGGCAATTGAAAGAACAAGAGCTCGATTGAGAGAAAATGAAGGCGAAGGAGATGATAATAATAGTCCAGCTCCCTCCAACGAA
AGAGCTTTAGATTTGACCACATTTGTTGCAGGTGATGATCAAGAGCCTAGTATTTCTGTGGTGACCCCAAAACCAAAGGTAGGCAAAGTAATAAAGATTCTTCGCAGAAT
CACAAATGTGGAAGAATCCGAGCTGCTTACACCGCAGAAGAAGCTGTTGAACTCCATTGACAAAGTGGAGAAAGTAGTAAGGGAAGAGTTGCAGAAACTGAGAAGGACAC
CGAGTGCCAAGAGGGCCGAGAGGGAAAAAAGAGTTCGCACTTTGATGTCATTTCGTTGATTATTATTATTTTTTAGTTCAACTACAATTGAGGAAAAGAGATTTGAACAC
ATGATCTCTTGGTCATGGAAACACATGGATGCCGTTTAGCTACTGTGATTATTGGCATCATTTTCAGATTTAGTTCAACACAATCACTCCTAGAATTGGGGAGACCAGAT
TCACTCAAATCTTAGACCGTCCAATCATCTGCTGATGATTCTTTGGTAAACAGTGCTGGTTGATCAGATGGAGGAGTCTCATCTTCTGATGACATCTCTAGAAGACTATT
ATGTTACTTTTCTGTTGAATGAATTCTTTTCATTTTCAAAAGCCTTGTGAGTTTTGTTTACTGCAAATGTAGATAGTCAAAGTAGGCCTTTTTGGGGTGGAAATCATGTA
TATAGAATATTATATTCGTGCTCTTAGACTTTAATTTTTGTCTTTCATTATCTGATAAGATGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFSLFVCFQSSIMSESRDRLERQVDYAEVFARRRSDEPEMSTSFVGTPIAARERATNLGPRRGFDSPASVVGIGLSRFMYRSPVLSRENSGAGSFRRCRSRRRNSVLPIW
YPRTPLRDITAFVRAIERTRARLRENEGEGDDNNSPAPSNERALDLTTFVAGDDQEPSISVVTPKPKVGKVIKILRRITNVEESELLTPQKKLLNSIDKVEKVVREELQK
LRRTPSAKRAEREKRVRTLMSFR