; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0012885 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0012885
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionMADS-box transcription factor 23-like isoform X2
Genome locationLG13:2566179..2581875
RNA-Seq ExpressionSed0012885
SyntenySed0012885
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_038905562.1 MADS-box transcription factor 23-like isoform X2 [Benincasa hispida]4.8e-11291.21Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BYM8 MADS-box transcription factor 23 isoform X32.0e-10889.92Show/hide
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A0A1S3BYR5 MADS-box transcription factor 23 isoform X26.0e-10889.79Show/hide
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A0A6J1D512 MADS-box transcription factor 23 isoform X21.5e-10687.45Show/hide
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A0A6J1FUQ5 MADS-box transcription factor 23-like isoform X23.5e-10888.14Show/hide
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A0A6J1JL93 MADS-box transcription factor 23-like isoform X21.7e-10787.71Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q38840 Agamous-like MADS-box protein AGL171.1e-5855.31Show/hide
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Q6EP49 MADS-box transcription factor 277.6e-6859.41Show/hide
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Q6Z6W2 MADS-box transcription factor 571.1e-5854.73Show/hide
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Q9SI38 MADS-box transcription factor ANR14.9e-6760.59Show/hide
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Q9SZJ6 Agamous-like MADS-box protein AGL214.8e-6256.83Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G14210.1 AGAMOUS-like 443.5e-6860.59Show/hide
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AT2G22630.1 AGAMOUS-like 177.8e-6055.31Show/hide
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