; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0012739 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0012739
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionGlycine rich protein
Genome locationLG04:42941194..42942439
RNA-Seq ExpressionSed0012739
SyntenySed0012739
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR010800 - Glycine rich protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CEG62450.1 Glycine rich protein [Cucumis sativus]2.6e-2673.39Show/hide
Query:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAK-----YDRGYGGHHGGYDHGHGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGG-GRYGG
        M SK  VF+ L LAFVLL+SSEVAARDLAETS+   NEATVETNGVEDAK     YDRGYG   GG+D G+GGGR G G G YGG GG  YGGG G YG 
Subjt:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAK-----YDRGYGGHHGGYDHGHGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGG-GRYGG

Query:  GCRYGRCGHRCCSYAGEVVEGAKP
        GCRYGRCGH+CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GCRYGRCGHRCCSYAGEVVEGAKP

KAE8645725.1 hypothetical protein Csa_020407 [Cucumis sativus]2.9e-2568.15Show/hide
Query:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAK-----YDRGYG-----GHHGGYDHGHGGG---RYGGGGGRYG----GGGG
        M SK  VF+ L+LAFVLL+SSEVAARDLAETS+   NE TVETNGVEDAK     YDRGYG     G+ GGYD G+GGG    YGGG G YG    GG G
Subjt:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAK-----YDRGYG-----GHHGGYDHGHGGG---RYGGGGGRYG----GGGG

Query:  GRYGGGGRYGGGCRYGRCGHRCCSYAGEVVEGAKP
        G  GG G YG GCRYGRCGH+CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GRYGGGGRYGGGCRYGRCGHRCCSYAGEVVEGAKP

KGN43456.1 hypothetical protein Csa_020456 [Cucumis sativus]1.6e-2673.39Show/hide
Query:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAK-----YDRGYGGHHGGYDHGHGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGG-GRYGG
        M SK  VF+ L+LAFVLL+SSEVAARDLAETS+   NEATVETNGVEDAK     YDRGYG   GG+D G+GGGR G G G YGG GG  YGGG G YG 
Subjt:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAK-----YDRGYGGHHGGYDHGHGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGG-GRYGG

Query:  GCRYGRCGHRCCSYAGEVVEGAKP
        GCRYGRCGH+CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GCRYGRCGHRCCSYAGEVVEGAKP

NP_001267708.1 glycine-rich protein-like precursor [Cucumis sativus]1.6e-2673.39Show/hide
Query:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAK-----YDRGYGGHHGGYDHGHGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGG-GRYGG
        M SK  VF+ L+LAFVLL+SSEVAARDLAETS+   NEATVETNGVEDAK     YDRGYG   GG+D G+GGGR G G G YGG GG  YGGG G YG 
Subjt:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAK-----YDRGYGGHHGGYDHGHGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGG-GRYGG

Query:  GCRYGRCGHRCCSYAGEVVEGAKP
        GCRYGRCGH+CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GCRYGRCGHRCCSYAGEVVEGAKP

XP_022952570.1 cold and drought-regulated protein CORA-like isoform X1 [Cucurbita moschata]1.1e-2473.55Show/hide
Query:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAK---YDRGYGGHHGGYDHGHGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGGGRYGGGCR
        M SK  +F+ L+ A VLLISSEVAARDLAETST   NEAT ETNGVEDAK   YD GYGG  GGY  G  GGR GG GGR G GG G YGGGG YG GCR
Subjt:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAK---YDRGYGGHHGGYDHGHGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGGGRYGGGCR

Query:  YGRCGHRCCSYAGEVVEGAKP
        YGRCG+RCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  YGRCGHRCCSYAGEVVEGAKP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K6L7 Uncharacterized protein7.5e-2773.39Show/hide
Query:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAK-----YDRGYGGHHGGYDHGHGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGG-GRYGG
        M SK  VF+ L+LAFVLL+SSEVAARDLAETS+   NEATVETNGVEDAK     YDRGYG   GG+D G+GGGR G G G YGG GG  YGGG G YG 
Subjt:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAK-----YDRGYGGHHGGYDHGHGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGG-GRYGG

Query:  GCRYGRCGHRCCSYAGEVVEGAKP
        GCRYGRCGH+CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GCRYGRCGHRCCSYAGEVVEGAKP

A0A0A1IXP4 Glycine rich protein1.3e-2673.39Show/hide
Query:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAK-----YDRGYGGHHGGYDHGHGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGG-GRYGG
        M SK  VF+ L LAFVLL+SSEVAARDLAETS+   NEATVETNGVEDAK     YDRGYG   GG+D G+GGGR G G G YGG GG  YGGG G YG 
Subjt:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAK-----YDRGYGGHHGGYDHGHGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGG-GRYGG

Query:  GCRYGRCGHRCCSYAGEVVEGAKP
        GCRYGRCGH+CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GCRYGRCGHRCCSYAGEVVEGAKP

A0A5D3DE59 Cold and drought-regulated protein CORA-like9.2e-2570.4Show/hide
Query:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAKYDRGYGGHHGGYDHGHGGGRYGGGG------GRYGGGGGGRYGGG-GRYG
        M SK  VF+ L+LAFVLL+SSEVAARDLAETS+   NEATVETNGVEDAKY        GGYD G+GGG YG GG      GR G GG G YGGG G YG
Subjt:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAKYDRGYGGHHGGYDHGHGGGRYGGGG------GRYGGGGGGRYGGG-GRYG

Query:  GGCRYGRCGHRCCSYAGEVVEGAKP
         GCRYGRCG+RCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GGCRYGRCGHRCCSYAGEVVEGAKP

A0A6J1GM55 cold and drought-regulated protein CORA-like isoform X15.4e-2573.55Show/hide
Query:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAK---YDRGYGGHHGGYDHGHGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGGGRYGGGCR
        M SK  +F+ L+ A VLLISSEVAARDLAETST   NEAT ETNGVEDAK   YD GYGG  GGY  G  GGR GG GGR G GG G YGGGG YG GCR
Subjt:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAK---YDRGYGGHHGGYDHGHGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGGGRYGGGCR

Query:  YGRCGHRCCSYAGEVVEGAKP
        YGRCG+RCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  YGRCGHRCCSYAGEVVEGAKP

A0P8W6 Cell wall glycine-rich protein7.5e-2773.39Show/hide
Query:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAK-----YDRGYGGHHGGYDHGHGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGG-GRYGG
        M SK  VF+ L+LAFVLL+SSEVAARDLAETS+   NEATVETNGVEDAK     YDRGYG   GG+D G+GGGR G G G YGG GG  YGGG G YG 
Subjt:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAK-----YDRGYGGHHGGYDHGHGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGG-GRYGG

Query:  GCRYGRCGHRCCSYAGEVVEGAKP
        GCRYGRCGH+CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GCRYGRCGHRCCSYAGEVVEGAKP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q07202 Cold and drought-regulated protein CORA5.0e-0450.44Show/hide
Query:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAKYDRGY---GGHH-GGYDHG----HGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGGGR-
        M SK  + +  +LA + LISS ++ARDL ETST+   E   +TN V DAKY  GY   GG++ GGY+HG    HGGG Y  GGG Y  GGGG  GGGG  
Subjt:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAKYDRGY---GGHH-GGYDHG----HGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGGGR-

Query:  -YGGGCRYGRCGH
         +GGG   G  GH
Subjt:  -YGGGCRYGRCGH

Q09134 Abscisic acid and environmental stress-inducible protein1.6e-0540.26Show/hide
Query:  VLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAKYDRGY----------------GGHH--GGYDHG------------HGGGRYGGGGGRYGGGGGGR
        VLLISSEV+ARDL ET+++   E   +TN V DAKY  GY                GG++  GGY+HG            HGGG Y  GGG Y  GGGG 
Subjt:  VLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAKYDRGY----------------GGHH--GGYDHG------------HGGGRYGGGGGRYGGGGGGR

Query:  YGGGGRY----------------------GGGCRYGRCGHRCCSYAGEVVEGAK
          GGG Y                      GGGC+Y  C  RCCS+A  V   AK
Subjt:  YGGGGRY----------------------GGGCRYGRCGHRCCSYAGEVVEGAK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G05520.2 glycine-rich protein 38.0e-0545.93Show/hide
Query:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVED--AKYDRGYGGHHGGYDHGHGGGRYGGGGGRYGG------GGGGRY-GGGGR
        M SK LV   L L  VLL+ SEVAA   A  ++ +      +  G  D    Y+ G G   GG ++  GGG Y GGGGRY G      GGGGRY GGGGR
Subjt:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVED--AKYDRGYGGHHGGYDHGHGGGRYGGGGGRYGG------GGGGRY-GGGGR

Query:  YGGG------CRYGRC--GH----RCCSYAGEVVE
         GGG      CR+G C  G+    RCCSYAGE V+
Subjt:  YGGG------CRYGRC--GH----RCCSYAGEVVE

AT2G05520.3 glycine-rich protein 31.5e-0649.24Show/hide
Query:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAKYD-RGYGGHHGGYDHG-----HGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGGGRYGG
        M SK LV   L L  VLL+ SEVAA           + ATV +   E  K D RGYG + G Y++G      GGGRY GGGGRY GGGG   GGGGR GG
Subjt:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAKYD-RGYGGHHGGYDHG-----HGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGGGRYGG

Query:  G------CRYGRC--GH----RCCSYAGEVVE
        G      CR+G C  G+    RCCSYAGE V+
Subjt:  G------CRYGRC--GH----RCCSYAGEVVE

AT2G05520.4 glycine-rich protein 34.2e-0648.85Show/hide
Query:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAKYD-RGYGGHHGGYDHG----HGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGGGRYGGG
        M SK LV   L L  VLL+ SEVAA           + ATV +   E  K D RGYG + G Y++G     GGG Y GGGGRY GGGG   GGGGR GGG
Subjt:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAKYD-RGYGGHHGGYDHG----HGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGGGRYGGG

Query:  ------CRYGRC--GH----RCCSYAGEVVE
              CR+G C  G+    RCCSYAGE V+
Subjt:  ------CRYGRC--GH----RCCSYAGEVVE

AT2G05520.5 glycine-rich protein 32.5e-0651.24Show/hide
Query:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAKYD-RGYGGHHGGYDHGHGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGGGRYGGGCRYG
        M SK LV   L L  VLL+ SEVAA           + ATV +   E  K D RGYG + G Y+  +GGGRY GGGGRY  GGGGR GGGG  G  CR+G
Subjt:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAKYD-RGYGGHHGGYDHGHGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGGGRYGGGCRYG

Query:  RC--GH----RCCSYAGEVVE
         C  G+    RCCSYAGE V+
Subjt:  RC--GH----RCCSYAGEVVE

AT2G05520.6 glycine-rich protein 31.6e-0549.6Show/hide
Query:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAKYD-RGYGGHHGGYDHG----HGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGGGRYGGG
        M SK LV   L L  VLL+ SEVAA           + ATV +   E  K D RGYG + G Y++G     GGG Y GGGGRY  GGGGR GGGG  G  
Subjt:  MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAKYD-RGYGGHHGGYDHG----HGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGGGRYGGG

Query:  CRYGRC--GH----RCCSYAGEVVE
        CR+G C  G+    RCCSYAGE V+
Subjt:  CRYGRC--GH----RCCSYAGEVVE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATTTCGAAGCCTTTAGTTTTTGTGTGTCTTGTTTTGGCCTTTGTTCTTCTCATCTCCTCCGAGGTGGCTGCCAGAGACCTCGCTGAGACCTCCACCAACAACCACAA
CGAAGCCACAGTAGAGACAAATGGTGTAGAAGATGCCAAATATGACCGAGGTTATGGAGGCCATCACGGTGGTTACGACCATGGTCATGGCGGCGGCAGATACGGTGGCG
GTGGTGGTAGGTACGGTGGTGGTGGCGGTGGCAGGTATGGTGGTGGCGGAAGATACGGTGGCGGTTGCCGATACGGTCGGTGCGGGCACAGGTGCTGCAGCTACGCAGGT
GAAGTGGTAGAGGGGGCAAAGCCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACAAAAAACAAAAAAATCTCTTAAAAATGATTTCGAAGCCTTTAGTTTTTGTGTGTCTTGTTTTGGCCTTTGTTCTTCTCATCTCCTCCGAGGTGGCTGCCAGAGACCTC
GCTGAGACCTCCACCAACAACCACAACGAAGCCACAGTAGAGACAAATGGTGTAGAAGATGCCAAATATGACCGAGGTTATGGAGGCCATCACGGTGGTTACGACCATGG
TCATGGCGGCGGCAGATACGGTGGCGGTGGTGGTAGGTACGGTGGTGGTGGCGGTGGCAGGTATGGTGGTGGCGGAAGATACGGTGGCGGTTGCCGATACGGTCGGTGCG
GGCACAGGTGCTGCAGCTACGCAGGTGAAGTGGTAGAGGGGGCAAAGCCTTGAGGCTAATATGGATGTGCTGAAATAGTAAAGTATAAAGGTTATGTTGTGTGAGTATGG
TTTGTGTGTAAAAGTTCATGAAATAAATGCATGGGGAATGGAGTGGCTAGCTTAGGCTTTTCTTTCTTCTTTTCCCTTTGTTTGGTTTTTAGTGTCTTGCTTTAGATTTG
CTTTTGCAAACTTTTATGATATCAAGAAGAAATTTCAGCTTTGTGTGTCATTATACTTCTATCTTCATGAATCCACCTTATTTCAATGCTTAAAATATTTCAAGATGGCT
CCATATGGAAAAGATATCTTGGACCAGATTTATGTAAATTTGTGAATTGAAATACATGTTTAAGTTTTACCCGCTTGAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MISKPLVFVCLVLAFVLLISSEVAARDLAETSTNNHNEATVETNGVEDAKYDRGYGGHHGGYDHGHGGGRYGGGGGRYGGGGGGRYGGGGRYGGGCRYGRCGHRCCSYAG
EVVEGAKP