; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0011539 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0011539
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionNADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial
Genome locationLG04:47404074..47408290
RNA-Seq ExpressionSed0011539
SyntenySed0011539
Gene Ontology termsGO:0006120 - mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone (biological process)
GO:0032981 - mitochondrial respiratory chain complex I assembly (biological process)
GO:0005747 - mitochondrial respiratory chain complex I (cellular component)
GO:0003954 - NADH dehydrogenase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0051539 - 4 iron, 4 sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domainsIPR010226 - NADH-quinone oxidoreductase, chain I
IPR017896 - 4Fe-4S ferredoxin-type, iron-sulphur binding domain
IPR017900 - 4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6572037.1 hypothetical protein SDJN03_28765, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.5e-10996.59Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1C2E8 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial3.6e-11299.02Show/hide
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A0A6J1I8H7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial5.1e-11197.55Show/hide
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A0A6J1I8W0 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial-like1.7e-10997.06Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O21233 NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 86.5e-7985.71Show/hide
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O24143 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial3.1e-9779.57Show/hide
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P80269 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial1.9e-10282.53Show/hide
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Q42599 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-A, mitochondrial1.3e-10086.83Show/hide
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Q9FX83 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-B, mitochondrial4.2e-10282.43Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G16700.1 Alpha-helical ferredoxin3.0e-10382.43Show/hide
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AT1G79010.1 Alpha-helical ferredoxin9.6e-10286.83Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AGACCGCTGGGAGACCGAGATTGCAGAGAACCTAAGATCTGAAAGCCTCTATCGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAACGCTGCGTTTCGACGATCGAAAATCGGAGCGATTCAGGGACTCGCACAGCGATCAAGTAGGCTCAGTCTGTGCAGAAATCATTTCGCCCTGTGAGTTTTGGTGAAG
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