; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0011700 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0011700
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionPhosphoribosylaminoimidazole carboxylase atpase-subunit isoform 1
Genome locationLG05:530459..531228
RNA-Seq ExpressionSed0011700
SyntenySed0011700
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606390.1 hypothetical protein SDJN03_03707, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-2773.91Show/hide
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        I+L NPMEAARVM GE WMK K+D+ FVLPIQVLQRAPVPPSG NPC  IPGQSNGRCTLQTMN+AGG  RFV APP +     +A AAQSS
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KAG6738307.1 hypothetical protein POTOM_057918 [Populus tomentosa]1.2e-0843.16Show/hide
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        MG  +R  CL + + + IV    ++ + AAR ++GE W+  K+D+     IQ L+RAPVPPSG +PC + PG+ +G C L  MN AG    HAPP
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TXG63783.1 hypothetical protein EZV62_010777 [Acer yangbiense]1.2e-0844.83Show/hide
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        +VL + M +++A+     + A R ++G+ W  +KED    L  Q LQ+ P+PPSG NPC NIPGQ +G CTL   N AGGR    PP
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XP_022931191.1 uncharacterized protein LOC111437447 [Cucurbita moschata]6.8e-3171.56Show/hide
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        MG+SKR  LV FVLM  I+L NPMEAARVM G  WMK K+D+ FVLPIQVLQRAPVPPSG NPC  IPGQSNGRCTLQTMN+AG  GRFV APP +    
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XP_022995941.1 uncharacterized protein LOC111491306 [Cucurbita maxima]2.8e-3273.39Show/hide
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         +A AAQSS
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LCX8 Uncharacterized protein8.1e-2262.11Show/hide
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        MGIS++  L+ F+++ +  +  M  ARVMK E WMK++++    FVLP IQVLQRAPVPPSG NPC  IPGQSNGRCTLQTMN+AG  FVHA PP
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A0A2N9F903 Uncharacterized protein9.3e-1041.67Show/hide
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        +++F+++F++  +   A R + GE W+         L +Q LQR PV PSGPNPC  IPG+S+GRCTL  M++A     HAPP     +V+ AA S
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A0A5C7I2P2 Uncharacterized protein6.0e-0944.83Show/hide
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A0A6J1ET04 uncharacterized protein LOC1114374473.3e-3171.56Show/hide
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        MG+SKR  LV FVLM  I+L NPMEAARVM G  WMK K+D+ FVLPIQVLQRAPVPPSG NPC  IPGQSNGRCTLQTMN+AG  GRFV APP +    
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A0A6J1K3A7 uncharacterized protein LOC1114913061.3e-3273.39Show/hide
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         +A AAQSS
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGATCTCCAAAAGAGGTTGTTTGGTGTTGTTTGTGTTGATGTTTATTGTGTTGGCTAATCCTATGGAAGCAGCCAGGGTTATGAAAGGAGAGGATTGGATGAAGGA
CAAGGAAGATATGCCTTTTGTGTTGCCTATTCAAGTTTTGCAGCGTGCCCCGGTTCCACCCTCCGGTCCCAACCCGTGCGGTAACATTCCTGGCCAAAGCAACGGCCGAT
GCACCCTCCAGACGATGAACATTGCAGGTGGTCGTTTTGTCCATGCGCCGCCACCTCTCGTTGCCTTGGCTGCTCAAAGCTCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTTTACAAACTTCACCTACTTGTGAGGATCAAAAAACAAGAGTTTGTTTGTTTGATAATCTTTTTTTGGGGCATTTAAGGTAATGGGGATCTCCAAAAGAGGTTGTTTG
GTGTTGTTTGTGTTGATGTTTATTGTGTTGGCTAATCCTATGGAAGCAGCCAGGGTTATGAAAGGAGAGGATTGGATGAAGGACAAGGAAGATATGCCTTTTGTGTTGCC
TATTCAAGTTTTGCAGCGTGCCCCGGTTCCACCCTCCGGTCCCAACCCGTGCGGTAACATTCCTGGCCAAAGCAACGGCCGATGCACCCTCCAGACGATGAACATTGCAG
GTGGTCGTTTTGTCCATGCGCCGCCACCTCTCGTTGCCTTGGCTGCTCAAAGCTCTTGATGGTTCATAAGGGTGGAACCGTGGAGGCTGTGGTCAGTTTCATGAGGGACC
TCTCATTTTATTGAACCTGTTATTTAATTATCTTTTTCTTTTGCTTGGGAGCATCGTCCAAAAAAGAATTGGTTGCAACCCATGTAATTTATGTTCAAGTAAAAGTTTTT
TTCCTTTTTAAATTGTTATTATTATTTTCATAGATTGTGTTACTTGATAAAAGATTAGTTTATTCTTTGACAATTTCAAATATGATAAGCTTTACAAAAAGAGCATTTGG
AATTATTGTCCGAGTTTAAGACCAACTTATACATATACTATATTTTAAATAAGTTGGTGAAGATTACGGTTTGAATTTCAAACTTGAGAAGTAATTTTAATGTTTTAATT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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