; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0011379 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0011379
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionNuclear proteasome inhibitor UBLCP1
Genome locationLG06:42409677..42415846
RNA-Seq ExpressionSed0011379
SyntenySed0011379
Gene Ontology termsGO:0006470 - protein dephosphorylation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0004722 - protein serine/threonine phosphatase activity (molecular function)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000626 - Ubiquitin-like domain
IPR004274 - FCP1 homology domain
IPR011943 - HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIID
IPR023214 - HAD superfamily
IPR029071 - Ubiquitin-like domain superfamily
IPR036412 - HAD-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004135342.2 ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase [Cucumis sativus]1.3e-17494.21Show/hide
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XP_008445998.1 PREDICTED: ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase [Cucumis melo]5.7e-17594.82Show/hide
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XP_022956710.1 ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase [Cucurbita moschata]1.2e-17595.43Show/hide
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XP_022998279.1 ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase [Cucurbita maxima]7.5e-17595.12Show/hide
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XP_038877891.1 ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase [Benincasa hispida]1.2e-17795.47Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KRY1 Nuclear proteasome inhibitor UBLCP16.2e-17594.21Show/hide
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A0A1S3BE06 Nuclear proteasome inhibitor UBLCP12.8e-17594.82Show/hide
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A0A6J1DD82 Nuclear proteasome inhibitor UBLCP19.8e-17393.39Show/hide
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A0A6J1GYI7 Nuclear proteasome inhibitor UBLCP15.6e-17695.43Show/hide
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A0A6J1KDX1 Nuclear proteasome inhibitor UBLCP13.6e-17595.12Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2KJD7 Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 11.1e-9354.19Show/hide
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Q5FWT7 Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 18.8e-9454.52Show/hide
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Q5ZJJ8 Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 14.6e-9554.52Show/hide
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        N NYKIT +LD  AMITV +  RG  D KPLG+IW +F E+Y+ +NTIMFDD+ RN++MNPQNGL I+PF KAH NRD D+EL+KLTQYL  IA+LDD  
Subjt:  NPNYKITALLDHLAMITVQSDHRGTFDCKPLGLIWAQFPEFYNSRNTIMFDDLRRNYVMNPQNGLVIKPFRKAHANRDSDQELMKLTQYLLAIAELDDLS

Query:  PLDHNNWELY
         L+H +WE Y
Subjt:  PLDHNNWELY

Q8W3M6 Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase6.8e-15581.46Show/hide
Query:  ASSASTSSSSEEEMTLTVKWSGKEYTVRVCGDDSVAELKRRICEVTNVLPKRQKLLYPKVGSKLADDSLLLSQLPLKSSLKMTMIGTVEDDIIVDQAESP
        +++A+ S  +EEE+TLTVKW+GKEYTVR+C DDSVAELKRRIC +T VLPKRQKLLYPK+G+KL+DDSLLLS +  K SLKMTMIGTVEDDIIVDQAESP
Subjt:  ASSASTSSSSEEEMTLTVKWSGKEYTVRVCGDDSVAELKRRICEVTNVLPKRQKLLYPKVGSKLADDSLLLSQLPLKSSLKMTMIGTVEDDIIVDQAESP

Query:  EIIDDFELGKEEVIDIRDKDVNKQKLRRRISQYKIELRNPCREGKKLLVLDIDYTLFDHRSPAENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATSLKWVEL
        EI+DDFELGKEE +D++DK+VNKQKLRRRI QYKI LR PCR+GKKLLVLDIDYTLFDHRS AENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATS+KWVEL
Subjt:  EIIDDFELGKEEVIDIRDKDVNKQKLRRRISQYKIELRNPCREGKKLLVLDIDYTLFDHRSPAENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATSLKWVEL

Query:  KMGQLGVLSNPNYKITALLDHLAMITVQSDHRGTFDCKPLGLIWAQFPEFYNSRNTIMFDDLRRNYVMNPQNGLVIKPFRKAHANRDSDQELMKLTQYLL
        KM +LGVL+NPNYK+TALLDHLAMITVQSD RG FDCKPLGLIWA  PEFYN  NTIMFDDLRRN+VMNPQNGL IKPFRKAHANRD+DQEL+KLTQYLL
Subjt:  KMGQLGVLSNPNYKITALLDHLAMITVQSDHRGTFDCKPLGLIWAQFPEFYNSRNTIMFDDLRRNYVMNPQNGLVIKPFRKAHANRDSDQELMKLTQYLL

Query:  AIAELDDLSPLDHNNWELYSEDGPKRRRR
         IAEL DLS L H+ WE +S+D  KRRR+
Subjt:  AIAELDDLSPLDHNNWELYSEDGPKRRRR

Q8WVY7 Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 11.1e-9354.19Show/hide
Query:  MTLTVKWSGKEYTVRVCG-DDSVAELKRRICEVTNVLPKRQKLLYPKVGSKLADDSLLLSQLPLKSSLKMTMIGTVE---DDIIVDQAESPEIIDDFELG
        + + VKW G+EY+V     DD+V +LK+ +  +T VLP+RQKLL  KV  K A++ + L  L LK + K+ M+GT E   +D++    ++ ++++DF++ 
Subjt:  MTLTVKWSGKEYTVRVCG-DDSVAELKRRICEVTNVLPKRQKLLYPKVGSKLADDSLLLSQLPLKSSLKMTMIGTVE---DDIIVDQAESPEIIDDFELG

Query:  KEEVIDIRDKDVNKQKLRRRISQYKIELRNPCREGKKLLVLDIDYTLFDHRSPAENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATSLKWVELKMGQLGVLS
        ++EV+++ +++ N  K+ RR+ +YK+E+ NP REGKKLLVLD+DYTLFDHRS AE  ++LMRPYLHEFLT+AY +YDI+IWSAT++KW+E KM +LGV +
Subjt:  KEEVIDIRDKDVNKQKLRRRISQYKIELRNPCREGKKLLVLDIDYTLFDHRSPAENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATSLKWVELKMGQLGVLS

Query:  NPNYKITALLDHLAMITVQSDHRGTFDCKPLGLIWAQFPEFYNSRNTIMFDDLRRNYVMNPQNGLVIKPFRKAHANRDSDQELMKLTQYLLAIAELDDLS
        N NYKIT +LD  AMITV +  RG  D KPLG+IW +F EFY+ +NTIMFDD+ RN++MNPQNGL I+PF KAH NRD D+EL+KLTQYL  IA+LDD  
Subjt:  NPNYKITALLDHLAMITVQSDHRGTFDCKPLGLIWAQFPEFYNSRNTIMFDDLRRNYVMNPQNGLVIKPFRKAHANRDSDQELMKLTQYLLAIAELDDLS

Query:  PLDHNNWELY
         L+H  WE Y
Subjt:  PLDHNNWELY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G06599.1 ubiquitin family protein4.8e-15681.46Show/hide
Query:  ASSASTSSSSEEEMTLTVKWSGKEYTVRVCGDDSVAELKRRICEVTNVLPKRQKLLYPKVGSKLADDSLLLSQLPLKSSLKMTMIGTVEDDIIVDQAESP
        +++A+ S  +EEE+TLTVKW+GKEYTVR+C DDSVAELKRRIC +T VLPKRQKLLYPK+G+KL+DDSLLLS +  K SLKMTMIGTVEDDIIVDQAESP
Subjt:  ASSASTSSSSEEEMTLTVKWSGKEYTVRVCGDDSVAELKRRICEVTNVLPKRQKLLYPKVGSKLADDSLLLSQLPLKSSLKMTMIGTVEDDIIVDQAESP

Query:  EIIDDFELGKEEVIDIRDKDVNKQKLRRRISQYKIELRNPCREGKKLLVLDIDYTLFDHRSPAENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATSLKWVEL
        EI+DDFELGKEE +D++DK+VNKQKLRRRI QYKI LR PCR+GKKLLVLDIDYTLFDHRS AENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATS+KWVEL
Subjt:  EIIDDFELGKEEVIDIRDKDVNKQKLRRRISQYKIELRNPCREGKKLLVLDIDYTLFDHRSPAENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATSLKWVEL

Query:  KMGQLGVLSNPNYKITALLDHLAMITVQSDHRGTFDCKPLGLIWAQFPEFYNSRNTIMFDDLRRNYVMNPQNGLVIKPFRKAHANRDSDQELMKLTQYLL
        KM +LGVL+NPNYK+TALLDHLAMITVQSD RG FDCKPLGLIWA  PEFYN  NTIMFDDLRRN+VMNPQNGL IKPFRKAHANRD+DQEL+KLTQYLL
Subjt:  KMGQLGVLSNPNYKITALLDHLAMITVQSDHRGTFDCKPLGLIWAQFPEFYNSRNTIMFDDLRRNYVMNPQNGLVIKPFRKAHANRDSDQELMKLTQYLL

Query:  AIAELDDLSPLDHNNWELYSEDGPKRRRR
         IAEL DLS L H+ WE +S+D  KRRR+
Subjt:  AIAELDDLSPLDHNNWELYSEDGPKRRRR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGCCGCCGCCGCTTCTTCAGCTTCCACTTCGTCTTCTTCAGAGGAAGAGATGACATTGACGGTGAAATGGAGCGGAAAGGAGTACACTGTGCGAGTTTGCGGCGA
TGACTCTGTGGCTGAGCTCAAGCGCCGAATCTGCGAGGTCACTAACGTCTTGCCCAAGCGCCAAAAGCTTCTCTATCCCAAAGTCGGATCCAAATTAGCCGATGATTCGC
TTTTGCTCTCTCAGCTTCCTCTCAAATCGTCGCTCAAGATGACCATGATCGGGACTGTTGAAGATGATATAATCGTGGATCAAGCGGAGTCTCCTGAAATTATTGACGAT
TTTGAACTTGGGAAAGAGGAAGTCATTGACATTCGAGATAAGGATGTTAATAAGCAGAAACTGAGAAGACGTATTAGTCAATACAAGATAGAACTTCGCAATCCATGCCG
TGAAGGAAAGAAATTACTTGTTCTGGACATTGACTATACACTTTTTGATCATCGCTCTCCTGCAGAAAATCCTCTTCAACTCATGCGACCTTATCTTCATGAATTTCTGA
CAGCTGCTTATGCTGAATATGATATCATGATATGGTCAGCAACCAGTCTTAAGTGGGTTGAATTAAAGATGGGTCAGCTTGGCGTTCTCAGTAACCCAAACTACAAAATC
ACTGCTCTTCTAGACCATTTAGCTATGATCACAGTTCAGTCGGATCATCGCGGGACCTTTGATTGCAAGCCTCTAGGCTTGATTTGGGCACAGTTTCCAGAGTTTTACAA
CTCAAGAAATACTATAATGTTTGATGATCTTCGGAGAAATTATGTGATGAATCCACAAAATGGCCTGGTAATTAAGCCATTCAGGAAAGCCCATGCGAATCGTGATAGTG
ACCAGGAGCTTATGAAGCTCACTCAGTACTTGCTTGCCATTGCGGAACTTGATGACTTGAGCCCTCTTGATCATAATAACTGGGAGCTATACTCTGAAGATGGTCCGAAA
AGACGGCGGCGACATGCCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAAAAAAATGAAATGAAATATATTTAATTTGGTTTCGATTTCATTCGAAGGAGAAATTGAGTGGAAGAAGAAAAAAGGTTTTGGTTTAGAGAGCAAGAAAGCTCGACAAT
GGCCGCCGCCGCCGCTTCTTCAGCTTCCACTTCGTCTTCTTCAGAGGAAGAGATGACATTGACGGTGAAATGGAGCGGAAAGGAGTACACTGTGCGAGTTTGCGGCGATG
ACTCTGTGGCTGAGCTCAAGCGCCGAATCTGCGAGGTCACTAACGTCTTGCCCAAGCGCCAAAAGCTTCTCTATCCCAAAGTCGGATCCAAATTAGCCGATGATTCGCTT
TTGCTCTCTCAGCTTCCTCTCAAATCGTCGCTCAAGATGACCATGATCGGGACTGTTGAAGATGATATAATCGTGGATCAAGCGGAGTCTCCTGAAATTATTGACGATTT
TGAACTTGGGAAAGAGGAAGTCATTGACATTCGAGATAAGGATGTTAATAAGCAGAAACTGAGAAGACGTATTAGTCAATACAAGATAGAACTTCGCAATCCATGCCGTG
AAGGAAAGAAATTACTTGTTCTGGACATTGACTATACACTTTTTGATCATCGCTCTCCTGCAGAAAATCCTCTTCAACTCATGCGACCTTATCTTCATGAATTTCTGACA
GCTGCTTATGCTGAATATGATATCATGATATGGTCAGCAACCAGTCTTAAGTGGGTTGAATTAAAGATGGGTCAGCTTGGCGTTCTCAGTAACCCAAACTACAAAATCAC
TGCTCTTCTAGACCATTTAGCTATGATCACAGTTCAGTCGGATCATCGCGGGACCTTTGATTGCAAGCCTCTAGGCTTGATTTGGGCACAGTTTCCAGAGTTTTACAACT
CAAGAAATACTATAATGTTTGATGATCTTCGGAGAAATTATGTGATGAATCCACAAAATGGCCTGGTAATTAAGCCATTCAGGAAAGCCCATGCGAATCGTGATAGTGAC
CAGGAGCTTATGAAGCTCACTCAGTACTTGCTTGCCATTGCGGAACTTGATGACTTGAGCCCTCTTGATCATAATAACTGGGAGCTATACTCTGAAGATGGTCCGAAAAG
ACGGCGGCGACATGCCTGAGTAACAGATTTAGTCTTTTTTTGTGACTAGTTGAGGGATGCTGATAAGGATTTGGATCCGAAGGGGCCTTAACTTGAATGAAATTGCATCT
GCTTTTCAACTTTTTTGTTCTCTGGTGACATAATTTATAGATCGTGTGATAAATACGGTCATGTACTACATGGACCCCTTTTTCTTTCTGACTGCAAATAGCATTTCCTC
TAGGAGATATAGCATGAAATTGCTAAAGATTGCAAGATTGCATTTTCTTGTCATGCTGTACGATCAAGCATTAGCAACCATTCACTAATGACAAAGATTGGTGACTTATC
AAAATTACGAGTGTGTAAAAAAATTGAAAATCCGTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAAAASSASTSSSSEEEMTLTVKWSGKEYTVRVCGDDSVAELKRRICEVTNVLPKRQKLLYPKVGSKLADDSLLLSQLPLKSSLKMTMIGTVEDDIIVDQAESPEIIDD
FELGKEEVIDIRDKDVNKQKLRRRISQYKIELRNPCREGKKLLVLDIDYTLFDHRSPAENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATSLKWVELKMGQLGVLSNPNYKI
TALLDHLAMITVQSDHRGTFDCKPLGLIWAQFPEFYNSRNTIMFDDLRRNYVMNPQNGLVIKPFRKAHANRDSDQELMKLTQYLLAIAELDDLSPLDHNNWELYSEDGPK
RRRRHA