; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0013499 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0013499
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionGlutaredoxin family protein
Genome locationLG09:25596225..25600804
RNA-Seq ExpressionSed0013499
SyntenySed0013499
Gene Ontology termsGO:0034599 - cellular response to oxidative stress (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0015038 - glutathione disulfide oxidoreductase activity (molecular function)
GO:0097573 - glutathione oxidoreductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002109 - Glutaredoxin
IPR014025 - Glutaredoxin subgroup
IPR036249 - Thioredoxin-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6576070.1 Glutaredoxin-C5, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.8e-5368.04Show/hide
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XP_022954295.1 glutaredoxin-C5, chloroplastic-like [Cucurbita moschata]8.9e-5367.69Show/hide
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XP_022991298.1 monothiol glutaredoxin-S10-like [Cucurbita maxima]3.2e-5066.15Show/hide
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XP_023549357.1 glutaredoxin-C5, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-5267.01Show/hide
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XP_038874858.1 glutaredoxin-C5, chloroplastic-like [Benincasa hispida]2.0e-5266.67Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KA52 Glutaredoxin domain-containing protein9.9e-5064.32Show/hide
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        CSYS EVKALF RLGVQPLVIELDELGPQGPQLQK+LERLTGQHTVPNVF+              GGKHIGGCTDTVKLYRKGELE +LSEAN+KN+ET
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A0A1S3CB05 glutaredoxin-C5, chloroplastic6.4e-4963.96Show/hide
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A0A5D3DLT6 Glutaredoxin-C56.4e-4963.96Show/hide
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A0A6J1GS13 glutaredoxin-C5, chloroplastic-like4.3e-5367.69Show/hide
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A0A6J1JVU3 monothiol glutaredoxin-S10-like1.5e-5066.15Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O81187 Glutaredoxin8.2e-1746.73Show/hide
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        V++N VVV+SKT+C Y + VK L N+LG Q  VIELD     G  LQ  L   TGQ TVPNVF+              GGKHIGGC  T  ++++G+L  
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        LL+EA +
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P55142 Glutaredoxin-C64.1e-1645.45Show/hide
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        K TV + PVVVYSK++C +   VK LF +LG     IELD     G +LQ  L   TGQ TVPNVF++              GKHIGGC DT+ L  +G+
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Query:  LERLLSEANS
        L  LL+EA +
Subjt:  LERLLSEANS

Q0J3L4 Monothiol glutaredoxin-S108.1e-4163.38Show/hide
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        R+R PF        + +ASSSS  SSFG R+E +VK T+ +NPVV+YSK+WCSYS EVKALF R+GVQP VIELD+LG QGPQLQK+LERLTGQ TVPNV
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Query:  FVDAKSLLKILSIVLKGGKHIGGCTDTVKLYRKGELERLLSE
        F+              GGKHIGGCTDTVKL+RKGEL  +LSE
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Q8GWS0 Glutaredoxin-C5, chloroplastic4.6e-4463.89Show/hide
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        S  +R+  S  +++SSSSSSFG R+E++++ TVT N VV+YSKTWCSY +EVK LF RLGVQPLV+ELD+LGPQGPQLQK+LERLTGQHTVPNVFV    
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                   GKHIGGCTDTVKL RKG+LE +L+EAN KN ++
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Q8LBS4 Monothiol glutaredoxin-S12, chloroplastic5.8e-3961.76Show/hide
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        S++A SSSSSSS G  LE+TVK+TV  NPVVVYSKTWCSYSS+VK+LF  L V+PLV+ELD+LG +G QLQ +LE++TGQ+TVPNVF+            
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          GGKHIGGC+DT++L+ KGELE +L+EAN KN +T
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20270.1 Thioredoxin superfamily protein4.1e-4061.76Show/hide
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        S++A SSSSSSS G  LE+TVK+TV  NPVVVYSKTWCSYSS+VK+LF  L V+PLV+ELD+LG +G QLQ +LE++TGQ+TVPNVF+            
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          GGKHIGGC+DT++L+ KGELE +L+EAN KN +T
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AT2G20270.2 Thioredoxin superfamily protein1.1e-3551.53Show/hide
Query:  SIQASSSSSSSSFGYRLEQTVKSTVTNNPVVVYSKTWCSYSSEVKALFNRLGVQPLVIELDEL---------------------------GPQGPQLQKL
        S++A SSSSSSS G  LE+TVK+TV  NPVVVYSKTWCSYSS+VK+LF  L V+PLV+ELD+L                           G +G QLQ +
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Query:  LERLTGQHTVPNVFVDAKSLLKILSIVLKGGKHIGGCTDTVKLYRKGELERLLSEANSKNTET
        LE++TGQ+TVPNVF+              GGKHIGGC+DT++L+ KGELE +L+EAN KN +T
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AT4G28730.1 Glutaredoxin family protein3.3e-4563.89Show/hide
Query:  STRIRSPFSIQASSSSSSSSFGYRLEQTVKSTVTNNPVVVYSKTWCSYSSEVKALFNRLGVQPLVIELDELGPQGPQLQKLLERLTGQHTVPNVFVDAKS
        S  +R+  S  +++SSSSSSFG R+E++++ TVT N VV+YSKTWCSY +EVK LF RLGVQPLV+ELD+LGPQGPQLQK+LERLTGQHTVPNVFV    
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Query:  LLKILSIVLKGGKHIGGCTDTVKLYRKGELERLLSEANSKNTET
                   GKHIGGCTDTVKL RKG+LE +L+EAN KN ++
Subjt:  LLKILSIVLKGGKHIGGCTDTVKLYRKGELERLLSEANSKNTET

AT5G40370.1 Glutaredoxin family protein3.5e-1541.59Show/hide
Query:  QTVKSTVTNNPVVVYSKTWCSYSSEVKALFNRLGVQPLVIELDELGPQGPQLQKLLERLTGQHTVPNVFVDAKSLLKILSIVLKGGKHIGGCTDTVKLYR
        Q  K  V +  VVV+SKT+C Y   VK L  +LG +   +ELD     G Q+Q  L   TGQ TVPNVF+              GG HIGGC  T  L++
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Query:  KGELERLLSEANS
         G+L  LL+EA +
Subjt:  KGELERLLSEANS

AT5G63030.1 Thioredoxin superfamily protein4.6e-1540.91Show/hide
Query:  KSTVTNNPVVVYSKTWCSYSSEVKALFNRLGVQPLVIELDELGPQGPQLQKLLERLTGQHTVPNVFVDAKSLLKILSIVLKGGKHIGGCTDTVKLYRKGE
        K  V+  PVVV+SKT+C Y   VK L  +LG    V+ELDE+   G ++Q  L   TGQ TVPNVF+               G HIGGC   ++  ++G+
Subjt:  KSTVTNNPVVVYSKTWCSYSSEVKALFNRLGVQPLVIELDELGPQGPQLQKLLERLTGQHTVPNVFVDAKSLLKILSIVLKGGKHIGGCTDTVKLYRKGE

Query:  LERLLSEANS
        L  LL+EA +
Subjt:  LERLLSEANS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGCCGCTTCCAGTTTGGTGTCTCCTCATCTTACTTCTTCTCATCCCTCTCTTTCCTTCTTCAAACCTTCCCTTCCCGTCTCCACTTCCATTTCCTCTGCCAAATC
CAAATCCAAATCCATCTCTACAAGAATCAGATCCCCCTTCTCCATTCAAGCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTGGTTATAGACTCGAACAGACCGTCAAATCCA
CAGTTACCAACAACCCAGTTGTCGTCTACTCCAAGACTTGGTGCTCCTACTCTTCTGAGGTCAAGGCGCTGTTCAACAGGCTTGGGGTGCAGCCATTGGTTATTGAATTG
GATGAATTGGGTCCCCAAGGGCCACAATTGCAAAAGCTACTTGAGAGGCTTACTGGACAACATACGGTACCAAATGTTTTCGTCGATGCAAAGAGTCTCCTGAAAATACT
ATCGATTGTATTGAAAGGGGGAAAACATATAGGCGGTTGTACAGATACTGTGAAACTATACCGAAAAGGGGAACTTGAACGTTTGCTATCCGAGGCTAATTCTAAAAATA
CAGAGACGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATGGAAAACAAGCTTTTAGGAAAGAAGCTCAGAGAAGAGAAGTGTGAGCTTAAGAAAAAAGGGAGGAAGGCGAAGCGGTGGTCTGTCCTCATCAATGGCTGCCGCTTCC
AGTTTGGTGTCTCCTCATCTTACTTCTTCTCATCCCTCTCTTTCCTTCTTCAAACCTTCCCTTCCCGTCTCCACTTCCATTTCCTCTGCCAAATCCAAATCCAAATCCAT
CTCTACAAGAATCAGATCCCCCTTCTCCATTCAAGCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTGGTTATAGACTCGAACAGACCGTCAAATCCACAGTTACCAACAACC
CAGTTGTCGTCTACTCCAAGACTTGGTGCTCCTACTCTTCTGAGGTCAAGGCGCTGTTCAACAGGCTTGGGGTGCAGCCATTGGTTATTGAATTGGATGAATTGGGTCCC
CAAGGGCCACAATTGCAAAAGCTACTTGAGAGGCTTACTGGACAACATACGGTACCAAATGTTTTCGTCGATGCAAAGAGTCTCCTGAAAATACTATCGATTGTATTGAA
AGGGGGAAAACATATAGGCGGTTGTACAGATACTGTGAAACTATACCGAAAAGGGGAACTTGAACGTTTGCTATCCGAGGCTAATTCTAAAAATACAGAGACGTAAGCCT
CTAAGCACATTTTGGTTTCTGTGCCATTTGCTGACTGACCTGTTGTTGATGTTTCCTAATTCTACCTTAAGAGACTTGTGTGTCTTTGTTAGGAAAATGTATGTAAATCT
ATTTATTGATGCATTTGTTAGAAGGAACTTCATCATGTGCATGTAATGACAGAGCATTTGATTACCATTTGGAAAGTTGATGGTGTCTTGACAATGTGTTTTAAGTATTT
AGATGCTTGTACAATAACAGAAGGACTGTGCTTGGTTCGACAATGAAATCTCTACCATTTATTTAGATTACCATTGTTAGAAGGAATTTCTTCGGCATTTGGATTGAGAT
AGCAATGTGCTCCTGGGATTGTGCTTGCTTCGATAATGAAATCTCTACGCCATTCTGAAAGGAAAACGTCTGTTGTAAGGACGATTTCATTCACTTGTTTGTTAAAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAASSLVSPHLTSSHPSLSFFKPSLPVSTSISSAKSKSKSISTRIRSPFSIQASSSSSSSSFGYRLEQTVKSTVTNNPVVVYSKTWCSYSSEVKALFNRLGVQPLVIEL
DELGPQGPQLQKLLERLTGQHTVPNVFVDAKSLLKILSIVLKGGKHIGGCTDTVKLYRKGELERLLSEANSKNTET