; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0013331 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0013331
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptioncalmodulin-like
Genome locationLG09:12631349..12632382
RNA-Seq ExpressionSed0013331
SyntenySed0013331
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005509 - calcium ion binding (molecular function)
GO:0032440 - 2-alkenal reductase [NAD(P)] activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002048 - EF-hand domain
IPR011992 - EF-hand domain pair
IPR018247 - EF-Hand 1, calcium-binding site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6574954.1 hypothetical protein SDJN03_25593, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.3e-5371.71Show/hide
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        ME+GEALTK+QM++L+E FLLFDKNRDGCITLDELR  I+++G N TE+ELKDMI+EVDADGN  I+F EF   MS  +KEETE+KLK+AFKVFD+NQDG
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        YIS +ELR V +MLNLGEKLTEEEV+++ R+ADLNGDG VDY EFV +MT+H
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XP_022930395.1 calmodulin-like protein 8 [Cucurbita moschata]5.2e-5171.71Show/hide
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        YIS +EL  VL MLNLGE+LT EE+ QM  DADL+GDGHVDY EFVNMMTE+
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XP_022958889.1 calmodulin-like [Cucurbita moschata]6.2e-5270.39Show/hide
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        ME+GEALTK+QM++L+E FLLFDKNRDGCITLDELR  I+++G N TE+ELKDMI+EVDADGN  I+F EF   MS  +KEETE+KLK+AFKVFD+NQDG
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        YIS +ELR V +MLNLGEKLT++EV+++  +ADLNGDG VDY EFV +MTEH
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XP_023548669.1 calmodulin-1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-5372.37Show/hide
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        ME+GEALTK+QM++L+E FLLFDKNRDGCITLDELR  I+++G N TE+ELKDMI+EVDADGN  I+F EF   MS  +KEETE+KLK+AFKVFD+NQDG
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        YIS +ELR V +MLNLGEKLTEEEV+++ R+ADLNGDG VDY EFV +MTEH
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XP_038907158.1 calmodulin-2/4-like [Benincasa hispida]1.6e-5274.5Show/hide
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        ME+GE LTK+QM+QL E FL FDKNRDGCITLDELR  IR +G N TE+ELK MI EVDADGN KIDF EF   MS  ++EETEEKLKEAFKVFD+NQDG
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        YIS +EL  V +MLNLGEKLT+EEV+QM RDADL+GDG VDY EFVNMM
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LLM7 Uncharacterized protein1.7e-4769.33Show/hide
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        +GEALTK+QM+QL+E F LFDKN+DG IT+DELRA IR +G N TE+ELK+MI+EVDADGN  I+F EF N MS  +KEETE+KLKEAFKVFD+NQDGYI
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Query:  SPSELRQVLVMLNLG-EKLTEEEVVQMFRDADLNGDGHVDYDEFVNMMTE
        S +EL  V  MLN G EKLT+EEV  M  +ADLNGDGHVDY EFV +MT+
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A0A6J1CB59 calmodulin-like protein 83.3e-5174Show/hide
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        +GE L K+QM++L+E F LFDKNRDGCIT DELR V IRQ+G N TEQELKDMI+EVDADGN  I+F EFL  MS  +KEE EEKLKEAFKVFD+NQDGY
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        IS +EL  V VMLNLGEKLTEEEVVQM R+ADL+GDG V+YDEFV +MTE
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A0A6J1EWT4 calmodulin-like protein 82.5e-5171.71Show/hide
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        ME+GE LT+QQM+QLQE F LFD+N DGCITLDELR  I++   NLTE+ELKDMI EVDADGN  I+F E  N MS   KEETEEKL+EAFK+FDENQDG
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        YIS +EL  VL MLNLGE+LT EE+ QM  DADL+GDGHVDY EFVNMMTE+
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A0A6J1H6E9 calmodulin-like3.0e-5270.39Show/hide
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        ME+GEALTK+QM++L+E FLLFDKNRDGCITLDELR  I+++G N TE+ELKDMI+EVDADGN  I+F EF   MS  +KEETE+KLK+AFKVFD+NQDG
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        YIS +ELR V +MLNLGEKLT++EV+++  +ADLNGDG VDY EFV +MTEH
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A0A6J1KG52 calmodulin-like protein 82.1e-5071.05Show/hide
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        ME+GE LT+QQM+QLQE F LFD+N DGCITLDELR  I++   NLTE+ELKDMI EVDADGN  I+F E  N MS   KEETEEKL+EAFK+FDENQDG
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        YIS +EL  VL MLNLGE+LT EE+ QM  DADL+GDG VDY EFVNMMTE+
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23320 Calmodulin-like protein 83.0e-4161.38Show/hide
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        ALTK Q+ + +E F LFDK+ DGCIT++EL  VIR +  N TEQEL D+I E+D+D N  I+F EFLN M+  L+E + EE+LKEAFKVFD++Q+GYIS 
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        SEL    VM+NLGEKLT+EEV QM ++ADL+GDG V+YDEFV MM
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P27161 Calmodulin7.3e-4058.78Show/hide
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        + E LT++Q+ + +E F LFDK+ DGCIT  EL  V+R +G N TE EL+DMI EVDAD N  IDF EFLN M+  +K+ ++EE+LKEAFKVFD++Q+G+
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        IS +ELR   VM NLGEKLT+EEV +M R+AD++GDG V+Y+EFV MM
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Q7DMN9 Calmodulin-5/6/7/85.6e-4057.43Show/hide
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        + + LT+ Q+++ +E F LFDK+ DGCIT  EL  V+R +G N TE EL+DMI EVDADGN  IDF EFLN M+  +K+ ++EE+LKEAF+VFD++Q+G+
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Query:  ISPSELRQVLVMLNLGEKLTEEEVVQMFRDADLNGDGHVDYDEFVNMM
        IS +ELR   VM NLGEKLT+EEV +M R+AD++GDG ++YDEFV +M
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Q84MN0 Calmodulin-like protein 44.3e-4060.27Show/hide
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        E LT +QM   QE FLLFDKN DGCITL+EL AV R +G   T+QEL DM++EVD DGN  IDF EFL+ ++  +K+ + +E+LKEAF+V D++Q+G+IS
Subjt:  EALTKQQMNQLQEDFLLFDKNRDGCITLDELRAVIRQMGSNLTEQELKDMIKEVDADGNEKIDFLEFLNFMSIPLKE-ETEEKLKEAFKVFDENQDGYIS

Query:  PSELRQVLVMLNLGEKLTEEEVVQMFRDADLNGDGHVDYDEFVNMM
        P+ELR   VM NLGEK+T+EEV QM R+AD +GDG V+YDEFV MM
Subjt:  PSELRQVLVMLNLGEKLTEEEVVQMFRDADLNGDGHVDYDEFVNMM

Q9LIK5 Calmodulin-like protein 114.6e-4261.64Show/hide
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        + LT++Q+ + +E F LFDK+ DGCIT DEL  VIR +  N TEQEL+DMI E+D+DGN  I+F EFLN M+  L+E + +E+LKEAFKVFD++Q+GYIS
Subjt:  EALTKQQMNQLQEDFLLFDKNRDGCITLDELRAVIRQMGSNLTEQELKDMIKEVDADGNEKIDFLEFLNFMSIPLKE-ETEEKLKEAFKVFDENQDGYIS

Query:  PSELRQVLVMLNLGEKLTEEEVVQMFRDADLNGDGHVDYDEFVNMM
         SELR   VM+NLGEKLT+EEV QM ++ADL+GDG V+YDEFV MM
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G66410.1 calmodulin 48.9e-4156.76Show/hide
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        + + LT +Q+++ +E F LFDK+ DGCIT  EL  V+R +G N TE EL+DMI EVDADGN  IDF EFLN M+  +K+ ++EE+LKEAF+VFD++Q+G+
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        IS +ELR   VM NLGEKLT+EEV +M R+AD++GDG ++Y+EFV +M
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AT3G22930.1 calmodulin-like 113.3e-4361.64Show/hide
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        + LT++Q+ + +E F LFDK+ DGCIT DEL  VIR +  N TEQEL+DMI E+D+DGN  I+F EFLN M+  L+E + +E+LKEAFKVFD++Q+GYIS
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Query:  PSELRQVLVMLNLGEKLTEEEVVQMFRDADLNGDGHVDYDEFVNMM
         SELR   VM+NLGEKLT+EEV QM ++ADL+GDG V+YDEFV MM
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AT3G43810.1 calmodulin 72.0e-4056.76Show/hide
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        + + LT  Q+++ +E F LFDK+ DGCIT  EL  V+R +G N TE EL+DMI EVDADGN  IDF EFLN M+  +K+ ++EE+LKEAF+VFD++Q+G+
Subjt:  IGEALTKQQMNQLQEDFLLFDKNRDGCITLDELRAVIRQMGSNLTEQELKDMIKEVDADGNEKIDFLEFLNFMSIPLKE-ETEEKLKEAFKVFDENQDGY

Query:  ISPSELRQVLVMLNLGEKLTEEEVVQMFRDADLNGDGHVDYDEFVNMM
        IS +ELR   VM NLGEKLT+EEV +M R+AD++GDG ++Y+EFV +M
Subjt:  ISPSELRQVLVMLNLGEKLTEEEVVQMFRDADLNGDGHVDYDEFVNMM

AT4G14640.1 calmodulin 82.1e-4261.38Show/hide
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        ALTK Q+ + +E F LFDK+ DGCIT++EL  VIR +  N TEQEL D+I E+D+D N  I+F EFLN M+  L+E + EE+LKEAFKVFD++Q+GYIS 
Subjt:  ALTKQQMNQLQEDFLLFDKNRDGCITLDELRAVIRQMGSNLTEQELKDMIKEVDADGNEKIDFLEFLNFMSIPLKE-ETEEKLKEAFKVFDENQDGYISP

Query:  SELRQVLVMLNLGEKLTEEEVVQMFRDADLNGDGHVDYDEFVNMM
        SEL    VM+NLGEKLT+EEV QM ++ADL+GDG V+YDEFV MM
Subjt:  SELRQVLVMLNLGEKLTEEEVVQMFRDADLNGDGHVDYDEFVNMM

AT5G37780.1 calmodulin 18.9e-4156.76Show/hide
Query:  IGEALTKQQMNQLQEDFLLFDKNRDGCITLDELRAVIRQMGSNLTEQELKDMIKEVDADGNEKIDFLEFLNFMSIPLKE-ETEEKLKEAFKVFDENQDGY
        + + LT +Q+++ +E F LFDK+ DGCIT  EL  V+R +G N TE EL+DMI EVDADGN  IDF EFLN M+  +K+ ++EE+LKEAF+VFD++Q+G+
Subjt:  IGEALTKQQMNQLQEDFLLFDKNRDGCITLDELRAVIRQMGSNLTEQELKDMIKEVDADGNEKIDFLEFLNFMSIPLKE-ETEEKLKEAFKVFDENQDGY

Query:  ISPSELRQVLVMLNLGEKLTEEEVVQMFRDADLNGDGHVDYDEFVNMM
        IS +ELR   VM NLGEKLT+EEV +M R+AD++GDG ++Y+EFV +M
Subjt:  ISPSELRQVLVMLNLGEKLTEEEVVQMFRDADLNGDGHVDYDEFVNMM


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGATTGGGGAAGCTCTGACCAAACAACAAATGAATCAGCTCCAAGAAGATTTTCTTTTATTTGACAAGAACAGAGATGGTTGCATAACCCTTGATGAACTGAGGGC
AGTGATCAGACAAATGGGTTCAAACTTAACAGAACAAGAACTCAAGGACATGATCAAAGAAGTTGATGCTGATGGCAATGAGAAAATTGACTTCTTGGAATTTCTCAACT
TCATGTCCATCCCCTTGAAGGAAGAAACAGAGGAGAAACTGAAGGAAGCCTTCAAAGTGTTCGATGAAAACCAAGATGGATACATATCACCAAGTGAGTTGAGGCAAGTT
CTTGTGATGCTTAATCTGGGGGAAAAGTTAACAGAAGAGGAAGTAGTGCAGATGTTCAGAGATGCTGATTTGAATGGAGATGGCCATGTTGACTATGATGAGTTTGTCAA
CATGATGACTGAGCATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCTCTTTCTCTGTTTTTGTTTACTGCTTTTGTGTTCATTAGTTTCCTTTCTAACATTTTCATGGAGATTGGGGAAGCTCTGACCAAACAACAAATGAATCAGCTCCAAGA
AGATTTTCTTTTATTTGACAAGAACAGAGATGGTTGCATAACCCTTGATGAACTGAGGGCAGTGATCAGACAAATGGGTTCAAACTTAACAGAACAAGAACTCAAGGACA
TGATCAAAGAAGTTGATGCTGATGGCAATGAGAAAATTGACTTCTTGGAATTTCTCAACTTCATGTCCATCCCCTTGAAGGAAGAAACAGAGGAGAAACTGAAGGAAGCC
TTCAAAGTGTTCGATGAAAACCAAGATGGATACATATCACCAAGTGAGTTGAGGCAAGTTCTTGTGATGCTTAATCTGGGGGAAAAGTTAACAGAAGAGGAAGTAGTGCA
GATGTTCAGAGATGCTGATTTGAATGGAGATGGCCATGTTGACTATGATGAGTTTGTCAACATGATGACTGAGCATTGAAGTTGTCTAGAAATCCTATAAAAAAGGATGG
CTAAATTATTAAGAATACCCCCAAGTTTGTTAATTTAAGAAAAAATATTTGTAATCTTTGGTAGATACAATATCCACATGATGACCTAGAACGATGTGACGATAATGAAA
ACAATTAAGATTATACCTTCACATTATCGATATTAGAATTTAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEIGEALTKQQMNQLQEDFLLFDKNRDGCITLDELRAVIRQMGSNLTEQELKDMIKEVDADGNEKIDFLEFLNFMSIPLKEETEEKLKEAFKVFDENQDGYISPSELRQV
LVMLNLGEKLTEEEVVQMFRDADLNGDGHVDYDEFVNMMTEH