; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0012533 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0012533
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionglucan endo-1,3-beta-glucosidase 12-like isoform X8
Genome locationLG10:1019947..1022520
RNA-Seq ExpressionSed0012533
SyntenySed0012533
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
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GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0004553 - hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds (molecular function)
InterPro domainsIPR012946 - X8 domain
IPR044788 - Carbohydrate-binding X8 domain-containing protein, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7034687.1 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.2e-10573.62Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3AZA1 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3-like5.1e-10472.24Show/hide
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A0A5D3CNT9 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3-like5.1e-10472.24Show/hide
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A0A6J1EFQ7 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 1-like isoform X12.7e-10572.29Show/hide
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A0A6J1IUV4 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 2-like isoform X17.8e-10571.97Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65399 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 15.9e-1749.46Show/hide
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P52409 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase5.0e-1640.8Show/hide
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Q84V39 Major pollen allergen Ole e 103.8e-1641.23Show/hide
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Q8VYE5 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 123.0e-1340.59Show/hide
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Q9FJU9 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 132.3e-1340.34Show/hide
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        ++  +  T +   +S +TP
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09460.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein1.2e-2039.21Show/hide
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Query:  ALNYACGYGGADCSAIQTGSSCFEPNTMRDHASYAFNQYYQKNPAPTSCVFGGAAQLSSTDPSSGSCRY--ASSTSSRSSPSTTTP------INPPTSPT
        AL+YACG   ADCS +Q G +C+ P +++ HAS+AFN YYQKNP+P SC FGGAA L +T+PS+GSC Y   SSTS+  +  TTTP      +N P   +
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Query:  TPINPPTSPTLMPPSTPTPTVTTPAPPDTMPTDTTPTTTTPTDAGGFSSVPPD---TASSAMPVTSFFSFVFLGSLLM
        TPI  PT   ++   TP P +  PA P T  T   P++       GF   P +   T+S +  +   F    + +L++
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AT1G29380.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein4.8e-3042.57Show/hide
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        IP+V+PT  GG+  T TP +T  SPPS   P  +T T        TTPT        TT                                         
Subjt:  IPIVDPTTTGGTTPTLTPIVTPTSPPSQQIPTGSTVT-------PTTPT--------TT-----------------------------------------

Query:  ---------GGGSWCIASPNASPTTLQVALNYACGYGGADCSAIQTGSSCFEPNTMRDHASYAFNQYYQKNPAPTSCVFGGAAQLSSTDPSSGSCRYASS
                 G G WCIA  NASPT+LQVAL+YACGYGGADC  IQ G++C+EPNT+RDHAS+AFN YYQK+P   SC FGGAAQL+STDPS GSC ++SS
Subjt:  ---------GGGSWCIASPNASPTTLQVALNYACGYGGADCSAIQTGSSCFEPNTMRDHASYAFNQYYQKNPAPTSCVFGGAAQLSSTDPSSGSCRYASS

Query:  TSSRSSPSTTTPINPPT--SPTTPINPPTSPTLMPPSTPTPTVTTPAPP
               S T   +PP+  SP    +PP+S    P +TPT  +T   PP
Subjt:  TSSRSSPSTTTPINPPT--SPTTPINPPTSPTLMPPSTPTPTVTTPAPP

AT2G30933.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein3.4e-2041.95Show/hide
Query:  DPTTTGGTTPTLTP--IVTPTSPPSQQIPTGSTVTPTTP---TTTGGGSWCIASPNASPTTLQVALNYACGYGGADCSAIQTGSSCFEPNTMRDHASYAF
        D TT   T PT TP  +V  +   +  + T     P++P      G  SWC+A  N +   LQ AL+YACG GGADCS IQ G +C+ PN++R HAS+AF
Subjt:  DPTTTGGTTPTLTP--IVTPTSPPSQQIPTGSTVTPTTP---TTTGGGSWCIASPNASPTTLQVALNYACGYGGADCSAIQTGSSCFEPNTMRDHASYAF

Query:  NQYYQKNPAPTSCVFGGAAQLSSTDPSSGSCRYASSTSSRSSPSTTTPINPPTSPTTPINPPTSPTLMPPSTPT
        N YYQKNP P+SC F G A   S DPS GSC + S+++S S  + T+          P +P   P     S+ T
Subjt:  NQYYQKNPAPTSCVFGGAAQLSSTDPSSGSCRYASSTSSRSSPSTTTPINPPTSPTTPINPPTSPTLMPPSTPT

AT2G30933.2 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein3.7e-2248.03Show/hide
Query:  DPTTTGGTTPTLTP--IVTPTSPPSQQIPTGSTVTPTTP---TTTGGGSWCIASPNASPTTLQVALNYACGYGGADCSAIQTGSSCFEPNTMRDHASYAF
        D TT   T PT TP  +V  +   +  + T     P++P      G  SWC+A  N +   LQ AL+YACG GGADCS IQ G +C+ PN++R HAS+AF
Subjt:  DPTTTGGTTPTLTP--IVTPTSPPSQQIPTGSTVTPTTP---TTTGGGSWCIASPNASPTTLQVALNYACGYGGADCSAIQTGSSCFEPNTMRDHASYAF

Query:  NQYYQKNPAPTSCVFGGAAQLSSTDPS
        N YYQKNP P+SC F G A   S DPS
Subjt:  NQYYQKNPAPTSCVFGGAAQLSSTDPS

AT4G29360.1 O-Glycosyl hydrolases family 17 protein2.2e-1440.59Show/hide
Query:  DTIPIVDPTTTGGTTPTLTPIVTPTSPPSQQIPTGSTVTPTTPTTTGGGS--WCIASPNASPTTLQVALNYACGYGGADCSAIQTGSSCFEPNTMRDHAS
        +T P+    +T GT+P         SP S  I  G++ T T     GGG+  WCIAS  AS T LQ AL++ACG G  DCSA+Q    CFEP+T+  HAS
Subjt:  DTIPIVDPTTTGGTTPTLTPIVTPTSPPSQQIPTGSTVTPTTPTTTGGGS--WCIASPNASPTTLQVALNYACGYGGADCSAIQTGSSCFEPNTMRDHAS

Query:  YAFNQYYQKNPAPT-SCVFGGAAQLSSTDPSSGSCRY--ASSTSSRSSPSTTTPINPPTSPTTPINPPTS
        YAFN YYQ++ A +  C F GA+     DPS G+C Y  A +T   +           T+  +P+  P+S
Subjt:  YAFNQYYQKNPAPT-SCVFGGAAQLSSTDPSSGSCRY--ASSTSSRSSPSTTTPINPPTSPTTPINPPTS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTACCTGCATTCACCTCCATTTTGCAATATTGTCCTGGTTTATCTTCCTCAATCTAGGTTCAAGTATAGCTCAGAATCCATACTTTGATGCTCACCGAGAAAACTT
TGTGCTGCAAAATCAAGAGGATCGAATACCATACTTTTCAACTCCATACTTTTCAACTTCAACACCTAACACTCAACTGGACACAATCCCCATTGTGGATCCAACCACCA
CAGGCGGCACGACTCCAACTCTGACCCCAATTGTGACCCCGACATCGCCGCCATCACAACAAATCCCAACCGGATCTACCGTAACCCCGACAACCCCAACAACCACAGGT
GGTGGAAGTTGGTGCATAGCAAGCCCAAATGCTTCTCCAACCACATTGCAGGTAGCTCTTAACTATGCTTGTGGATACGGAGGAGCAGATTGCTCGGCAATTCAAACGGG
AAGTAGTTGCTTCGAGCCGAACACCATGCGAGACCATGCTTCTTATGCCTTCAACCAATACTACCAGAAGAATCCTGCACCTACAAGCTGCGTCTTTGGAGGAGCGGCAC
AGCTCTCGAGCACAGACCCCAGCAGTGGAAGTTGTCGCTACGCATCATCAACGTCATCAAGATCATCGCCAAGCACGACAACGCCAATCAATCCACCTACAAGTCCAACC
ACACCAATCAATCCACCAACAAGTCCAACTCTCATGCCACCATCAACTCCAACTCCAACCGTTACAACACCAGCACCACCAGACACAATGCCTACCGATACGACACCGAC
CACTACCACACCGACCGACGCTGGCGGTTTCAGCTCAGTACCACCAGACACAGCAAGCTCCGCGATGCCCGTCACAAGTTTCTTCTCTTTCGTCTTCTTGGGATCACTTC
TTATGGCAAATTGCATATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAAAGCTTAAGATTCTGTCCTTCACTTCTCTTTATATATTGCTAACTGCCAAAAAGGGTCATTCTTCTTTGCATAAACACATTTGTTGTAGTTCTACATTTCATAAATCT
TTGGTTCTATATCATTGTTCAAAGATTCAGAAACAAACATTTGAAGTAATTTGCTGAGATGGGTACCTGCATTCACCTCCATTTTGCAATATTGTCCTGGTTTATCTTCC
TCAATCTAGGTTCAAGTATAGCTCAGAATCCATACTTTGATGCTCACCGAGAAAACTTTGTGCTGCAAAATCAAGAGGATCGAATACCATACTTTTCAACTCCATACTTT
TCAACTTCAACACCTAACACTCAACTGGACACAATCCCCATTGTGGATCCAACCACCACAGGCGGCACGACTCCAACTCTGACCCCAATTGTGACCCCGACATCGCCGCC
ATCACAACAAATCCCAACCGGATCTACCGTAACCCCGACAACCCCAACAACCACAGGTGGTGGAAGTTGGTGCATAGCAAGCCCAAATGCTTCTCCAACCACATTGCAGG
TAGCTCTTAACTATGCTTGTGGATACGGAGGAGCAGATTGCTCGGCAATTCAAACGGGAAGTAGTTGCTTCGAGCCGAACACCATGCGAGACCATGCTTCTTATGCCTTC
AACCAATACTACCAGAAGAATCCTGCACCTACAAGCTGCGTCTTTGGAGGAGCGGCACAGCTCTCGAGCACAGACCCCAGCAGTGGAAGTTGTCGCTACGCATCATCAAC
GTCATCAAGATCATCGCCAAGCACGACAACGCCAATCAATCCACCTACAAGTCCAACCACACCAATCAATCCACCAACAAGTCCAACTCTCATGCCACCATCAACTCCAA
CTCCAACCGTTACAACACCAGCACCACCAGACACAATGCCTACCGATACGACACCGACCACTACCACACCGACCGACGCTGGCGGTTTCAGCTCAGTACCACCAGACACA
GCAAGCTCCGCGATGCCCGTCACAAGTTTCTTCTCTTTCGTCTTCTTGGGATCACTTCTTATGGCAAATTGCATATAAGAGGATGCAGAAAGCAACTCGGATCACATTTA
TAACAATCTATTAATTGATAAGACCAATATGCGCAGCCATTGTTACGTTTATATAAAAGAGATAGGGAGCTCAAGGGAGGAATTAGTGTTTGGATAGTAAGAAATATGGG
GGAAAATTATACTAGAATTTCTACTTTAGTAGTGATAGAATAAATTTGTAACATTTATCTACATTTAGGACTGTAATTCCATCTGCAGCTATCCAATTTAGTTCATGTTC
ATCCAGTTCAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGTCIHLHFAILSWFIFLNLGSSIAQNPYFDAHRENFVLQNQEDRIPYFSTPYFSTSTPNTQLDTIPIVDPTTTGGTTPTLTPIVTPTSPPSQQIPTGSTVTPTTPTTTG
GGSWCIASPNASPTTLQVALNYACGYGGADCSAIQTGSSCFEPNTMRDHASYAFNQYYQKNPAPTSCVFGGAAQLSSTDPSSGSCRYASSTSSRSSPSTTTPINPPTSPT
TPINPPTSPTLMPPSTPTPTVTTPAPPDTMPTDTTPTTTTPTDAGGFSSVPPDTASSAMPVTSFFSFVFLGSLLMANCI