; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0011140 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0011140
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionChlorophyll A-B binding protein
Genome locationLG01:23135529..23136367
RNA-Seq ExpressionSed0011140
SyntenySed0011140
Gene Ontology termsGO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK05751.1 uncharacterized protein E5676_scaffold98G002400 [Cucumis melo var. makuwa]2.7e-6272.97Show/hide
Query:  MASIPSSSLQFPNTLTLPSNPKPHKCKPPTFTTRSSPDPESTPQ-----SDGGGDFEDRLAKIRLRYRSGTGKKAEDRKARKSKKGSAAAAASSSVYLPP
        MA+IPSSSLQFPN+LTLPSN K HK +  TF TR++ DPESTP         G DFEDRLAK+R RYRSGTGKKAE RKARKSKKGS  AA  SSVYLPP
Subjt:  MASIPSSSLQFPNTLTLPSNPKPHKCKPPTFTTRSSPDPESTPQ-----SDGGGDFEDRLAKIRLRYRSGTGKKAEDRKARKSKKGSAAAAASSSVYLPP

Query:  LPLREAVSGGLRVELGFTPYSERVNGWIAMVGISALLLVELATGKGVIHYHTPGTVLIQLYFVAAVAALFIKYEKEKLSVWPSDD
        +PL+E VSGGL+VE GF+PYSER+NGWIA++GISAL+LVELATGK VI YHTP  +LIQ+YFVAAVAA++IKYEKEK+SVWP D+
Subjt:  LPLREAVSGGLRVELGFTPYSERVNGWIAMVGISALLLVELATGKGVIHYHTPGTVLIQLYFVAAVAALFIKYEKEKLSVWPSDD

XP_004149820.1 uncharacterized protein LOC101221723 [Cucumis sativus]2.3e-6173.66Show/hide
Query:  MASIPSSSLQFPNTLTLPSNPKPHKCKPPTFTTRSSPDPES------TPQSDGGGDFEDRLAKIRLRYRSGTGKKAEDRKARKSKKGSAAAAASSSVYLP
        MA+IPSSSLQFPN+LTLPSN KP K K  TF TR++ DPES       P SD G DFEDRLAK+R+RYRSGTGKKAE RKARKSK+GS  AA  SSVYLP
Subjt:  MASIPSSSLQFPNTLTLPSNPKPHKCKPPTFTTRSSPDPES------TPQSDGGGDFEDRLAKIRLRYRSGTGKKAEDRKARKSKKGSAAAAASSSVYLP

Query:  PLPLREAVSGGLRVELGFTPYSERVNGWIAMVGISALLLVELATGKGVIHYHTPGTVLIQLYFVAAVAALFIKYEKEKLSVWPSDD
        P+ L+EAVSGGL+VE GF+PYSER+NGWIA++GISAL+LVELATGK VI YHTP  +LIQ+YFVAAVAA++IKYEKEK+SVWPSD+
Subjt:  PLPLREAVSGGLRVELGFTPYSERVNGWIAMVGISALLLVELATGKGVIHYHTPGTVLIQLYFVAAVAALFIKYEKEKLSVWPSDD

XP_008463533.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501667 [Cucumis melo]8.0e-6272.43Show/hide
Query:  MASIPSSSLQFPNTLTLPSNPKPHKCKPPTFTTRSSPDPESTPQ-----SDGGGDFEDRLAKIRLRYRSGTGKKAEDRKARKSKKGSAAAAASSSVYLPP
        MA+IPSSSLQFPN+LTLPSN K HK +  TF TR++ DPESTP         G DFEDRLAK+R RYRSGTGKKAE RKARKSKKGS  AA  SSVYLPP
Subjt:  MASIPSSSLQFPNTLTLPSNPKPHKCKPPTFTTRSSPDPESTPQ-----SDGGGDFEDRLAKIRLRYRSGTGKKAEDRKARKSKKGSAAAAASSSVYLPP

Query:  LPLREAVSGGLRVELGFTPYSERVNGWIAMVGISALLLVELATGKGVIHYHTPGTVLIQLYFVAAVAALFIKYEKEKLSVWPSDD
        +PL+E VSGGL+VE GF+PYSER+NGWIA++GISAL+LVELATGK VI YHTP  +LIQ+YFVAAV A++IKYEKEK+SVWP D+
Subjt:  LPLREAVSGGLRVELGFTPYSERVNGWIAMVGISALLLVELATGKGVIHYHTPGTVLIQLYFVAAVAALFIKYEKEKLSVWPSDD

XP_022133568.1 uncharacterized protein LOC111006119 [Momordica charantia]4.2e-6371.35Show/hide
Query:  MASIPSSSLQFPNTLTLPSNPKPHKCKPPTFTTRSSPDPESTPQSD-----GGGDFEDRLAKIRLRYRSGTGKKAEDRKARKSKKGSAAAAASSSVYLPP
        MA+IPSSSLQFPN+L  PSN KPHK KP TF TR++ DPE TP +D      G DFE+RLAK+RL+YRSGTGKKAE RKARKS KGS A A  SSVYLPP
Subjt:  MASIPSSSLQFPNTLTLPSNPKPHKCKPPTFTTRSSPDPESTPQSD-----GGGDFEDRLAKIRLRYRSGTGKKAEDRKARKSKKGSAAAAASSSVYLPP

Query:  LPLREAVSGGLRVELGFTPYSERVNGWIAMVGISALLLVELATGKGVIHYHTPGTVLIQLYFVAAVAALFIKYEKEKLSVWPSDD
        +PL+EAVSGGL+VE GF+P+SER+NGWIA++GISAL+LVELATGKGVI+YHTP  +LIQ+YFVAAVAA+++K+EKEK+SVWP ++
Subjt:  LPLREAVSGGLRVELGFTPYSERVNGWIAMVGISALLLVELATGKGVIHYHTPGTVLIQLYFVAAVAALFIKYEKEKLSVWPSDD

XP_038890345.1 uncharacterized protein LOC120079944 [Benincasa hispida]2.0e-6073.51Show/hide
Query:  MASIPSSSLQFPNTLTLPSNPKPHKCKPPTFTTRSSPDPESTPQSDG-----GGDFEDRLAKIRLRYRSGTGKKAEDRKARKSKKGSAAAAASSSVYLPP
        MA+IPSSSLQFPN+LTLP  P     K  TF TR++ DPES P +D      G DFEDRLAK+RLRYRSGTGKKAE RKARKSKKGS   AA+SSVYLPP
Subjt:  MASIPSSSLQFPNTLTLPSNPKPHKCKPPTFTTRSSPDPESTPQSDG-----GGDFEDRLAKIRLRYRSGTGKKAEDRKARKSKKGSAAAAASSSVYLPP

Query:  LPLREAVSGGLRVELGFTPYSERVNGWIAMVGISALLLVELATGKGVIHYHTPGTVLIQLYFVAAVAALFIKYEKEKLSVWPSDD
        +PL+EAVSGGL+VE GF+PYSER+NGWIA++GISAL+LVELATGKGVI+YHTP  +LIQ+YFVAAVAAL+IKYEKEK+SVWP D+
Subjt:  LPLREAVSGGLRVELGFTPYSERVNGWIAMVGISALLLVELATGKGVIHYHTPGTVLIQLYFVAAVAALFIKYEKEKLSVWPSDD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KS45 Uncharacterized protein1.1e-6173.66Show/hide
Query:  MASIPSSSLQFPNTLTLPSNPKPHKCKPPTFTTRSSPDPES------TPQSDGGGDFEDRLAKIRLRYRSGTGKKAEDRKARKSKKGSAAAAASSSVYLP
        MA+IPSSSLQFPN+LTLPSN KP K K  TF TR++ DPES       P SD G DFEDRLAK+R+RYRSGTGKKAE RKARKSK+GS  AA  SSVYLP
Subjt:  MASIPSSSLQFPNTLTLPSNPKPHKCKPPTFTTRSSPDPES------TPQSDGGGDFEDRLAKIRLRYRSGTGKKAEDRKARKSKKGSAAAAASSSVYLP

Query:  PLPLREAVSGGLRVELGFTPYSERVNGWIAMVGISALLLVELATGKGVIHYHTPGTVLIQLYFVAAVAALFIKYEKEKLSVWPSDD
        P+ L+EAVSGGL+VE GF+PYSER+NGWIA++GISAL+LVELATGK VI YHTP  +LIQ+YFVAAVAA++IKYEKEK+SVWPSD+
Subjt:  PLPLREAVSGGLRVELGFTPYSERVNGWIAMVGISALLLVELATGKGVIHYHTPGTVLIQLYFVAAVAALFIKYEKEKLSVWPSDD

A0A1S3CJX9 uncharacterized protein LOC1035016673.9e-6272.43Show/hide
Query:  MASIPSSSLQFPNTLTLPSNPKPHKCKPPTFTTRSSPDPESTPQ-----SDGGGDFEDRLAKIRLRYRSGTGKKAEDRKARKSKKGSAAAAASSSVYLPP
        MA+IPSSSLQFPN+LTLPSN K HK +  TF TR++ DPESTP         G DFEDRLAK+R RYRSGTGKKAE RKARKSKKGS  AA  SSVYLPP
Subjt:  MASIPSSSLQFPNTLTLPSNPKPHKCKPPTFTTRSSPDPESTPQ-----SDGGGDFEDRLAKIRLRYRSGTGKKAEDRKARKSKKGSAAAAASSSVYLPP

Query:  LPLREAVSGGLRVELGFTPYSERVNGWIAMVGISALLLVELATGKGVIHYHTPGTVLIQLYFVAAVAALFIKYEKEKLSVWPSDD
        +PL+E VSGGL+VE GF+PYSER+NGWIA++GISAL+LVELATGK VI YHTP  +LIQ+YFVAAV A++IKYEKEK+SVWP D+
Subjt:  LPLREAVSGGLRVELGFTPYSERVNGWIAMVGISALLLVELATGKGVIHYHTPGTVLIQLYFVAAVAALFIKYEKEKLSVWPSDD

A0A5D3C1D6 Uncharacterized protein1.3e-6272.97Show/hide
Query:  MASIPSSSLQFPNTLTLPSNPKPHKCKPPTFTTRSSPDPESTPQ-----SDGGGDFEDRLAKIRLRYRSGTGKKAEDRKARKSKKGSAAAAASSSVYLPP
        MA+IPSSSLQFPN+LTLPSN K HK +  TF TR++ DPESTP         G DFEDRLAK+R RYRSGTGKKAE RKARKSKKGS  AA  SSVYLPP
Subjt:  MASIPSSSLQFPNTLTLPSNPKPHKCKPPTFTTRSSPDPESTPQ-----SDGGGDFEDRLAKIRLRYRSGTGKKAEDRKARKSKKGSAAAAASSSVYLPP

Query:  LPLREAVSGGLRVELGFTPYSERVNGWIAMVGISALLLVELATGKGVIHYHTPGTVLIQLYFVAAVAALFIKYEKEKLSVWPSDD
        +PL+E VSGGL+VE GF+PYSER+NGWIA++GISAL+LVELATGK VI YHTP  +LIQ+YFVAAVAA++IKYEKEK+SVWP D+
Subjt:  LPLREAVSGGLRVELGFTPYSERVNGWIAMVGISALLLVELATGKGVIHYHTPGTVLIQLYFVAAVAALFIKYEKEKLSVWPSDD

A0A6J1BZH5 uncharacterized protein LOC1110061192.0e-6371.35Show/hide
Query:  MASIPSSSLQFPNTLTLPSNPKPHKCKPPTFTTRSSPDPESTPQSD-----GGGDFEDRLAKIRLRYRSGTGKKAEDRKARKSKKGSAAAAASSSVYLPP
        MA+IPSSSLQFPN+L  PSN KPHK KP TF TR++ DPE TP +D      G DFE+RLAK+RL+YRSGTGKKAE RKARKS KGS A A  SSVYLPP
Subjt:  MASIPSSSLQFPNTLTLPSNPKPHKCKPPTFTTRSSPDPESTPQSD-----GGGDFEDRLAKIRLRYRSGTGKKAEDRKARKSKKGSAAAAASSSVYLPP

Query:  LPLREAVSGGLRVELGFTPYSERVNGWIAMVGISALLLVELATGKGVIHYHTPGTVLIQLYFVAAVAALFIKYEKEKLSVWPSDD
        +PL+EAVSGGL+VE GF+P+SER+NGWIA++GISAL+LVELATGKGVI+YHTP  +LIQ+YFVAAVAA+++K+EKEK+SVWP ++
Subjt:  LPLREAVSGGLRVELGFTPYSERVNGWIAMVGISALLLVELATGKGVIHYHTPGTVLIQLYFVAAVAALFIKYEKEKLSVWPSDD

A0A6J1FK14 uncharacterized protein LOC1114447344.0e-5971.74Show/hide
Query:  MASIPSSSLQFPNTLTLPSNPKPHKCKPPTFTTRS----SPDPESTPQSDGGGDFEDRLAKIRLRYRSGTGKKAEDRKARKSKKGSAAAAASSSVYLPPL
        MA+IPSSSLQFPN+L L  N KPHK K  TF TR+    SP  +S P+SD G DFEDRLA  RL+ R GTGKKAE RKARKS+KGS  AAA SSVYLPP+
Subjt:  MASIPSSSLQFPNTLTLPSNPKPHKCKPPTFTTRS----SPDPESTPQSDGGGDFEDRLAKIRLRYRSGTGKKAEDRKARKSKKGSAAAAASSSVYLPPL

Query:  PLREAVSGGLRVELGFTPYSERVNGWIAMVGISALLLVELATGKGVIHYHTPGTVLIQLYFVAAVAALFIKYEKEKLSVWPSDD
        PL+EAVSGGL+VE GF+PYSER+NGWIA++G+SAL+LVELATGKGVI+YHTP  +LIQ+YFVAA AAL+IKYEKEK+SVWP D+
Subjt:  PLREAVSGGLRVELGFTPYSERVNGWIAMVGISALLLVELATGKGVIHYHTPGTVLIQLYFVAAVAALFIKYEKEKLSVWPSDD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G12345.1 unknown protein1.2e-4462.25Show/hide
Query:  TTRSSPDPESTPQSDGGGD---FEDRLAKIRLRYRSGTGKKAEDRKARKSKKGSAAAAASSSVYLPPLPLREAVSGGLRVELGFTPYSERVNGWIAMVGI
        T  + PDPE+T QS+ G D   FE RL+ IRLRYRSGTGKKAE RK++K   GS   +  + +YLPP+ L+EAVSGGL+VE GF+P+SER+NG IA +G+
Subjt:  TTRSSPDPESTPQSDGGGD---FEDRLAKIRLRYRSGTGKKAEDRKARKSKKGSAAAAASSSVYLPPLPLREAVSGGLRVELGFTPYSERVNGWIAMVGI

Query:  SALLLVELATGKGVIHYHTPGTVLIQLYFVAAVAALFIKYEKEKLSVWPSD
        +ALLLVELATGK V++YHTP  V +Q+YFVAAV+A+F+K EKEK+SVWP D
Subjt:  SALLLVELATGKGVIHYHTPGTVLIQLYFVAAVAALFIKYEKEKLSVWPSD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTCCATCCCATCTTCCTCTCTACAATTCCCAAACACCCTCACACTCCCTTCCAATCCAAAGCCCCACAAATGCAAGCCCCCCACATTCACAACCAGATCGTCGCC
AGATCCAGAATCCACACCCCAATCCGACGGCGGCGGCGATTTCGAGGACCGGCTGGCCAAGATCCGGCTCAGGTACCGAAGCGGGACCGGGAAGAAGGCGGAGGACCGGA
AGGCTCGGAAGTCGAAGAAAGGATCCGCCGCCGCCGCGGCCTCCTCCTCGGTGTACCTGCCGCCGCTGCCGCTGAGGGAGGCCGTTTCCGGCGGGCTCAGGGTCGAGCTC
GGGTTCACCCCGTACAGCGAGCGGGTGAATGGCTGGATCGCCATGGTTGGGATTTCGGCGCTGCTTTTGGTGGAGCTGGCCACCGGAAAAGGCGTCATTCACTATCACAC
GCCGGGGACTGTTCTCATTCAGCTTTATTTTGTGGCGGCGGTGGCGGCTCTGTTCATCAAATACGAAAAGGAGAAGCTTAGTGTTTGGCCCTCTGATGATGATATTAACA
ATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAAGAAAGATAAGGCCCAACAAAGGGTTGATTTTATCTTGGAAGTCACAAATTCCCCATCCATGGCGTCCATCCCATCTTCCTCTCTACAATTCCCAAACACCCTCA
CACTCCCTTCCAATCCAAAGCCCCACAAATGCAAGCCCCCCACATTCACAACCAGATCGTCGCCAGATCCAGAATCCACACCCCAATCCGACGGCGGCGGCGATTTCGAG
GACCGGCTGGCCAAGATCCGGCTCAGGTACCGAAGCGGGACCGGGAAGAAGGCGGAGGACCGGAAGGCTCGGAAGTCGAAGAAAGGATCCGCCGCCGCCGCGGCCTCCTC
CTCGGTGTACCTGCCGCCGCTGCCGCTGAGGGAGGCCGTTTCCGGCGGGCTCAGGGTCGAGCTCGGGTTCACCCCGTACAGCGAGCGGGTGAATGGCTGGATCGCCATGG
TTGGGATTTCGGCGCTGCTTTTGGTGGAGCTGGCCACCGGAAAAGGCGTCATTCACTATCACACGCCGGGGACTGTTCTCATTCAGCTTTATTTTGTGGCGGCGGTGGCG
GCTCTGTTCATCAAATACGAAAAGGAGAAGCTTAGTGTTTGGCCCTCTGATGATGATATTAACAATTAGAATTTTATTTAACCCTTTTTTTTAAAAAAAATTACTTATGA
ATTTGGGAGATGTGCATTGTTGAGAGTAATATAATGCTTGTTTATTAAGTCATAAATTTCATTTCTATGATTGGAAGATAATTTCCAAGTGTTGATTTTATTTCATTGGT
GGAAGGTAATCCAATTCCATCTAATAATTTAATCTATAGAGATACAACTTAATAAATTAGGGTAGGGAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASIPSSSLQFPNTLTLPSNPKPHKCKPPTFTTRSSPDPESTPQSDGGGDFEDRLAKIRLRYRSGTGKKAEDRKARKSKKGSAAAAASSSVYLPPLPLREAVSGGLRVEL
GFTPYSERVNGWIAMVGISALLLVELATGKGVIHYHTPGTVLIQLYFVAAVAALFIKYEKEKLSVWPSDDDINN