| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG7011405.1 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 1.2e-62 | 91.85 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRRSAGVNASRTF
IHKGKVSE+FPKSRYRSRSRSPRRR + R +
Subjt: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRRSAGVNASRTF
|
|
| XP_004136874.2 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis sativus] | 1.2e-62 | 96.8 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG++VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRR
IHKGK+SEAFPKSRYRSRSRSPRRR
Subjt: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRR
|
|
| XP_022963472.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 [Cucurbita moschata] | 1.2e-62 | 91.85 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRRSAGVNASRTF
IHKGKVSE+FPKSRYRSRSRSPRRR + R +
Subjt: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRRSAGVNASRTF
|
|
| XP_023554223.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 1.2e-62 | 91.85 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRRSAGVNASRTF
IHKGKVSE+FPKSRYRSRSRSPRRR + R +
Subjt: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRRSAGVNASRTF
|
|
| XP_023554224.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 1.2e-62 | 91.85 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRRSAGVNASRTF
IHKGKVSE+FPKSRYRSRSRSPRRR + R +
Subjt: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRRSAGVNASRTF
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K7C0 RRM domain-containing protein | 5.7e-63 | 96.8 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG++VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRR
IHKGK+SEAFPKSRYRSRSRSPRRR
Subjt: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRR
|
|
| A0A1S3C0I4 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 5.7e-63 | 96.8 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG++VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRR
IHKGK+SEAFPKSRYRSRSRSPRRR
Subjt: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRR
|
|
| A0A6J1HFC7 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 | 5.7e-63 | 91.85 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRRSAGVNASRTF
IHKGKVSE+FPKSRYRSRSRSPRRR + R +
Subjt: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRRSAGVNASRTF
|
|
| A0A6J1HG77 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X1 | 5.7e-63 | 91.85 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRRSAGVNASRTF
IHKGKVSE+FPKSRYRSRSRSPRRR + R +
Subjt: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRRSAGVNASRTF
|
|
| A0A6J1HHW9 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X3 | 5.7e-63 | 91.85 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRRSAGVNASRTF
IHKGKVSE+FPKSRYRSRSRSPRRR + R +
Subjt: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRRSAGVNASRTF
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 3.5e-25 | 46.67 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG+V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRRSAGVNASRTFS
+G + S Y RSRSPRRR + SR+ S
Subjt: HKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRRSAGVNASRTFS
|
|
| Q01130 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.7e-24 | 45.93 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG+V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRRSAGVNASRTFS
+G + Y RSRSPRRR + SR+ S
Subjt: HKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRRSAGVNASRTFS
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.7e-24 | 45.93 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG+V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRRSAGVNASRTFS
+G + Y RSRSPRRR + SR+ S
Subjt: HKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRRSAGVNASRTFS
|
|
| Q62093 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.7e-24 | 45.93 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG+V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRRSAGVNASRTFS
+G + Y RSRSPRRR + SR+ S
Subjt: HKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRRRSAGVNASRTFS
|
|
| Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 1.7e-56 | 89.52 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRR
I KG+V E PKSR RSRSRSPRR
Subjt: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRR
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT3G10400.1 RNA recognition motif and CCHC-type zinc finger domains containing protein | 4.6e-12 | 35.58 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKVSEAFPKSRYR
+L V N+ F T D++ LF +GKV + + +DR T SRG AFV Y ++A KA +D +++GR++TV A G+ SE K Y+
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKVSEAFPKSRYR
Query: SRSR
+SR
Subjt: SRSR
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 1.6e-12 | 37.1 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAERIHK
FG S D+ SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF F+++ +A +A ++DG ++ GRE+TV FA+ N ++ +
Subjt: FGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAERIHK
Query: GKVSEAFPKS-RYRSRSRSPRRRS
+ + +S R++ R RSP R S
Subjt: GKVSEAFPKS-RYRSRSRSPRRRS
|
|
| AT5G18810.1 SC35-like splicing factor 28 | 8.9e-16 | 37.9 | Show/hide |
Query: LLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYG---PNAERIHKG---------K
LL+ N+ +DL F ++G + DI++PR+ TG+ RGF FV+Y+YA++A +A++R++ V+ GREI + FA+ P R G +
Subjt: LLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYG---PNAERIHKG---------K
Query: VSEAFPKSRYR--SRSRSPRRRSA
S P+ RYR SRSRSP RR +
Subjt: VSEAFPKSRYR--SRSRSPRRRSA
|
|
| AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC35 | 1.2e-57 | 89.52 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRR
I KG+V E PKSR RSRSRSPRR
Subjt: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRR
|
|
| AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC35 | 1.2e-57 | 89.52 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGSVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRR
I KG+V E PKSR RSRSRSPRR
Subjt: IHKGKVSEAFPKSRYRSRSRSPRR
|
|
